матричные биосинтезы
TRANSCRIPT
Слайды к лекции
24.09.2013
Доцент Ершиков Сергей Михайлович
Нуклеиновые кислоты
Нуклеиновые кислоты (полинуклеотиды) –биополимеры, состоящие из мономеров –нуклеотидов, соединённых в цепь.
Два типа нуклеиновых кислот: РНК и ДНК
Каждый нуклеотид состоит из азотистого основания, углевода (пентозы) и остатка фосфорной кислоты.
2
Нуклеотидный состав ДНК и РНК
В состав нуклеотидов ДНК входят азотистые основания тимин, аденин, гуанин, цитозин, углевод дезоксирибоза и остатки фосфорной кислоты.
В состав нуклеотидов РНК входят азотистые основания урацил, аденин, гуанин, цитозин, углевод рибоза и остатки фосфорной кислоты.
3
Схема строения нуклеиновых кислот
4
Матричные биосинтезы:
определение
Матричный биосинтез – процесс сборки новых макромолекул из мономеров, последовательность которых запрограммирована с помощью нуклеиновых кислот.
Матрицы - молекулы, которые содержат информацию о структуре других макромолекул.
5
Главные матричные биосинтезы
Репликация ДНК происходит в клеточном ядре, предшествует делению клеток, в результате чего дочерние клетки получают полный набор генов;
Транскрипция также осуществляется в ядре, в результате образуются матричные, транспортные и рибосомальные РНК, участвующие в синтезе белка в клетке;
Трансляция происходит на рибосомах и приводит к образованию специфических клеточных белков.
6
Главный постулат (центральная
догма) молекулярной биологии
Описывает направление переноса информации от генотипа к фенотипу
7
Общие закономерности матричных
биосинтезов
Активация предшественников
Три основных этапа: инициация, элонгация, терминация
Наличие на матрице элементов, указывающих на место начала и окончания синтеза
Модификация синтезированной молекулы
8
Репликация ДНК
Основные принципы:
комплементарность
антипараллельность
униполярность
потребность в затравке
прерывистость
полуконсервативность9
Репликация («удвоение») – процесс самоудвоения ДНК, или биосинтез дочерней молекулы, полностью идентичной исходной молекуле (матрице)
Репликация ДНК: необходимые условия (1)
1. Матрица – обе цепи молекулы ДНК
10
2. Расплетающие белки (хеликазы)
Образуется репликативная вилка; ДНК-связывающие белки препятствуют воссоединению цепей
Репликация ДНК: необходимые условия (2)
3. Праймаза (РНК-полимераза) -фермент, синтезирующий затравочную РНК
11
4. Субстраты и источники энергии –дезоксирибонуклеозидтрифосфаты(дАТФ, дГТФ, дТТФ, дЦТФ).
Репликация ДНК: необходимые условия (3)
5. ДНК-полимераза образует 3’,5’-фосфодиэфирные связи за счёт энергии макроэргических связей.
12
На одной ветви репликативной вилки синтезируется непрерывная цепь, на другой –фрагменты Оказаки
Репликация ДНК: необходимые условия (4)
6. ДНК-лигаза соединяет фрагменты Оказакив непрерывную цепь.
13
В результате образуются две идентичные молекулы ДНК
Репарация ДНК
Процесс, позволяющий живым организмам восстанавливать повреждения, возникающие в ДНК.
Процесс репарации включает несколько этапов:
выявление нарушения комплементарности цепей ДНК;
удаление некомплементарного нуклеотида или основания;
восстановление целостности цепи по принципу комплементарности.
14
Повреждения ДНК
Спонтанные:
ошибки репликации;
депуринизация;
дезаминирование азотистых оснований;
Индуцируемые:
образование димеров пиримидинов;
алкилирование, окисление, восстановление оснований под действием химических мутагенов.
15
Ферменты репарации ДНК
ДНК-гликозилаза;
Эндонуклеаза;
Экзонуклеаза;
ДНК-полимераза β;
ДНК-лигаза;
ДНК-инсертаза
16
Транскрипция
Основные принципы:
комплементарность
антипараллельность
униполярность
беззатравочность
асимметричность
17
Транскрипция («переписывание») –биосинтез РНК на матрице ДНК.
Транскрипция: необходимые условия (1)
1. Матрица – участок одной из цепей ДНК –оперон или транскриптон
18
Транскриптон содержит:
• информативные участки – экзоны;
• неинформативные участки - интроны
Транскрипция: необходимые условия (2)
2. ДНК-зависимая РНК-полимераза – главный фермент, участвующий в транскрипции
19
3. Субстраты и источники энергии –рибонуклеозидтрифосфаты(АТФ, ГТФ, ЦТФ, УТФ)
Процессинг мРНК
Процессинг мРНК –посттранскрипционноесозревание первичного транскрипта
20
Образующаяся мРНКпоступает из ядра в цитоплазму
Трансляция
Трансляция («перевод») –преобразование генетической информации, содержащейся в последовательности нуклеотидов мРНК, в линейную последовательность аминокислот полипептидной цепи.
Осуществляется посредством генетического кода.
21
Генетический код
Последовательность нуклеотидов мРНК , соответствующая определённым аминокислотам в полипептидной цепи.
22
Генетический код: свойства
триплетный;
неперекрывающийся;
непрерывный;
вырожденный;
универсальный
23
Адапторная функция тРНК
Молекула мРНКсодержит участок, способный взаимодействовать с кодонами мРНК –антикодон, и участок, взаимодействующий с соответствующими аминокислотами – 3’-конец (акцепторный стебель)
24
Активация аминокислот
подготовительный этап биосинтеза белка;
происходит в цитоплазме клетки;
включает связывание аминокислот со специфическими тРНК с участием аминоацил-тРНК-синтетаз (АРС-аз).
25
Трансляция
Рибосома – место синтеза белка
состоит из малой (40S) и большой (60S) субчастиц
содержит пептидильный (П) и аминоацильный (А) участки.
26
Трансляция: стадия инициации
27
Трансляция: стадия элонгации
удлинение полипептидной цепи на 1 аминокислотный остаток –происходит в три шага.
1 шаг: присоединение к инициирующему комплексу аминоацил-тРНК, соответствующей кодону, находящемуся в аминоацильном участке рибосомы.
Условия:
белковые факторы элонгации,
источник энергии – 1 молекула ГТФ28
Трансляция: стадия элонгации
2 шаг : транспептидация– образование пептидной связи между остатками аминокислот.
Условия:
рибосомальный фермент
пептидилтрансфераза.
29
Трансляция: стадия элонгации
3 шаг : транслокация –перемещение рибосомы относительно мРНК на 1 триплет.
Условия:
белковые факторы элонгации;
источник энергии – 1 молекула ГТФ.
30
Трансляция: стадия терминации
Окончание синтеза полипептидной цепи.
Условия:
появление в А-участке рибосомы одного из стоп-кодонов мРНК – УАА, УГА или УАГ;
белковые факторы терминации.
31
Формирование пространственной
структуры
Фолдинг –сворачивание полипептидной цепи в правильную трёхмерную структуру.
32
Шаперон
• фолдинг протекает при участии специальной группы белков, которые называются шаперонами
Посттрансляционные
модификации
частичный протеолиз;
присоединение простетической группы;
модификации аминокислотных остатков:
гидроксилирование пролина в гидроксипролин в коллагене;
метилирование аргинина в гистоне;
йодирование тирозина в тироглобулине.
33
Регуляция синтеза белка
Оперон – совокупность генов, способных включаться и выключаться в зависимости от метаболических потребностей клетки. Состав оперона: структурные гены; ген-оператор; ген-регулятор
Основные механизмы регуляции: индукция; репрессия.
34
Индукция синтеза белка (на
примере лактозного оперона)
35
Индуктор – исходный субстрат метаболического пути.
Репрессия синтеза белка (на
примере гистидинового оперона)
36
Корепрессор – конечный продукт метаболического пути.