Федеральное государственное автономное образовательное учреждение

высшего профессионального образования«СИБИРСКИЙ ФЕДЕРАЛЬНЫЙ УНИВЕРСИТЕТ»

Институт фундаментальной биологии и биотехнологииКафедра биофизики

РЕФЕРАТ

по Информационно-коммуникационным технологиям в естественнонаучных исследованиях

Современные направления исследований в области получения и практического применения аптамеров

Студент БФ12-02М О.А. Зубкова

Красноярск 2013

Актуальность Аптамеры представляют новое перспективное направление в медицинских исследованиях. Их применение возможно в терапии (в качестве лекарственных препаратов) и диагностики (в качестве основы для аптасенсоров) различных заболеваний, а также для целевой доставки лекарств.

Актуальность

Аптамеры - синтетические однонитевые молекулы РНК или ДНК, способные к специфичному связыванию с другими молекулами-мишенями.

Количество публикаций

Ключевые слова

Результаты поиска (количество публикаций)

Базы данных

ScienceDirect GoPubMed SpringerLink OxfordJournal

aptamer 4,374 3,143 786 668

SELEX 2,097 1,006 1 034 537

aptamer + cancer 2,272 515 873 256

aptamer + glioblastoma 194 15 44 15

aptamer + blood-brain barrier 352 4 102 12

Статистика

Рисунок 1 – Количество публикаций с ключевым словом «аптамер» по данным GoPubMed

Статистика

Рисунок 2 – Распределение научных лабораторий, занимающихся исследованиями в области получения и практического применения аптамеров.

По данным GoPubMed

СтатистикаСтраны – лидеры по количеству

публикаций

Россия на 16 месте с 21 публикацией

Журналы с наибольшим числом публикаций

СтатистикаЖурналы с наибольшим числом публикаций

Analytical Chemistry (ACS Publications)

IF 5.856Biosensors and Bioelectronics

(Elsevier)IF 5.602

Nucleic Acids Research(Oxford Journals)

IF 8.026

Journal of the American Chemical Society

(ACS Publications)IF 9.907

СтатистикаАвторы наибольшего числа статей

Обзор публикаций

cell-SELEX - технология селекции аптамеров к целым живым клеткам (Mao Ye, 2012; Nagarkatti R., 2012; Labib M.,2012)

» не требуется предварительная очистка белка;» белок находится в нативной конформации и естественном молекулярном окружении;» возможность обнаружения новых, ранее неизвестных биомаркеров заболеваний.

Обзор публикацийАптамеры в терапии онкологических заболеваний (Mao Ye, 2012)

» терапия эндокринной неоплазии. Аптамеры специфичные к мутантной форме RET (рецептор тирозинкиназы) ингибируют активность RET-опосредованного сигнального пути; » система из двух аптамеров, связывающихся с опухолевой клеткой и NK-клеткой (nature killer cell) для повышенной цитотоксичности.

Обзор публикацийСелекция аптамеров к клеткам глиобластомы (Abdullah Tahir Bayrac, 2011; Gao H., 2012)

» аптамеры к клеткам глиобластомы человека линии A-172 показали специфичность к клеткам других линий этого типа опухоли ;» доставка лекарственных препаратов (в качестве модели использовали доцетаксел) к месту локализации глиомы с помощью наночастиц, покрытых аптамером.

Список использованных источников:

1. Mao Ye. Generating Aptamers by Cell-SELEX for Applications in Molecular Medicine / Mao Ye, Jun Hu, Minyuan Peng, Jing Liu, Jun Liu, Huixia Liu, Xielan Zhao, Weihong Tan // International Journal of Molecular Sciences. 2012. № 13. С. 3341-3353.

2. Nagarkatti R. Development of an Aptamer-Based Concentration Method for the Detection of Trypanosoma cruzi in Blood / Nagarkatti R., Bist V., Sun S., Debrabant A. // PLOS ONE. 2012. Т 7, № 8. 12 С.

3. Labib M. Aptamer-Based Impedimetric Sensor for Bacterial Typing / Labib M., Zamay A. S., Kolovskaya O. S., Reshetneva I. T., Zamay G. S. // Analytical chemistry. 2012. № 84. С. 8114−8117.

4. Abdullah Tahir Bayrac. In Vitro Selection of DNA Aptamers to Glioblastoma Multiforme / Abdullah Tahir Bayrac, Kwame Sefah, Parag Parekh, Ceren Bayrac, Basri Gulbakan, Huseyin Avni Oktem, Weihong Tan // Chemical Neuroscience. 2011. № 2. С. 175–181.

5. Gao H. Whole-cell SELEX aptamer-functionalised poly(ethyleneglycol)-poly(ε-caprolactone) nanoparticles for enhanced targeted glioblastoma therapy / Huile Gao, Jun Qian, Zhi Yang, Zhiqing Pang, Zhangjie Xi, Shijie Cao, Yuchen Wang, Shuaiqi Pan, Shuang Zhang, Wei Wang, Xinguo Jiang, Qizhi Zhang // Biomaterials. 2012. № 33. С. 6264-6272.