— 美文三千 我只阅我所需

生命科学领域的文献检索

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做好科学研究

掌握掌握科技文献科技文献是前提是前提

学术研究中的时间分配

• 据美国科学基金会统计，一个科研人员花费在查找和消化科技资料上的时间需占全部科研时间的51%，计划思考占 8%，实验研究占 32%，书面总结占 9%。由上述统计数字可以看出，科研人员花费在科技出版物上的时间为全部科研时间的60%。

• 美国科学基金会 NSF(National Science Foundation)• http://www.nsf.gov

…… 更多

科技文献的获取和利用

文献的类型零次文献：口头信息、未公开发表的文字资料（手稿、书信、笔

记等）；时效性强；大量而无序一次文献：期刊论文、专利文献、科技报告、会议录等；研究人

员最终索取的文献二次文献：检索工具；如 Web of Science(SCI) ;

PubMed(Medline); Biosis Previews; SciFinder Scholar(CA) 等三次文献：选用大量有关的文献，经过综合、分析、研究而编写

出来的文献。 如：综述、评论、评述、进展、动态 等；研究人员最终需要的文献

科研人员与科学信息的获取和利用

科研过程中合理利用文献

• 研究人员的文献平台可以由二次文献作为入口，满足整体的需求；然后，通过这个入口来获取有用的高质量的全文期刊（一、三次文献）来满足纵深的研究需要。

主题词索引（ MeSH 主题词表）

OR

科学引文索引：引文数据库

1. 由美国国立医学图书馆所属国家生物技术信息中心(NCBI) 开发的生物医学文献检索系统

2. 从 1997 年 6 月起， PubMed 在网上免费向用户开放。 3. 登录 PubMed 的网址： http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed

一、 PubMed 数据库概述

• MEDLINE• PreMEDLINE• Record supplied by Publisher （出版商提供

的文献题录）。

二、 PubMed 系统的内容：

（ 1 ） MEDLINE

• 收录了全世界 70 个国家和地区的 4600 余种生物医学期刊，起始时间 1966 年，目前文摘条目 1200 万篇，年报道量近 40 万条，英文刊物占 90% 、周更新。

• 内容涉及：医学、药学、牙医学、护理学、卫生保健、兽医学等专业。

• 记录标注 [PubMed - indexed for MEDLINE]

（ 2 ） PreMEDLINE

• 是临时性医学文献数据库，每天接收新数据，经MeSH 词表标引后，每周向 medline 移加一次。故通过 PreMEDLINE 得到的信息比 MEDLINE 更快更新。

• 记录标注 [PubMed - in process]

（ 3 ） Publisher Supplied Citation

• PubMed 还通过电子通讯方式接受出版商提供的文献条目数据，这种条目每天都在不停地向PreMEDLINE 数据库中传送，包括不被 Medline收录的部分。因此用户可以看到最新发表的文章。

• 记录标注 [PubMed - as supplied by publisher]

PubMed 与 MEDLINE 的区别

• 收录范围广：– 部分生命科学相关文章的非医学专业期刊（物

理、天文、化学等）• 收录记录新：

– 在 MEDLINE 数据标引前的最新题录• 文献类型全：

– 提供电子原文链接（部分免费）

案例一 : 诱导多能干细胞（ IPS Cell ）相关研究

将人体皮肤细胞改造成了几乎可以和胚胎干细胞相媲美的干细胞——“ iPS 细胞”，它也被通俗地称为“皮肤干细胞”。它的诞生仿佛给沉寂一时的国际干细胞研究打入了一剂强心剂。

输入关键词

检索课题 : ： (Induced Pluripotent Stem Cell*) or (IPS cell*)

Web of Knowledge: 为科研工作流建立整合的创新研究平台

Web of Science同平台其它数据库

与其它数据库的链接

EndNoteWeb

ScholarOne-

Manuscript Central

期刊引证报告 JCR

基本科学指标 ESI

ResearcherID.com

检索

分析

发现

写作

引用

审稿

评估

论文发表

晋升 / 基金

论文提交

Web of Knowledge

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22

Web of Knowledge 与 Web of Science

Web of Science

• Science Citation Index Expanded( 科学引文索引， SCIE ） : ~8401 种核心期刊，可回溯到 1898 年

• Social Science Citation Index( 社会科学引文索引， SSCI ）： ~3003 种核心期刊，可回溯到 1899 年

• Arts & Humanities Citation Index( 艺术与人文索引A&HCI ） : ~1663 种核心期刊，可回溯到 1975 年

• Conference Proceedings Citation Index - Science (CPCI-S)--1990- 至今

• Conference Proceedings Citation Index - Social Science & Humanities (CPCI-SSH)--1990- 至今

Dr. Eugene GarfieldFounder & Chairman Emeritus ISI, Thomson Scientific

“Our ultimate goal is to extend our retrospective coverage of the scientific literature back to the twentieth century. The Century of Science initiative makes that dream come true.”

引文索引• Dr. Garfield 1955 年在 Science

发表论文提出将引文索引作为一种新的文献检索与分类工具。将一篇文献作为检索字段从而跟踪一个 Idea 的发展过程

• 1963 年出版 Science Citation Index • 1973 年出版 Social Sciences Citation Index• 1978 年出版 Arts & Humanities Citation Index

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输入关键词

检索课题 : ： (Induced Pluripotent Stem Cell*) or (IPS cell*)

快速锁定高影响力论文

全记录的引文链接（施引文献）

全记录的引文链接（参考文献）

全记录的引文链接（相关记录）

Web of Science 中的相关记录

Synthesis of Amino Acids

Synthesis and/or collection of Synthesis and/or collection of amino acids is critical for cell survival. They not only serve as the building blocks for proteins but also as starting points for the synthesis of many important cellular molecules including vitamins and nucleotides.

Synthesis of Amino Acids

Synthesis and/or collection of Synthesis and/or collection of amino acids is critical for cell survival. They not only serve as the building blocks for proteins but also as starting points for the synthesis of many important cellular molecules including vitamins and nucleotides.

论文甲 论文乙

A B C D E F

32

全记录的引文链接（相关记录）

2004

Cited References

19931991

1995

1980

2003Times Cited

Related Records

2003

2004

1999

2002

1994

2004

Citing

从一篇高质量的文献出发沿着科学研究的发展道路…

… Cited References 越查越旧 Times Cited 越查越新

Related Records 越查越深

1998

分析：学科分布、发展趋势、机构 / 作者等

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如何从整体上把握课题的发展方向和趋势？

如何快速定位研究领域中高影响力的论文？ 如何从检索结果中找到某个学科的相关论文？ 如何准确找到研究领域中的综述性文献？ 如何查找与我课题最相关的课题组网站及研究者博客？

如何快速定位研究领域中高影响力的论文？ 如何从检索结果中找到某个学科的相关论文？ 如何准确找到研究领域中的综述性文献？ 如何查找与我课题最相关的课题组网站及研究者博客？

案例 : 诱导多功能干细胞

检索到与本课题最相关的互联网信息，包含科技新闻，研究人员博客等内容，

点击即可浏览

检索到与本课题最相关的互联网信息，包含科技新闻，研究人员博客等内容，

点击即可浏览

快速锁定特定学科领域论文

快速检索到高影响力的综述

强大的分析功能：

▪ 作者 ▪出版年 ▪来源期刊 ▪文献类型 ▪ 会议名称 ▪国家 / 地区 ▪编者

▪ 基金资助机构 ▪授权号 ▪团体作者 ▪ 机构 ▪语种 ▪学科类别 ▪ WOS 学科类别

出版年分析：了解课题的发展趋势以及判断课题的发展阶段。

著者： - 发现该领域的高产出研究人员- 有利于机构的人才招聘- 选择小同行审稿专家- 选择潜在的合作者

山中伸弥： 1962 年出生于日本大阪府，日本医学家，京都大学再生医科研究所干细胞生物系教授，大阪市立大学医学博士（ 1993 年），美国加利福尼亚州旧金山心血管疾病研究所高级研究员。 　　山中伸弥是诱导多功能干细胞（ iPScell ）创始人之一。 2006 年，他所在的研究团队通过对小鼠的实验，发现诱导人体表皮细胞使之具有胚胎干细胞活动特征的方法。此方法诱导出的干细胞可转变为心脏和神经细胞，为研究治疗目前多种心血管绝症提供了巨大助力。这一研究成果在全世界被广泛应用，因为其免除了使用人体胚胎提取干细胞的伦理道德制约。山中伸弥也因此获得 2009 年拉斯克基础医学奖。 　　同时他在 2008 年获颁邵逸夫生命科学与医学奖。

机构 - 发现该领域高产出的大学及研 究机构- 有利于机构间的合作- 发现深造 /访问的研究机构

利用 Web of Science 获取思路，激发研究思想

• 以一篇高质量的文章为检索起点进行被引参考文献检索 Cited

Reference Search

被引参考文献检索的特点：• 以一篇文章、一个作者、一个期刊、一篇会议文献或者一本书作为检索词 ,

进行被引文献的检索 . 在不了解关键词或者难于限定关键词的时候，您可以从一篇高质量的文献出发，了解课题的全貌。

– 某一理论有没有得到进一步的证实？是否已经应用到了新的领域 ?

– 某项研究的最新进展极其延伸？

– 某个实验方法是否得到改进？

– 如何了解某篇论文 / 某部论著被引用情况？以揭示其影响力 .

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案例 2007 年高雄大学医学院罗怡卿博士撰文“ San-Huang-Xie-

Xin-Tang inhibits Helicobacter pylori-induced inflammation in human gastric epithelial AGS cells” 并发表在期刊 JOURNAL OF ETHNOPHARMACOLOGY 上，文中介绍了三黄泄心汤及主要成分黄芩苷对幽门螺杆菌导致的胃炎的治疗作用

作者 : Lo Yi-Ching

来源出版物 : JOURNAL OF ETHNOPHARMACOLOGY 卷 : 112 期 : 3 页 : 537 出版年 : 2007 该成果的最新应用如何 ? 该研究的最新进展如何 ?

被引文献作者

被引著作

被引文献出版年

此处列出的施引文献都是对该方法的应用与深入研究

黄芩及其主要活性成分的抗癌效用

了解最新进展

创建引文跟踪 ,追踪该技术的最新改进与应用

Web of Knowledge 平台中的 Medline

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Web of Knowledge 平台上的 Medline

输入关键词

检索课题 : ：” Induced Pluripotent Stem Cell*” or “IPS cell*”

Web of Knowledge 平台中 Medline 的分析功能：

▪ 作者 ▪机构作者 ▪ MeSH主题词 ▪ MeSH限定词▪ 来源出版物 ▪学科类别 ▪ ▪ 出版物类型 出版年

著者： - 发现该领域的高产出研究人员- 有利于机构的人才招聘- 选择小同行审稿专家- 选择潜在的合作者

希望大家能够充分利用好这些二次文献

美文三千，我只阅我所需

http://science.thomsonreuters.com.cn/