《结构化学》多媒体的制作

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《结构化学》多媒体《结构化学》多媒体的制作的制作


§1 §1 《结构化学》素材特点与应用《结构化学》素材特点与应用

• 好素材使问题的理解变得非常容易好素材使问题的理解变得非常容易

Atkins “Atkins’ Physical Chemistry”


• 准确：正确表述概念准确：正确表述概念• 精确：函数、分子和晶体的空间结构等要精确：函数、分子和晶体的空间结构等要求精确反映其特点求精确反映其特点

• 素材制作要尽可能用专业绘图软件素材制作要尽可能用专业绘图软件


结构化学素材类型结构化学素材类型

A. A. 图片类图片类

矢量图矢量图位图位图


B. B. 动画类动画类

A3 堆积中的正八面体空隙

GIFGIF 格式格式体积小体积小 ,, 不能控制播放不能控制播放

视频格式视频格式体积大体积大 ,, 不能控制播放不能控制播放

丁二烯电环合反应该视频来源于该视频来源于 PD Dr. Stefan ImmelPD Dr. Stefan Immel 网站网站


嵌入对象嵌入对象通过嵌入插件播放通过嵌入插件播放

氢原子 4dz2 轨道轮廓图

链接对象链接对象通过链接调用外部程序通过链接调用外部程序

CaF2 型晶体结构

B. B. 动画类动画类


C. C. 结构数据类结构数据类

晶体结构数据MSV Accelry, Viewerlite

CIF Crystallographic Information file ENT ， PDB Brookhaven Protein Data Bank MSI Accelrys, Cerius2

CSD Cambridge Structural Database Crystallographic files

分子结构数据MSV Accelry, Viewerlite

ENT ， PDB Brookhaven Protein Data Bank MOL Molecular Design, Ltd. (MDL)

MOL2 Tripos

HIN Hyperchem

可应用各种可应用各种分子模拟软分子模拟软件处理件处理


常用分子模拟软件常用分子模拟软件• CS ChemofficeCS Chemoffice 商业商业• HyperchemHyperchem 商业商业 DEMO10DEMO10 天天 http://www.hyper.com/

• GaussViewGaussView 商业商业• KnowItAll KnowItAll 学术版学术版 FreeFree http://www.knowitall.com/academic/

• DS ViewerLiteDS ViewerLite 不再提供支持不再提供支持• DS VisualizerDS Visualizer 注册下载注册下载 (( 需要专业显卡需要专业显卡 )) http://accelrys.com/

• ArgusLabArgusLab FreeFree http://www.arguslab.com/

• MolekelMolekel Free Free http://molekel.cscs.ch/http://molekel.cscs.ch/ • MoldenMolden Free Free http://www.cmbi.ru.nl/molden/ http://www.cmbi.ru.nl/molden/

• GabeditGabedit Free Free http://gabedit.sourceforge.net/http://gabedit.sourceforge.net/

• VMDVMD Free Free http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/ http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/

http://www.hyper.com/

http://www.knowitall.com/academic/

http://accelrys.com/

http://www.arguslab.com/


§2§2 《结构化学》多媒体制作技巧《结构化学》多媒体制作技巧

2.1 2.1 图片：矢量图与位图图片：矢量图与位图

矢量图—放大不失真，优先选择


矢量图种类与来源矢量图种类与来源

• 化学结构式、方程式化学结构式、方程式ChemwinChemwin ，， ChemDrawChemDraw ，， ChemSketchChemSketch 等等


• 2D2D 函数图函数图 Origin, Sigmaplot, ExcelOrigin, Sigmaplot, Excel 等等


• 示意图等示意图等CorelDraw Chemwin CorelDraw Chemwin 绘图等绘图等

X射线源

晶体

铅准直器

电离室

0.0731nm0.0709nm

石墨

X射线源

晶体

铅准直器

电离室

0.0731nm0.0709nm

石墨

X射线源

晶体

铅准直器

电离室

0.0731nm0.0709nm

石墨

X射线源

晶体

铅准直器

电离室

0.0731nm0.0709nm

石墨2pz

E1 =

E2 =

E3 =

E4 =


• 3D3D 函数、结构矢量图函数、结构矢量图SurferSurfer ，， Chem3D(4.5Chem3D(4.5 以前版本以前版本 ))


• 文件形式的矢量图文件形式的矢量图

WMFWMF WindowsWindows 图元文件图元文件可直接使用可直接使用EMFEMF 增强图元文件格式增强图元文件格式

SWF SWF FlashFlash 格式格式转化为位图或上面矢量转化为位图或上面矢量格式格式PDFPDF 可携式文件格式可携式文件格式 PSPS PostScriptPostScript

CDRCDR CorelDrawCorelDraw


• 从从 PDFPDF 文件中截取矢量图的技巧文件中截取矢量图的技巧

10%10%

25%25%

75%75%

200%200%

选择快照工具，选择截取区域，放大， ^C 拷贝


x

x

x

x

鼠标右键—设置图片格式—重新着色鼠标右键—设置图片格式—重新着色可调整颜色和填充颜色可调整颜色和填充颜色

• 矢量图调色技巧矢量图调色技巧


• 矢量图修改技巧（巧用选择性粘贴）矢量图修改技巧（巧用选择性粘贴）如得到的矢量图有问题，可利用如得到的矢量图有问题，可利用 PowerpointPowerpoint 绘图简单修改，绘图简单修改，利用选择性粘贴重新合成新矢量图，拆合自由利用选择性粘贴重新合成新矢量图，拆合自由

CH3

鼠标右键—组合—取消组合，同意转换对象

再次重复上一操作，将原图拆为多个元素

修改需要修改的地方，如将 C改为 N ，将 3 改为 2

将所有元素选上， ^X 剪切，Edit— 选择性粘贴为 Windows元文件

NH2


位图类型位图类型BMPBMP 、、 TIFFTIFF 、、 PNGPNG 、、 JPEGJPEG 、、 GIFGIF 等等优先选用没有压缩、单一背景、高像素的图片优先选用没有压缩、单一背景、高像素的图片

位图—放大失真


原图原图

亮度亮度对比度对比度

去单色背景去单色背景

剪裁剪裁旋转旋转

• 修饰位图—使用好图片工具栏修饰位图—使用好图片工具栏


2.2 GIF2.2 GIF 动画与视频动画与视频

GIFGIF 按图片插入按图片插入视频格式：插入—影片和声音—视频格式：插入—影片和声音—文件中的影片，可选播放的方式文件中的影片，可选播放的方式

视频来源于视频来源于 Stefan ImmelStefan Immel 网站网站 http://csi.chemie.tu-darmstadt.de/ak/immehttp://csi.chemie.tu-darmstadt.de/ak/immel/ l/


视图—工具栏—选控件工具箱视图—工具栏—选控件工具箱其它控件按钮—其它控件按钮— Shockwave Flash Object—Shockwave Flash Object— 鼠标变为十字鼠标变为十字指针，拖动鼠标选择嵌入指针，拖动鼠标选择嵌入 FlashFlash 窗口的大小窗口的大小 (( 可用鼠标右可用鼠标右击—设置控件格式精确大小击—设置控件格式精确大小 )—)— 鼠标右击—设置属性—鼠标右击—设置属性— mmovieovie 输入对象文件名称输入对象文件名称 (( 包括扩展名包括扩展名 ))

如双击打开了如双击打开了 VBVB 窗口，关闭即可！窗口，关闭即可！

2.3 2.3 嵌入嵌入 FlashFlash 动画动画


控件工具箱“其它控件按钮”—控件工具箱“其它控件按钮”—ParalleGraph Cortona Control—ParalleGraph Cortona Control— 十十字鼠标拖动设窗口的大小字鼠标拖动设窗口的大小 (( 窗口窗口无边框无边框 ))

或或插入—对象—插入—对象— ParalleGraph CorParalleGraph Cortona Control—tona Control— 调整窗口大小调整窗口大小

鼠标右击窗口—设置属性—鼠标右击窗口—设置属性— ScenScene—e— 浏览…输入对象文件浏览…输入对象文件

2.4 2.4 嵌入嵌入 VRMLVRML 对象对象注注 :: 预先已安装预先已安装 Cortona VRML Client !Cortona VRML Client !


控件工具箱“其它控件控件工具箱“其它控件按钮”—按钮”— Accelrys ViewAccelrys Viewer Control50—er Control50— 十字鼠标十字鼠标拖动设窗口的大小—鼠拖动设窗口的大小—鼠标右击窗口—设置属性标右击窗口—设置属性—— Source—Source— 输入输入 MSVMSV文件文件

2.5 2.5 嵌入嵌入 ViewerActiveX 5.0ViewerActiveX 5.0 对象对象注注 :: 预先已安装预先已安装 Viewer ActiveX 5.0 !Viewer ActiveX 5.0 !

嵌入对象的特点嵌入对象的特点优点：指定窗口位置显示，版面整齐优点：指定窗口位置显示，版面整齐缺点：播放不可调窗口缺点：播放不可调窗口

资源占用多资源占用多多为绝对路径多为绝对路径 (( 改变文件目录位置就出问题改变文件目录位置就出问题 ))


FlashFlash Flash 原子轨道原子轨道 VRMLVRML

石英晶体外型石英晶体外型

2.6 2.6 采用链接打开对象采用链接打开对象• 建议设定对象（而不是文字）的链接• 链接打开对象的前提是预先在系统中设定了打开该类型

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