ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΟ ΜΑΘΗΜΑ ΓΕΝΕΤΙΚΗΣ ΚΑΙ ΑΝΟΣΟΛΟΓΙΑΣ

ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΟ ΜΑΘΗΜΑ ΓΕΝΕΤΙΚΗΣ ΚΑΙ ΑΝΟΣΟΛΟΓΙΑΣ

ΑΣΚΗΣΕΙΣ ΔΡΟΣΟΦΙΛΑΣ10/12/2015

ΟΜΑΔΑ Α

♀ ♀ [κίτρινο σώμα , λευκά μάτια, κεκαμμένες σμήριγγες] Χ [άγριος τύπος] ♂ ♂

♀ Όλα (220) [άγριος τύπος]♀ [κίτρινο σώμα , κόκκινα μάτια, ίσιες σμήριγγες]♂ 131 [κίτρινο σώμα , λευκά μάτια, κεκαμμένες σμήριγγες]♂ 1 [άγριος τύπος]

F1

Οι γενετικοί τόποι φυλοσύνδετοι. Άρα οι τόποι συνδεδεμένοι. Τα αλληλόμορφα για το κίτρινο σώμα και τα λευκά μάτια υπολειπόμενα.

Αναλογία φύλων

Θηλυκά : Αρσενικά♀ / ♂ = 220 / 131 == 1.68 χ2 = 22.57

y w f / y w f X + / Y

y w f / + X y w f / Y

Μάτια Σώμα Σμήριγγες+ + + 345w y f 331+ + f 232w y + 230+ y + 14w + f 6w + + 5+ y f 5

Σύνολο 1168

♀♀ [αγρίου τύπου] Χ [κίτρινο σώμα, λευκά μάτια, κεκαμμένες σμηριγγες]♂ ♂ y w f / + X y w f / YF1

NCONCOSCOSCOSCOSCODCODCO

NCO 1 : 1 ?χ2

= 0,29df = 1 critical = 3,814

SCO-1 1 : 1 ?

προφανές

SCO-2 1 : 1 ?χ2

= 3,2df = 1 critical = 3,814

DCO 1 : 1 ?

προφανές

♀ / ♂

654/514 =1,272

χ2 = 16,79df = 1cr = 3.814

Μάτια Σώμα Σμήριγγες+ + + 345w y f 331w y + 232+ + f 230+ y + 14w + f 6w + + 5+ y f 5

Σύνολο 1168

♀♀ [αγρίου τύπου] Χ [κίτρινο σώμα, λευκά μάτια, κεκαμμένες σμηριγγες]♂ ♂ y w f / + X y w f / YF1

NCONCOSCO(w,f)SCO(w,f)SCO(y,w)SCO(y,w)DCODCO

RF(w,f) = 56,093 cmuRF(y,w) = 2,57 cmuRF(y,f) = 58,667 cmu

y w f / +

RF(w,f) = 472/1168 = 0,4041RF(y,w) = 30/1168 = 0,0256RF(y,f) = 482/1168 = 0,4126 χωρίς διόρθωσηRF(y,f) = 502/1168 = 0,4298 με διόρθωση

σσ = 10/(1168*0,4041*0,0256) = 0,8248

RFcor = ¼ ln [(1 + 2 * RF) / (1 - 2 * RF)]

y , wΦαινοτ. ##

+ + 577 NRy w 561 NRy + 19 R+ w 11 R

Σύνολο 1168 RF(y,w) = 30/1168 =0,0256

Φαινοτ. ##+ + 359 NRw f 337 NRw + 235 R+ f 237 R

Ηο (ασύνδετα: 1:1:1:1)χ2 = 43,8 df = 3 critical 7,184

Σύνολο 1168 RF(w,f) = 472/1168 =0,4041Φαινοτ. ##

+ + 350 NRy f 336 NRy + 244 R+ f 238 RΗ0 όπως πριν χ2 = 36,02 df = 3

Σύνολο 1168 RF(y,f) = 482/1168 = 0,4126

y w f

y , f

w , f

Μάτια ♀ ♂ Σύνολο χ2

+ 334 262 596 8,698w 320 252 572 8,084

Σύνολο 654 514 1168 16,78χ2 0,3 0,195 0,493

Σώμα ♀ ♂ Σύνολο χ2

+ 326 262 588 6,966

y 328 252 580 9,959

Σύνολο 654 514 1168 16,78

χ2 0,006 0,195 0,055

Σμήριγγες ♀ ♂ Σύνολο χ2

+ 337 257 594 10,774f 317 257 574 6,271

Σύνολο 654 514 1168 16,78χ2 0,612 0 0,342

Αποστάσεις (cmu) Υπολογισθείσες Πραγματικές (FlyBase)

w – f 56,093 55,2y – w 2,57 1,5y - f 58,667 56,7

Μάτια Σώμα Σμήριγγες Παρατ. Αναμ.+ + + 345 343,93w y f 331 343,93w y + 232 231,31+ + f 230 231,31+ y + 14 5,91w + f 6 5,91w + + 5 2,85+ y f 5 2,85

Σύνολο 1168 1168

χ2 = 14,818

df = 7

critical = 14,067

bw

cn

wt

♀ ♀ [κυρτά φτερά, άσπρα μάτια] Χ [άγριος τύπος] ♂ ♂

♀ 153 άγριος τύπος♂ 141♂ 2 Κυρτά, λευκά

Οι γενετικοί τόποι είναι αυτοσωμικοί.Τα αλληλόμορφα που δίνουν άλλο φαινότυπο από εκείνον του άγριου τύπου είναι όλα υπολειπόμενα.

F1

Αναλογία Φύλων

♀ / ♂ = 153 / 141 = 1,085

1:1χ2 = 0,490 df = 1 critical 3,814

♀ ♀ [άγριος τύπος] Χ [κυρτά φτερά, άσπρα μάτια] ♂ ♂

Μάτια Φτερά ΣύνολοΚαφέ κυρτά 76Καφέ + 127

Πορτοκαλί + 78Πορτοκαλί κυρτά 127

Άσπρα + 19Άσπρα κυρτά 331

Κόκκινα (+) + 334Κόκκινα (+) κυρτά 22

Σύνολο 1114

Αναλογία Φύλων

♀ / ♂ = 579 / 535 = 1,082

χ2 = 1,738

Φτερά Απόγονοικυρτά 556

+ 558Σύνολο 1114

Η0: 1 τόπος (1:1)χ2 = 0,004 df = 1critical = 3,841

Μάτια Απόγονοικαφέ 203

πορτοκαλί 205άσπρα 350

+ 356Σύνολο 1114

Το σχήμα φτερών ελέγχεται από ένα γενετικό τόπο.

Το χρώμα ματιών τουλάχιστον από 2 διαφορετικούς γενετικούς τόπους.

Άσπρα : + : καφέ : πορτοκαλί είναι 1:1:1:1 ?χ2 = 79,79Άσπρα : + είναι 1:1 ? χ2 = 0,051καφέ : πορτοκαλί είναι 1:1 ? χ2 = 0,01

Drosopterin pathway

2άμινο4υδροξυπτεριδίνη ξανθοπτερίνη ισοξανθοπτερίνη

τετραυδροϊοπτερίνη

βιοπτερίνη δροσοπτερίνη σεπιαπτερίνη

ισοσεπιαπτερίνη

GTP

brown

Τρυπτοφάνη

N-Φόρμυλ-κυνουρενίνη

Κυνουρενίνη

3-Υδροξυ-κυνουρενίνη

Ξανθοματίνη

vermillion

cinnabar

Ommochrome pathway

Interacting mutations affect eye color in Drosophila

Figure 1-9 part 1


Figure 1-9 part 2


Figure 1-9 part 3


Figure 1-9 part 4


Figure 1-9 part 5

Σχήμα φτερών ελέγχονται από ένα γενετικό τόπο.Χρώμα ματιών τουλάχιστον από 2 διαφορετικούς γενετικούς τόπους.

Αν το χρώμα των ματιών ελέγχεται από 2 τόπους

RF(cn,bw) = (203 + 205) / 1114 = 408 / 1114 ~ 0, 3662 36,62 cM

cn bw---------------- + +

c cn bw / c cn bw X + / +

c cn bw / + X c cn bw / c cn bw


+ 558Σύνολο 1114

Μάτια Απόγονοικαφέ 203

πορτοκαλί 205άσπρα 350

+ 356Σύνολο 1114

Φτερά Μάτια Απόγονοι+ + 334

Κυρτά άσπρα 331+ καφέ 127

Κυρτά πορτοκαλί 127+ πορτοκαλί 78

Κυρτά καφέ 76Κυρτά + 22

+ Άσπρα 19Σύνολο 1114

NCONCOSCOSCOSCOSCODCODCO

Φτερά Μάτια Απόγονοι+ + + 334c cn bw 331+ + bw 127c cn + 127+ cn + 78c + bw 76c + + 22+ cn bw 19

Σύνολο 1114


Σύνολο 1114

NCONCO

SCO-1SCΟ-1SCO-2SCO-2DCODCO

NCO 1 : 1 ?

προφανές

SCO-1 1 : 1 ?

προφανές

SCO-2 1 : 1 ?

προφανές

DCO 1 : 1 ?

προφανές


Σύνολο 1114

RF(c,cn) = 195 / 1114 = 0,175 ~ 17,5 cM

RF(c,bw) = 295 / 1114 = 0,2648 ~ 26,48 cM

RF(cn,bw) = 408 / 1114 = 0,3662 ~ 36,62 cM χωρίς διορθώσεις για DCORF(cn,bw) = 490 / 1114 = 0,4399 ~ 43,99 cM με διορθώσεις για DCO

Η σειρά των τόπων είναι

cn c bw

NCONCO

SCO(c,bw)SCO(c,bw)SCO(cn,c)SCO(cn,c)

DCODCO

σσ = 41 / (1114 * 0,175 * 0,2648) = 0,794

♀ ♀ c cn bw / + X c cn bw / c cn bw ♂ ♂

RF(c,cn) = 0,1828RF(c,bw) = 0,2948RF(cn,bw) = 0,467

RFcor = ¼ ln [(1 + 2 * RF) / (1 - 2 * RF)]

Τόποι Υπολογισθείσες αποστάσεις (cM)

Mapping function(Kosambi)(cM)

Αποστάσεις από βιβλιογραφία (cM)

cn - bw 36,62 46,7 47c - cn 17,5 18,28 18c - bw 26,48 29,48 29

cn c bw




cn - bw 36,62 46,7 47c - cn 17,5 18,28 18c - bw 26,48 29,48 29

Φτερά Μάτια Παρατηρ. Αναμεν.+ + + 334 333,87c cn bw 331 333,87+ + bw 127 127,11c cn + 127 127,11+ cn + 78 77,75c + bw 76 77,75c + + 22 18,57+ cn bw 19 18,57

Σύνολο 1114 1114

χ2 = 0,708df = 7critical = 14,067


+ 558Σύνολο 1114

Μάτια Απόγονοικαφέ + bw / cn bw** 203

πορτοκαλί cn + / cn bw** 205Άσπρα cn bw / cn bw** 350

+ + + / cn bw** 356Σύνολο ** πατρικής

προέλευσης1114

cn #Πορτοκαλί ή λευκά 555

Καφέ ή + 559Σύνολο 1114

bw #Καφέ ή λευκά 553Πορτοκαλί ή + 561

Σύνολο 1114

Είναι 1:1 ; χ2 = 0,014df = 1 critical = 3.814

Είναι 1:1 ; προφανές

Είναι 1:1 ; χ2 = 0,057df = 1 critical = 3.814

♀ ♀ c cn bw / + X c cn bw / c cn bw ♂ ♂

Για να κοιτάξω τους τόπους ανά ζεύγη:

Αν αγνοήσω το bw τότε πρέπει να συνυπολογίσω τα cn [πορτοκαλί] και cn bw [λευκά]

Αν αγνοήσω το cn τότε πρέπει να συνυπολογίσω τα bw [καφέ] καιcn bw [λευκά]

c cn bw / + X c cn bw / c cn bw

Τόποι c cn (αγνοώ το bw)

Φτερά ΜάτιαΚυρτά Πορτοκαλί ή λευκά 458 NR

Κυρτά Καφέ ή + 98 R

+ Πορτοκαλί ή λευκά 97 R

+ Καφέ ή + 461 NR

RF(c,cn) = 195 / 1114 = 0,175 17,5 cM


Σύνολο 1114

Μάτια Απόγονοικαφέ 203 R

πορτοκαλί 205 Rάσπρα 350 NR

+ 356 NRΣύνολο 1114

Φτερά ΜάτιαΚυρτά Καφέ ή λευκά 407 NR

Κυρτά Πορτοκαλί ή + 149 R

+ Καφέ ή λευκά 146 R

+ Πορτοκαλί ή + 412 NR

Τόποι c bw (αγνοώ το cn) RF(c,bw) = 295 / 1114 = 0,2648

26,48 cM

Τόποι cn bw

RF(cn,bw) = 408 / 1114 = 0,3662

36,62 cM


Σύνολο 1114

Φτερά ♀ ♂ Σύνολο χ2

+ 296 262 558 2,072c 283 273 556 0,180

Σύνολο 579 535 1114 1,738χ2 0,292 0,226 0,004

cinnabar ♀ ♂ Σύνολο χ2

+ 304 255 559 4,295

cn 275 280 555 0,045

Σύνολο 579 535 1114 1,738

χ2 1,453 1,168 0,014

brown ♀ ♂ Σύνολο χ2

+ 286 275 561 0,216bw 293 260 553 1,969

Σύνολο 579 535 1114 1,738χ2 0,085 0,421 0,057




cn - bw 36,62 46,7 47c - cn 17,5 18,28 18c - bw 26,48 29,48 29

cn c bw

ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΟ ΜΑΘΗΜΑ ΓΕΝΕΤΙΚΗΣ ΚΑΙ ΑΝΟΣΟΛΟΓΙΑΣ

Documents