การใช chemsketch v8 · 1 biologistchemsketch/satit p. 1 การใช chemsketch v8...

1

BiologistChemSketch/Satit P. 1

การใช ChemSketch V8สําหรับ biologists

โดย อ. สาธิต ปยนลินมาศ ภาควิชาเคมีอุตสาหกรรมคณะวิทยาศาสตร มหาวิทยาลัยเชียงใหม

วันท่ี 13 ธ.ค. 2549 เวลา 10.00-12.00 น.


ContentHow to install ChemSketch V8

วาดรูปสูตรโครงสรางทางเคมีสูตรโครงสรางโมเลกุลที่ซับซอนDrawing of scientific apparatusWriting of chemical reactionMolecular modelling in biological studies

End of lecture, Q&A , 問題

2


1.How to install ChemSketch V8

หลังจาก install โปรแกรมนี้ครบแลว ChemSketch ไดทันที ซ่ึงมี 2 commands หลักคือ structure mode และ draw mode อีกทั้งใชระบบ GUI (graphic user interface)

Tutorial manual:CHEMSK_TR.pdf (Technical Reference)Reference manual : CHEMSK_RF.pdf (Reference Manual)


FAQ in ChemSketch

สรางและเก็บ file = MS wordCopy Paste, Group, Delete Transcient error ใช Undo Embeded in MS word and PowerpointAfter finishing to pdf fileEdit and add are easier than before.

3


Structure mode in ChemSketch8


Draw mode in ChemSketch8

4


2. วาดรปูสูตรโครงสรางทางเคมี

O

O

O

O

O

O

H

H

H

H

H

H HH

H

H

H

H

D-Glucose structure


Structure mode/ template

5


molecular modelling in 3D


3D viewer in ChemSketch8

6


Embeded in MS word


ผลลัพธทีไ่ด

OO

O

O

O

OH

H

H

H

H

HH

H

H

H

H

H

Molecular Formula = C6H12O6

Formula Weight = 180.15588Composition = C(40.00%) H(6.71%) O(53.29%)Molar Refractivity = 37.54 ± 0.3 cm3

Molar Volume = 113.9 ± 3.0 cm3

Parachor = 352.9 ± 4.0 cm3

Index of Refraction = 1.573 ± 0.02Surface Tension = 92.0 ± 3.0 dyne/cmDensity = 1.581 ± 0.06 g/cm3

Dielectric Constant = Not availablePolarizability = 14.88 ± 0.5 10-24cm3

Monoisotopic Mass = 180.063388 DaNominal Mass = 180 DaAverage Mass = 180.157761 Da

ทําไดแลวงายจัง

7


3. สูตรโครงสรางโมเลกุลที่ซับซอน

Fused rings structure

O

SH

O

NH2N

NH

OH

Histidine


Template + Bond connection

8


Rotate + Template of radicals


Add side group from periodic table(-SH, =O)

9


Stepforward

ลองทําตามไดไหมครับสุดทายเปลี่ยน –OH to =O

O

NH2

N

NH

OH

OH

O

NH2

N

NH

OH

SH

O

O

N H 2

N

N H

OH

SH


4. Drawing scientific apparatus

Extraction for product purification

10


Lab Kit in Template window

เลือกเครื่องมือที่ตองการใชงานมีทั้งหมด 7 page in Lab kit only


5. Writing of chemical reaction for academic document

CH3Decomposition

2500C+ CH3

CH3

11


Chemical reactionเขียนสารตั้งตนเขียนผลิตภัณฑที่ไดเขียนสมการเคมี และสภาวะดวยลูกศร


6. Molecules modelling in biological studies

N

NH

NH

N

NH2

OGuanine

CH2

OH

CH3

CH3

CH3CH3

H

H

Vitamin D2

12


DNA building block unit

NO

OH

OP

O

OH

OH

N

NN

NH2

NO

OH

OP

O

OH

OH

NH

O

O

CH3

Adenine Thymine


RNA building block unit

NH

NH

N

NH

O

O

Xanthine

OHOO

OH

PO

OHOH

OHO

OP

2-Deoxyriboso-5-diphosphate

13


Referencesสาธิต ปยนลนิมาศ,“การใชงานChemSketch ของนักศึกษาเคมีอุตสาหกรรม ระดับบัณฑิตศึกษา,” ภาควิชาเคมีอุตสาหกรรม คณะวิทยาศาสตร ม.เชียงใหม, 29 พ.ย.2549.สาธิต ปยนลนิมาศ,“การใชChemSketch Lab 209342Petrochemical Industries,”ภาควิชาเคมีอุตสาหกรรม คณะวิทยาศาสตร ม.เชียงใหม, 2549.สาธิต ปยนลนิมาศ,“เทคโนโลยีตัวเรงปฏิกิริยาสําหรับเคมีที่พิทักษสิ่งแวดลอม,”LAB.Today ฉบับที3่5 ปที่ 2549Satit Phiyanalinmat, and Stoyan Karakashev,“The Spreading of Fire-fighting Foam in a Confined Chamber by Digital Image Visualization,” Chiang Mai J. Sci. 2006:33(3):283-291.


End of lecture/ ChemSketch V8

Questions + Answers

ChemSketch8 may change your writing and academic life becomes easier than before.Thank you for your attention.

การใช chemsketch v8 · 1 biologistchemsketch/satit p. 1 การใช chemsketch v8...

Documents