מכתב המלצה - צבי בלשן · בושחמה ףגא תלהנה ministry of health...

16
הנהלת אגף המחשוב משרד הבריאותHealth information end computer services Ministry of Health רח' ירמיהו39 , ירושלים טל:02-5080170 39 Yirmiyahu Jerusalem Tel: 02-5080170 31 אוקטובר2016 לכבוד- כל מאן דבעי( בקשה לקבלת מידעRFI ) 2016 - 264 עבור מוצר ים וכלים לאנליזה וויזואליזציה של מידע התנהגותי, קליני וגנומי, במסגרת המיזם לרפואה מותאמת אישית לוחות הזמנים של הבקשה לקבלת מידע: פעילות מועד הפצת הבקשה31/10/2016 מועד אחרון להעברת שאלות הבהרה01/12/2016 שעה: 12:00 מועד אחרון לקבלת מענה29/12/2016 שעה: 12:00 מצגות ספקים05/01/2017 שעות:10:30-16:00 א. רקע המאה ה21 הביאה אתה אתגר משמעותי בתחום הבריאות, אך גם הזדמנות גדולה. מחד גיסא, מדינות רבות ניצבות בשנים האחרונות בפני אתגרים בריאותיים כבדי משקל הנובעים מהזדקנות האוכלוסייה, ריבוי מחלות כרוניות, ואורח חיים לא בריא הכולל תזונה לקויה ומיעוט פעילות גופנית. זא ת ועוד, חרף השקעה העולמית הגבוהה במחקר רפואי, מיליארדי חולים סובלים ממחלות אשר טרם נמצאה דרך מאידך גיסא, מהפיכת המידע יצרה מצב חדש במסגרתו כמויות אפקטיבית למנוע אותן או לטפל בהן. מידע בריאותי וסביבתי אדירות מיוצרות בכל רגע ורגע, ויוצרות הזדמנות חסרת תקדים לפריצות דרך רפואיות. השימוש הנרחב בחיישנים ובאמצעים דיגיטליים מייצר בכל יום נתונים בכמות ובאיכות

Upload: others

Post on 10-Jul-2020

3 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

Page 1: מכתב המלצה - צבי בלשן · בושחמה ףגא תלהנה Ministry of Health תואירבה דרשמ Health information end computer services םילשורי והימרי

הנהלת אגף המחשוב משרד הבריאות

Health information end computer services Ministry of Health

, ירושלים39ירמיהו רח' 02-5080170 טל:

39 Yirmiyahu Jerusalem Tel: 02-5080170

Department of Health Information Ministry of Health

P.O.B 1176, Jerusalem 91010 [email protected] Tel: 02-6706810 Fax: 02-6706863

2016אוקטובר 31

דבעימאן כל -לכבוד

2016-264( RFIבקשה לקבלת מידע )

, ים וכלים לאנליזה וויזואליזציה של מידע התנהגותי, קליני וגנומימוצרעבור

במסגרת המיזם לרפואה מותאמת אישית

לוחות הזמנים של הבקשה לקבלת מידע:

מועד פעילות

31/10/2016 הבקשההפצת

12:00: שעה 01/12/2016 מועד אחרון להעברת שאלות הבהרה

12:00: שעה 29/12/2016 מענהמועד אחרון לקבלת

05/01/2017 מצגות ספקים

10:30-16:00שעות:

רקע .א

הביאה אתה אתגר משמעותי בתחום הבריאות, אך גם הזדמנות גדולה. מחד גיסא, מדינות 21המאה ה

רבות ניצבות בשנים האחרונות בפני אתגרים בריאותיים כבדי משקל הנובעים מהזדקנות האוכלוסייה,

ת ועוד, חרף ריבוי מחלות כרוניות, ואורח חיים לא בריא הכולל תזונה לקויה ומיעוט פעילות גופנית. זא

השקעה העולמית הגבוהה במחקר רפואי, מיליארדי חולים סובלים ממחלות אשר טרם נמצאה דרך

אפקטיבית למנוע אותן או לטפל בהן. מאידך גיסא, מהפיכת המידע יצרה מצב חדש במסגרתו כמויות

לפריצות דרך מידע בריאותי וסביבתי אדירות מיוצרות בכל רגע ורגע, ויוצרות הזדמנות חסרת תקדים

רפואיות. השימוש הנרחב בחיישנים ובאמצעים דיגיטליים מייצר בכל יום נתונים בכמות ובאיכות

Page 2: מכתב המלצה - צבי בלשן · בושחמה ףגא תלהנה Ministry of Health תואירבה דרשמ Health information end computer services םילשורי והימרי

הנהלת אגף המחשוב משרד הבריאות

Health information end computer services Ministry of Health

, ירושלים39ירמיהו רח' 02-5080170 טל:

39 Yirmiyahu Jerusalem Tel: 02-5080170

Department of Health Information Ministry of Health

P.O.B 1176, Jerusalem 91010 [email protected] Tel: 02-6706810 Fax: 02-6706863

חסרות תקדים. ניתוח מעמיק ומערכתי של הנתונים הללו עשוי להוביל לתובנות חדשות שיסייעו

ים שעלולים במציאת תרופות חדשות, באיתור טיפולים מצילי ומאריכי חיים, וגילוי מוקדם של מקר

להתפתח לכדי מחלה.

את בחשבון המביאה, במחלות ולטיפול למניעה חדשנית גישה היא מותאמת אישית רפואה

עתק נתוני של מעמיק ניתוח באמצעות. הפרטים בין והסביבתיים, ההתנהגותיים, הביולוגיים ההבדלים

באופן לשפר וכך, עבורו יותרב האפקטיבי הטיפול את חולה לכל להתאים מאפשרת זו גישה(, דאטה-ביג)

. מיותרים טיפולים מביצוע ולהימנע הטיפול הצלחת סיכויי את דרמטי

הרפואית המציאות, המדויקת הרפואה בתחום מרשימה התקדמות חלה האחרונות שבשנים אף

יותר פשטניות בשיטות מטופלים, הרפואיים המצבים ומרבית, המטופלים שמרבית היא כיום

עשויים אלה כל – ורזים שמנים, וצעירים קשישים, וגברים נשים, כך. הללו מההבדלים המתעלמות

שבהם לחסמים הסיבה. אף בלתי יעיל ומזיק ולעתים, שונה באופן עליהם המשפיע זהה טיפול לקבל

שיאפשרו והפיסיים הלוגיסטיים המנגנונים בהיעדר ,היתר בין ים,קשור המדויקת הרפואה נתקלת

.זה מסוג למחקרים הרב הנדרש המידע את ביניהם לשתף בריאות ולארגוני לחוקרים, לחולים

במדינות שונות בעולם המערבי, מקודמים בשנים האחרונות מיזמי מחקר נרחבים לצורך קידום

המיזם האמריקני לרפואה מדויקת ןרפואה מותאמת אישית. יוזמות ראויות לציון בהקשר זה ה

המבוסס על קהילה שתכלול מיליון מתנדבים, והמיזם המקביל לו בבריטניה המבוסס על קהילה

שתכלול מאה אלף מתנדבים. על מנת להסיר את החסמים הקיימים כיום בפני מחקר שכזה בישראל,

על אתיקה, שקיפות ועל מנת לקדם מחקר ישראלי שייעשה במסגרת לאומית רחבה, תוך הקפדה

והעצמת האזרח, משרד הבריאות החל בתכנון המיזם הישראלי לרפואה מותאמת אישית.

המיזם הישראלי לרפואה מותאמת אישית 0.1

על המבוסס, מסוגו ראשון מחקר המיזם הישראלי לרפואה מותאמת אישית הוא פרויקט

הקהילות למגוון המותאמים שיםחד רפואיים טיפולים לפתח יחד שיסייעו, שותפים מתנדבים קהילת

באמצעות שימוש בכלי רפואה מותאמת אישית, מבקש הפרויקט .הישראלית החברה את המרכיבות

לייצר תשתית לאומית שתוכל לאפשר קידום המטרות הבאות:

, באמצעות הארכת חיים, מניעת מחלות, ואבחון מוקדם של מצבים מסוכניםלמצוא דרכים חדשות ל .1

ורמים שמאפשר חיים בריאים וארוכים בקרב מטופלים בעלי מאפיינים שונים.ניתוח שילוב הג

Page 3: מכתב המלצה - צבי בלשן · בושחמה ףגא תלהנה Ministry of Health תואירבה דרשמ Health information end computer services םילשורי והימרי

הנהלת אגף המחשוב משרד הבריאות

Health information end computer services Ministry of Health

, ירושלים39ירמיהו רח' 02-5080170 טל:

39 Yirmiyahu Jerusalem Tel: 02-5080170

Department of Health Information Ministry of Health

P.O.B 1176, Jerusalem 91010 [email protected] Tel: 02-6706810 Fax: 02-6706863

, המביאים בחשבון את מאפייניהם הייחודים של מטופלים שונים, לבנות תהליכי טיפול רפואי חדשים .2

וכך מעלים את סיכויי ההחלמה, מקצרים את משך הטיפול, ומונעים תופעות לוואי קשות וסיבוכים

רפואיים.

, כך שניתן יהיה להעניק את התרופה הנכונה, למצוא תרופות חדשות, ולשפר את התרופות הקיימות .3

במועד הנכון, במינון הנכון, למטופל הנכון. התאמה שכזו יכולה לשפר באופן דרמטי את יעילותו של

טיפול תרופתי, ולצמצם את תופעות הלוואי השליליות של הטיפול.

מכשירים ( ולהשתמש בInternet of Thingsלמנף את מהפכת מרשתת הדברים )לבדוק האם וכיצד ניתן .4

, על מנת לקדם אורח חיים בריא ולאפשר למטופל במכשירים ביתייםומכשירים ניידים , בלבישים

שליטה טובה יותר במצב בריאותו.

ורמים , מודל שבו קהילת המתנדבים התמודל חדש ומהפכני לשיתוף הציבור בתהליכי מחקרלקדם .5

למחקר היא שותפה מלאה בתהליכי קבלת ההחלטות, ויש ביכולתה להשפיע על מפת הדרכים של

המיזם, על האופן שבו יבוצעו מחקרים במסגרת המיזם, ועל המטרות שלשמן ייעשה שימוש במידע.

. קהילה זו, שגודלה ינוע בין קהילת המתנדביםבליבו של המיזם לרפואה מותאמת אישית תעמוד

מתנדבים, מורכבת מפרטים מכל גווני החברה הישראלית, אשר במטרה לסייע 100,000ל 10,000

לקידום המחקר הרפואי ולקידום הבריאות, יהיו מעוניינים לתרום מידע רפואי והתנהגותי למטרות

מחקר. המתנדבים יהיו שותפים מלאים במיזם, ויוכלו להשפיע על קבלת החלטות אסטרטגית, על

ייעשה במידע, ועל מפת הדרכים של המיזם. השימוש ש

ההצטרפות לקהילת המתנדבים תיעשה מרצונם החופשי של המתנדבים, ולאחר שקיבלו את כל המידע

הרלוונטי אודות המיזם והתנדבותם אליו, הבינו את תוכן המידע, ושאלותיהם נענו. בעת ההתנדבות,

חל ממידע קליני ואדמיניסטרטיבי שישותף יבחרו המתנדבים את סוגי המידע אותם הם תורמים: ה

באמצעות מערכות מידע קיימות, דרך מידע גנטי שייאסף וינותח באמצעות שיטות הרצפה מתקדמות,

וכלה במידע התנהגותי, שישותף לפי רצון הפרטים באמצעות שימוש במכשירים לבישים, באפליקציות

. ובמכשירים ביתיים שיחולקו למתנדבים המעוניינים בכך

המידע שייאסף במסגרת המיזם ייאגר תחת נהלי אבטחת מידע מחמירים, ובאמצעות תכנון המדגיש

(. מידע זה יוכל בעתיד לשמש חוקרים ממוסדות מחקר שיאושרו, Design for Privacyהגנה על הפרטיות )

אזן בין לצורך מטרות מחקריות מאושרות, כאשר מנגנון האישור של כל מחקר ומחקר יהיה מנגנון המ

Page 4: מכתב המלצה - צבי בלשן · בושחמה ףגא תלהנה Ministry of Health תואירבה דרשמ Health information end computer services םילשורי והימרי

הנהלת אגף המחשוב משרד הבריאות

Health information end computer services Ministry of Health

, ירושלים39ירמיהו רח' 02-5080170 טל:

39 Yirmiyahu Jerusalem Tel: 02-5080170

Department of Health Information Ministry of Health

P.O.B 1176, Jerusalem 91010 [email protected] Tel: 02-6706810 Fax: 02-6706863

הרצון למקסם את התועלת המדעית מן המיזם לבין הצורך לשמור על פרטיותם של הנבדקים. בהתאמה

אידנטיפיקציה(, ו/או במידע סינתטי, -לאופי המחקר והמידע, ייעשה שימוש בטכניקות התממה )דה

ארגונים לשם הגנה על פרטיות המתנדבים. ביצוע המחקר על המידע שנאסף במסגרת המיזם ייעשה ע"י

מוסמכים וחוקרים מוסמכים בלבד, ובהתאם לנהלים החלים על שימושים מחקריים במידע רפואי

פרטני. ייתכן כי חלק מתהליכי עיבוד המידע, טיובו, הנגשתו לחוקרים, והמחקר שלו, ייעשו באמצעות

ההתממה דאטה הלאומית המוקמת בימים אלה ע"י המשרד, וייתכן כי חלק מתהליכי-פלטפורמת הביג

יבוצעו באמצעות מנוע ההתממה הלאומי, הנבנה בימים אלה ע"י המשרד.

: פתרונות תומכים לרפואה מותאמת אישית120/2016מכרז 0.2

, שעשוי ליצור מהפכה מחקרית המיזם לרפואה מותאמת אישיתכי מאמיןמשרד בריאות

ורפואית, יכול להצליח רק אם ייעשה בשותפות פעילה של כלל הגורמים הרלוונטיים במערכת הבריאות

ומחוצה לה. משום כך, התכנון המדויק של המיזם ייעשה תוך שיתוף של ארגונים שונים ובעלי עניין

ון, ועל מנת שהמשרד יהיה מסוגל לרכוש שונים, ותוך התייעצות עם הציבור הרחב. כחלק מתהליך התכנ

מכרז טכנולוגי 2016בחודש ספטמבר משרד פרסם הפתרונות טכנולוגיים הנדרשים לשם מימוש המיזם,

לפתרונות תומכים לרפואה מותאמת אישית.

לצורך בניית המכרז, חולקו האלמנטים השונים הדורשים פתרונות טכנולוגיים לארבעה אשכולות

החל מכלים המעניקים אפשרות למתנדבים המעוניינים בכך לשתף מידע –לתת יחד נפרדים, הבאים

רפואי והתנהגותי, דרך כלים המאפשרים ניתוח של מידע שכזה, וכלה ביישומים רפואיים הממנפים את

את רפואיות טובות יותר עבור המטופל. להלן טבלה המסבירה המידע הנ"ל לשם השגת תוצאות

ונים במכרז:החלוקה לאשכולות הש

הסבר שם האשכול האשכול

סנסורים רפואיים אשכול א'

והתנהגותיים

אשכול זה מיועד לאפשר רכישה ו/או חכירה של

סנסורים רפואיים והתנהגותיים, בין היתר לצורך

חלוקתם למתנדבים באופן שיאפשר למעוניינים

בכך לשתף מידע רפואי והתנהגותי.

שירותי הרצפה אשכול ב'

גנומית

אשכול זה מיועד לאפשר רכישת שירותי הרצפה

(, במטרה לאפשר NGSגנומית )בדגש על שירותי

איסוף וניתוח ראשוני של מידע גנומי ממתנדבים

Page 5: מכתב המלצה - צבי בלשן · בושחמה ףגא תלהנה Ministry of Health תואירבה דרשמ Health information end computer services םילשורי והימרי

הנהלת אגף המחשוב משרד הבריאות

Health information end computer services Ministry of Health

, ירושלים39ירמיהו רח' 02-5080170 טל:

39 Yirmiyahu Jerusalem Tel: 02-5080170

Department of Health Information Ministry of Health

P.O.B 1176, Jerusalem 91010 [email protected] Tel: 02-6706810 Fax: 02-6706863

אשר יתרמו דגימות לצורך זה

ויזואליזציה ואנליזה אשכול ג'

של מידע גנומי

והתנהגותי

אשכול זה מיועד לאפשר רכישת כלים וכן שימוש

בשירותים לצורך האנליזה והויזואליזציה של

המידע הגנומי וההתנהגותי המגיע מן הדגימות ומן

הסנסורים השונים, וכן מתיקים קליניים

האופן וממקורות מידע נוספים, לצורך ניתוח

גורמים קליניים, גנטיים המורכב שבו

ם יחדיו על בריאות האדם.משפיעיוהתנהגותיים

אלגוריתמים וכלים אשכול ד'

המאפשרים התאמה

אישית של טיפול

רפואי למאפייני

המטופל

אשכול זה מיועד לאפשר רכישה והטמעה של כלים

ואלגוריתמים קיימים, אשר ביכולתם לשפר את

הטיפול הרפואי בישראל באמצעות שימוש

בטכנולוגיות רפואה מותאמת אישית.

להלן תרשים המתאר את האופן שבו האשכולות השונים עתידים להשתלב יחד במערכת שתיתן מענה

טכנולוגי לצרכיו השונים של המיזם:

Page 6: מכתב המלצה - צבי בלשן · בושחמה ףגא תלהנה Ministry of Health תואירבה דרשמ Health information end computer services םילשורי והימרי

הנהלת אגף המחשוב משרד הבריאות

Health information end computer services Ministry of Health

, ירושלים39ירמיהו רח' 02-5080170 טל:

39 Yirmiyahu Jerusalem Tel: 02-5080170

Department of Health Information Ministry of Health

P.O.B 1176, Jerusalem 91010 [email protected] Tel: 02-6706810 Fax: 02-6706863

120הפרדת אשכול ג' מיתר האשכולות במכרז 0.3

עוד שאשכולות א', ב' וד' של המכרז יצאו כמקשה אחת, באשכול ג' )ויזואליזציה ואנליזה של מידע ב

גותי( התגלו במהלך כתיבת המכרז פערי ידע אשר המשרד מעוניין להשיב עליהם, בנוגע גנומי והתנה

למגוון המערכות הקיימות בשוק למתן מענה לצורך הטכנולוגי, ולתהליכי העבודה המקובלים בתחום

(, אשר RFI, מתוך כוונה לצאת להליך לבקשת מידע )120מורכב זה. משום כך, אשכול ג' הוסר ממכרז

הוליד מכרז חדש שיוקדש לאשכול זה. עם זאת, יש להדגיש כי ככל הליך לבקשת מידע, גם עשוי ל

(. כמו כן, על RFPבמקרה זה, אין כל התחייבות של המשרד כי ההליך אכן יוביל לבקשה לקבלת הצעות )

המשיבים להביא בחשבון כי המשרד עשוי לעשות שימוש במידע שיתקבל לצורך עיצוב של בקשות

, ובאות לתת מענה לצרכים נוספים של המשרד.120הצעות שונות, אשר חורגות מגבולות מכרז לקבלת

דאטה הלאומית-רקע על פלטפורמת הביג 0.4

נתונים של וניתוח , הנגשהאיסוף , אגירהלפלטפורמה דאטה הלאומית היא -פלטפורמת הביג

ונים להפיק מהמידע תועלת לסייע למערכת הבריאות וגופי מחקר ש , שמטרתהבטכנולוגיות מתקדמות

. לציבור באמצעות גילוי תהליכי טיפול חדשניים, קידום רפואה מונעת וקביעת מדיניות

Page 7: מכתב המלצה - צבי בלשן · בושחמה ףגא תלהנה Ministry of Health תואירבה דרשמ Health information end computer services םילשורי והימרי

הנהלת אגף המחשוב משרד הבריאות

Health information end computer services Ministry of Health

, ירושלים39ירמיהו רח' 02-5080170 טל:

39 Yirmiyahu Jerusalem Tel: 02-5080170

Department of Health Information Ministry of Health

P.O.B 1176, Jerusalem 91010 [email protected] Tel: 02-6706810 Fax: 02-6706863

שעתיד להכיל מרכזימחקר הנמצאת בימים אלה בשלבי פיילוט בתוך המשרד, היא כלי ,זופלטפורמת

ת את הבסיס . היות ומערכת זו עשויה להוומערכת הבריאותמן המחקר המתקיים בבתוכו חלק

למערכת האנליזה של המידע הגנומי, ההתנהגותי והקליני שייאסף במסגרת המיזם לרפואה מותאמת

תוך התייחסות למערכת, ובאופן ספציפי, להפנות את תשומת לב RFIאישית, יש לנסח את המענה ל

, ולציין םשבהן המערכת דורשת השלמה על מנת לתת מענה הולם לצרכי המיז חולשה, המשרד לנקודות

במענה מודולים ויכולות אשר להערכת המשיב רצוי להשלימם.

המערכת מורכבת ממספר רכיבי מפתח:

( הוא נושא משמעותי ביותר במערכת, וזאת בשל De-Identification: נושא ההתממה )רכיבי ההתממה .1

הצורך לאפשר מידע העושה שימוש בנתונים רבים ומגוונים תוך מזעור הסיכון לפרטיות הנבדקים.

ההתממה במערכת מבוצעת בשלושה שלבים, כאשר השלב הראשון, המתרחש בעת הגעת המידע מן

ים מזהים מסוימים במידע, וטוקניזציה של המקורות השונים למערכת המרכזית, כולל הסרה של מאפיינ

מאפיינים אחרים; השלב השני מתרחש בעת הכנסת המידע ל"שמורות", וכולל הרעשה של פריטי מידע

מסוימים; והשלב השלישי מתרחש בעת יצירת סביבת מחקר חדשה, וכולל התממה דינמית מבוססת

דע מותמם שהותאם לצרכי המחקר.ניהול סיכונים מורכב, שבסופו מתקבל מאגר מי הכללה תוך

אובטחים אשר בהם נשמר המידע לאחר שעבר את ן רשת של מאגרים מ: "שמורות המידע" ההשמורות .2

שני השלבים הראשונים של תהליך ההתממה. המידע הנאגר בשמורות הינו מגוון, אולם בשמורות עצמן

טיוב, אינדוקס, הבנייה וכיו"ב. לא מבוצע כל מחקר על המידע, והתהליכים המתבצעים הינם תהליכי

: סביבות המחקר הן סביבות ייעודיות, המוקמות בעת שמתקבלת בקשה לעריכת מחקר סביבות המחקר .3

קבוצות של מידע מתוך השמורה, ומידע ממאגרי מידע -תתיעל מידע מתוך השמורות. הסביבות כוללות

.מסדר שלישינוספים, אשר עברו התממה

Page 8: מכתב המלצה - צבי בלשן · בושחמה ףגא תלהנה Ministry of Health תואירבה דרשמ Health information end computer services םילשורי והימרי

הנהלת אגף המחשוב משרד הבריאות

Health information end computer services Ministry of Health

, ירושלים39ירמיהו רח' 02-5080170 טל:

39 Yirmiyahu Jerusalem Tel: 02-5080170

Department of Health Information Ministry of Health

P.O.B 1176, Jerusalem 91010 [email protected] Tel: 02-6706810 Fax: 02-6706863

המתאר את מבנה הארכיטקטורה של הפלטפורמה:להלן תרשים

הכלים שנעשה בהם שימוש במסגרת המערכת הם כלים מגוונים, אשר באים לתת מענה למגוון תרחישים

-מחקריים. המערכת מאפשרת לחוקר להשתמש בקשת רחבה של כלי קוד פתוח המקובלים בעת ניתוחי ביג

-Big-Insights ,Cognos ,Big, כגון IBMשל חברת ייםקניינ דאטה, ולצד זאת מאפשרת גם שימוש בכלים

Sheets וSPSS.

Page 9: מכתב המלצה - צבי בלשן · בושחמה ףגא תלהנה Ministry of Health תואירבה דרשמ Health information end computer services םילשורי והימרי

הנהלת אגף המחשוב משרד הבריאות

Health information end computer services Ministry of Health

, ירושלים39ירמיהו רח' 02-5080170 טל:

39 Yirmiyahu Jerusalem Tel: 02-5080170

Department of Health Information Ministry of Health

P.O.B 1176, Jerusalem 91010 [email protected] Tel: 02-6706810 Fax: 02-6706863

להלן תרשים המתאר חלק מן הכלים שנעשה בהם שימוש במסגרת הפלטפורמה:

דאטה, אשר נדרש -הקיימים בראייתו במערכת ביג במסגרת המענה, על המשיב לחוות דעתו בנוגע לחוסרים

להשלימם לצורך מתן מענה לכלל צרכי הויזואליזציה והאנליזה במיזם לרפואה מותאמת אישית. בהקשר זה,

על המשיב לציין:

כיצד נכון בראייתו להרחיב את הארכיטקטורה? .א

באילו שכבות נכון בראייתו להוסיף מוצרים, כלים ופתרונות? .ב

אה הפתרון המלא? מומלץ להוסיף תרשים ארכיטקטוני המתאר את המערכת המשולבת. כיצד ייר .ג

Page 10: מכתב המלצה - צבי בלשן · בושחמה ףגא תלהנה Ministry of Health תואירבה דרשמ Health information end computer services םילשורי והימרי

הנהלת אגף המחשוב משרד הבריאות

Health information end computer services Ministry of Health

, ירושלים39ירמיהו רח' 02-5080170 טל:

39 Yirmiyahu Jerusalem Tel: 02-5080170

Department of Health Information Ministry of Health

P.O.B 1176, Jerusalem 91010 [email protected] Tel: 02-6706810 Fax: 02-6706863

מהות המידע המבוקש .ב

אודות פתרונות תוכנה ושירותים המסוגלים לתמוך באופן שוטף במשימות מעוניין לקבל מידע המשרדלים, ולאפשר לחוקרים מתחומי ויזואליזציה ואנליזה של מידע גנומי, התנהגותי וקליני, אודות מספר רב של מטופ

ידע שונים להגיע לתובנות קליניות, אדמיניסטרטיביות ואחרות באמצעות הצלבת מידע מסוגים שונים.

בתוך קשת הפתרונות אשר המשרד מעוניין לקבל מידע אודותיהם נמצאים:

פתרונות ייעודיים לניתוח ביואינפורמטי של מידע גנומי .1

מידע התנהגותי, המגיע מסנסורים רפואיים והתנהגותיים שונים ומטלפונים פתרונות ייעודיים לניתוח .2 סלולריים

פתרונות אינטגרטיבייים להצלבה של מידע גנומי, קליני והתנהגותי .3

(, העושים שימוש במערכות Data Scienceשירותי מחקר ביואינפורמטי, התנהגותי ומחקר מידע ) .4 .1-3המופיעות בסעיפים

שימושהתרחישי 0.5

רכיב הויזואליזציה והאנליזה עשוי להיות נצרך במגוון רחב של תרחישי שימוש מחקריים ואף קליניים. על

מנת להמחיש את המורכבות הנדרשת מהכלי, מובאים כאן מספר תרחישים שכאלה. במסגרת המענה

כיצד לבקשה, על המשיבים לפרט לאילו תרחישי שימוש מתאימים הכלים המתוארים על ידם, ולהסביר

התרחישים עשויים לחפוף חלקית זה את זה, ואינם מהווים מעניק הכלי המוצע מענה לתרחישים אלה.

קטגוריות מחקר מובחנות וזרות.

הסבר שם התרחיש #

אנליזה ביואינפורמטית 1

נבדק בודד שלבסיסית

גנטי )כדוגמת המידע ניתוח שמטרתו הבנה של המידע הגולמי המגיע מריצוף

(. FastQבצי הנמצא בק

אנליזה ביואינפורמטית 2

מתקדמת של נבדק

בודד

ניתוח שמטרתו הבנה מעמיקה יותר של המידע המגיע מריצוף גנטי של פרט

בודד, למשל לשם איתור של מוטציות נדירות

ויזואליזציה של מידע 3

גנומי בסיסי של נבדק

בודד ביחס לאוכלוסיה

הצגה ויזואלית של נתונים שהתקבלו בבדיקות גנטיות מסוגים שונים, בדגש

על הנתונים המאפשרים השוואה בין פרט מסוים באוכלוסיה לבין אוכלוסיות

שונות, והתחקות אחר השכיחות של מוטציות שונות באוכלוסיות אלה.

ויזואליזציה ואנליזה 3

בסיסית של מידע המגיע

מערכת סנסורים ביתית

התנהגותית" של פרט, –ניתוח שמטרתו גיבוש "תמונת מצב בריאותית

באמצעות שקלול כלל הנתונים המתקבלים מסנסורים רפואיים והתנהגותיים

לבישים וביתיים שהפרט עושה בהם שימוש

ניתוח שמטרתו הבנה מעמיקה יותר של המידע המגיע מסנסורים רפואיים אנליזה מתקדמת של 4

Page 11: מכתב המלצה - צבי בלשן · בושחמה ףגא תלהנה Ministry of Health תואירבה דרשמ Health information end computer services םילשורי והימרי

הנהלת אגף המחשוב משרד הבריאות

Health information end computer services Ministry of Health

, ירושלים39ירמיהו רח' 02-5080170 טל:

39 Yirmiyahu Jerusalem Tel: 02-5080170

Department of Health Information Ministry of Health

P.O.B 1176, Jerusalem 91010 [email protected] Tel: 02-6706810 Fax: 02-6706863

מידע המגיע מסנסורים

רפואיים והתנהגותיים

והתנהגותיים, על מנת, למשל, לזהות מראש מצבים מסוכנים, להתריע על

חריגה מדפוס הפעילות הרגיל של הפרט, לאתר תקלות במכשירים ומדידות

שאינן מדויקות, ולאפשר הענקת המלצות לגורם המטפל, או לפרט עצמו

אליזציה של מידע ויזו 5

גנומי, קליני והתנהגותי

של נבדק בודד

הצגה מתכללת של מידע מסוגים שונים באופן המאפשר למתבונן לבצע

ניתוחים שונים במידע, ולהתבונן במאפיינים מרכזיים של המידע

אנליזה אינטגרטיבית 6

של מידע גנומי, קליני

והתנהגותי של נבדק

בודד

ת הקשרים שבין מידע גנומי, קליני והתנהגותי של אנליזה המביאה בחשבון א

נבדק בודד, במטרה לתת "תמונת מצב" של הפרט, לזהות דפוסים חריגים

ועוד

אנליזה ביואינפורמטית 7

של מידע גנומי ממספר

פרטים, ושל מידע גנומי

ממספר סוגים

ניתוח מתקדם של מידע גנומי, המביא בחשבון פרטים שונים באוכלוסיה

מסוימת ומאפשר להסיק מסקנות לגבי הבדלים בין הפרטים ולגבי

האוכלוסיה הנבדקת

אנליזה של מידע 8

התנהגותי המגיע

מפרטים שונים

ניתוח מתקדם של מידע התנהגותי המגיע מסנסורים שונים, שמטרתו לאפשר

להתחקות אחר אלמנטים משותפים לפרטים השונים ואלמנטים ייחודיים

כל פרט ופרט, על מנת לנסות ולמצוא דפוסי התנהגות חוזרים, בהתנהגות של

כגון עונתיות, התנהגות כלשהי האופיינית למרחב גיאוגרפי מסוים ועוד.

אנליזה של מידע ביולוגי 9

מסוגים שונים, מעבר ל

DNA האנושי

, אנליזה Proteomics( ,rna-seq ) Transcriptomicsאנליזה של מידע מתחומי ה

וביום אנושי, אנליזה אפיגנטית, אנליזה של שינויים בגנומיקה של של מיקר

גידולים סרטניים ועוד.

אנליזה מנבאת 10

(predictive analysis )

העושה שימוש

בפרמטרים קליניים,

גנומיים והתנהגותיים

כדי לנסות ולחזות את

הנתונים העתידיים

שיתקבלו במערכת

אנליזה המביאה בחשבון את כלל הפרמטרים שהתקבלו במערכת אודות פרט

מסוים או פרטים מסוימים, ומבקשת לנבא את ההתנהגות העתידית של

הפרט, כפי שתשתקף במידע עתידי )התנהגותי וקליני( שיזרום למערכת.

כלים המוצעיםמה פונקציונליות דרישות 0.6

. המשרד מבקש לקבל מידע של המיזם לרפואה מותאמת אישיתהמשרד נמצא בשלבי גיבוש תפיסת ההפעלה , בכדי לסייע בגיבוש תפיסת האנליזה והוויזואליזציה של מידע גנומי והתנהגותימספקים המתמחים בתחום

רשימת הדרישות .אשכול ג' מענה לצרכי ושיספק /ים ושירות/יםהפתרון, וכרקע לגיבוש דרישות המשרד למוצר

Page 12: מכתב המלצה - צבי בלשן · בושחמה ףגא תלהנה Ministry of Health תואירבה דרשמ Health information end computer services םילשורי והימרי

הנהלת אגף המחשוב משרד הבריאות

Health information end computer services Ministry of Health

, ירושלים39ירמיהו רח' 02-5080170 טל:

39 Yirmiyahu Jerusalem Tel: 02-5080170

Department of Health Information Ministry of Health

P.O.B 1176, Jerusalem 91010 [email protected] Tel: 02-6706810 Fax: 02-6706863

פה את כלל צרכי המשרד אלא מהווה הגדרה כללית של תחום הבעיה, תוך בקשה לקבל המפורטת איננה מקי, וניתן ניתן להציע מוצרים אשר עומדים רק בחלק מהדרישות מהמציעים מידע על היכולות הקיימות בתחום זה.

להציע פירוט חלקי

לציין האם . עבור כל דרישה יש מפתרון אנליזה וויזואליזציה פונקציונליות דרישותחלקית של להלן רשימת

, וכן להוסיף התייחסות מתאימה.נתמכתחלקית או לא נתמכת, נתמכת במוצר

i. של מידע למערכת האנליזה: על הפתרון לתמוך בייבוא מידע ייבוא ידני ואוטומטי

בצורות שונות לצרכי אנליזה וויזואליזציה

ii. מקורות המידע החיצוניים אשר יש לפרט את : מקורות מידע חיצוניים אינטגרציה עם

, והפרוטוקולים המשמשים לקליטת המקורות המערכת מותאמת לקליטת מידע מהם

ובתוך כך את תמיכתה של המערכת / הכלים המוצעים בשילוב מידע קליני, מידע

אדמיניסטרטיבי, מידע מרשתות חברתיות ומאפליקציות סלולריות.

iii. ( אנליזה של מידע אצוותיBatch ומידע ) המגיע בStream : על המערכת לתמוך הן

באנליזה של מידע המגיע באופן אצוותי, והן לתמוך תמיכה מסוימת )לא מלאה(

יש לפרט את סוגי .Streamבאנליזה בזמן אמת )או קרוב לזמן אמת( של מידע המגיע ב

האנליזה הנתמכים עבור שני סוגי המידע הנ"ל.

iv. וע טיוב המידע, סינון רשומותתהליכי( יבוד מוקדםpre-processing יש לפרט את :)

התהליכים שעובר המידע טרם האנליזה, ואת הדרכים להתמודד עם שגיאות במידע,

כפילויות, ערכים ריקים ועוד.

v. יש לפרט את הדרכים שבהן מבוצעת הבנייה של מידע לא מובנה :הבנייה של המידע

ומבוצעת. בתוך המערכת )כדוגמת טקסט, תמונות ועוד(, במידה

vi. התנהגותיים ורפואיים: יש לפרט את לקיבוץ ולניתוח של מידע מסנסוריםדרכים

האופן שבו המערכת מקבצת את המידע המגיע מן הסנסורים השונים )כגון מידע אודות

דופק של המטופל, תאוצה, צעדים, לחץ דם ועוד(.

vii. יש לפרט את המודלים החישוביים העיקריים :מודלים חישוביים שוניםתמיכה ב

שבהם המערכת תומכת, ואת אופן ההכנסה של מודלים חישוביים חדשים לשימוש

במערכת.

viii. יש לפרט את סוגי הניתוח אינפורמטיים באמצעות המערכת: -ניתוחים ביו

הביואינפורמטי הנתמכים ע"י המערכת, ואת הכלים הייחודיים שכוללת המערכת

דות עם מידע גנומי ופרותיאומי מורכב.לצורך התמוד

ix. יש לפרט את האופן שבו המערכת או הכלים ניתוחים גיאוגרפיים באמצעות המערכת :

המוצעים מתמודדים עם אתגרי אנליזה של מידע גיאוגרפי

Page 13: מכתב המלצה - צבי בלשן · בושחמה ףגא תלהנה Ministry of Health תואירבה דרשמ Health information end computer services םילשורי והימרי

הנהלת אגף המחשוב משרד הבריאות

Health information end computer services Ministry of Health

, ירושלים39ירמיהו רח' 02-5080170 טל:

39 Yirmiyahu Jerusalem Tel: 02-5080170

Department of Health Information Ministry of Health

P.O.B 1176, Jerusalem 91010 [email protected] Tel: 02-6706810 Fax: 02-6706863

x. יש לפרט את יכולות המערכת לבצע ניתוחים של קשרים בין ישויות : ניתוח קשרים

הכלים הגרפיים שנעשה בהם שימוש לצורך ניתוח (, ואת Link analysisשונות )

הקשרים והצגתם.

xi. יכולותMachine Learning: יש לפרט מודלים וכליMachine Learning

שהמערכת profile matching, ו clusteringשהמערכת עושה בהם שימוש, וכן יכולות

.10עושה בהם שימוש, למשל במסגרת תרחיש שימוש מס'

xii. :ש לפרט את מודל ניהול הישויות של המערכת, ואת האופן שבו מוכנסות י ניהול ישויות

יש לפרט את יכולות היצוא של למערכת ישויות חדשות וקשרים חדשים בין ישויות.

, וכן את יכולת הייבוא של מידע מכלים אחרים. כמו כן, יש מידע מסוג זה לכלים אחרים

בתוך המערכת. Metadataלפרט כיצד נשמרת השכבה הסמנטית, וכיצד נשמר ה

xiii. יש לפרט כיצד מבוצע חיפוש מידע במערכת במערכת חיפוש מידע ואחזור מידעיכולות :

וכיצד מאוחזר מידע במערכת.

xiv. במערכת, וייצוא של מידע ושל תובנות: יש לפרט יכולות אלה. הוצאת דו"חותיכולות

xv. רה במערכת, : יש לפרט כיצד נשמרת היסטוריית החקיניהול היסטוריית החקירה

וכיצד יכול )אם יכול( החוקר לחזור לנקודות קודמות בתהליך האנליזה.

xvi. ותהליכי עבודה: יש לפרט כיצד מתמודדת המערכת עם ריבוי תעדוף בין משתמשים

משתמשים, וכיצד מאוזן העומס בין המשימות השונות שעל המערכת לבצע עבור

משתמשים שונים ומחקרים שונים.

xvii. לפרט את ביצועי המערכת )זמני התגובה של השאילתות המרכזיות, : יש זמני תגובה

והטכנולוגיות שבהם נעשה שימוש להפחתת עומסים(.

xviii. יש לתאר את ממשק המשתמש של החוקר העושה : ממשק המשתמש של החוקר

הכלים הנגישים עבורו, האופן שבו עוצבו תהליכי העבודה המרכזיים –שימוש במערכת

במידה ובמערכת קיימים במערכת, ומסכי העבודה העיקריים של המשתמש.

Dashboards שנועדו להראות למשתמש את עיקרי הממצאים באנליזה מסוימת, יש

לפרט את תוכנם של מסכים אלה.

xix. את ממשק המשתמש של : יש לתארממשק המשתמש של האדמינסטרטור

האופן שבו הוא מבצע באמצעות המערכת את –האדמיניסטרטור הטכני של המערכת

תהליכי העבודה האדמיניסטרטיביים הבסיסיים )כגון הגדרת משתמש חדש, הקצאת

Dashboardבמידה וקיים במערכת הרשאות, שליטה ובקרה במערכת(.

אדמיניסטרטיבי, יש לתאר את תוכנו.

Page 14: מכתב המלצה - צבי בלשן · בושחמה ףגא תלהנה Ministry of Health תואירבה דרשמ Health information end computer services םילשורי והימרי

הנהלת אגף המחשוב משרד הבריאות

Health information end computer services Ministry of Health

, ירושלים39ירמיהו רח' 02-5080170 טל:

39 Yirmiyahu Jerusalem Tel: 02-5080170

Department of Health Information Ministry of Health

P.O.B 1176, Jerusalem 91010 [email protected] Tel: 02-6706810 Fax: 02-6706863

ורת פתרוןארכיטקט 0.7

כולל חלופות אם ישנן. – כלים והפתרונות המוצעיםיש לפרט את ארכיטקטורת הפעולה וההתקנה של ה

התקנה מרכזית .1

בארגונים המדווחים –התקנה מבוזרת .2

פירוט מדויק של התצורה המוצעת –התקנה משולבת .3

ומשמעויות הבחירה פתרוןמיקום התקנת ה

בתצורת ענן .1

On-Premiseבתצורת .2

פירוט מדויק של התצורה המוצעת –בתצורה משולבת .3

b. ניטור ודיווח

i. יש לציין את יכולות הדיווח של המערכת

ii. יש לציין יכולות לוג וניטור פנימי של השימוש

c. אינטגרציה

i. הפתרון את לשלב מעוניין להיות עשוי המשרד: דאטה-ביג פלטפורמת בתוך הפתרון השתלבות

הפתרון כיצד בהצעה לפרט יש. במשרד פריסה בשלבי הנמצאת דאטה-ביג למחקרי בפלטפורמה

בפתרון שקיימים הממשקים ומהם, שונות פלטפורמות בתוך להשתלב מסוגל המציע שמציע

.למחקר נרחבת פלטפורמה בתוך ייעודי אנליזה רכיב להוות לו ומאפשרים

ii. בשלבים שונים של תהליכי לשילוב פעולות ההתממה –אינטגרציה עם מוצרי ניהול מימשקים

העברת מידע

iii. אינטגרציה עם מוצריB2B המנהלים שותפים מורשים, תוך קישור לרמות התממה הנדרשות

חוקרים המנוהלים –)למשל עבורם, הפניה למזהה מחקר שמאפשר המרת זהויות ספציפית וכיו"ב

במנגנון ההתממה(., ועבור כל אחד מהם ישנו מפתח שונה להמרת תעודות זהות B2B-במוצר ה

iv. אינטגרציה עם מוצרי שו"ב ואבטחת מידע

v. אינטגרציות מובנות נוספות המוצעות במוצר

d. תמיכה בעברית

Page 15: מכתב המלצה - צבי בלשן · בושחמה ףגא תלהנה Ministry of Health תואירבה דרשמ Health information end computer services םילשורי והימרי

הנהלת אגף המחשוב משרד הבריאות

Health information end computer services Ministry of Health

, ירושלים39ירמיהו רח' 02-5080170 טל:

39 Yirmiyahu Jerusalem Tel: 02-5080170

Department of Health Information Ministry of Health

P.O.B 1176, Jerusalem 91010 [email protected] Tel: 02-6706810 Fax: 02-6706863

i. יש לפרט אילו מרכיבי המוצר תומכים בעברית )תוכן שדות, כיוון כתיבה, מימשק

.משתמש(

RFIהצעות והמלצות של הספקים עבור מכרז עתידי הנוגע לנושא ה 0.8

יוביל להליך מכרזי, הליך שכזה הינו אפשרות סבירה, ומשום כך המציעים RFIאף שאין הכרח שה 0.8.1

כבמה להצעת הצעות הנוגעות להליך מכרזי שאפשר שיקרה RFIמוזמנים להשתמש במענה ל

בעתיד, במטרה לאפשר למשרד לרכוש פתרונות לוויזואליזציה ולאנליזה של מידע גנומי, התנהגותי

על ההצעות להיות כאלה שתאפשרנה את ההליך השוויוני והפתוח ביותר, ותאפשרנה למשרד וקליני.

לבחור את הפתרונות המתאימים ביותר לצרכי מערכת הבריאות הישראלית מבין כלל הפתרונות

הקיימים בשוק.

הצעות והמלצות עשויות להתייחס, בין היתר, לאלמנטים הבאים בתכנון מכרז עתידי בנושא זה: 0.8.2

ן הסוגיות שיש להביאן בחשבון בעת תכנון מכרז למימוש פתרונות אנליזה וויזואליזציה של מה 0.8.2.1

מידע מסוגים אלה?

מהם המכשולים שעלולים למנוע את הצלחתו של מכרז שכזה, וכיצד ניתן להימנע מהם? 0.8.2.2

אילו מרכיבים ראוי שהמשרד יכניס כקריטריונים בתהליך בחינת האיכות של הפתרונות 0.8.2.3

השונים?

אילו מודלי תמחור על המשרד להשתמש על מנת לאפשר השוואה הוגנת בין כלל המציעים?ב 0.8.2.4

RFI -מענה ל .ג

a. שם הפונה, את הפרטים הבאים:כנ"ל גם לדרישות בנוסף על ההתייחסות על הפונה לספק

כתובתו ופרטי התקשרות, לרבות פרטי איש הקשר לעניין מענה לפנייה זו.

b. אין לכלול בתשובות לפניה זה שום הצעה כספית מכל סוג, לרבות עלויות או מחירי

מקסימום, בין מפורשות ובין במשתמע.מינימום/

הנחיות כלליות .ד

a. לפרסם מכרז בנושא פנייה זו, ואין הבריאותאין בפניה זו משום התחייבות כלשהי של משרד

בהיענות לה כדי להקנות יתרון במכרז כאמור, אם יפורסם, ואין בה כדי להבטיח עמידה בתנאי

הסף או בכל תנאי אחר לעניין מכרז כאמור.

b. לאחר שלב ה-RFI יחליט המשרד אם לפרסם מכרז, ואת תנאיו, בין אם לאור תוצאות ה-RFI

וזאת בהתאם לשיקול דעתו הבלעדי ובכפוף לכל דין. ובין אם מכל סיבה שהיא,

Page 16: מכתב המלצה - צבי בלשן · בושחמה ףגא תלהנה Ministry of Health תואירבה דרשמ Health information end computer services םילשורי והימרי

הנהלת אגף המחשוב משרד הבריאות

Health information end computer services Ministry of Health

, ירושלים39ירמיהו רח' 02-5080170 טל:

39 Yirmiyahu Jerusalem Tel: 02-5080170

Department of Health Information Ministry of Health

P.O.B 1176, Jerusalem 91010 [email protected] Tel: 02-6706810 Fax: 02-6706863

c. אם יחליט המשרד לפרסם מכרז כאמור, הוא יהיה רשאי לדרוש במכרז שירותים שונים מאלה

שהוצגו בפניה זו, ויהיה רשאי להציב תנאים נוספים או שונים מאלה שהוצגו בפניה זו, על פי

שיקול דעתו הבלעדי של המשרד.

d. רשאי לבקש הבהרות, השלמות או מידע נוסף מכל מי שנענה לבקשה זו או יהיה הבריאותמשרד

מגופים אחרים, והכל כפי שיראה לנכון.

e. ,כל גוף העונה לפניה זו מצהיר כי הוא מסכים שהמדינה תוכל להשתמש במידע שיימסר על ידו

תראה כולו או חלקו, לצרכי הכנת המכרז, הנספחים והמפרטים למכרז או לכל צורך אחר שהיא

לנכון.

f. ,גוף שיבחר לענות לפניה זו מצהיר כי הוא מוותר מראש על כל טענה, לרבות בעניין קניין רוחני

ו/או תביעה ו/או דרישה מאת משרד האוצר ו/או מאת מי מטעמו ו/או מאת המדינה ו/או מאת

ת מי מטעמה בגין מידע, כולו או חלקו, שהגוף סיפק במסגרת תשובתו לפניה זו או במסגר

בקשות ההבהרה בעקבותיה ככל שיהיו.

g. לא יאוחר 01/12/2016-ה' הניתן יהיה להגיש שאלות או בקשות הבהרה לעניין פניה זה עד יום

:מייל כתובתב לתיבת "מכרזים מחשוב"בדואר אלקטרוני ,12:00מהשעה

[email protected]

h. יתקיים יום מרוכז למצגות מוצרים בנושא 05.01.2017 -לתשומת לב המציעים, בתאריך ה

. המפגש 16:00עד לשעה 10:30בין השעות אנליזה וויזואליזציה של מידע גנומי והתנהגותי,

ב'. 157חדר 1ירושלים קומה 39יתקיים במשרד הבריאות , מגדלי הבירה, רח' ירמיהו

i. יבים המעוניינים בכך לפרט את הפתרונות שהציעו עבור בקשת מידע זו, ביום המצגות יוכלו מש

.מועד זה ומשום כך מומלץ כי הספקים ישריינו

j. עד שעה 29/12/2016-ה' בעד ליום תיבת המייל הנ"לאת התשובות לפניה זו יש להגיש אל

12:00.

בברכה

עמי -שירה לב

מנהלת אגף המחשוב

משרד הבריאות