10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

107
10分で分かる R言語入門 ver2.9 大城信晃 2014/09/20 TokyoR#43 1

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第43回R勉強会@東京(#TokyoR) https://atnd.org/events/56275

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10分で分かる R言語入門 ver2.9

大城信晃 2014/09/20 TokyoR#431

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開催情報ATND

• https://atnd.org/events/56275 セキココ

• http://sekico.co/zaseki/384 !

2

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本セッションの役割

•R初心者のために基礎を説明 •本勉強会の以降の他セッションの前提知識を得てもらう

•資料は後ほど公開しますのでざっと眺めていただければと思います

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アジェンダ

•自己紹介 • Rって何 • Rの使い方 • Rの資料

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自己紹介• 名前:大城信晃 • Twitter:doradora09 • 職業:データマイニングエンジニア • R:勉強中。 • 業務ではhadoop使ってます • マイブーム: • カクテル作り • カメラ • 肉(ブロック) 5

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これまで/現在の仕事•ショッピング関連 •商品/製品DB 保守開発 •データ分析関連 •行動ターゲティング •データを使って顧客像を探る • DMP

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TokyoRでは

•第1回から主に運営側で参加 •初心者セッション •最近は懇親会でピザ注文したりお酒作ったりしてます

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最近の個人的news

8

Page 9: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

執筆しました!(一部)

http://www.amazon.co.jp/dp/47981349029

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その他お知らせ

10

Page 11: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

お酒もあります!(懇親会)

11

Page 12: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

懇親会も是非 ご参加下さい!

12

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アジェンダ

•自己紹介とお知らせ •Rって何 • Rの使い方 • Rの資料

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R言語(アールげんご)は、オープンソースでフリーソフトウェアの統計解析向けプログラミング言語、及びその開発実行環境である。

Wikipediaより引用

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での使われ方

•プロトタイプをRで作って検証 • PythonやC++で実装

GoogleとFacebookではRをどうやって使っているのか? http://pracmper.blogspot.jp/2010/01/googlefacebookr.html

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Page 16: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

用途で分類

プロトタイピング実務利用

コマンドライン形式(CUI)

画面上で操作(GUI)

業務専用 ソフト

実装

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特徴 価格 大規模データ 速度統計特化 無料 △

(メモリ依存)△

SAS/ SPSS 統計特化 数十万~ ○ ○

エクセル 直感的 1万~ × (約100万行)

×

C++ 高速だが 開発コスト高

無料~ 数万

実装次第 ◎

Python スクリプト 言語

無料 実装次第 ○

他言語との比較

17

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こんな方におすすめ

•色々な統計手法を試してみたい方 •エクセルでは物足りない方 •まずは無料で始めてみたい方

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あると望ましいスキル

•プログラミングの基礎 •統計学の知識 • (英語力)

19

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アジェンダ

•自己紹介とお知らせ • Rって何 •Rの使い方 • Rの資料

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インストール

Windows http://cran.md.tsukuba.ac.jp/bin/windows/base/

Mac http://cran.md.tsukuba.ac.jp/

Linux http://cran.md.tsukuba.ac.jp/

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Rコンソール起動

22

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Rコンソール起動

ココに処理を 記述していく

23

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処理の記述

3+5 = 8 10-7 = 3

24

Page 25: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

処理

解析の流れデータ

レポート25

Page 26: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

処理

解析の流れデータ

レポート

変数配列行列

関数

パッケージ

自作関数

作図CSVデータフレーム

26

Page 27: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

処理

解析の流れデータ

レポート

変数配列行列

データフレーム

関数

パッケージ

自作関数

作図CSV27

Page 28: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

ここでは

•Rを使ったデータの表現/操作方法について説明します

28

Page 29: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

値を入れる箱> hako <- 10

> hako

[1] 10

> hako * 2

[1] 20

変数

29

Page 30: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

値を入れる箱> hako <- 10

> hako

[1] 10

> hako * 2

[1] 20

変数

変数に対して 処理(かけ算)

変数に値を入れる 左矢印のイメージ

30

Page 31: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

複数の値をまとめる> array <- c(10,20,30)

> array

[1] 10 20 30

> array * 2

[1] 20 40 60

配列

31

Page 32: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

複数の値をまとめる> array <- c(10,20,30)

> array

[1] 10 20 30

> array * 2

[1] 20 40 60

処理は 配列全体に 適用される

配列

3つの値を 配列に格納

32

Page 33: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

各要素へのアクセス> array[1]

[1] 10

> array[2]

[1] 20

> array[3]

[1] 30

配列

33

Page 34: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

各要素へのアクセス> array[1]

[1] 10

> array[2]

[1] 20

> array[3]

[1] 30

配列[番号]で 1個ずつ値を 取り出せる

配列

2個目

3個目34

Page 35: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

2次元の配列> array2 <- matrix(c(10,20,30,  

40,50,60), 2, 3)

> array2

[,1] [,2] [,3]

[1,] 10 30 50

[2,] 20 40 60

行列

35

Page 36: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

2次元の配列> array2 <- matrix(c(10,20,30,  

40,50,60), 2, 3)

> array2

[,1] [,2] [,3]

[1,] 10 30 50

[2,] 20 40 60

matrixという 関数を利用して

作る

行列

2行3列の 行列

36

Page 37: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

行列覚え方

http://wakuteka.info/R/110729 より転載37

Page 38: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

各要素の指定> array2[1,1]

[1] 10

> array2[1,]

[1] 10 30 50

> array2[,1]

[1] 10 20

行列

38

Page 39: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

各要素の指定> array2[1,1]

[1] 10

> array2[1,]

[1] 10 30 50

> array2[,1]

[1] 10 20

1行1列を 指定

行列

1行目全体 を指定

1列目全体 を指定

39

Page 40: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

複数の型を持てる> sex <- c("F","F","M","M","M") #性別

> height <- c(158,162,177,173,166) #身長

> weight <- c(51,55,72,57,64) #体重

> ( x <- data.frame(SEX=sex, HEIGHT=height, WEIGHT=weight) )

SEX HEIGHT WEIGHT

1 F 158 51

2 F 162 55

3 M 177 72

4 M 173 57

5 M 166 64

データフレーム

40

Page 41: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

複数の型を持てる> sex <- c("F","F","M","M","M") #性別

> height <- c(158,162,177,173,166) #身長

> weight <- c(51,55,72,57,64) #体重

> ( x <- data.frame(SEX=sex, HEIGHT=height, WEIGHT=weight) )

SEX HEIGHT WEIGHT

1 F 158 51

2 F 162 55

3 M 177 72

4 M 173 57

5 M 166 64

性別(文字列型) 身長、体重(数値型)

データフレーム

data.frame関数で セット

41

Page 42: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

要素の指定> x$HEIGHT

[1] 158 162 177 173 166

!

> x$HEIGHT[1]

[1] 158

!

> x$HEIGHT[1:3]

[1] 158 162 177

$で 身長(HEIGHT) を全指定

データフレーム

身長1つめだけ

身長1-3番目

42

Page 43: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

ここまで

• 変数:1種類の型の値を1つ入れる箱(スカラー) • 配列:1種類の型の値を複数入れる箱(ベクトル) • 行列:1種類の型の複数ベクトルをまとめて表現 • データフレーム:複数の型のベクトルをまとめて表現

43

Page 44: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

CSV

処理

解析の流れデータ

レポート

変数配列行列

関数

自作関数データフレーム

パッケージ

作図44

Page 45: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

ここでは

•関数の利用/作成方法 • CSVによるデータ読み込み

45

Page 46: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

処理の呼び出し関数

•関数は複数の処理をまとめたもの •様々な計算が手軽に実行できる

46

Page 47: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

処理の呼び出し関数

目的 関数名と書式データの結合 C(データ)合計 sum(データ)

個数を求める length(データ)平均 mean(データ)標準偏差 sd(データ)・・・ ・・・

47

Page 48: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

合計を求める関数

> array

[1] 10 20 30

> sum(array)

[1] 60

48

Page 49: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

合計を求める関数

> array

[1] 10 20 30

> sum(array)

[1] 60

処理結果が 出力される

関数名(引数) で処理呼び出し

先ほどの配列

49

Page 50: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

行列も足せる> array2

[,1] [,2] [,3]

[1,] 10 30 50

[2,] 20 40 60

> sum(array2)

[1] 210

関数

50

Page 51: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

行列も足せる> array2

[,1] [,2] [,3]

[1,] 10 30 50

[2,] 20 40 60

> sum(array2)

[1] 210 合計値が 表示される

関数

先ほどの行列 array2

51

Page 52: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

結果を格納関数

> ret <- sum(array2)

> ret

[1] 210

変数

52

Page 53: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

結果を格納関数

> ret <- sum(array2)

> ret

[1] 210

処理結果を 変数に格納

変数

合計値の 確認

53

Page 54: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

CSV読み込み

•変数に毎回データを手入力するのは面倒 • CSV形式(カンマ区切り)ファイルを読み込む関数がある

関数CSV

54

Page 55: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

関数CSV> hawks <- read.csv("hawks.csv")

!

> hawks

height salary

1 173 17000

2 178 14000

3 180 9000

CSV読み込み

55

Page 56: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

関数CSV> hawks <- read.csv("hawks.csv")

!

> hawks

height salary

1 173 17000

2 178 14000

3 180 9000

read.csv関数に hawks.csvという CSVファイルを

渡して 変数に代入

CSV読み込み

56

Page 57: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

CSV読み込み関数CSV> hawks <- read.csv("hawks.csv")

!

> hawks

height salary

1 173 17000

2 178 14000

3 180 9000

CSVファイルの 変数への 読み込みが 確認できる

57

Page 58: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

自分で関数を作る

•関数は自分で定義することも可能 •繰り返し使う処理は自作関数にする

自作関数

58

Page 59: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

関数の書き方

関数名 <- function (引数) { 処理

}

59

Page 60: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

自分で関数を作る自作関数

> varp <- function(x) {

retsult <- var(x) * (length(x) - 1) / length(x)

retsult

}

> varp(array)

[1] 66.66667

60

Page 61: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

自分で関数を作る自作関数

> varp <- function(x) {

retsult <- var(x) * (length(x) - 1) / length(x)

retsult

}

> varp(array)

[1] 66.66667

関数の定義

処理を記述する 実行

61

Page 62: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

ここまで

•組み込み関数:基本的な演算が可能 • CSV:read.csv関数でCSV形式のデータを読み込める

•自作関数:自身で関数を定義できる

62

Page 63: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

処理

解析の流れデータ

レポート

変数配列行列

関数

パッケージ

自作関数

作図CSVデータフレーム

63

Page 64: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

ここでは

•作図関数 •外部パッケージの利用方法

64

Page 65: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

標準作図関数作図

•標準の関数でも色々と作図可能目的 関数名

ヒストグラム hist散布図 plot箱ヒゲ図 boxplot・・・ ・・・

http://cse.naro.affrc.go.jp/takezawa/r-tips/r/50.html参考URL

65

Page 66: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

> x <- rnorm(50)

> hist(x, breaks=seq(-3, 3,1))

標準作図関数作図

66

Page 67: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

> x <- rnorm(50)

> hist(x, breaks=seq(-3, 3,1))

標準作図関数作図

乱数生成

ヒストグラム 作図関数

67

Page 68: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

> x <- rnorm(50)

> plot(x)

標準作図関数作図

乱数生成

プロット 関数

68

Page 69: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

関数をまとめたもの

•複数の関数をまとめたもの •様々なパッケージがCRANというシステムにて無料公開されている

•自作のパッケージも公開できる

パッケージ

69

Page 70: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

•作図パッケージggplot2を使えるようにする

70

Page 71: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

> install.packages(“ggplot2”)

> library("ggplot2")

外部パッケージパッケージ作図

71

Page 72: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

> install.packages(“ggplot2”)

> library("ggplot2") CRANから パッケージ ダウンロード& インストール

外部パッケージパッケージ作図

パッケージを ロード

72

Page 73: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

a <- 1:10

b <- a^2

qplot(a,b)

qplotが利用可能パッケージ作図

73

Page 74: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

a <- 1:10

b <- a^2

qplot(a,b)

qplotが利用可能パッケージ作図

ggplot2 パッケージ の関数 74

Page 75: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

qplot(carat, price,

data = diamonds,

colour = clarity)

サンプルデータ diamonds

パッケージ作図

diamonds データの

carat, priceを 描画

75

Page 76: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

参考資料パッケージ作図

http://www.slideshare.net/dichika/ggplot276

Page 77: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

紹介:分析用もあるパッケージ

目的 パッケージ名主成分分析 stats(組み込み済)対応分析 MASS

クラスター分析 stats線形回帰分析 stats生存分析 survival

ニューラルネット nnet・・・ ・・・

処理

77

Page 78: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

詳細はこちらの書籍で

http://amazon.jp/dp/4627096011/

•過去にTokyoRでもテキストとして利用

78

Page 79: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

ここまで

•作図関数:可視化が可能 •パッケージ:CRANからダウンロードして利用する。作図用や分析用など色々ある

79

Page 80: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

処理

Rで一連の分析が可能データ

レポート80

Page 81: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

アジェンダ

•自己紹介とお知らせ • Rって何 • Rの使い方 •Rの資料

81

Page 82: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

•日本語の資料

82

Page 83: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

seekR

http://seekr.jp/

• R言語用検索エンジン

83

Page 84: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

ちなみに•中の人がTokyoRで発表して下さいました!

http://www.slideshare.net/hiratake55/seekrjp-2228155484

Page 85: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

RjpWiki• R言語のWikihttp://www.okada.jp.org/RWiki/

85

Page 86: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

Rコミュニティ発表資料http://lab.sakaue.info/wiki.cgi/JapanR2010?page=FrontPage 「勉強会発表内容一覧」のリンクから

• Tokyo.R, Nagoya.R, Tukuba.Rのアーカイブ

86

Page 87: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

RとSQLの対応付け•SQLが分かる人は一読の価値有りhttp://d.hatena.ne.jp/a_bicky/20110529/1306667230

87

Page 88: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

サンプルデータ•統計を学びたい人へ贈る、統計解析に使えるデータセットまとめ

• http://d.hatena.ne.jp/hoxo_m/20120214/p1

• データセット一覧

• http://vincentarelbundock.github.io/Rdatasets/datasets.html

88

Page 89: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

89

Page 90: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

•以下海外のサイト(英語)

90

Page 91: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

CRAN Task Viws•Rには5000以上パッケージがある(2014/09現在)

• 用途別におすすめパッケージを紹介http://cran.r-project.org/web/views/

91

Page 92: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

CRAN Task Viws•日本語訳してるサイト(一部機械翻訳)

http://www.trifields.jp/r-cran-task-views-639

92

Page 93: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

R-Chart• Rでの作図のサンプルが多数ある

http://www.r-chart.com/

93

Page 94: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

まとめ

•Rは無料の統計解析ソフト •データ解析からレポートまで利用可能 •Web上の資料も充実

94

Page 95: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

まとめ

•Rは無料の統計解析ソフト •データ解析からレポートまで利用可能 •Web上の資料も充実

是非使ってみましょう!95

Page 96: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

ご清聴ありがとうございました

96

Page 97: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

質疑応答

97

Page 98: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

予備資料

98

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連携も可能

プロトタイピング実務利用

プログラミング言語寄り (カスタマイズ可能)

直感的な操作(用途は限定)

業務専用 パッケージ

.C()関数

RExcel

99

Page 100: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

イケメンツールRStudio

100

Page 101: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

RStudio資料

http://www.slideshare.net/wdkz/rstudio-13866958101

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初心者だけど2回目•箕田さんの初心者セッション

•集計、条件分岐、ループ、作図など

http://www.slideshare.net/aad34210/tokyo-r21

http://www.slideshare.net/aad34210/tokyo-r30-beginner 102

Page 103: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

Tips

103

Page 104: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

補足:クリップボード関数

#windowsの場合!>hawks <- read.table("clipboard", header=TRUE,sep=’,’);!#macの場合!>hawks <- read.table(pipe("pbpaste"), header=TRUE,sep=’,’)!> hawks! height salary!1 173 17000!2 178 14000!3 180 9000!

クリップボードからも 読み込み可能

CSV

104

Page 105: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

補足2:関数調べ方関数CSV

> ?read.table

> ??read.table

>help(read.table)

! ヘルプを 呼び出すことが出来る

105

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補足2:関数調べ方関数CSV

後半には 用例もあるので 参考に

> ?read.table

> ??read.table

>help(read.table)

!

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Page 107: 10分で分かるr言語入門ver2.9 14 0920

紹介:テキスト解析ツール KH Corder

•茶筅やRを裏側で利用(Rのソースで出力可)

• GUIで形態素解析、対応分析、ネットワーク分析が簡単にできる

http://khc.sourceforge.net/107