110201 catalogue adnucleis

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CATALOGUE

MATERIELS ET CONSOMMABLESJanvier 2011

ADNUCLEIS SAS Au capital de 491 000 Sige social : 30 chemin des Mouilles 69290 GREZIEU LA VARENNE SIRET : 497 802 165 000 17 TVA intraCEE : FR 3649780216500017 Email : [email protected] Tl : + 33 (0) 478 571 640 Port : + 33 (0) 660 960 141

ADNUCLEIS SAS 30 chemin des Mouilles, 69290 GREZIEU LA VARENNE Email : [email protected] Tl : + 33 (0) 478 571 640

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TABLE DES MATIERES

I. 1 2 3 4

Conditions de mise en place dun laboratoire PCR.3 Ressources matrielles et personnel ncessaires .................................................................... 3 Formation ............................................................................................................................... 4 Prix des kits ADNucleis ......................................................................................................... 5 Avantages des kits ADNucleis ............................................................................................... 5

II Les matriels & consommables ncessaires la dtection de cibles gntiques par PCR temps rel .6 1 2 3 4 5 Extraction et purification dADN/ARN ................................................................................. 7 Milieux de culture .................................................................................................................. 8 Les kits damplification de germes recherchs (cibles) ......................................................... 8 Gnotypage........................................................................................................................... 14 Autres consommables et matriel, .................................................................................. 15


3 I. Conditions de mise en place dun laboratoire PCR1 Ressources matrielles et personnel ncessaires

MATERIEL RT PCR ou QPCR Thermocycleur simple* Ultra Centrifugeuse plaques ou barrettes** Pipette multicanaux 1-10l Pipette multicanaux 30-50l

PRIX en HT 30 000 6 500 4 900 700 700

* non indispensable. Son achat peut viter lachat dune 2me PCR ou permettre de gagner le temps de lextraction dans le cas de plusieurs plaques de 96 puits amplifier. ** Si ncessaire : voir lingnieur ADNucleis pour configurer le laboratoire danalyse et le matriel.

Installation comprise du matriel dans le laboratoire + essais : 48h. Matriel requis : 1 conglateur 1 rfrigrateur 1 stomacher 1 Poste de scurit microbien (P2)

Laboratoire niveau L1 donc pas dexigence sanitaire spcifique.

Ventilation : extraction dair partir de la salle damplification / entre dair dans la salle dextraction. Climatiseur recommand (temprature infrieure ou gale 25C).


42 Formation

ADNucleis est agre pour la formation professionnelle : N SIREN de lorganisme de formation : 497 802 165 000 17 Dclaration dactivit de FORMATION enregistre sous le N 82 69 09708 69 auprs du prfet de la Rgion Rhne-Alpes. Tarifs et dures de la formation : Une journe de formation : 400 (hors frais de dplacement) Selon le niveau de formation initiale et la complexit de a demande, 1 10 jours sont ncessaires pour la formation.


53 Prix des kits ADNucleis

Le prix des kits dextraction et damplification varie en fonction des cibles et du nombre danalyses annuelles. Pour plus dinformation lie une demande de devis, merci de nous contacter ladresse suivante : [email protected]

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Avantages des kits ADNucleisRponse en 3h, 15h lors dun enrichissement. Kits optimiss pour une utilisation avec des matrices complexes Prsentation sous forme de barrettes scables colores en fonction de la cible. Profils thermique unique quelle que soit la cible ADN ou ARN. Pas de manipulation des ractifs de lyse et de PCR car les tubes ractionnels sont pr-remplis (sauf incompatibilit avec le thermocycleur). Purification sur colonne ou par billes magntiques pour une puret des ADN/ARN optimale. Protocoles compatibles avec les grandes sries (96) Compatibilit avec tous les thermocycleurs (Systme ouvert).

Seuls les thermocycleurs suivant ont t tests dans le cadre de la marque AFNOR Validation : Applied Biosystems : 7000, 7300, 7500, 7900 Qiagen : Rotogene (Corbet) Stratagen-Agilent : MX 3005P Eppendorf : Realplex


Matriel ncessaire la dtection de pathognes alimentaires par PCR avec les kits de dtection ADNUCLEIS2 protocoles de purification des ADN sont proposs : sur colonne de silice, sur billes magntique revtues de silice. x H O = Inclus dans le kit = Hors kit = Optionnel = Ractifs et consommables AFNOR

II Les matriels & consommables ncessaires la dtection de cibles gntiques par PCR temps rel

ADN 33/01 02/10 F in de validit : 05/02/2014 ME T HO DE S AL T E R NAT IVE S DANAL Y S E P O UR L AG R O AL IME NT AIR E www.afnor-validation.org

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Protocoles a) Billes b) Colonne de magntiques silice (AFNOR)

Fonctions

Prcisions

Enrichissement Matriel * Stomacher * Etuve stabilise 37C * Micropipette 25-200l Consommables * Sac stomacher filtre * Tube centrifuger de 15ml gradu avec bouchon Ractifs * Milieu de culture PCRone * Eau dionise Concentration bactrienne (optionnelle) Matriel * Centrifugeuse avec rotor pour tube 15ml Consommables * Tube centrifuger de 15ml gradu avec bouchon Extraction Matriel * Centrifugeuse plaque ou barrettes * Thermocycleur ou bain marie sec * Micropipette 25-200l Ractifs (1) * Microtube prrempli de ractif de lyse (25l de ractif concentr) * Ethanol 96 * Tampon de lyse Purification Matriel * Centrifugeuse avec rotor tubes 1.5/2ml * Centrifugeuse avec rotor plaque * Tapis magntique * Portoir magntique 96x * Pipette 300l (1 ou 8 canaux) * Ripette et combitip (5mL) Consommables * Plaque 96 prremplie de solution de billes magntiques scelle d'aluminum * Microtube 200l * Colonne de filtration * Tubes collecteurs X4 * Tube 1.5ml * Pointes filtre 300l Ractifs * Solution de billes magntiques (prremplie dans plaque 96 deepwell) * Tampon de lavage 1 * Tampon de lavage 2 * Tampon d'lution Amplification Matriel * Thermocycleur (canal Sybr) * Centrifugeuse avec rotor plaque * Portoir de plaque * Plaque support de microtube 200l Consommables * Pointes filtre 10l * * * * * * ConfirmationDans le cadre de la marque AFNOR VALIDATION, les rsultats positifs doivent tre confirms de la (de lune des) manire(s) suivante(s) : - Mise en uvre des techniques classiques dcrites dans les mthodes normalises par le CEN ou ISO (en incluant ltape de purification) partir des bouillons d'enrichissement 12 24h. - Utilisation de toute autre mthode certifie AFNOR VALIDATION, de principe diffrent de celui de la mthode HQS E.coli O157H7 Sybr dont on cherche confirmer le rsultat. Le protocole valid de la seconde mthode devra tre respect dans son ensemble. En cas de rsultats discordants (positifs par la mthode alternative, non confirms par la mthode ISO), le laboratoire devra mettre en uvre les moyens suffisants pour sassurer de la validit du rsultat rendu.

H H H H H H H

H H H H H H H

Homognisation Enrichissement Transfert liquide Homognisation Transfert liquide Croissance bactrienne Croissance bactrienne 400mL 10mL 10,6g 225mL

H H

H H

Concentration bactrienne Concentration bactrienne

4500g 10mL

H H H x x

H H H x H x

Culotage des ractifs Lyses enzymatiques et thermique Transfert liquide Lyses enzymatiques Binding ADN/ARN Binding ADN/ARN 100L 70l 70l

H H H H O x O

H H

H O

Concentration des ractifs Acclration de la sparation magntique Sparation magntique Transfert liquide Distribution de liquide Plastiques Conservation ADN Filtration Filtration Elution d'ADN Transfert liquide Capture ADN Lavage des colonnes Lavage des colonnes Elution ADN/ARN

300g

500l

H x

x x H H

x

x x x

500l 500l =

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