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Les conférencesde l’Institut de l’Elevage
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LES ANOMALIES GÉNÉTIQUES : LES DÉTECTER, LES COMPRENDRE, LES ÉRADIQUER
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LES ANOMALIES GÉNÉTIQUES : LES DÉTECTER, LES COMPRENDRE, LES ÉRADIQUER
D. BOICHARD, INRA GABIC. DANCHIN-BURGE, Institut de l’Elevage
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Les causes peuvent être génétiques mais aussi toxiques, infectieuses, traumatiques …Un même type d’anomalie peut avoir plusieurs causes
Qu’est ce qu’une anomalie ?
Causes traumatiques (DG <40j.) ?Cause(s) génétique(s) ?
Une description clinique précise est indispensable !
Atrésie du colon
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Causes d’apparition des anomalies génétiques
Duchesne et al, 2006
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Tout individu est porteur de quelques mutations (récessives) délétères
Estimations réalisées chez l’homme : de l’ordre de 4 ou 5
Notion de fardeau génétique
1. Le taureau parfait n’existe pas !
2. Il y a des anomalies dans toutes les races !
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Space 2014Anomalies et consanguinité• L’incidence des anomalies génétiques est (très) faible
en situation normale …
• Ex : si fréquence allélique p=1%, freq(cas)=p2=0.01%
• … mais elle augmente avec la consanguinité …
• Et les races animales sont des populations de petite taille génétique => la consanguinité augmente régulièrement
• On est régulièrement confronté à des crises aigües :
Þ Nécessité d’une gestion efficace de ces anomalies
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Pourquoi et comment éradiquer les anomalies
Dr JM Nicol, 2014
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Space 2014Pour la filière, un coût
important
Probablement plus de 5% de pertes de fertilité
Probablement plusieurs % de mortalité après naissance
Des cas plus rares chez les adultes, mais bien plus coûteux
Un coût probable de l’ordre de 50 à 100 millions € / an
Souvent, une carrière interrompue prématurément pour les reproducteurs
Des risques de contentieux
Une mauvaise image auprès du public
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Space 2014 Besoin d’une surveillance spécifique
• Les dispositifs de contrôle de performances classiques sont peu opérationnels
• La collecte d’information spontanée est réduite
• L’auto-censure est forte
• Généralement peu de cas par élevage
• Les signes d’appel sont parfois difficiles à distinguer d’autres affections (ex du BLAD : infections récidivantes pulmonaires, digestives)
• Rôle essentiel du vétérinaire pour une bonne caractérisation clinique et l’élimination des causes non génétiques
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Space 2014… Nous avons besoin de VOUS pour rapporter les
anomalies !!Site de l’Observatoire des Anomalies Bovines (ONAB)
http://www.onab.fr=> Fiche papier déclaration téléchargeable en ligne
Ou fiche en ligne
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La révolution des outils technologiques
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Génération 1
Génération 2
a/A A/A
A/A a/A A/A
A/A A/Aa/Aa/a a/aa/a
. . .
Génération n
Les animaux affectés sont homozygotes à proximité de la mutation
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Le génotypage par puce Exemple : « Cartographie par homozygotie »
• Atteints = homozygotes
• Aussi homozygotes pour un fragment chromosomique entourant la mutation
Þ On recherche un segment toujours homozygote chez les atteints et rarement homozygotes chez les normaux
Þ On met ainsi en évidence la région portant la mutation
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Space 2014Détection d’une mutation délétère:
la situation aujourd’hui
Une mutation peut être localisée en quelques semaines/mois à partir de quelques cas (5 à 10 en général) !
=> Création d’un premier test génétique à partir de marqueurs de la région
En revanche, l’identification de la mutation reste aléatoire mais elle peut déboucher en quelques mois, grâce à l’évolution du séquençage d’ADN
Þ Second test, soit spécifique (~25€ / animal), soit sur une puce multi-objectifs Þ Screening de la population, identification des porteursÞ Elimination progressive de l’anomalie
Facteur limitant = identification et caractérisation de l’anomalie
=> Importance de l’ONAB !
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Et demain ?Détection des anomalies = de plus en plus efficace
(approches d’amont)
Problème: tout reproducteur sera identifié comme porteur d’une ou plusieurs anomalies
=> Plus d’éradication directe
=> Comment gérer la situation ?
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Space 2014 Recommandations
Augmenter notre réactivité
But: limiter l’augmentation de fréquence
Objectif : faire remonter les cas !
Conduite à tenir
- Anomalie dominante => éradiquer immédiatement
- Anomalie récessive => éviter les accouplements à risque
Avec une fréquence faible : garder les mâles non porteurs à N+1
Avec une fréquence élevée : intégrer l’anomalie dans l’ISU (poids économique)
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Présentation disponible en téléchargement sur www.idele.fr
Retrouvez aussi l’Institut de l’Elevage sur le stand A6 - hall 4