3- automatizacion en microbiologia
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Automatización en Microbiología
DR CESAR CABRERA CARRILLO
MEDICO ASISTENTE DEL SERVICIO MICROBIOLOGIA
DEPARTAMENTO PATOLOGIA CLINICA-HNERM
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Automatización
en identificación
y pruebas de
sensibilidad
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Ventajas de los sistemas automatizados de
estudios de susceptibilidad bacteriana
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Desventajas de los sistemas automatizados de
estudios de susceptibilidad bacteriana
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Ssitemas automatizados para identificación y
estudio de susceptibilidad bacteriana
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• MicroScan Walkaway (Dade)
• Sistema Vitek (BioMerieux)
• Sistema Phoenix (Becton Dickinson)
Sistema Semiautomatizados y Automatizados
en el Peru
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MicroScan 1. Equipos
2. Paneles
3. Software de trabajo
4. Sistema experto
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MicroScan 1. Equipos
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Equipos de Microscan
MicroScan WalkAway 96 plus
MicroScan WalkAway 40 plus
Microscan AutoScan - 4
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•Sistema de Lectura
automatizada de paneles
convencionales en solo 5
segundos simplificando
las prueba ID/AST y la
estandarización de
resultados
Microscan AutoScan – 4
Semiautomatizado
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Incubar
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MicroScan WalkAway 96 plus
Completamente automatizado
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MicroScan 2. Paneles
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1. Paneles Convencionales
2. Paneles Rápidos
3. Paneles Plus ESBL
4. Paneles Plus Sinergias
• VRE , MRSA
5. Paneles Plus MicroStrep
• MIC para Streptococcus
6. Paneles ID Especiales
• ID de levaduras, BGN
fastidosos, anaerobios
Paneles de MicroScan
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MicroScan – Paneles Convencionales
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MicroScan – Pos Combo Panel Type 33 (PC 33) (Gram positivos)
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- CV (Crystal Violet)-
- MS (Micrococcus Screen)
- NIT (Nitrate)
GLYCOSIDASES
- PGR (PNP Glucoronoside)
- PGT (PNP Galactopyranoside)
- NOV (Novobiocin)
- IDX (Indoxyl Phosphatase)
- VP (Voges-Proskauer)
- OPT (Optochin)
- PHO (Phosphatase)
- BE (Bilis Esculin 40%)
- PYR (Pyrrolidomyl naphthylamide)
- ARG (Arginine)
- URE (Urea)
- MAN (Mannitol)
CARBOHIDRATOS
- LAC (Lactose)
- TRE (Trehalose)
- MNS (Mannose)
- SOR (Sorbitol)
- ARA (Arabinose)
- RBS (Ribose)
- INU (Inulin)
- RAF (Raffinose)
- NACL (Solucion Chloride 6.5%)
- BAC (Bacitracin)
- PRV (Pyruvate)
Microscan - PC 33 (Gram positivos)
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MicroScan – PC 33 Antibioticos y diluciones
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MicroScan – Neg Combo Panel Type 50 (NC 50) (Bacilos gram negativos)
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CARBOHIDRATOS
- GLU (Glucose)
- SUC (Sucrose)
- SOR (Sorbitol)
- RAF (Raffinose)
- RHA (Rhamnose)
- ARA (Arabinose)
- INO (Inositol)
- ADO (Adonitol)
- MEL (Melbiose)
- URE (Urea)
- H2S (Hydrogen Sulfide)
- IDN (Indole)
- LYS (Lysine)
- ARG (Arginine)
- ORN (Ornithine)
-TDA (Trytophan Deaminase)
- ESC (Esculin Hydrolisis)
- VP (Voges – Proskauer)
- CIT (Citrate)-
- MAL (Malonate)
- ACE (Acetamide)
- TAR (Tartrate)
- ONPG (O NitroPhenyl Galactopyranoside)
- CET (Cetrimide)
- OF/G (Oxidation-Fermentation/Glucosa)
- OF/B (Oxidation-Fermentation/Base)
- DCB (Decarboxylation Control Base)
NC 50 – Bacilos gram negativos
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MicroScan – Neg Combo Panel Type 50 Antibioticos y diluciones
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MicroScan – Neg Urine Combo Panel Type 55 (NUC 55) (Uropatogenos)
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MicroScan – NUC 55 Antibioticos y diluciones
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MicroScan 3. Software : LABPRO
4. Sistema Experto : ALERTEX
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LABPRO con ALERTEX
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1 2 4 8 MIC
8
4
2
1
8
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Phoenix 1. Equipos
2. Paneles
3. Software de trabajo
4. Sistema Experto
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Phoenix 1. Equipos
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• Sistema automatizado de identificación y sensibilidad para bacterias de importancia clínica
• Comunicación intuitiva con el aparato a través de iconos
• Capacidad de incubación de 100 paneles
• Nuevo sistema de inoculación
• Control y calibración interna
Equipo PHOENIX
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Phoenix 2. Paneles
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• Paneles para ID/AST Combo
o solo AST para :
• Gram negativos
• Gram positivos
• Streptococcus
• Panel de formato único
• Almacenamiento a
temperatura ambiente
• Hermetíco
• Resultados rapidos
• 80% de los resultados de
AST completado en < de
10h.
• Lectura continua cada 20
minutos
PHOENIX - Paneles
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• Identificación :
• 45 substratos
•convencionales, fluorogénicos y cromogénicos, carbohidratos, fuentes de carbono, esculina
• Sin adición de reactivos
• Sin tests complementarios • 5 base de datos • Resultados a las 2, 3, 4, 6 y 12
horas
• Información de valores de
confianza, y reacciones de los
substratos
• B-Lact en la parte ID para los
paneles G+
PHOENIX - Paneles
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• Sensibilidad : • 20 a 22 antibioticos por
panel • > de 3 dil por Ab • Doble diluciones
• ESBL incluido en cada
panel G- con 2 metodos
de detección
PHOENIX - Paneles
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Phoenix
3. Software: EPICENTER
4. Sistema Experto: BDXpert
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Vitek 2 1. Equipos
2. Tarjetas
3. Software de trabajo
4. Sistema Experto
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Vitek 2 1. Equipos
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Equipo Vitek 2 Compact
Vitek 2 compact 40
Vitek 2 compact 60
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Vitek 2 2. Tarjetas
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Vitek 2 - Tarjetas
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Vitek 2 3. Software
4. Sistema Experto
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As presented at the 105th General Meeting of the
American Society for Microbiology, 2005.
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As presented at the 105th General Meeting of the
American Society for Microbiology, 2005.
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Automatización
en hemocultivos
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AUTOMATIZACION EN
HEMOCULTIVOS
•En el Perú en 1998
COSTO - BENEFICIO
•Primero en el HNERM
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![Page 56: 3- Automatizacion en Microbiologia](https://reader036.vdocuments.pub/reader036/viewer/2022081414/55cf9b15550346d033a4aa9e/html5/thumbnails/56.jpg)
IMPACTO DE LA AUTOMATIZACIÓN
• El impacto de la automatización de los hemocultivos versus la
metodología convencional puede ser evaluado desde 4 puntos de vista:
clínico, microbiológico, epidemiológico y económico.
IMPACTO CLÍNICO: La implementación de sistemas
automatizados de hemocultivos con monitoreo sensibles y continuos y
con agitación constante han llevado a un aumento de la velocidad de
detección, con una disminución del tiempo de respuesta y a un
aumento de la sensibilidad de los hemocultivos. Esto permite mejorar
la capacidad diagnóstica en bacteriemias y un uso más racional de la
terapia antimicrobiana.
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IMPACTO MICROBIOLÓGICO: Ha sido principalmente una
disminución de la carga de trabajo con posibilidades de procesar
grandes volúmenes de muestras, una disminución de la contaminación
cruzada por técnicas de detección no invasivas y un aumento del
espectro de microorganismos que se detectan por estos sistemas.
IMPACTO EPIDEMIOLÓGICO: El soporte computacional que
poseen estos sistemas permiten obtener listados de positividad por
pacientes, por muestra, por microorganismo, conocer el rendimiento
(% de positividad) y la contaminación de los hemocultivos. Estos datos
se pueden evaluar por servicio, por tipo de muestra, diarios, semanales,
mensuales y/o anuales, lo que constituyen gran aporte en el control de
las bacteriemias intrahospitalarias.
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• IMPACTO ECONÓMICO
A nivel del laboratorio: aumento del costo por botella (2 a 4 veces el costo de la convencional), disminución de las horas/hombre, disminución de los costos del material de resiembra, disminución del riesgo de cortopunzantes en el operador. Esto conduce a una disminución del costo global de los hemocultivos negativos siempre y cuando no se considere el costo del equipo.
A nivel del hospital: podría conducir a una disminución de los días de uso de antibióticos de amplio espectro (más caros y con mayor toxicidad) y podría significar también una disminución de los días/cama; sin embargo casi no existen publicaciones que avalen estos impactos.
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Tres de tales sistemas: El BacT/Alert; el BACTEC
9240/9120 y el TREK tienen un uso muy extendido. El
sistema de cultivo de sangre BioMeriux Vital no esta
autorizado por la FDA (en USA) sin embargo tiene
ensayos exitosos.
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Sistema Bact/alert
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SISTEMA BacT/Alert (OrganonTeknika)
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MECANISMO DE DETECCIÓN BacT/Alert
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Sistema Bactec
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Analizador
Sensor Señal fluorescente
Detector
BACTEC 9000 SYSTEMS
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BACTEC 9000 SYSTEMS
• Permite una detección
más temprana y rápida
• Viales con resinas para
neutralización de
antibióticos
Lectura cada 10 minutos
Precocidad en el
diagnóstico del paciente
Aumenta rendimiento
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BACTEC 9000 SYSTEMS Resinas
• Dos tipos de Resinas :
– Resinas de intercambio catiónico: Se unen
iónicamente a los antimicrobianos cargados
positivamente como los aminoglucósidos.
– Resinas absorbentes poliméricas (Hidrofóbicas):
Se unen a las porciones hidrofóbicas de
prácticamente cualquier antimicrobiano.
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resinas
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Sistema Trek
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SISTEMA TREK
Antes Sistema ESP(Extra sensing Power)
• Este difiere de los 2 anteriores debido a :
1) La producción de CO2 es monitoreada por manometria.
2) Tanto la producción como el consumo de gas son monitoreados.
3) Cambios en la [ ] de H2 y O2 son detectados además del de
CO2 (Principal ventaja porque las lecturas se hacen 1 a 8
horas antes que aquellos sistemas que solo detectan CO2 –
Ayuda en organismos asacaroliticos que no produzcan suficiente
CO2)
• La unidad también actúa como auto contenido, agitador y detector.
• Presenta capacidad para 128 o 384 frascos.
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Tinción de gram con resinas (BACTEC)
Tinción de gram con carbon (BACT/ALERT)
Diferencias BACTEC vs BACT/ALERT
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Botellas de BACTEC
Botellas de VERSATREK
La botella tiene
una sola
etiqueta de
código de barra
Diferencias BACTEC vs VERSATREK
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Comparison of the VersaTrek blood culture system against the Bactec 9240 system in
patients with suspected bloodstream infections.
Annal of clinical Microbiology and Antimicrobial 2011, 10;4
Diferencias BACTEC vs VERSATREK
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Comparison of the VersaTrek blood culture system against the Bactec 9240 system in patients with
suspected bloodstream infections.
Annal of clinical Microbiology and Antimicrobial 2011, 10;4
Brucella?
Haemophilus?
Diferencias BACTEC vs VERSATREK
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Automatización
en tuberculosis
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Bactec MGIT 960
fluorometrico
MGIT Bactec 460
radiometrico
COMPARACION
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Bactec MGIT 960
fluorometrico
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Tiempo hasta que el cultivo de positivo
-
0
50
100
0 10 20 30 40 50 60
Dias
% P
os
itiv
o
MODS
MBBacT
LJ
7 13 26 7 13 26
Moore DAJ et al, NEJM 2006; 355 (15): 1539 - 50
-
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MODS - características diagnósticas
MODS MBBacT LJ
Sensibilidad - cultivo 98% 89% 84%
Especifidad - cultivo 99.6% 99.9% 100%
Características - PS (sens, espec, VPP & VPN)
Equivalente
Costo Diagnostico + PS (USD)
2 50 9
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GRACIAS