物種學名與地理空間資訊處理
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公⺠民科學⽰示範網站及資料庫系統 教育訓練
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物種學名與 地理空間資訊處理
鄧東波 !
中央研究院資訊科學研究所 地理資訊研究
!Nov. 28 2013
公⺠民科學 (Citizen Science)
• 公⺠民科學(Citizen Science)是⼀一種協同合作⽅方式科學活動，通常在科學家規劃之下，讓⼀一般⼤大眾有系統地參與科學研究案中的全部或其中⼀一部分，這些參與所涵蓋的範圍包含探索問題、發展科學技術、收集與分析資料等。
• 這個類型的科學計劃之核⼼心價值在於科學知識的協同合作，⽽而研究與知識⽣生產過程中，是不被少數⼈人或專家所把持，⽽而是在公⺠民參與研究過程中，將成果和經驗分享於公⺠民。
• 事實上，公⺠民科學並⾮非是新興的概念，早在1900年，奧杜邦協會 (National Audubon Society) 在北美進⾏行聖誕節⿃鳥類調查 (Christmas Bird Count)，即開啟最早的且具規模的公⺠民科學計畫，之後，這個計畫並每年舉⾏行，其成果形成重要的⿃鳥類調查資源。
擴展公⺠民科學計畫的要素• Silvertown(2009)認為有三個主要因素：
• ⼀一、能夠使⽤用已存在且容易取得的⼯工具來分享公⺠民科學計畫的相關訊息及其成果於普羅⼤大眾，降低參與的技術性⾨門檻；
• ⼆二、能夠將參與者所貢獻的資料、技術、計算資源、勞⼒力、甚⾄至⾦金錢，進化成真實的科學成果，使參與者感受到貢獻所帶來效益；
• 三、公⺠民科學計畫能接受公眾課責(public accountability)，科學研究計畫的資⾦金來多數來⾃自於政府資助，⽽而公部⾨門的資⾦金事實上是納稅⼈人的錢，若要⽤用納稅⼈人的錢繼續做研究，公開成果且取得公眾認同是最好的做法。
不同型態的 公⺠民科學計畫平台
Roadkill Taiwan
可以確保資料品質
使⽤用者容易提供資料
eBird的資料收集⽅方式
iNaturalist.org 的資料收集⽅方式
網路科技⾰革新• 網路技術的⾰革新使得網路上的內容不只是由網⾴頁擁有者提供
• 網路內容的形成經常是協同合作的⽅方式所構成。社群媒體(Social Media)為⼈人們在網路世界彼此溝通的⼯工具之⼀一， 如Facebook、Twitter、Flickr、Plurk、Foursquare...等，
• 使⽤用者可撰寫簡短的⽂文字訊息，混雜照⽚片、網址、地圖或地理座標，以分享他/她的⽣生活⼤大⼩小事或周遭所⾒見所聞於社交網絡中，使⽤用者在閱讀網路上的資訊，同時，使⽤用者也扮演資料提供者的⾓角⾊色
• 社群媒體是否可以成為公⺠民科學計畫的資料收集⼯工具？
社群媒體中的賞⿃鳥資料(1)
Geotagged
Species: Little Egret
Location: Ueno park, Tokyo, Japan
社群媒體中的賞⿃鳥資料(2)
Species: Great white egret
Location: London wetland centre
Species: Spotted Munia (Lonchura punctulata)
Location: Zhong-Du brick kiln
常⾒見⿃鳥類的資料多 如⽩白鷺鷥(Egret)
珍稀⿃鳥類的資料少 如⼋八⾊色⿃鳥 (Fairy Pitta)
• People post
語意含糊的問題 Fairy Pitta 可以是⼀一個韓國歌星
只有吸引⼈人的才會被報導
櫻花照⽚片空間分佈
使⽤用社群媒體為 公⺠民科學資料提供平台優缺點
• 優點 • 可及性⾼高，容易提供資料 • 互動性好，容易與其它⼈人分享成果 • 容易形成同儕競爭，使資料提供更為有趣 • 參與者不⽤用再熟悉新的應⽤用程式或資料平台的介⾯面
• 參與者和資料的成⻑⾧長皆快速 • 缺點
• 資料品質和內容都難以掌握 • 需要投⼊入⼤大量⼯工作在資料品質處理 • 資料容易被社群媒體所限制 • 社群媒體的平台若有任何變動，都可能影響到後端資料管理和處理
⼀一筆提供到 Facebook上的⽣生態資料
多樣化的空間指涉(georeference)
經緯度座標 公路⾥里程
容易處理的地理資訊(1)
容易處理的地理資訊(2)
公路⾥里程
容易處理的地理資訊(3)
國道省道之公程⾥里程資料⼰己經是Open Data
容易處理的地理資訊(4)
電⼒力座標
電⼒力座標有公開的⽅方法，轉換成TM2 67
有點難處理的地理資訊(1)Google Map的連結
有點難處理的地理資訊(2)特⽴立獨⾏行的座標格式
有點難處理的地理資訊(3)尺度⼤大且模糊的地名 只有公路沒有⾥里程
有點難處理的地理資訊(4)地名簡寫
有點難處理的地理資訊(5)本來的地名資料庫中沒有這個地名
嵌在照⽚片中的座標資訊
很難處理的地理資訊(1)
簡化或⼝口語化的 物種名
⼝口語中的物種名楊⽟玉祥 @_@ 我覺得： 這是⼀一隻顏⾊色不太明顯的擬⻱⿔龜耶…⼀一時想不出其他可能性，是眼拙了嗎？
Jie Fang Cheng 我覺得不是茶斑也不是梭德，牠們應該不會這麼肥⼤大。
梁智盛 不是茶斑也不是梭德 我也覺得是擬⻱⿔龜 !如果可以截圖再上傳說不定會好⼀一點
邱柏愷 是擬⻱⿔龜殼花！
Information Extraction Information Reuse處理Facebook上資料的⼯工作流程
中⽂文物種俗名的簡名及其問題
⽟玉帶鳳蝶 (Papilio Polytes)
曙鳳蝶(Atrophaneura Horishana)
琉璃紋鳳蝶(Papilio Hermosanus)
曙鳳
⽟玉帶
琉璃
Adjective Noun
細紋 (pronounced Si-Wen, meaning “fine veined”
細紋新蠍蛉細紋蠍蛉細紋⿈黃鉤蛾
...15 species names with prefix name “細紋”
(1)
(2)
Confidence value =
辨識物種名的⽅方法
如何決定⼀一個thread中的物種名
• 這個回應被按了多少 “讚”？
• 回應的這個⼈人的“聲望”⾼高低(由過去的記錄所得)？
• 物種名出現在整個thread的次數？
• 物種名出現在回應的位置？經驗法則，愈晚回覆的通常愈是正確的物種名
地名縮寫的問題
特⽣生中⼼心
特有⽣生物研究保育中⼼心Te-You-Sheng-Wu-Yan-Jiou-Bao-Yu-Jhong-Sin
The Endemic Species Research Institute
Te-Sheng-Jhong-Sin
shorten to
•地名資料庫中的地名是完整全名
•沒有特定規則 •超過4個字以上容易產 ⽣生縮寫
辨識縮寫地名的⽅方法
結構化的資訊
FB Crowdsourcing Toolkit
http://roadkilled.biota.biodiv.tw http://enjoymoths.biodiv.tw/
基於結構化的資訊發展內容管理系統(CMS)
表格
地圖
圖庫
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