А-Ген: программное обеспечение и сервис для сборки генома

Федор Царев

Август 2011

Проблемы«Знание геномной последовательности так же необходимо для развития медицины и других

наук о здоровье, как знание анатомии было необходимо для достижения ее нынешнего

состояния» (Джеймс Уотсон)

Секвенирование генома

Сборка генома

• Высокие требования к вычислительным ресурсам у программного обеспечения

• Высокая стоимость ПО• Биологи не хотят «разбираться» с компьютерами

Продукт• Услуги по сборке геномных

последовательностей– 2012 год: 50$ (геном бактерии) … 5000$ (геном

человека)– 2014 год: 10$ (геном бактерии) … 100$ (геном

человека)• Программное обеспечение

– Стоимость лицензии – 3500$• Техническая поддержка и обучение

пользователей– В течение года: 3500$

Потенциальные потребители

• Научно-исследовательские центры по геномике (около 150 шт. в мире)

• Производители секвенаторов– Illumina (80% мирового рынка секвенаторов)

• Клинико-диагностические лаборатории• Фармацевтические компании• Медицинские центры (в перспективе)

Конкуренты• Научно-исследовательские центры:

o Пекинский геномный институт (Китай)o Европейский институт биоинформатикиo и др.

• Частные компании:o Roche (Швейцария)o Life Technologies (США)o и др.

Конкурентные преимущества• Услуги по сборке генома пока больше никем не предоставляется• Меньшие требования к вычислительным ресурсам у программного

обеспечения (по оперативной памяти – примерно в 4 раза)• Более низкая стоимость ПО для сборки генома человека (3 500 $) и

поддержки ПО и обучения (3 500 $) по сравнению с конкурентами: ПО - 5 000 $, поддержка ПО и обучение – 5 000 $

Низкое качество ПО

Цель – не продажа, а исследования

Предложение инвестору• Требуемые инвестиции на 2012 год – 800 000 $

51%

34%15%Распределение долей:

•34% - СПбГУ ИТМО•51% - команда•15% - инвестор

• Доходы за 2012 год: 2 200 000 $– Продажа лицензий на ПО: 100 шт. x 3 500 $ = 350 000 $– Обучение и поддержка ПО: 100 шт. x 3 500 $ = 350 000 $– Услуги по сборке генома: 300 шт. x 5 000 $ = 1 500 000 $

• Затраты на вычислительные ресурсы: 300 шт. x 200$ = 60 000$

Этапы проекта№ Название этапа Готовно

стьФинансирование

Сроки

I Исправление ошибок в ридах 100%

270 000$

-

Сборка квазиконтигов 100% -

Сборка контигов 100% -

Сборка скэффолдов 75% IV кв. 2011г.

II

Создание предприятия - I кв. 2012 г.

Покупка суперкомпьютеров (6 шт.) - 120 000 $ I кв. 2012 г.

Команда (10 чел.) 50% 35 000 $ / месяц

II кв. 2012 г.

Участие в выставках, конференциях, переговоры с партнерами

- 21 000 $ / месяц

2012 год

Команда проекта• СПбГУ ИТМО

– Руководитель проекта – Царев Ф. Н.• Чемпион мира по программированию 2008 года

– Разработчики ПО: Сергушичев А., Александров А., Казаков С., Мельников С. – участники полуфинала чемпионата мира по программированию 2010 года

• Центр «Биоинженерия» РАН – биологи– Зав. лабораторией, канд. биол. наук Прохорчук Е. Б.

• Лауреат премии Европейской Академии Наук Academia Europea (1999г.)

– Специалисты из группы академика К. Г. Скрябина

Спасибо за внимание!

Федор Царев