(~8/22)
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送受信班進行状況. (~8/22). 冨永将大・川崎浩平・井山佳美. 全体像. AHL. 求められること. 5 hours…. ③ 発現量 を下げる. ①AHL 合成量(合成速度) を下げる. ② 感受性 を下げる. 全体像. ①AHL 合成量、合成速度を下げる. →luxI の発現量を小さくする( RBS を替える). ② 感受性を下げる. → シグナル分子を替える. ② 出力量を下げる. →luxR の発現量を小さくする( RBS を替える). 送信システム作成の流れ. AHL. LasI(OdDHL). luxI(OHHL). - PowerPoint PPT PresentationTRANSCRIPT
(~8/22)
冨永将大・川崎浩平・井山佳美
送受信班進行状況
AHL
求められること
①AHL合成量(合成速度) を下げる
②感受性 を下げる
③発現量 を下げる
5 hours…
①AHL合成量、合成速度を下げる
→ luxIの発現量を小さくする( RBSを替える)
②感受性を下げる
→シグナル分子を替える
②出力量を下げる
→luxRの発現量を小さくする( RBSを替える)
luxI(OHHL)
AHL
LasI(OdDHL)
cinIRhlI(BHL)
PNAS November 25, 2003 vol. 100 suppl. 2 14549–14554Fig2. Structures of different autoinducers.
ptet(R0040)
LasI(C0178)CinI(C0176)RhlI(C0170)
LasI+LVA(C0078)CinI+LVA(C0076)RhlI+LVA(C0070)
B0034PCR +
+
AHL合成装置
+ptet (J13002)+RBS(B0034)
orplac(J04500)+RBS(B0034)
BioBrick パーツの準備( AHL合成酵素)
Bba_ パーツ概要 プラスミド 2008 2007 2006
C0178 LasI pSB1A2 ‐ ○ ○
C0170 RhlI pSB1A2 ‐ ○ ○
C0076 CinI + LVA pSB2K3 × × ×
C0078 LasI + LVA pSB2K3 × × ×
C0070 RhlI + LVA pSB2K3 × ● ●
I9020 RBS+RhlI pSB1A2 ‐ △ △
I9030 RBS+CinI pSB1A2 ‐ △ △
S03154 RBS+LasI pSB1A2 ‐ △ △
「○」…ミニプレインサートチェック OK、「●」…PCRインサートチェック OK
「△」…保留、「× 」…DNA得られず、「‐」…未実施
BioBrick パーツ(プロモータ+RBS)
Bba_ パーツ概要 プラスミド 2008 2007 2006
J04500 pLac+RBS pSB1AK3 △ △ △
J13002 Ptet+RBS pSB1A2 △ △ △
「○」…ミニプレインサートチェック OK、「●」…PCRインサートチェック OK
「△」…保留、「× 」…DNA得られず、「‐」…未実施
2006年iGEMで、バンドの位置がおかしいことが確認されている
AHL合成装置 (luxI以外 )
ptet orplac
B0034
+
lasIRhlI
Receiver(BBa_T9002)
ptet luxR plux GFP
ptet B0034 luxI+LVA
Sender(luxI)(BBa_S03623)
Cross-talkの確認
?
Cross-talkの確認
Receiver
Sender
Spot
①AHL合成量、合成速度を下げる
→ luxIの発現量を小さくする( RBSを替える)
②感受性を下げる
→シグナル分子を替える
②出力量を下げる
→luxRの発現量を小さくする( RBSを替える)
ptet B0034 luxI+LVA
Sender(BBa_S03623)
①B0033(weaker)②B0032(medium)③B0031(weak)
①
②
③
時間
[AH
L]
PCR
AHL合成量を下げる
ptet B0034
Sender(BBa_S03623)
①B0033(weaker)②B0032(medium)③B0031(weak)
①
②
③
時間
[Lux
R]
PCR
luxR合成量を下げる
luxR
luxI
AHL
LasI
cinIRhlI
PNAS November 25, 2003 vol. 100 suppl. 2 14549–14554
TraI
Fig2. Structures of different autoinducers.