(~8/22)

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(~8/22) 冨冨冨冨 冨冨冨冨冨 冨冨冨冨 ・・ 冨冨冨冨冨冨冨冨

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送受信班進行状況. (~8/22). 冨永将大・川崎浩平・井山佳美. 全体像. AHL. 求められること. 5 hours…. ③ 発現量  を下げる. ①AHL 合成量(合成速度)  を下げる. ② 感受性  を下げる. 全体像. ①AHL 合成量、合成速度を下げる. →luxI の発現量を小さくする( RBS を替える). ② 感受性を下げる. → シグナル分子を替える. ② 出力量を下げる. →luxR の発現量を小さくする( RBS を替える). 送信システム作成の流れ. AHL. LasI(OdDHL). luxI(OHHL). - PowerPoint PPT Presentation

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Page 1: (~8/22)

(~8/22)

冨永将大・川崎浩平・井山佳美

送受信班進行状況

Page 2: (~8/22)

AHL

求められること

①AHL合成量(合成速度) を下げる

②感受性 を下げる

③発現量 を下げる

5 hours…

Page 3: (~8/22)

①AHL合成量、合成速度を下げる

  → luxIの発現量を小さくする( RBSを替える)

②感受性を下げる

  →シグナル分子を替える

②出力量を下げる

→luxRの発現量を小さくする( RBSを替える)

Page 4: (~8/22)

luxI(OHHL)

AHL

LasI(OdDHL)

cinIRhlI(BHL)

PNAS November 25, 2003 vol. 100 suppl. 2 14549–14554Fig2. Structures of different autoinducers.

Page 5: (~8/22)

ptet(R0040)

LasI(C0178)CinI(C0176)RhlI(C0170)

LasI+LVA(C0078)CinI+LVA(C0076)RhlI+LVA(C0070)

B0034PCR +

+

AHL合成装置

+ptet (J13002)+RBS(B0034)

orplac(J04500)+RBS(B0034)

Page 6: (~8/22)

BioBrick パーツの準備( AHL合成酵素)

Bba_ パーツ概要 プラスミド 2008 2007 2006

C0178 LasI pSB1A2 ‐ ○ ○

C0170 RhlI pSB1A2 ‐ ○ ○

C0076 CinI + LVA pSB2K3 × × ×

C0078 LasI + LVA pSB2K3 × × ×

C0070 RhlI + LVA pSB2K3 × ● ●

I9020 RBS+RhlI pSB1A2 ‐ △ △

I9030 RBS+CinI pSB1A2 ‐ △ △

S03154 RBS+LasI pSB1A2 ‐ △ △

「○」…ミニプレインサートチェック OK、「●」…PCRインサートチェック OK

「△」…保留、「× 」…DNA得られず、「‐」…未実施

Page 7: (~8/22)

BioBrick パーツ(プロモータ+RBS)

Bba_ パーツ概要 プラスミド 2008 2007 2006

J04500 pLac+RBS pSB1AK3 △ △ △

J13002 Ptet+RBS pSB1A2 △ △ △

「○」…ミニプレインサートチェック OK、「●」…PCRインサートチェック OK

「△」…保留、「× 」…DNA得られず、「‐」…未実施

2006年iGEMで、バンドの位置がおかしいことが確認されている

Page 8: (~8/22)

AHL合成装置 (luxI以外 )

ptet  orplac

B0034

lasIRhlI

Receiver(BBa_T9002)

ptet luxR plux GFP

ptet B0034 luxI+LVA

Sender(luxI)(BBa_S03623)

Cross-talkの確認

?

Page 9: (~8/22)

Cross-talkの確認

Receiver

Sender

Spot

Page 10: (~8/22)

①AHL合成量、合成速度を下げる

  → luxIの発現量を小さくする( RBSを替える)

②感受性を下げる

  →シグナル分子を替える

②出力量を下げる

→luxRの発現量を小さくする( RBSを替える)

Page 11: (~8/22)

ptet B0034 luxI+LVA

Sender(BBa_S03623)

①B0033(weaker)②B0032(medium)③B0031(weak)

時間

[AH

L]

PCR

AHL合成量を下げる

Page 12: (~8/22)

ptet B0034

Sender(BBa_S03623)

①B0033(weaker)②B0032(medium)③B0031(weak)

時間

[Lux

R]

PCR

luxR合成量を下げる

luxR

Page 13: (~8/22)

luxI

AHL

LasI

cinIRhlI

PNAS November 25, 2003 vol. 100 suppl. 2 14549–14554

TraI

Fig2. Structures of different autoinducers.