6.1メタアナリシス revman practice

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兵兵兵兵兵兵兵兵兵兵兵兵兵兵 Hospital Care Research Unit 兵兵 兵/ 兵兵兵兵兵兵兵兵兵兵 兵兵 兵兵兵兵兵兵兵兵兵兵兵兵兵兵兵兵兵兵兵兵兵兵兵 兵兵兵兵兵兵兵兵兵兵 兵兵兵兵 Meta-analysis 兵兵

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Page 1: 6.1メタアナリシス revman practice

兵庫県立尼崎総合医療センター Hospital Care Research Unit

辻本 啓 /小野薬品工業株式会社

 小谷 基

診断精度研究の系統的レビュー作成ワークショップ@兵庫県立尼崎総合医療センター

Meta-analysis実習

Page 2: 6.1メタアナリシス revman practice

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前半の目標

• 与えられた 1検査についてのデータセットとパラメータからMoses-Littenberg modelを用いて、 Revman5.3で sROCを描くことができる

Page 3: 6.1メタアナリシス revman practice

実習

お手元のデータシート

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Page 4: 6.1メタアナリシス revman practice

一応:レビューの RQ

P:プライマリケアの場で心不全が疑われる患者

I: BNP

C:なし

T: 専門家パネルの診断の心不全

O: 感度・特異度など

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Page 5: 6.1メタアナリシス revman practice

RevManを起動5

Page 6: 6.1メタアナリシス revman practice

新しい Reviewを作成6

Page 7: 6.1メタアナリシス revman practice

DTAを選択7

Page 8: 6.1メタアナリシス revman practice

次へ

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Page 9: 6.1メタアナリシス revman practice

今回はシンプルなものを選択

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Page 10: 6.1メタアナリシス revman practice

次へ

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Page 11: 6.1メタアナリシス revman practice

Full reviewを選択11

Page 12: 6.1メタアナリシス revman practice

次へ

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Page 13: 6.1メタアナリシス revman practice

Reviewの名前を入力13

Page 14: 6.1メタアナリシス revman practice

Meta-analysisする研究のリストを入力しましょう14

Page 15: 6.1メタアナリシス revman practice

Meta-analysisする研究のリストを入力しましょう15

Page 16: 6.1メタアナリシス revman practice

Meta-analysisする研究のリストを入力しましょう16

Page 17: 6.1メタアナリシス revman practice

Add Studyを押す17

Page 18: 6.1メタアナリシス revman practice

お手元のリストの Study IDを入れる18

Page 19: 6.1メタアナリシス revman practice

お手元のリストの Study IDを入れる19

Page 20: 6.1メタアナリシス revman practice

今回は名前だけ入れて終わり

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Page 21: 6.1メタアナリシス revman practice

1つ目入りました

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Page 22: 6.1メタアナリシス revman practice

つぎつぎ入れます

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Page 23: 6.1メタアナリシス revman practice

全部入れます

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Page 24: 6.1メタアナリシス revman practice

入れ終わったらデータを入れます

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Page 25: 6.1メタアナリシス revman practice

Meta-analysisする index test名を入れる25

Page 26: 6.1メタアナリシス revman practice

Meta-analysisする index test名を入れる26

Page 27: 6.1メタアナリシス revman practice

Meta-analysisする index test名を入れる27

Page 28: 6.1メタアナリシス revman practice

入りました

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Page 29: 6.1メタアナリシス revman practice

BNPのデータを入れる29

Page 30: 6.1メタアナリシス revman practice

Meta-analysisする研究をすべて選択して Finishを押す

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Page 31: 6.1メタアナリシス revman practice

データテーブルが出来ました

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Page 32: 6.1メタアナリシス revman practice

データを入れます

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Page 33: 6.1メタアナリシス revman practice

データを入れました

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Page 34: 6.1メタアナリシス revman practice

Analysisを右クリック34

Page 35: 6.1メタアナリシス revman practice

Add Analysisをクリック35

Page 36: 6.1メタアナリシス revman practice

名前を BNPに36

Page 37: 6.1メタアナリシス revman practice

Single test を選ぶ37

Page 38: 6.1メタアナリシス revman practice

チェックを選ぶ

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Page 39: 6.1メタアナリシス revman practice

Finishを押す39

Page 40: 6.1メタアナリシス revman practice

データを入れました

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Page 41: 6.1メタアナリシス revman practice

Mores-Rittenbergモデルの sROCができました!41

対称にしかならないのがポイント

Page 42: 6.1メタアナリシス revman practice

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後半の目標

• 与えられた 1検査についてのデータセットとパラメータから Bivariate modelを用いて、 Revman5.3を用いて sROCとsummary pointを描くことができる

Page 43: 6.1メタアナリシス revman practice

データを入れました

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Page 44: 6.1メタアナリシス revman practice

Bivariateを選ぶ44

Page 45: 6.1メタアナリシス revman practice

空白を選んでお手元のパラメータを入れます

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Page 46: 6.1メタアナリシス revman practice

お手元の統計ソフトで推定したパラメータを入れます

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Page 47: 6.1メタアナリシス revman practice

注意:オレンジのところにデータは入れません

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Page 48: 6.1メタアナリシス revman practice

チェックを入れます

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Page 49: 6.1メタアナリシス revman practice

出来上がり

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Page 50: 6.1メタアナリシス revman practice

点線の意味

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外側の点線= 95% 予測区間 : 新規の研究があったときのその研究の推定値が入る範囲 内側の点線= 95% 信頼区間 : 新規の研究があったときの統合推定値が入る範囲

Page 51: 6.1メタアナリシス revman practice

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後半の目標

• 与えられた 1検査についてのデータセットとパラメータから Bivariate modelを用いて、 Revman5.3を用いて sROCとsummary pointを描くことができる

Page 52: 6.1メタアナリシス revman practice

補足  Stataで作ったデータシートの作り方52

Page 53: 6.1メタアナリシス revman practice

Excel / CSVファイルを貼り付け53

Page 54: 6.1メタアナリシス revman practice

Commandのボックスに“ describe”と入力し Enter54

Page 55: 6.1メタアナリシス revman practice

“ssc intall metandi, replace”と入力して Enter55

Page 56: 6.1メタアナリシス revman practice

“metandi tp fp fn tn”と入力して Enter56

出来上がり !!

Page 57: 6.1メタアナリシス revman practice

Cochrane trainingでムービーもあります

http://training.cochrane.org/authors/dta-reviews

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Page 58: 6.1メタアナリシス revman practice

参考文献

・ Handbook for DTA Reviews [internet] available from http://srdta.cochrane.org/handbook-dta-reviews・ Takwoingi Y. Meta-analysis of test accuracy studies in Stata: a bivariate model approach. Version 1.0. November 2013. Available from: http://srdta.cochrane.org/

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