6goc - nucleus · 1975 det første komplette dna-genom fra bakteriofag φx174 sekventeres 1977 det...
TRANSCRIPT
1953 Watson og Crick publicerer modellen for DNA-molekylets opbygning1960 Messenger-RNA opdages1962 Watson og Crick modtager Nobelprisen i medicin for deres opdagelse af DNA’s opbygning1966 Den genetiske kode knækkes. Man finder ud af at 3 RNA-baser ad gangen koder for en aminosyre1970 Restriktionsenzymer opdages1972 Man opdager at der er 99 % lighed mellem menneskets DNA og DNA fra gorillaer og chimpanser1973 Cohen og Boyer udfører den første gensplejsning på bakterier1975 Det første komplette DNA-genom fra bakteriofag φX174 sekventeres1977 Det første menneskegen udtrykkes i bakterier Det første genteknologifirma producerer medicin via gensplejsede mikroorganismer Sanger udvikler en metode til DNA-sekventering, altså DNA-sekvensbestemmelse1978 Humaninsulin produceres via gensplejsede mikroorganismer1980 Et amerikansk oliefirma opnår patent på en genmodificeret olieædende bakterie1981 Amerikanere producerer den første transgene mus Kinesere fremstiller den første klonede fisk – en guldkarpe Menneskeoncogener, altså cancergener, opdages1983 Fremstilling af det første kunstige kromosom Opdagelse af genetiske markører for alvorlige arvelige sygdomme1984 Etablering af DNA-fingerprinting, altså teknikken for at lave genetisk fingeraftryk Hiv-virus-genom klones og sekventeres1985 DNA-fingerprinting bruges i retssager Prøvedyrkning af genmodificerede planter1986 Kommerciel dyrkning af gensplejsede tobaksplanter tillades i USA Introduktion af PCR-metoden der kan opformere DNA1988 Det humane genom-projekt starter1989 Genmutationen for cystisk fibrose opdages1990 Pige med immunforsvarssygdom ADA behandles med genterapi Enzym dannet via gensplejsede mikroorganismer til osteproduktion kommer på markedet Transgen malkeko producerer menneskeproteiner i sin mælk1993 Markedsføring af gensplejset langtidsholdbar tomat1994 Brystkræftgen opdages1995 Første fuldstændige sekventering af en organismes DNA, bakterien Haemophilus influenzae Genterapi og antistoffer fremstillet via genteknologi anvendes til kræftbehandling1996 Fåret Dolly klones fra en yvercelle1997 Der udvindes DNA fra ca. 40.000 år gamle neandertalerknogler 1998 Anvendelse af embryonale stamceller til dannelse af væv Det første fulde dyregenom sekventeres fra nematoden Caenorhabditis elegans2000 Gensplejset ‘golden rice’ med højere A-vitamin-indhold Fremstilling af klonede svin der kan producere humane organer Malariamyggen gensplejses så sygdommen ikke så let spredes2001 Det humane genom publiceres2003 Japanske forskere laver gensplejset koffeinfri kaffebønne2004 RNAi-medicin anvendes, dvs. medicin der blokerer translation af mRNA til protein Første klonede kæledyr – en kat2009 Ny ‘switch’-metode skaber afgrænsede mutationer, og metoden giver håb om mulig voksen-stamcelleterapi på patienter med muskelsvindslidelser
DPi
Kromatinfiber
Deoxyribose
Kromosom
Histoner (protein)DNA
Strukturprotein
Phosphatgruppe
3’-ende
5’-ende
D DD D
Pi Pi Pi Pi Pi PiPi Pi
Pi Pi Pi Pi PiPiPi Pi
D D D D
D D DD D DD D
T T GA C TA T
T GA C T A AA
5CH2OH
C1
C3
4C
2C
OHO
HH H
HOH
H
a
H
NH2
C
N
N
HC C
CN
N
CH
O
C
NH
HN
C CH
C CH3
O
Thymin
DeoxyribosePhosphat (PO43-)
Symbol
A
G C
T
Symbol Symbol
Symbol
Symbol
O
H
C C
N
HN
C C
C
H2N
N
N
CH
Guanin
Adenin
SymbolDPi
P
O-
O-
O- O
CytosinH
NH2
N
N
CO CH
CH
b
ADPi
D GPi
TDPi
CDPi
a
3’
b
URPi
Pi CH2OH
C
C C
C
OHO
HH H
OHOH
H
Ribose
Symbol
R
Uracil
O
C
NH
HN
C CH
CH
O
U
Symbol
U
C A U G C A U G C A U G C A U G C A U G C A U G C
C U AA
GA
C
GA
C
GA
C
UG
A G
UG
A
UG
AG
5’
Phosphat (PO43-)
P
O-
O-
O- O
Tema 2
Figur 6. DNA-replikation.Bioteknologi 1 © 2009 · by Nucleus Forlag ·
· ISBN 978-87-90363-43-7.
TA
1. Helikase åbner strengen
2. DNA-polymerase sætternucleotider på den ledendestreng i 5’-3’-retningen
4. DNA-polymerasefylder hullerne udmed nucleotider i 5’-3’-retningen
3. DNA-polymerasesætter nucleotiderpå følgestrengeni 5’-3’-retningen
Primer
5. Hullerne lukkes
A 5’ 3’
5’
3’
5’
5’
5’
5’
3’
5’
3’
5’
3’5’
3’5’
3’
3’ 5’
3’5’T
A T
TA
AT
C G A TG
C T
G C
C G
T A
T A
T A
A T
G C
C G
T A
A
T A
A T
G C
C G
T A
T
TA
AT
AT
TA
GC
CG
met eller start
thr
asnlys
ser
arg
val
ala
aspglu
gly phe leuser
tyrStop
cysStoptrp
leu
pro
hisgln
argile
UCAG
UCAGUCAG
UCAG
UCAGUCAG
UCAG
UCAG
UCAG
UC
UC
UC
UC
UCUC
UC
AGAG
AG
AG
AG
AG
G
G
G G
G
AA
A
AA
C
C
C
C
C
U
U
U
U
U AG
RNA-kode
met eller start
thr
asnlys
ser
arg
val
ala
aspglu
gly phe leuser
tyrStop
cysStoptrp
leu
pro
hisgln
argile
AGTC
AGTC
AGTC
AGTC
AGTC
AGTC
AGTC
AGTCAGTC
AG
AG
AG
AG
AG
AG
AGTC
TC
TC
TC C
C
CC
C
TT
T
TT
G
G
G
G
G
A
A
A
A
A
TC
C
TC
T
DNA-kode
DNA RNA mRNA Protein
Transkription Translation
Gen
Promotor TerminatorExon
Intron
Exon
Intron
CCG
gly
asn glnvalalaarg
CAG
UUAGUCCGAGCUGUCAAUCAGGGCACGAUCUCG
Kerne
DNA
RNA
mRNA
tRNA
Aminosyre
RibosomrRNA
Cytoplasma
snRNA
TranskriptionTranslation
CellemembranCellevæg
Nydannet aminosyrekæde (protein)
Ribosom
5’
mRNA
Bakterie-DNA
’
Organisme Kromosomtal
Huskat 38
Hund 78
Ræv 34
Hest 64
Æsel 62
Svin 40
Ko 60
Husmus 40
Menneske 46
Gorilla 48
Orangutang 48
Høne 78
Alligator 32
Salamander 24
Bananflue 8
Husflue 12
Kartoffel 48
Tomat 24
Sojabønne 40
Ris 24
Majs 20
Slangetungeart (en bregne) 1320
Frytleart (en halvgræs) 6
T GA A C
Et STR (Short Tandem Repeat) eksempel kunne være dette
Her er ATTCG basesekvensen gentaget tre gange
T GA A
T T GA
D
C T TA GC T T GA C
C T GA A C
PiD
PiD
PiD
PiD
PiD
PiD
PiD
PiD
PiD
PiD
PiD
PiD
PiD D
D D D D D D D D D D D D D D D
Pi
Pi Pi Pi Pi Pi Pi Pi Pi Pi Pi Pi Pi Pi Pi
T GA A C
Hc16
15
13
13
21
24
26
28
31
32
35
H
Gruppe I – Dobbeltstrenget DNA-virus (dsDNA)
• Adenoviridae • Herpesviridae (skoldkopper, mononukleose) • Papillomaviridae • Papovaviridae (fodvorter) • Poxviridae (kopper)
Gruppe II – Enkeltstrenget DNA-virus (ssDNA)
• Nanoviridae • Parvoviridae (lussingesyge/5. børnesygdom)
Gruppe III – Dobbeltstrenget RNA-virus (dsRNA)
• Reoviridae
Gruppe IV – Positivt polariseret enkeltstrenget RNA-virus (+ssRNA)
• Togaviridae (røde hunde og gul feber) • Coronaviridae (fugleinfluenza) • Picornaviridae (polio)
Gruppe V – Negativt polariseret enkeltstrenget RNA-virus (-ssRNA)
• Rhabdoviridae (hundegalskab) • Orthomyxoviridae (influenza A, B og C) • Paramyxoviridae (Newcastle disease, fåresyge og mæslinger) • Filoviridae (Ebola og Marburg-feber)
Gruppe VI – Reverstranskriberende enkeltstrenget RNA-virus (ssRNA-RT)
• Retrovirus (hiv)
Gruppe VII – Reverstranskriberende dobbeltstrenget DNA-virus (dsDNA-RT)
• Hepatitis B (smitsom leverbetændelse)
Fælles stamfar
Bakterier Archaea Eukaryoter
Thermotoga
FlavobakterierCyanobakterier
Purpurbakterier Gram-negative bakterier
AquifexDiplomonader
Microsporidier
PyrodictiumThermokokker
Methanopyrus
Methanokokker ThermoplasmaThermoproteus
Skimmel-svampeMethanobakterier
Halobakterier Entamoeba Dyr
Svampe
Ciliater
Flagellater
Planter
DNA-molekyle
3’ 5’5’ 3’
3’ 5’
3’ 5’
5’ 3’
5’ 3’
3’ 5’5’ 3’
3’ 5’5’ 3’
3’ 5’5’ 3’
3’ 5’5’ 3’
3’ 5’5’ 3’
3’ 5’
5’ 3’
3’ 5’
5’ 3’
Primer
Første cyklus Anden cyklus
Osv.
Ved ca. 90 ˚C bliver DNA delt i to enkelt-strenge
Temperaturen sænkes til ca. 60 ˚CPrimere hæfter sig på de to enkeltstrenge, og DNA-polymerase tilkobler frie nucleo-tider. Resultatet er to DNA bestående af en ny og en gammel streng
Temperaturen sænkes til ca. 60 ˚C, og DNA bliver dobbeltstrenget vha. primere og DNA-polymerase og frie nucleotider
Processen fortsætter ved at hæve og sænke temperaturen til man har en stor mængde af de samme DNA
Temperaturen hæves til ca. 90 ˚C, og DNA adskilles i enkelt-strenge
BamHI
EcoRI
HindIII
T
G
G A
GA
A
C
G
A A T T C
C
C C T A G
A A
G
A
AG
G
C TT
CT T
TTC
+
-Negativ pol DNA-stykkernes vandringsretningStore DNA-stykker
Små DNA-stykker
Påsætningsbrønde
Størrelses- 1 2 3markør
Positiv pol
Skabelonstreng
Strengen denaturerer
Smeltning
Primer
dGTP, dCTP, dATP, dTTP
Fluorescerende ddTTP, ddCTP, ddATP, ddGTP
DNA-polymerase
T G A A T G
TA
GC
AT
AT
TA
GC
CG
TA
CG
GC
AT
TA
AT
AT T C A C
A C T T A CCG
TA
CG
GC
AT
TA
A AT
GT T C A C
TA
GC
AT
AT
TA
GC
CG
TA
CG
GC
AT
TA T T T C A C
TA
GC
AT
AT
TA
GC
CG
TA
CG C T A T T T C A CT
A
5’
3’
G
C
A
T
A
T
T
A
G
C
C
G
T
A
C
G
G
C
A
T
T
A
A
T
A
T
A
T
G
C
T
A
G
C
3’
5’
TA
5’3’
GC
AT
AT
TA
GC
CG
TA
CG
GC
AT
TA
AT
AT
AT
GC
TA
GC
3’5’
T G A A T G
A
Art 1
100
50
070 80 90 °C
100
50
070 80 90 °C
% enkeltstrenget DNA
% enkeltstrenget DNAHybrid-DNA
Ts
Smeltekurver
Smeltning
Hybridisering
Smeltning
Art 2
Ts
DNA
mRNA
Kunstigt RNA
Transkription Translation
Protein Aminosyrer
Ribosom
Cellen tilføres dobbelt-strenget RNA der er komplementært til det man vil slukke
RISC tilføres udefra eller aktiveres af cellen selv.
RISC spalter siRNA til enkeltstrenget RNA
Dicer-enzymet klipper dsRNA i stykker til siRNA
Dicer-enzym
Cellemembran
Det aktive RISC-kompleks binder sig til mRNA fra det gen man vil ’slukke’
Aktivt RISC-kompleks
siRNA
mRNA
Nedbrudt mRNA
Enzymerne i RISC-komplekset nedbryder mRNA så der ikke bliver dannet noget protein
dsRNA
RISC
RISC kobler sig til siRNA
+ -
1
2
3
4
Kombineret mikroelektrode og mikropipette
Celler
RNA eller DNA
RNA eller DNA
Cellemembran med midlertidige porer
Celle med lukket cellemembran og optaget RNA eller DNA
Cellekerne
Elektriske impulser