Ácidos nucleicos - simbiotica
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DNA,RNATRANSCRIPT
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29/03/2015 cidosNucleicossimbiotica.org
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Naturezaqumicados
cidosnucleicos
Isolandoepurificandoocontedonuclear,foipossvelidentificarosseusconstituintes.Estespodemseragrupadosemtiposfundamentais:
cidofosfricopresenteemambosostiposdecidosnucleicos,oresponsvelpelocarctercidodestasbiomolculas
Pentosesosglcidosde5carbonospresentespodemserdedoistipos:
RiboseC5H10O5estpresentenocidoribonucleico(RNA),sendoaorigemdasuadesignao
Desoxirribose C5H10O4 est presente no cido desoxirribonucleico (DNA), sendo, novamente, a responsvel pela suadesignao.
Basesazotadasexistemcincotiposdebasesazotadasdiferentes,quepodemserdivididasemdoisgrupos.
Basesazotadaspricasoudeanelduploadenina(A)eguanina(G)
Basesazotadaspirimdicasoudeanel simplescitosina (C), timina (T)presenteapenasnoDNA euracilo (U) presenteapenasnoRNA.
Oscidos nucleicos so polmeros emque osmonmeros se designamnucletidos.Essa unidade bsica vai, ento, ser composta por umelementodecadaumadascategoriasanteriores(umfosfato,umapentoseeumabaseazotada).Adesignaodonucletidoderivadabaseazotada que entra na sua composio: nucletido adenina, nucletido citosina, nucletido guanina, nucletido timina e nucletido uracilo.Quandoaumnucletidoseretiraogrupofosfatoobtmseumnuclesido(pentosemaisbaseazotada).
Paraformarcadanucletidoocorremreacesdecondensao,estabelecendose ligaesentreogrupo fosfatoeocarbono5dapentoseeentreabaseazotadaeocarbono1dapentose.
Estesnucletidospodemunirsesequencialmente,originandoumacadeiapolinucleotdica.Oscidosnucleicospodemestarorganizadosemcadeiasimplesoudupladenucletidos,unidosatravsdapentosedeumeogrupo fosfatodeoutro:quandoumacadeiaestem formao,cada novo nucletido ligase seu grupo fosfato ao carbono 3 da pentose do ltimo nucletido da cadeia. Assim, sempre que um nucletidoapresenta o seu carbono 3 livre pode ligarse a outro. Por este motivo, as cadeias polinucleotdicas de DNA ou RNA crescem sempre nosentido5"3.
EstruturadoDNA
Assim,combaseemnumerosasexperinciasrealizadaspordiversosinvestigadores,em1953JamesWatsoneFrancisCrick,daUniversidadedeCambridge,apresentaramumapropostadeestruturaparaoDNA.Osdadosemquesebasearamforam:
HumaconstncianocontedodebasesnoDNAdecadaespcie
AcomposiomdiaembasesdoDNAdiferedeespcieparaespcie
Arazoentreaadeninaeatiminaeentreacitosinaeaguanina,nasvriasclulas,sempreaproximadamenteiguala1
Asomadaspurinassempreigualsomadaspirimidinas(deduzidoapartirdoanterior)
FotografiastridimensionaisrevelaramumagranderegularidadenoarranjoatmicodasmolculasdeDNA
FotografiasderaioXrevelamumaestruturahelicoidal.
Esta hiptese, posteriormente comprovada, valeulhes oprmioNobel em1962.Segundoestemodelo, cada cadeiade DNA formada por duas cadeias polinucleotdicasenroladas helicoidalmente em volta do mesmo eixo,comoumaescadadecaracol.
DestaestruturadoDNAsalientase:
Os lados da molcula (os corrimes da escada decaracol) so formados por grupos fosfato alternadoscom desoxirribose, enquanto os degraus da escada,aocentro,soparesdebasesazotadasligadasentresiporponteshidrognio
As bases azotadas emparelhadas nos degraus socomplementares,ou seja, a adenina ligase timinaporduaspontesH(A=T)ecitosina ligaseguaninaportrspontesH(C=G)
As duas cadeias polinucleotdicas desenvolvemseemsentidos opostos cadeias antiparalelas , cadauma iniciandose uma extremidade 5 e terminandonumaextremidade3
Apesardeapenasexistiremapenas4tiposdiferentesde nucletidos no DNA, dado que cada um delespode estar presente em quantidades variveis eelevadas, a sequncia de bases de cada cadeiapolinucleotdica ter bilies de possibilidades,permitindoquecadaindivduotenhaumDNAnico.
O DNA est sempre localizado no ncleo da clula, comexcepo do DNA original das mitocndrias e doscloroplastos.AquantidadedeDNAdeum indivduo igualemcadaumadassuasclulas,ondesemantmconstante(comexcepodoperodomittico).
Podeseagoracompreenderque,sendooDNAosuportedainformaogentica,osgenesnosomaisquesegmentosde cadeias polinucleotdicas que codificam determinadacaracterstica. Cada gene pode ser composto por milhares
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EstruturacomparativadoDNAedoRNAde pares de nucletidos. Nos quase dois metros de DNApresente no ncleo de cada clula humana, existemmilharesdegenes.
Ogenomacorrespondeaoconjuntodosgenesedainformaogenticadeumdadoindivduo.
EstruturadoRNA
Ocidoribonucleico,ouRNA,formamolculasmuitomenoresqueasdoDNA.Nasuagrandemaioria,oRNAencontrasenocitoplasma,ondedesempenhadiversas funes relacionadascomaconstruodeprotenas,ouseja, fazchegara informaocontidanoDNAaoexterior doncleo.
ORNAumcidonucleicodecadeiasimples, contendoapentose riboseeasbasesazotadasadenina, citosina, guaninaeuracilo (vejaimagemacima).
Conformaafunoquedesempenha,oRNAapresentaformasdiferentes,podendomesmoapresentarzonasdobradassobresimesmo,emqueacadeiaseemparelhaporligaesA=UeC=G.
ExistemtrstiposdiferentesdeRNA:
RNAribossmicoouRNArrepresentacercade80%doRNApresentenaclula.Tem,emmdia,cercade3700nucletidos.umamolculalargaedobradaque,associadaaprotenas,formaoribossoma,organitoscitoplasmticosquecoordenamasnteseproteica
RNAdetransfernciaouRNAtrepresentacercade15%doRNAdaclulaetem,emmdia,75nucletidos.Emboraformadaporumanicacadeiadenucletidos,dobrasesobresiprpriodeumaformacaracterstica(emfolhadetrevo),originandozonasdecadeiadupla.EmtodasasmolculasdeRNAtalgumascaractersticassocomuns:
Extremidade5fosforilada
Extremidade3temasequnciaCCA,comaadeninaligadaaumgrupohidroxiloOH),localdeligaodoaminocidoactivadopeloATP,originandoocomplexoRNAtaminoacil
Nucletidosquenoestabelecempontesdehidrognioentresioriginamquatroansas(azonaalargadaqueformaasfolhasdotrevo):naansa1ligaseaenzimaquecatalisaasreaces,aansa2oanticodo(sequnciade3nucletidoscomplementaresdecadacododoRNAm),naansa3ligaseoribossomaeaansa4formadapelasextremidades3e5,ondeseligaoaminocido
RNAmensageiroouRNAmpresenteembaixapercentagemnaclula(cercade5%),temumtamanhomuitovarivel.Estamolculatemvidamuitocurta,apenastransmiteamensagemdoDNAdoncleoparaocitoplasma.
AquantidadedeRNApresentenumacluladependeemgrandeparteda taxametablicada clula (quantomaior esta for,maisRNAestarpresente).
Replicao AmolculadeDNAafontedeinformaodaclula,logodeverserumamacromolculacomumaltograudeorganizao.Estaorganizaotraduzidapelasequnciadenucletidos,deacordocomumaordemespecficaparacadaindivduo.
AclulatemacapacidadedereproduzirainformaocontidanoDNA,formandooutramolculaigualprimeira,atravsdoprocessoconhecidoporreplicao.
Antesdesecomearareplicar,oDNAseparasedashistonas,aquesesegueodesenrolamentodaduplahlice.
Duranteareplicao,ouseja,duranteaformaodarplicaoucpia,asduascadeiaspolinucleotdicascomeamporseseparar,poracodeumaenzimaquequebraasponteshidrognioentreasbasesazotadascomplementares.Esteprocessoocorreemvrioslocaisdamolculamepontosdeiniciaoprosseguindoemambosossentidosatquetodaamolculaestejareplicada.Cadaumadestasbolhasdereplicaodesignasereplico.Cadaumadascadeiasmevaiservirdemoldeprimerparaasntesedacadeiacomplementar,porincorporaodenovosnucletidos,presentesnaclula.
Deseguida,formaseacadeiacomplementaracadaumadascadeiasme,poradioenzimticaDNApolimerasesdenucletidospresentesnaclula.Osnovosnucletidossoadicionadossegundoaregradasbasescomplementares,garantindo,assim,queanovacadeiasejaigualhquejexistia.
Comojsesabe,ascadeiaspolinucleotdicassoantiparalelas,ouseja,umaencontraseorientadanosentido53eaoutranosentido35.ComotodasasDNApolimerasessintetizamacadeiapolinucleotdicanosentido53,acadeianovacomessaorientaocrescerporadiocontnuadenovosnucletidos.Noentanto,acadeiacomorientao35terqueresultardauniodepequenossegmentos,sintetizadospreviamentenosentido53.AuniofeitaenzimaticamentepelaDNAligase.
Assim,cadacadeiafilhaconstitudaporumacadeiavelhaeporumacadeianova,antiparalelas.Poressemotivo,areplicaodizseumprocessosemiconservativo,queasseguraamanutenodascaractersticasdaespcie.
Estemecanismodereplicaocomumatodososorganismos,sejameleseucariontesouprocariontes.Noentanto,nosprocariontes,areplicaoiniciasenumnicopontodacadeiapolinucleotdicaeprossegueatterminar.IstopossvelpoisnestesorganismosapenasexisteumamolculadeDNAeporqueoseucomprimentomuitomenorqueodoDNAeucarionte.
Apesardefcildecompreender,estemecanismoestlongedesersimplesdopontodevistabioqumico,envolvendonumerosasenzimasemecanismosdesegurana,emborabastanterpido.
Estemodelodereplicaonofoionicoproposto,tendosidoigualmentepropostosoutrosdoismecanismos,quepareciamviveis:
Replicaoconservativasegundoestemodelo,amolculamemantinhasentegra(seriaconservada),apenasservindodemoldenovamolcula.Estaseriaformadaporduascadeiasconstrudasapartirdenucletidospresentesnaclula
Replicaodispersivanestemodelo,amolculameseriadistribuda,empores,pelasduasmolculasfilhas,asquaisseriamconstitudasporumamisturadenucletidosnovoseantigos.
CdigoGentico
Seapenasusssemosumabasepara representarumaminocidoapenas teramosprotenascom4 tiposdeaminocidos.Dadoque talnoacontece,teremosqueutilizarcombinaesdebasespararepresentaraminocidos.
Nopodemosterapenasparesdebasespoisassimapenasseriamcodificados16(42)aminocidos,logoteremosqueusartripletos,ouseja,conjuntosde3bases,quenospermitemcodificar64(43)possibilidades,muitasmaisdoqueasquenecessitamos.Esseconjuntode3basesquecodificamumaminocidodesignasevulgarmentecodo.
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Estecdigogenticoemalgumascaractersticasimportantes:
Universalidadeestetipodecodificaoemtripletosusadapor todaaVidanaTerra,desdeosorganismosmaissimples,comoasbactriasouosvrus,aosmaiscomplexos.Estauniversalidadegarantequeocdigo tersurgidomuitocedonaevoluodaVidanaTerra,provavelmentelogonoprimeiroancestralprocariontedosorganismosactuais
Redundncianocdigoexistemvrioscodescomomesmosignificado,identificandoomesmoaminocido,consequnciadirectadofacto de haver um nmero superior de tripletos do que de aminocidos. Por estemotivo, a terceira base de cada tripleto amenosespecfica(oaminocidoarginina,porexemplo,podesercodificadopeloscodesCGU,CGC,CGAeCGG)
Objectividadeocdigonoambguo,cadacodoapenascodificaparaumaminocido,nogerandoconfuses
Tripleto AUG tem dupla funo codifica o aminocido metionina e um codo de iniciao da sntese proteica (logo todas asprotenas comeam com este aminocido). Esta situao, no entanto, apenas se aplica aos organismos eucariontes e sarqueobactrias
Tripletos UAA, AAG, UGA so codes de finalizao estes codes aparentemente sem sentido, indicam o momento de fim desntese,nocodificandoaminocidos.
Um tripleto, portanto, corresponde menor unidade da informao gentica, sendo a sequncia de tripletos no DNA a responsvel pelasequnciadeaminocidosnumaprotena.Noentanto,oDNAcontma informaoparaaconstruomasnoacapacidadedeconstruireleprprioasprotenas.Esseprocessoocorrenosribossomas,organitoscitoplasmticos.
Comochegaaocitoplasmaessainformao?
SnteseProteica
Apassagemdalinguagemdoscidosnucleicosparaalinguagemdasprotenasocorreemduasetapas:
TranscriocpiadasequnciadebasesdoDNAparaumacadeiacomplementardeRNAm,quepassadoaocitoplasma.Estaetapadecorrenoncleo,maisexactamentenonuclolo.ApenasumacadeiadeDNAusadacomomoldeparasntesedeRNAm,segundoaregradoemparelhamentodebases.EstasntesecomandadapelaenzimaRNApolimerase,quedeslizaaolongodeumtroodeDNA,abrindoacadeiaeiniciandoasntese,semprenosentido53.ApsapassagemdaRNApolimeraseacadeiadeDNAvoltafechar,formandose as pontes H entre as bases. Aps a sntese deste RNAprmensageiro inicial ocorrem alteraes: sequncias nocodificantesintressocortadaseassequnciascodificantesrestantesexessounidasentresi,formandooRNAm funcional,quemigraparaocitoplasma
Traduoproduoda protena, segundoa sequncia de codes doRNAm, coma ajuda dosRNAt eRNAr. Esta etapa decorre nocitoplasma, em eucariontes quase sempre nas membranas do retculo endoplasmtico rugoso, onde os ribossomas esto inseridos.Nestecaso,asprotenassintetizadassoenviadasparaointeriordascisternasdoRER,sendodepoisdistribudasportodaaclula.Emprocariontes,quenoapresentamsistemasmembranares,osribossomasestodispersosnocitoplasma.Oprocessotem3etapas,porsuavez:
IniciaooRNAm ligase ao ribossoma na subunidade grande (atravs do RNAr). O RNAt iniciador transporta o aminocidometioninaatsubunidademenordoribossoma
Alongamento sequencialmente, um novo RNAt transporta um novo aminocido at ao ribossoma, ligandose ao codo. Hformaodeuma ligaopeptdicaentre o aminocido que chegae os anteriores e o ribossomaavana3 basesnoRNAm. Oestabelecimentodestasligaesrequerenergia,fornecida,comosempre,pordegradaodemolculasdeATP
Finalizaooscodes de finalizao j referidos no tmanticodo complementar, pelo que quando o ribossoma atinge umdeles,asnteseacaba,acadeiapolipeptdicadestacase,podendosofrer transformaesposterioresnoretculoenoGolgi. Assubunidadesdoribossomaseparamseeficamlivresparainiciarnovasntese.
Asnteseproteicatemcaractersticasfundamentaisparaasuafuno:
Complexidade so inmeros os intervenientes neste processo, entre enzimas, vrios tipos de cidos nucleicos e molculasfornecedorasdeenergia
Rapidezumaclulaeucariticapodeconstruirumaprotenacom140aminocidosem2minutos,mantendotodoorigordoprocesso
Amplificao a mesma zona do DNA pode ser transcrita vrias vezes, formandose vrias molculas de RNAm idnticas, o quecompensaasuacurtadurao.Outraformadeaceleraroprocessoutilizarpolirribossomas,ouseja,vriosribossomasvolendoamesmamolculadeRNAm,emsequncia,produzindocadaumasuaprotena.
Estruturadoscromossomaseucariticos
Desdemuitocedonautilizaodomicroscpio,queseobservavamnoncleoestruturasquecoravamdevermelhoouvioletacomcorantesbsicos.Osinvestigadoresapelidaramessasestruturascromossomas,literalmente,corposcorados.
Observaessubsequentesmostraramquecadaespcietemumnmerocaractersticodecromossomasporncleo:asclulashumanastm46,asdosperustem82ealgunsfetoschegamater1000cromossomas.
Oscromossomasdecadaespcietmumamorfologiacaracterstica,relativamenteaotamanhoeforma.Assim,oconjuntodecromossomasdeumaclulacaracterizaumaespcieepassaadesignarsecaritipo.
Vistoaomicroscpioptico,ocromossomacoradoparecesecomumpequenocorposlidoeflexvel.Noentanto,ocromossomanoumaestruturaslida,sendoantescompostoporumalongacadeiadeDNAenroladoemespiral(35%),associadoaprotenashistonas (60%)eRNA(5%).
ODNAeucariticotemvriosnveisdeenrolamento:
Duplahliceenrolamentodasduascadeiaspolinucleotdicasemvoltaumadaoutra
Nucleossomacercade200paresdebasesdaduplahliceenrolaseemvoltadeumconjuntode8subunidadesdehistona
Solenideousuperhliceconjuntosdenucleossomasdispemsehelicoidalmente,formandoumcilindroflexvelcomcercade30mdedimetro.Cadasolenideformadopor6nucleossomas.
Cadacromossomaapresentaumaconstriomaisoumenoscentraldesignadacentrmero.Seumcromossomativer1cmdecomprimento,amolculadeDNAqueocompemteria,quandoesticada,ocomprimentodeumcampodefutebol.
Estematerialgenticopodeapresentarsesobduasformas:
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Eucromatina tambmdesignadacromatinadispersa,estpresentequandoaclulanoseencontraemdiviso,dispersanoncleosobaformadefilamentosfinoselongos
Heterocromatinatambmdesignadacromatinacondensada,formasequandoaclulasepreparaparasedividir,formandofilamentoscurtoseespessos,comgrandeafinidadeparaoscorantes(cromossomas).
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