1ª Reunión de la RED DE BIOSENSORES Madrid, 13-02-07

ACTIVIDAD EN BIOSENSORES DEL ÁREA DE CONOCIMIENTO DE BIOTECNOLOGÍA

El Centro Tecnológico

SISTEMAS DE CALIDAD

Proyectos realizados bajo ISO 9001: 2000

Certificado GLP nº 10.BPLI/98.01/001 MSC

Laboratorios de contención de riesgo biológico nivel 2 y 3

Desarrollo de biochips en basadosmicrofluídica y microelectrónica con

aplicación en diagnóstico

Áreas de trabajo: •Genómica •Proteómica •Anatomía-Patología •Ontología clínica

Modelos: •Lineas Celulares (in vitro) •Muestras Human

Diagnóstico/Pronóstico

Biomarcadores: - Anticuerpos - Proteínas - RNA - DNA

Micro-chip Integral

Desarrollo de Biosensores

Líneas de Trabajo

BIOCHIP 1. EXTRACCIÓN DE ADN:

El objetivo de este biochip es desarrollar un sistema miniaturizado capaz de realizar la extracción rápida de ADN a partir de un modelo biológico.

BIOCHIP 2. MICRO-PCR DE FLUJO:

El objetivo es desarrollar un biochip capaz de realizar reacciones de PCR o amplificación del ADN a flujo continuo y alta velocidad (15 minutos). Gran versatilidad por ser un equipo portable que puede realizar análisis on line (en continuo) y on site.

BIOCHIP 3: DETECCIÓN DNA:

El objetivo es el desarrollo de un biosensor que básicamente es un módulo automatizado y miniaturizado capaz de detectar moléculas específicas de ADN electroquímicamente, magnéticamente y ópticamente.

BIOCHIP 1. Extracción de ADN

Sistema de captura inmunomagnética del analito

MezclasMuestra

(1)ExtracciónRNA / DNA

(2)

RTPCR(3)

Residuos

1 ml.Muestra

InmunomagneticBeads

Agua de Lavado

Agua de Lavado

Buffer de Lisisy / o DNAasa

Reactivos PCR(Bombeo)

Reactivos RT-PCR

Bombeomuestra

PCR

(1) IMÁN(2) BASE CON CALOR (95º C)(3) BASE CON CALOR (≈50º C)

Puesta a punto a escala laboratorio

AB

BIOCHIP 2. Micro-PCR de flujo

PCR Amp/Cycle Graph for CY5-635

2/3

4

H2O4

S. typhimurium2/3

Marker1

SampleLane

S. typhimurium histone H1-like protein (hns) gene

TACCAAAGCTAAACGCGCAGCTCGTCCGGCTAAATATAGCTAT

GTTGACGAAAACGGTGAAACTAAAACCTGGACTGGCCAGGGTCGTACACCGGCTGTAATCAAAAAAGCAATGGAAGAACAAGGTAAGCAACTGGAAGATTTCCTGATCA

BIOCHIP 3. Transducción electroquímica

Especificidad. Evitar uniones inespecíficas

Orientación. Favorecer hibridación con cadena complementaria ADN

Densidad en superficie. Mejorar sensibilidad.

Estabilidad. Capacidad de reutilización

Unión de la sonda de ADN a la superficie de oro

Unión del ADN a la superficie de oro por grupo tiolSAM (Self Assembled Monolayers)

Detección AFM (Atomic Force Microscopy)

Detección Electroquímica

Productos de amplificación de E.coli utilizando los primers B-Eae-3D y Eae-1R

Proyectos más significativos en Biosensores del equipo de trabajo

OptolabCard. Mass Produced Optical Diagnostic Labcards Based on Micro andNano SU8 Layers. STREP-016727. ParticipantMycoPlex: Development of innovative inmuno-PCR assay for the detection andquantification of ochratoxin and afalatoxin in complex matrices (milk, coffee) COOP-CT-2.004-513145. ParticipantMycoSens: Development of a novel test sensor for the rapid on-site determinationof mycotoxins in food. CRAFT-1999-70556. ParticipantSmartHealth. Smart Integrated Biodiagnostic Systems for Healthcare. IP-016817 .ParticipantNILSIS: Nanostructures functionalization for protein targets immobilisation. MEC CICYT. TEC2006-13910-C03-03/MICBIOMAG: Development of immunocapture techniques to detect E.coli.spp MEC CICYT. TEC2004-04975-C03-03/MIC

Publicaciones del equipo de trabajo en Biosensores

Berganza, J., Olabarria, G., Garcia, R.,Verdoy, D., Rebollo, A., and Arana,S.. DNA microdevice for electrochemical detection of Eschericchia coli0157:H7 molecular markers. Biosensors & bioelectronics, 2.007 in press .Micro SU-8 chamber for PCR and fluorescent real time detection ofSalmonella spp. DNA. Schulze, J.L.M., Verdoy, D., Berganza, J., OlabarriaG., Elizalde, J., Ruano-Lopez, J.M.. MICROTAS 2.006. Tokyo. Japan, November 2.006. Biosensor based on low magnetic field detectors developed with granular giant magnetoresistance (GMR) technology. Arana, S., Mujika, M., Sainz, L., Olabarria, G.. EMSA’06th European Conference on magnetic sensors andactuators . Bilbao. Spain, July 2.006DNA microdevice for electrochemical detection of E.coli O157:H7 molecular markers.. J. Berganza, G. Olabarria, R. García, D. Verdoy, A. Rebollo, S. Arana. BIOSENSORS 2006. Toronto Canada, May 2006Gold thin film planarization by thermal treatments for substrate of DNA self-assembled monolayers. A. Rebollo, S. Arana, E. Castaño, J. Berganza, G. Olabarria. EUROSENSORS XIX. Barcelona, September 2005