aktivitas induksi enzim hmg-coa reduktase oleh senyawa ... · 1 aktivitas induksi enzim hmg-coa...
Post on 30-Apr-2019
227 Views
Preview:
TRANSCRIPT
1
Aktivitas Induksi Enzim HMG-CoA Reduktase oleh Senyawa Aktif dari
Rimpang Bangle (Zingiber Purpureum) Secara In Silico
Ni Made Pitri Susanti1, Ni Kadek Warditiani
1, Ni Luh Putu Vidya Paramita
1, Luh Putu Febryana Larasanty
1
1Program Studi Farmasi, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas Udayana,
Bukit Jimbaran, Badung, Bali
Email: dekpitsusanti@unud.ac.id
Abstrak
Hiperlipidemia merupakan salah satu penyakit degeneratif akibat adanya gangguan
metabolisme lipid. Gangguan ini dapat ditandai dengan gejala klisis berupa peningkatan kadar
salah satu atau kombinasi dari kolesterol total, trigliserida dan LDL (Low Density
Lipoprotein) serta penurunan kadar HDL (High Density Lipoprotein). Bangle (Zingiber
purpureum) merupakan salah satu tanaman asli Indonesia yang secara empiris terbukti
memiliki aktivitas farmakologi sehingga berpotensi sebagai obat. HMG-CoA reduktase
merupakan salah satu enzim yang berperan dalam metabolisme lipid sehingga target obat
dengan menginduksi enzim ini akan memberikan pengaruh pada kadar lipid dalam darah.
Rimpang bangle (Zingiber Purpureum) diketahui memiliki senyawa biomarker terpenoid
(terpinen-4-ol) yang memiliki efek sebagai antioksidan. Pada penelitian sebelumnya, telah
ditemukan tiga senyawa lainnya yang merupakan kandungan aktif dari rimpang bangle.
Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui mekanisme penghambatan dari senyawa aktif
rimpang bangle pada enzim HMG-CoA reduktase dengan metode in silico.
Proses docking moleculer diawali dengan persiapan struktur 3D enzim HMG-CoA reduktase
menggunakan perangkat lunak chimera 1.10.1, optimalisasi struktur 3D senyawa uji
menggunakan perangkat lunak hyperchem 8 (semi-empiris AM1), validasi metode docking
molekuler dan doking senyawa uji ke enzim HMG-CoA Reduktase menggunakan perangkat
lunak Autodock 4.2. Analisis data dilakukan dengan parameter energi ikatan. Semakin rendah
energi ikatan antara senyawa uji dan enzim, semakin kuat dan stabil ikatan tersebut. Hasil
penelitian menunjukkan bahwa semua senyawa uji mampu mengikat enzim HMG-CoA
Reduktase dengan energi ikatan untuk keempat senyawa uji masing-masing -5,16; -6,00; -
4,57; dan -6,44 kkal / mol. Interaksi antara terpinen-4-ol dan tiga senyawa lain dengan
HMG-Coa Reduktase menunjukkan bahwa senyawa ini memiliki potensi sebagai
antihiperlipidemia dengan mekanisme induksi enzim HMG-CoA Reduktase.
Keywords: Rimpang bangle, HMG-CoA Reduktase, Antihiperlipidemia, In silico.
AKTIVITAS INDUKSI ENZIM HMG-COA
REDUKTASE OLEH SENYAWA AKTIF
DARI RIMPANG BANGLE (ZINGIBER
PURPUREUM) SECARA IN SILICO
Ni Made Pitri Susanti, Ni Kadek Warditiani, Ni Luh Putu Vidya Paramita,
Luh Putu Febryana Larasanty 1Program Studi Farmasi, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan
Alam, Universitas Udayana,
Bukit Jimbaran, Badung, Bali
Aterosklerosis
Penyakit
kardiovaskuler
Latar Belakang
HMG-CoA Reduktase,
SqS, NPC1L1, PPARα,
PPARγ and FXR << TC,
TG, LDL; >> HDL
Hiperlipidemia
(TC, TG, LDL,
HDL)
Obat Trasidional
Rimpang Bangle
(Zingiber Purpureum)
Back Ground
Terpinen-4-ol
Senyawa 1
Senyawa 2
Senyawa 3
Rimpang
Bangle
In Silico
Method
HMG-CoA
Reduktase
Metode
RMSD
<3 Å
Native ligand Protein tanpa
ligand
Protein Database (HMG-CoA
Reduktase)
Preparasi Protein
Redocking
(validasi)
Software
Autodock 4.2
Database
Senyawa aktif
rimpang bangle
Software Chimera
1.10.1
Protein +
Native ligand
Optimasi Senyawa aktif
Software HyperChem 8
Senyawa aktif
teroptimasi
Software
Autodock 4.2
Docking
Hasil
Struktur 3D HMG-CoA Reduktase PDB ID 3ccw
A B C D
Struktur 3D Terpinen-4-ol (A), Senyawa 1 (B),
Senyaw 2 (C) and Senyawa 3 (D)
Hasil Validasi
Protein RMSD (Å) Bond Energy
(Kcal/mol) Protein
Residu Gugus
HMG co A 1,31 -8,18
Asn755
Lys692
Lys691
Ser684
HD21-O4
HZ2-O3
HZ3-O4
HG-O6
Protein Bond Energy (KCal/mol)
Native ligan
Terpinen-4-ol Senyawa
1 Senyawa
2 Senyawa
3
HMG co- A
Reduktase -8,18 -5,16 -6,00 -4,57 -6,44
Terpinen-4-ol
Protein Bond Energy
(kCal/mol)
Protein
Residu Group
HMG Co-A
Reduktase -5,16
Asp690
Arg590
OD2-H
HH22-O
Senyawa 1
Protein Bond Energy
(kcal/mol)
Protein
Residu Group
HMG Co-A
Reduktase -6,00 - -
Senyawa 2
Protein Bond Energy
(kcal/mol)
Protein
Residu Group
HMG Co-A
Reduktase -4,57
Asp690
Lys691
OD2-H
HZ3-O
Senyawa 3
Protein Bond Energy
(kcal/mol)
Protein
Residu Group
HMG Co-A
Reduktase -6,44 Arg590 HH12-O
Konformasi hasil docking native ligand dengan protein HMG-CoA reduktase
Konformasi hasil docking Terpinen-4-ol dengan protein HMG-CoA
reduktase
Konformasi hasil docking Senyawa 1 dengan protein HMG-CoA reduktase
Konformasi hasil docking Senyawa 2 dengan protein HMG-CoA reduktase
Konformasi hasil docking Senyawa 3 dengan protein HMG-CoA reduktase
Kesimpulan
• Keempat senyawa uji dapat berinteraksi dengan protein
HMG-CoA Reduktase dengan energi ikatan terendah
sebesar -6,44 KKal/mol dari senyawa 3 (2- methoxy-8-
(3,4-dimethoxyphenyl)-1,4-napthoquinon).
• Interaksi antara terpinen-4-ol dan tiga senyawa uji
lainnya dengan protein target menunjukkan bahwa
senyawa ini memiliki potensi aktivitas antihiperlipidemia
dengan mekanisme penghambatan protein HMG-CoA
Reduktase
Terimakasih
Scanned by CamScanner
Scanned by CamScanner
Scanned by CamScanner
Scanned by CamScanner
top related