bakteriel)pathogeneseogsymbiose - mbg.au.dkmbg.au.dk/fileadmin/site_files/mb/uddannelse/... ·...
Post on 14-Jun-2019
214 Views
Preview:
TRANSCRIPT
Bakteriel pathogenese og symbiose Thomas Boesen
thb@mb.au.dk, bygn. 3120 lokale 104 www.bioxray.au.dk og www.pumpkin.au.dk
Øvrige medarbejdere: 1 speciale/kandidatstuderende, 2 bachelorstuderende
Molekylærbiologi: Ja Molekylær medicin: Ja Bioteknologi: Ja
Eksempler på studerede vekselvirkninger mellem overflade-‐receptorer og diverse adhæsiner, toksiner og signalmolekyler.
a) Krystalstrukturen af Exotoksin A (orange) i kompleks med Elongeringsfaktor 2 (rødt, blåt og gråt). Toksinet modificerer eEF2 og protein syntesen stopper medførende celledød. b og c) Toksinet eLerligner meget konserverede dele af ribosomet. 2
Baggrund
Mennesket er en superorganisme. Vi er koloniseret af en række forskellige mikroorganismer, primært bakterier – der er ca. O gange flere bakterieceller i og på kroppen i forhold Ol menneskeceller. Bakterierne har stor betydning for blandt andet vores immunforsvar og optagelse af føde – der er eksempelvis en sammenhæng mellem fedme og bakterie-‐mikrobiotaen i tarmen. 1 Derudover er sygdomme på grund af bakterieinfekOoner blandt de mest udbredte i verden.
Studiet af, hvordan bakterier vekselvirker med værtsorganismer, er derfor af stor betydning for forståelsen af de gavnlige og skadelige virkninger bakterie-‐kolonisering kan have på mennesker, planter og dyr. Udover det grundvidenskabelige aspekt, vil forskningsresultaterne således have medicinsk og bioteknologisk relevans.
Metoder
I laboratoriet anvendes en lang række metoder for at opnå en forståelse for struktur og funkOon af proteiner og kulhydrater involveret i samspillet mellem celler. Arbejdet omfaVer oLe kloning af det pågældende protein, ekspressions-‐analyser, mutaOonsstudier, proteinoprensning, cellearbejde, biokemisk og biofysisk karakterisering af proteinerne og protein-‐protein/protein-‐kulhydrat komplekser og endeligt forskellige metoder Ol strukturel analyse såsom ’small-‐angle X-‐ray scaVering’ og røntgenkrystallografi.
Et projektarbejde vil således give en bred inføring i en lang række molekylær-‐biologiske metoder.
Projekter
Projekter udbydes indenfor studier af bakterielle pathogenesefaktorer og deres substrater/værtscellereceptorer. Et eksempel er IgA proteasen, der udskilles fra en række sygdomsfremkaldende bakterier. Proteasen binder Ol Immunoglubulin A og kløver i hæhgselregionen mellem Fc og Fab. I projektet undersøges proteasens binding Ol substratet og en strukturel forståelse af denne vekselvirkning.
Adhæsiner er afgørende under infekOonsprocessen. De medierer vedhæLning af bakterierne Ol værtscellereceptorer og muliggør kolonisering og biofilmdannelse. I gruppen studeres en række adhæsiner og andre faktorer, såsom såkaldte ’nanowires’, som er vigOge i biofilmdannelse og energiudveksling mellem forskellige bakteriearter i og udenfor kroppen.
Aminosyretransporteren LeuT fra Aquifex aeolicus er et membranprotein, der betragtes som modelprotein for serotonintransporteren (SERT) fra mennesker. Der arbejdes på at opnå en bedre forståelse af transportmekanismen for LeuT og SERT.
Referencer: 1) Samuel, B. and Gordon, J. (2006). PNAS 103, 10011-‐10016. 2) Jørgensen et al., (2005). Nature 436, 979-‐984
B!
C!
From Spahn et al.
Eksempler på metoder anvendt i projektarbejder.
a
c
b
top related