dna as nukleat
Post on 25-Oct-2015
20 Views
Preview:
DESCRIPTION
TRANSCRIPT
ASAM NUKLEAT SEBAGAI MATERI GENETIK
KROMOSOM—GEN—DNA
KROMOSOM—GEN—DNA
Gen : Sekuen DNA yang
mengandung perintah penyandi (Kodon) untuk memsintesis protein tertentu
Beberapa sekuen DNA bertindak sebagai regulator ekspresi
Panjang gen ~3000 basa
KROMOSOM—GEN—DNA
KROMOSOM—GEN—DNA
Lokasi dan Fungsi DNA
Berada dalam inti sel Dikemas dalam
kromosom yang mengalami kondensasi
Sebagai materi genetik yang dapat diturunkan
Definisi DNA
Asam nukleat yang membawa informasi genetik untuk perkembangan dan fungsi sel organisme
Asam nukleat : merupakan polimer nukleotida
Nukleotida : struktur yang tersusun oleh gula pentosa, fosfat dan basa nitrogen
Nukleotida DNA
Komponen organik yang terdiri dari basa nitrogen, gula dan fosfat
Basa Nitrogen: Purin dan Pirimidin
Purin :Adenin dan Guanin Pirimidin : Sitosin dan Timin Gula pentosa : deoksiribosa,
yaitu monosakarida yang terdiri dari 5 rantai karbon (C5H10O4)
Struktur DNA-B (Regular) (Model Watson and Crick)
Bentuk Heliks ganda, memutar ke kanan
Lebar 20 AO (AO=ANGSTROM, 1 AO=0.001 MIKRON
Satu putaran lengkap 34AO, Jarak satu pasang basa dgn basa lain 3,4 AO (10 psg basa)
Adenin --- Timin dihubungkan dengan 2 ikatan hidrogen
Guanin --- Sitosin dihubungkan dengan 3 ikatan hidrogen
Kedua pita bersifat anti paralel : satu arah 3’----5’, komplomennya 5’----3’
BASA NITROGEN
STRUKTUR DASAR DNA
Struktur DNA-Z (Irregular)
Bentuk Heliks ganda, memutar ke kiri
Satu putaran terdiri dari 12 pasang basa
Sangat jarang ditemukan, dilaporkan terjadi secara in vivo
BASA NUKLEOSIDA
(BASA NITROGEN + PENTOSA)
NUKLEOTIDA
(NUKLEOSIDA
MONOFOSFAT)
NUKLEOTIDA
(NUKLEOSIDA
DIFOSFAT)
NUKLEOTIDA
(NUKLEOSIDA
TRIFOSFAT)
RNAADENIN
GUANIN
SITOSIN
URASIL
ADENOSINE
GUANOSINE
SITIDINE
URIDINE
AMP
GMP
CMP
UMP
ADP
GDP
CDP
UDP
ATP
GTP
CTP
UTP
DNAADENIN
GUANIN
SITOSIN
TIMIN
DEOKSIADENOSINE
DEOKSIGUANOSINE
DEOKSISITOSINE
DEOKSITIMINE
dAMP
d GMP
dCMP
dTMP
dADP
dGDP
dCDP
dUDP
dATP
dGTP
dCTP
dUTP
PERBEDAAN MOLEKULAR DNA DAN RNA
PERBANDINGAN BASA PADA DNA (DEOXYRIBO NUCLEIC ACID)
HUKUM CHARGAFF : JML PURIN = PIRIMIDIN
( A + G )=(C+T) JML ADENIN = TIMIN
A = T JML GUANIN = SITOSIN
G = C
Erwin Chargaff
Fredrick Griffith Experiment (1928)Streptococcus pneumoniae
Smooth strain=virulentRough strain = nonvirulent
BUKTI DNA PEMBAWA INFORMASI GENETIK : TRANSFORMING AGENT
TRANSFORMING AGENT DARI S KE R
Avery, MacLoed and McCarthy
PEMBAWA INFORMASI GENETIK:
TRANSFORMING AGENT ADALAH DNA
Enzim yang digunakan :
-Protease (menghancurkan protein)
-DNA-ase (menghancurkan DNA)
-RNA-ase (menghancurkan RNA)
REPLIKASI DNA
SEMIKONSERVATIFKONSERVATIF
DISPERSIF
REPLIKASI DNA(MODEL SEMIKONSERVATIF YG DITERIMA)PENELITIAN MESELSON DAN STHAL, 1958
a. E coli dibiak dgn N15 sbg sumber mkn---disentrifugasi---endapan mgd N15
b. E coli yg mgd N15 dibiak dgn sumber mkn N14—disentrifugasi—satu lapis endapan mgd N15 dan N14
------- semikonservatif Jk konservatif---bentuk 2
lapisan N15 dan N14
DENSITY GRADIENT CENTRIFUGATION
PENELITIAN MESELSON DAN STHAL, 1958
RNA (RIBO NUCLEIC ACID)
INFORMASI GENETIK DNA DITRANSKRIPSIKAN KE RNA MLL KODE GENETIK
RNA GENETIK (MATERI GENETIK DLM SEL DIBAWA OLEH RNA SAJA—VIRUS TMV DAN VIRUS INFLUENZA) DAN RNA NON GENETIK
PENTING DLM SINTESIS PROTEIN SBGN BSR DLM SITOPLASMA SUSUNAN NUKLEOTIDA MIRIP DNA, HANYA GULANYA RIBOSA, BASA
PIRIMIDIN THYMIN DIGANTI URASIL STRUKTUR : STRAIN TUNGGAL (SINGLE HELIX) YG DIBTK DARI TEMPLATE
DNA 3 MCM RNA :
- MESSENGER RNA (mRNA)
- TRANSFER RNA (tRNA)
- RIBOSOMAL RNA (rRNA)
MESSENGER RNA (mRNA)
DI NUKLEUS PENERIMA INFORMASI GENETIK DNA MLL TRANSKRIPSI BASA NITROGEN ADENIN, CYTOSIN, GUANIN, URASIL) TERSUSUN KODON TRIPLET. KODON
SENSE (MENYANDI ASAM AMINO), KODON NON SENSE (TDK MENYANDI ASAM AMINO) SISTRON : PANJANG SUATU mRNA MGD INFORMASI GENETIK UTK SATU MOLEKUL
POLIPEPTIDA POLISISTRONIK :---UTK LBH DR SATU MOLEKUL POLIPEPTIDA
TRANSFER RNA (tRNA)
TERSEBAR DI SITOPLASMA MENTRANSFER INFORMASI GENETIK KE
RIBOSOMA MENGENAL KODON mRNA DGN ANTI KODONNYA PANJANG KIRA-KIRA 90 NUKLEOTIDA LENGKUNG PERTAMA (1) : TEMPAT MELEKATNYA
tRNA KE RIBOSOM DI A SITE/P SITE LENGKUNG KEDUA (2) : LENGAN TAMBAHAN (THE
LUMP), FUNGSI BLM DIKETAHUI LENGKUNG KETIGA (3) : TDP 3 BASA ANTI KODON
YG KOMPLE-MEN DGN TRIPLET KODON mRNA LENGKUNG EMPAT (4) : TEMPAT MENGENAL DAN
MENGIKAT AMINO ACYL SINTETASE ATU ACID ACTIVATING ENZYME
1
2
3
4
RIBOSOMAL RNA (rRNA) DI SITOPLASMA SEBAGAI CETAKAN UNTUK SINTESIS
PROTEIN SINTESIS PROTEIN MLL TRANSLASI
DGN CARA MEMBACA KODE GENETIK (KODON) mRNA
PROKARIOTIK : 50S DAN 30S—70S EUKARIOTIK : 60 S DAN 40 S—80S SUB UNIT BESAR : ADA TEMPAT
MELEKAT tRNA YAITU PEPTIDYL SITE (P-SITE) DAN AMINOACYL SITE (A-SITE)
POLIRIBOSOM ATAU POLISOM : BEBERAPA RIBOSOM YG BERGERAK PADA MESIN SINTESIS
PERBEDAAN DNA DENGAN RNA
KETERANGAN DNA RNA
LOKASI
BASA PIRIMIDIN
BASA PURIN
REAKSI SITOKIMIA
GULA PENTOSA
ENZIM HIDROLISIS
STRUKTUR
PERAN DALAM SEL
NUKLEUS, MITOKONDRIA, KLOROPLAS
CYTOSIN + THYMIN
ADENIN + GUANIN
FEULGEN
DEOKSIRIBOSA
DEOKSIRIBONUKLEASE (DNA-ASE)
DOUBLE HELIX
PUSAT INFORMASI GENETIK
SITOPLASMA, NUKLEO-LUS, KROMOSOM
CYTOSIN + URASIL
ADENIN + GUANIN
ZAT WARNA BASOFILIK
RIBOSA
RIBONUKLEASE (RNA-ASE)
UNTAI TUNGGAL
SINTESIS PROTEN
KODE GENETIK
ATURAN YG DIANUT NUKLEOTIDA SAAT DITRANSLASI KE DLM URUTAN ASAM AMINO
SIFAT UNIVERSAL DARI PROKARIOTIK-----EUKARIOTIK, KECUALI DNA MITOKONDRIA
PERBEDAAN KODE GENETIK UNIVERSAL DGN DNA MITOKONDRIA
KODON UNIVERSAL MITOKONDRIA MAMMALIA
UGA STOP TRIPTOFAN AUA ISOLEUSIN METIONIN AGA ARGININ STOP AGG ARGININ STOP
KODE GENETIK
SIFAT KODE GENETIK : TRIPLET NUKLEOTIDA—RANGKAIAN NUKLEOTIDA DLM mRNA DIBACA BERURUTAN DLM KELOMPOK-KELOMPOK TIGA BASA (KODON)---1 TRIPLET UTK 1 ASAM AMINO.
4 BASA (A,G,C,T) MENGKODE 43 ATAU 64 KODON ASAM AMINO UTK 20 MACAM ASAM AMINO BERBEDA
KODON INISIASI : URUTAN BASA AUG (CAPITAL LETTER) PADA mRNA YG MENGAWALI PEMBACAAN KODE GENETIK, TRANSLASI METIONIN
KODON TERMINASI : ADA 3 KODON UAA, UAC, UGA. YG TDK MENYANDI ASAM AMINO (STOP KODON, KODON NON SENSE)
INFORMASI GENETIK NUKLEOTIDA
Sandi DNA---RNA
5' T G A C C T T C G A A C G G G A T G G A A A G G 3‘ 3' A C T G G A A G C T T G C C C T A C C T T T C C 5‚ 5' U G A C C U U C G A A C G G G A U G G A A A G G 3'
Uji Genetik
Family history Biochemical Cytogenetic DNA-Based
Tujuan Sidik DNA (DNA Fingerprint)
Identifikasi Personal Diagnosis penyakit keturunan Kemajuan ilmu Forensik/Kriminal
Metode Sidik DNA (DNA Fingerprint)
Isolasi DNA Amplifikasi DNA---PCR RLFP---Elektroforesis Gel DNA Sequencing
Isolasi DNA
Isolasi DNA
Isolasi DNA dengan Perangkat QIAGEN
PCR
RFLP (Restriction fragment length polymorphism)
Uji DNA dengan menggunakan enzim retriksi Materi DNA hasil PCR diseparasi dengan gel
elektroforesis Metode ini untuk mengetahui adanya mutasi atau
polimorfisme
PCR FORENSIC ANALYSIS –
RESTRICTION FRAGMENT LENGTH POLYMORPHISM
ABI 3700 sequencer
DNA SEQUENCING
top related