dna finger print and dna marker for sugarcane breedingkm.ocsb.go.th/uploads/11092018-dna finger...

DNA Finger Print and DNA Marker For Sugarcane Breeding

KEY CONCEPT

DNA fingerprints (DNA testing) identify

living organisms at the molecular level.

(mother) (child 1) (child 2) (father)

ใครเปนลกของคณพอและแม???

ขอมลพนธศาสตรออย • Scientific name: Saccharum spp. • ออยการคาจดเปนพชทโครโมโซมแบบออโตโพลพลอย

(autopolyploid) และอนวพลอย (aneuploid)

ขอมลพนธศาสตรออย • ออยปลกการคาสมยใหมเกดจากการผสมขามสปชย • Saccharum officinarum

มจ านวนจดโครโมโซม2n = 80 (x=10) มปรมาณน าตาลสง ปรมาณแปงและเยอใยต า

• Saccharum spontaneum มจ านวนจดโครโมโซม2n = 40-128 (x=8) มลกษณะตานทานโรค ทนทานในสภาพแวดลอมทไมเหมาะสม

วตถประสงคของการปรบปรงพนธออย

น าตาลสง

ทนแลง

ตานทานโรค

โตเรว ทนน าทวม

ล าใหญ

ลกษณะเหลาน เกดจากอะไร???

การใชเครองหมายโมเลกลในการปรบปรงพนธออย

• เครองหมายพนธกรรม (Genetic marker) – เครองหมายพนธกรรมเปนตวบงชลกษณะจ าเพาะทสามารถวดความแปรปรวนของจโนไทปและ/หรอฟโนไทปได

– เปนการวดความแปรปรวนในระดบโปรตนหรอดเอนเอ – ความแตกตางของฟโนไทปหรอจโนไทปเปนเครองหมายพนธกรรมเมอ • สามารถบงชคณลกษณะของจโนไทปหรอฟโนไทปของสงมชวต • ถายทอดลกษณะฟโนไทปหรอจโนไทปสสงมชวตรนตอไป

ชนดของเครองหมายพนธกรรม

ลกษณะทางกายภาพ (Morphological traits)

เครองหมายโปรตน (Protein or biochemical markers)

เครองหมายโมเลกล (DNA or molecular marker)

AFLP Amplified Fragment Length Polymorphism

AFLP

- a method based on PCR developed in 1995 by Vos et al.

- Involves the use of RFLP and PCR techniques

- Compared with the widely used RFLP, AFLP is faster, less labour intensive and provide more information.

- An additional advantage over RAPD is their reproducibility.

Polymorphism among 32 wheat samples revealed by AFLP

- dominant marker.

- DNA variation is detected by presence/absence of DNA bands due to:

a) presence/absence of restriction sites

b) additional bases (insertion) between two restriction sites are too large

Characteristics of AFLP

การใชประโยชนเครองหมายดเอนเอ

ชวยในการคดเลอกในการปรบปรงพนธออย

ระบลายพมพดเอนเอ

วเคราะหความหลากหลายทางพนธกรรม

ชวยวเคราะหความเปนพอ

ชวยในการวเคราะหความบรสทธของพนธพช

ชวยในการโคลนยน

การใชเครองหมายโมเลกลในการคดเลอก

ขอดของ MAS

ใชแทนการวธการคดเลอกโดยวธมาตรฐาน ทมวธการคดเลอกทยงยาก คาใชจายแพง สงแวดลอมมอทธพลตอการแสดงออกของลกษณะ เชน การตานทานตอโรคและแมลง

ชวยในการลดขนาดจ านวนประชากรทจะตองใชในการคดเลอกฟโนไทป

ชวยในการยนระยะเวลาของการปรบปรงพนธ ใชในการคดเลอกระยะกลา

ใชในการรวมยนทควบคมลกษณะหลายลกษณะเขามาในหนงพนธไดอยางมประสทธภาพ

วธการใชเครองหมายดเอนเอ ในโครงการปรบปรงพนธออย

• การคดเลอกครอบครว – คผสมพอแมทใหฟโนไทปของครอบครวไมด โอกาสทจะคดเลอกลกผสมทดจะมโอกาสนอยมาก

–การคดทงลกผสมจากครอบครวทพอแมใหคาฟโนไทปไมด – เปนการลดจ านวนสายพนธออยทจะท าการคดเลอกแบบรายตน

– เครองหมายดเอนเอชวยคดเลอกพอแมทมพนธกรรมใหความหวานสง เพอลดจ านวนคผสมและครอบครว

Good cane seed increasing by modern technique

- ใชเทคนค Meristem Tip ในการหาเนอเยอเจรญทปลอดโรค เพอเปนตงตนในการด าเนนการเพาะเลยงเนอเยอ (tissue culture) ไบโอรเอคเตอร (Bio-Reactor technique)

- ออยพนธดทปลอดโรคผานการเพาะเลยงเนอเยอ และ ไบโอรเอคเตอร น าไปปลกในพนททไมมการปลกออย (Isolate area) จะได ออยพนธดทปลอดโรค เพอขยายขอตากระจายใหเกษตรกร

Re-born Technique

Tissue culture

Bio – Reactor

รวบรวมขอมลโดย นางสาวปยะนช ค าแวน กลมสงเสรมดานออย

Thank you