doc. dr. ana jerončić - genom.mefst.hrajeronci/lis/uvod u lis_final.pdf · lisa i za izvršavanje...

doc. dr. Ana Jerončić

Definirati pojmove i žargon LISa

Opisati važnost rječnika za funkcionalnost LISa i za izvršavanje laboratorijskih radnji

Identificirati funkcije LISa. ◦ Na koji su način funkcije LISa povezane s radnim

tokovima u kliničkom (CP) i patološkom (AP) laboratoriju

1. Međusobno povezani softver (programi) i hardver (sklopovlje)

- Omogućava obradu elektroničkih podataka

- Ima funkciju informacijskog managementa

2. Baza podataka koja uspostavlja i održava standardne definicije i procedure obrade informacija (Elevitch and Aller)

LIS arhitektura

LIS rječnici

(LIS dictionaries ili Maintenance tables)

Funkcije LISa u laboratorijskom radnom toku Klinički laboratorij (CP)

Anatomsko patološki “Anatomic pathology” (AP)

Softver – LIS aplikacija

Sustav za upravljanje bazom podataka (DBMS od database management system)

Operacijski sustav

Hardver (Sklopovlje)

Glavno računalo: • kontrolira sve funkcije LISa i transakcije • na njemu su sačuvani baza podataka i cjelokupni LIS softver Terminali: • Isključivo prikaz i unos podataka • PC se mogu povezati korištenjem emulacije terminala

Host-based arhitektura

PCijevi (klijenti) šalju zahtjeve snažnijim računalima (serverima) koji izvršavaju različite LIS funkcije Server baze podataka

-na njemu se nalazi baza podataka Ostali serveri provode točno određene poslove (“business logic”) – fax, printanje, sučelje Funkcije LIS aplikacije su raspodijeljene po svim klijentima i serverima

Klijent-server arhitektura

Mainframe/Host-based Klijent/Server

Tekstualno sučelje (samo komandna linija)

Ograničena fleksibilnost

Sigurnost je zadovoljavajuća

Održavanje i kontrola su centralizirani

Izvor kvara moguć u samo jednoj točki

Grafičko sučelje (GUI) Veća konfigurabilnost Veći rizici za sigurnost

(virusi, PC ulazi) Održavanje je

decentralizirano Potencijalni izvor kvara

u više točaka, no kvarovi su manje katastrofični

Pojam “tanki” klijent odnosi se na mrežu u kojoj se na uređaju (npr. PC) pokreće softverska aplikacija koja je relativno jednostavna (=“tanka”) i koja zahtjeva manje računalnih resursa (CPU i memorije) Aplikacijska logika izvršava se na klijentskom poslužitelju (serveru) Malo podsjeća na host-based/mainframe model (povezivanje preko srednjeg poslužitelja)

Troškovi hardvera i licenci

Izvor kvara za sve radne stanice koje su povezane na “tanki” poslužitelj nalazi se u jednoj točci

Ovisite o učinkovitosti dobavljačeve implementacije “tankog” klijenta

Nemogućnost izvedbe specijaliziranih funkcija na “tankoj” klijentovoj radnoj stanici: slike, glasovno prepoznavanje, …

Olakšana administracija

Korištenje više platformi (PC, Mac)

Manji zahtjevi za hardverom i troškovi

Udaljeni pristup

Manje internetskog prometa

LIS arhitektura

LIS rječnici

(LIS dictionaries ili Maintenance tables)

Funkcije LISa u laboratorijskom radnom toku Klinički laboratorij (CP)

Anatomsko patološki “Anatomic pathology” (AP)

DEFINICIJE!

Standardiziraju općevažeća pravila i procedure za imenovanje

Standardiziraju laboratorijsku terminologiju i definicije

Ograničavaju izbore u podatkovnim poljima da bi osigurali valjan unos podataka (npr. spol M/Ž)

Određuju sadržaj i format izvještaja (npr. jedinice mjerenja)

Definiraju pravila i izračune

Definicije testova i baterije testova

Radne liste za testove

“Rječnik” osoba (liječnici koji naručuju, patolozi, tehnolozi)

Sigurnost/različite razine pristupa za vrste korisnika

Lokacija bolesnika

Lokacija laboratorija

Vrste uzoraka

Histološki protokoli za bojanje tkiva (npr. Giemsa)

Sučelje analizatora/instrumenata

Autoverifikacijski parametri

Mnogi drugi…

Vrste rječnika u LISu APa velikim se dijelom preklapaju s LISom CPa, ali..

Radnje i tokovi podataka u AP laboratoriju se dosta razlikuju od kliničkog laboratorija

Rječnici za Vrstu (dijela) uzoraka [Part Type] kao i rječnici za Vrstu boje [Special Stain] analogni su definicijama testova u CP

Definicije tablica su kritične za uspješnu implementaciju LISa i zahtijevaju pažnju i planiranje

Neki rječnici moraju se izgrađivati u slijedu budući da njihovi pojmovi ovise o drugim rječnicima

Rječnici mogu biti pre-definirani, no važno je definirati tablice na način koji odgovara specifičnim zahtjevima vašeg laboratorija

Promjena u definicijama zahtjeva da se odgovarajuće tablice pažljivo osvježe i da se promjene testiraju prije upotrebe.

Sučelje – softver (aplikacije) i računalne veze koje omogućavaju prijenos elektroničkih poruka između inače nekompatibilnih sustava

Sučelja LISa su od kritične važnosti za uspjeh laboratorija (npr. izvještavanje rezultata, zaprimanje zahtjeva za testove, …)

Download=direktan prijenos identifikacijskog broja pacijenta i podataka o naručenom testu iz LISa na instrument

Upload=direktan prijenos rezultata natrag u LIS

Jednosmjernost vs. dvosmjernost – narudžbe vs. rezultati

Objava vs. Upit

Jedinstveni broj uzorka koji se nalazi na oznaci barkoda a koju generira LIS, povezuje narudžbu i rezultate i u analizatoru i u LISu

Drugi uređaji povezani s LISom:

Dobavljači LISa imaju “off-the-shelf” sučelja za većinu instrumenata koji se učestalo koriste

Instalacija novog sučelja ipak nije “plug and play”

Softver sučelja mora biti instaliran u LIS rječnike ◦ Definicija podataka i slijed koji se očekuje prema

radnjama iz relevantnog radnog lista ◦ Rigorozno testiranje i validacija prije korištenja i

uvijek kada se uvode promjene

Elektronički medicinski zapisi (EMR) / Klinički informacijski sustavi / Bolnički informacijski sustavi (BIS)

Prijem-Otpuštanje -Transfer (ADT) – registracija bolesnika

Sustav web portala Sustav liječničkih ordinacija Sustav za izdavanje računa Drugi LIS Drugo…

HL7 definira format (sintaksu, strukturu) ali ne i specifični sadržaj poruke

HL7 definira različite vrste poruka, kao što su narudžbe laboratorijskih testova, ADT bolesnika, drugi.

Poruku (npr. narudžba, rezultat) čine segmenti koji su izgrađeni od polja

OBX|1|NM|CK^CK|1|251

|U/L|30-220|H|||F||||||201006082152|

Specifikacije za HL7 sučelje LISa ne moraju odgovarati drugim sustavima/dobavljačima

Institucije mogu definirati prilagođene, mjesno-specifične segmente u HL7.

Translacijske tablice su nužne da bi se povezali različiti kodovi testova u različitim sustavima.

Razvoj sučelja zahtjeva suradnju između dobavljača sustava, laboratorijskog osoblja i osoblja koje podržava informacijski sustav

–testiranje, validacija i dokumentacija

Sustav koji usmjerava i prenosi poruke između različitih računalnih sustava

Smanjuje se broj pojedinačnih sučelja (point to point) potrebnih za višestruke sustave

Česti u zdravstvenim ustanovama

Poboljšava upravljanje sučeljima u kompleksnim okružjima ali je isto tako i potencijalni izvor kvara

LIS arhitektura

LIS rječnici

(LIS dictionaries ili Maintenance tables)

Funkcije LISa u laboratorijskom radnom toku Klinički laboratorij (CP)

Anatomsko patološki “Anatomic pathology” (AP)

Unos narudžbe i odabir testa

Sakupljanje uzoraka i označavanje

Zaprimanje i praćenje uzoraka

Zaprimanje elektroničke narudžbe iz EMR/BIS

–narudžbe za određeni test unose se u EMR (na temelju odabiru iz menija i EMR definicija). ◦ Narudžbe preko HL7 sučelja => LIS. ◦ Dizajn sučelja osigurava da se točna narudžba unose u

LIS na temelju uparivanja kodova za test ili prevođenja koda za test.

Zaprimanje narudžbe u papirnatom obrazcu ◦ Papirnati obrazac prati uzorak do laboratorija ◦ Osoblje unosi narudžbu u LIS, s odabirom testa prema

LIS rječnicima.

npr. Sakupljanje uzoraka za dokazivanje Phlebotomus-a (nazofaringalni brisevi) u stacionarnih bolesnika ◦ LIS pridružuje jedinstveni broj uzoraka i/ili

spremnika svakoj narudžbi

◦ LIS postavlja narudžbu na listu čekanja

◦ Lista ili oznake mogu usmjeriti tehničara na vrstu odgovarajućeg spremnika koji treba koristiti

◦ Tehničar koristi oznaku za uzorak koju je generirao LIS

Stacionarni bolesnici - kliničar uzorkuje uzorak (npr. STAT) ◦ Kliničar unosi narudžbu u EMR ili ispunjava papirnati

obrazac

◦ EMR ispisuje generičke oznake za uzorak u trenutku unosa narudžbe; LIS može ispisati oznake na odjelu

Ambulantni bolesnici ◦ Narudžbe preko sučelja – tehničar pristupa postojećim

narudžbama u LISu, ispisuje oznake i sakuplja uzorak

◦ Papirnate narudžbe – tehničar unosi narudžbu za određene testove u LIS, ispisuje oznake i sakuplja uzorke

Narudžbe testova zaprimljene preko sučelja s EMR ◦ Kada uzorak stigne u laboratorij, narudžbe već

postoje u LISu. ◦ Osoblje potvrđuje primanje uzorka u LISu i prihvaća

oznaku i narudžbe.

Papirnati zahtjevi ◦ Narudžbe ne postoje u LISu kada uzorak stigne ◦ Osoblje naručuje testove u LISu, ispisuje i

upotrebljava oznake.

Status uzorka u LISu: ◦ “zaprimljen” ili “u-labu”

LIS pridružuje uzorku jedinstveni pristupni broj.

Koristi se određena struktura brojeva da bi se razlikovalo različite klase uzoraka ◦ Npr. prema lokaciji, HS-11-123, CS-11-123

Više poduzoraka (dijelova jednog uzorka) vode se pod jednim pristupnim brojem

A unose se i ostali podatci iz narudžbe (liječnik, odjel)

Demografski podatci bolesnika mogu biti već uneseni u LIS preko ADT sučelja (registracija bolesnika)

Dvije vrste polja u LISu identificiraju svaki dio uzorka: ◦ Vrsta (dijela) uzorka [Part type]– odabire se iz rječnika;

kategorije vrsta uzoraka su npr. kolon, polip, …

◦ Opis (dijela) uzorka [Part description] – dodatni opis koji se prikazuje uz uzorak; u slobodnom tekstu npr. “veliki polip na kolonu na 50tom cm”

Vrsta (dijela) uzorka može biti povezana u LISu s histološkim protokolom ili vrstama boja.

LIS može ispisati oznaku uzorka s bar kodom

Status uzorka je osvježen, npr. “Pristupan”.

Raspodjela posla i priprema uzoraka

Provođenje testova i analiza

Interpretacija testova

Dodatno testiranje na temelju početnih rezultata

Unos rezultata

Mnogi testovi koji se naručuju u CP u stvarnosti se sastoje od baterije testova (3-6testova) npr. elektroliti Na, K, Cr, ….

LIS zapisuje narudžbe za individualne komponente testa.

LIS generira oznake s barkodom koje sadrže ID uzorka i koje su ključne za povezivanje preko sučelja instrumenta i praćenje uzorka

Narudžbe testova se usmjeravaju na odgovarajuće radne liste LISa (radne liste temeljene na LIS definicijama).

Testovi koji su provedeni na instrumentima povezanima preko sučelja s LISom imaju radne liste LISa povezane s rječnikom održavanja instrumenta i tako osiguravaju download na odgovarajući instrument.

Download podataka na instrument može biti posljedica različitih okidača: ◦ Zaprimanje narudžbe u LISu preko EMR sučelja ◦ Zaprimanje uzorka u laboratorije (praćeno u LISu)

Za višestruke testove (baterija testova), narudžbe se usmjeravaju u odgovarajuće LIS radne liste kojima tehničari pristupaju (ili ih ispisuju) da bi vidjeli listu radnji za taj “run”.

Za instrumente povezane preko sučelja: ◦ Softver instrumenta “učitava” broj uzorka s barkod-a i

provodi testove prema download-anoj narudžbi (iz LISa) koja je povezana s tim brojem uzorka

Rezultati se upload-aju natrag u LIS, povezani preko broja uzorka

Specifikacije sučelja koje dijele i LIS i softver instrumenta osiguravaju prijenos podataka u očekivanom slijedu i formatu

Radne liste LISa povezane s održavanjem instrumenta osiguravaju da se rezultati testa upisuju ispravno u LIS.

Za testove koji se provode manualno ili na uređajima/s analizatorom bez sučelja, tehničar unosi rezultate u radnu listu LISa koristeći LIS funkcije.

Ponekad je potrebno rezultatima pridružiti komentar ili fusnotu – slobodni tekst vs. kodirani obrasci iz LIS rječnika

Radne liste povezuju test ili bateriju testova s određenim

pravilom ili izračunom koji se treba primijeniti/provesti na početnim rezultatima npr. “anion gap”

Ponovno testiranje (reflex testing) – automatsko generiranje nove narudžbe za određeni test u LISu na temelju inicijalnih rezultata koji zadovoljavaju određene kriterije npr. titracija pozitivnih ANA screen-ova

Autoverifikacija – automatska finalna verifikacija rezultata u LISu iz automatiziranih instrumenata bez manualne intervencije

Kriteriji se temelje na algoritmima definiranim u LISu Rezultati dobiveni iz instrumenta (ili bilo koji podatci koji

se odnose na uzorak) a nalaze se izvan definiranih kriterija zadržavaju se za naknadni pregled.

Referentni (normalni) raspon Tehnički raspon testa (rezolucija) Raspon punjenja definiran za instrument Raspon kritičnih vrijednosti ili neki drugi

“verificirani” raspon određen u rječniku Delta provjere (razlika u vrijednostima za

pojedinog bolesnika) Kriteriji za prihvat ambulantnih vs. stacionarnih

bolesnika Kriteriji temeljeni na izvedenim rezultatima istog

testa (npr. RBC index) Kritične vrijednosti instrumenta

Softver koji funkcionira kao spona između LISa i instrumenta ◦ Obrada podataka prema unaprijed određenim

pravilima proizvođača instrumenta

- Autoverifikacija

- Ponavljanje testova (reflex testing) na temelju rezultata

- Automatska ispiranja/razrjeđenja, ponavljanja, …

- Drugi aspekti upravljanja instrumentom (upozorenja vezana uz održavanje instrumenta)

Glavne izlazne informacija LISa u fazi pripreme uzoraka ( tzv. “grossing”) su: ◦ Unos teksta u polje LISa “Gross Description”

◦ Označavanje sekcije tkiva u Histološkom modulu

◦ Osvježavanje statusa, npr. “Gross Complete”

Interakcije s LISom tijekom faze pripreme uzorka mogu uključiti: ◦ Identifikaciju barkoda uzorka

◦ Softver za prepoznavanje govora nužan za unos podataka

◦ Snimanje digitalnih slika i unos u LIS

LIS navodi slijed radnji u pripremi preparata ◦ Predefinirani protokoli za bojanje

◦ Histološki zapisi (logovi) koji definiraju radne liste za slučajeve i blokove

◦ Oznake rezova (+/- barkodovi) koje se temelje na podatcima unesenima u histološki modulu i definicijama protokola/bojanja

Specijalne boje poredane su na temelju pojmova iz LIS rječnika i pojavljuju se u određenim logovima (npr. -imunohistokemijski log) ◦

LIS kao rezultat daje “draft radnji” ◦ Predaje se patologu zajedno s preparatima u

papirnatom obliku

◦ Digitalni pregled sačuvan u LISu

Obrazac i sadržaj “drafta radnji” temelje se na konfiguraciji predloška (tamplate) u LISu ◦ Klinička informacija

◦ Opis preparata

◦ Izvještaj za smrznutu sekciju

◦ Sažeti prikaz prethodnih rezultata, na temelju pretrage baze podataka u LISu.

Unos konačne dijagnoze u LIS olakšan je: ◦ Unaprijed definiranim predlošcima, checklistama i

formatima

◦ Unosom kodiranog teksta – kratki kodovi koji pokreću automatsku pretragu rječnika i translacije u prošireni tekst

◦ Mogućnost konverzije govora u tekst

◦ Automatski unos računovodstvenih kodova i kodova dijagnoza, a na temelju definicija u rječniku

Nakon unosa dijagnoze, status se osvježava u “Final complete”

Patolozi mogu uređivati i uređuju slučajeve iz radne liste

Odjava podrazumijeva da se na formu stavlja elektronički potpis kojim se slučajevi zaključavaju i koji predstavlja konačnu verifikaciju u bazi podataka.

Generiranje i dostava laboratorijskih rezultata i izvješća o testovima

Izmjena, dopuna i sažimanje izvješća

Format papirnatog izvješća temelji se na podesivim predlošcima u LISu ◦ Ispis – redoviti automatski ispis ili na zahtjev ◦ Faksiranje – automatski ukoliko je broj faxa u rječniku

Za elektronička izvješća, izvješća putuju internetom, od LISa da sustava koji ih prima

Format i prikaz izvješća koja se prenose preko sučelja diktiran je dizajnom zaslona u sustavima koja ih primaju

Sučelja koja se temelje na PDF i RTF mogu sačuvati formatiranje ali drugi sustav ne mora prikladno sačuvati i podatke

Izvješće koje se ispisuje iz LISa mora jasno označiti ispravljene rezultate kao takve

Ispravljeni rezultati moraju ujedno uključiti originalni rezultat

Uobičajeno je da takvi rezultati ujedno sadrže dokumentaciju o osobi koja ih je ispravila te zapis o bilo kakvoj komunikaciji između osoblja ukoliko ju je bilo

Ispravljeno izvješće obično zamjeni prethodno izvješće u EMR (original se čuva u kontrolnom zapisu)

LIS identificira dopunjena i sažeta izvješća

Formati izvješća moraju se podesiti tako da je status o dopuni i sažimanju očigledan

U EMR novo izvješće zamjenjuje staro izvješće

Middleware

Sustavi za identifikaciju bolesnika uz postelju

Lab portal = Web-orijentirani rezultati i naručivanje

Upravljanje dokumentima

Praćenje uzoraka i arhiviranje

Integracija digitalnih slika

Prepoznavanje glasa

LIS rječnici postavljaju okvir za obradu informacija i radni tok

Radne liste i logovi (zapisi) određuju tok podataka i uzoraka u laboratoriju

LIS je ključan za upravljanje podatcima tijekom cijelog ciklusa laboratorijskih testiranja

Postoje bitne razlike u radnim tokovima CP i AP laboratorija