emanuel teixeira nº24924 bioengenharia

Emanuel TeixeiraNº24924

Bioengenharia

KEGGBioinformática

2011-2012

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KEGG: Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes.

• Enciclopédia de genes e genomas de Kyoto •Fundação devida  ao programa

genoma humano japonês em 1995

•Colecção online de bases de dados de genómica para a análise das funções dos genes: genomas, vias enzimáticas, produtos químicos biológicos e redes de interacções moleculares nas células e variantes específicas a determinados organismos…

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 http://www.kegg.jp/http://www.genome.jp/kegg/

•Contem genomas completamente sequenciados e outros parcialmente, porem estes contêm anotações actualizadas a respeito das funções dos genes

•Contem representações gráficas (processos celulares i. e. metabolismo, transporte membranar, transdução de sinal e ciclo celular)

•E ainda, aplicações principalmente em JAVA que permitem “navegar” em mapas de genomas e ferramentas de comparação de sequências genéticas

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KEGG

• Bases de Dados principais

• KEGG Pathway (vias e complexos)• KEGG BRITE• KEGG Module• KEGG Mapper• KEGG Atlas

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http://www.genome.jp/kegg/kegg2.html

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• Relaciona a informação conhecida sobre redes de interacção molecular, genes e proteínas geradas por projectos de genoma, compostos bioquímicos e as suas reacções, dividindo-as pelas bases de dados respectivas.

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• KEGG Pathway

• Metabolismo;• Processamento de informação genética;• Processamento de informação ambiental;• Processos celulares;• Doenças Humanas;• Desenvolvimento de medicamentos…

• (Trabalhos em curso: adicionar bases de dados ortológicas i.e. arvores genealógicas)

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http://www.genome.jp/kegg/pathway.html

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• Outras bases de dados relacionam

• Compostos (moleculares, celulares…);• Medicamentos;• Reacções (celulares, dos

medicamentos…);• Enzimas;• …• http://www.genome.jp/kegg/kegg2.html

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drosophila melanogaster

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