kaiken takana on loinen

Kaiken takana on loinen

Tuomas AiveloBiotekniikan instituutti,Helsingin yliopistoDyna-miitti 2.10.2013

Kaikilla maailman eliöillä on loisia.

Yli puolet maailman eliöistä on loisia.

Mitä on loiset?Lä

heis yys+

-

Mutualismi

Kommensalismi

Sym

bi oo

si

Saalistus / laidunnus

ParasitoidismiUlkoloiset Sisäloiset

Loiselämä

Ongelma:

Loisen pitäisi käyttää niin paljon isäntää hyödyksi kuin pystyy vaarantamatta omaa lisääntymiskykyä.

TRAGEDY OF COMMONS!

Virulenssi

• Kuinka suurta haittaa kelpoisuudelle tauti aiheuttaa?

• Trade-off: Jos tapat uhrisi nopeasti, sinun pitää myös siirtyä seuraavaan uhriin nopeasti.

?

Tautien eri taktiikat

• Sukupuoliteitse• Vektorin välityksellä• Pisaratartunta• Yms.

Miksei taudeista päästä koskaan eroon?

John Tenniel

http://www.mpg.de/19341/Computational_disease_models?page=3

Monista taudeista on päästy eroon!

• Isorokko – > rokotukset

• Guineamato– > hygienia

• Malaria Suomessa– > elintason nousu

Monet taudit ovat vaikeita

• Zoonoosit:– Uusia tauteja koti- tai villieläimiltä• Viimeaikaisia mm. HIV, Ebola, influenssat

– Taudit liikkuvat enemmän toiseen suuntaan!

• Antibioottiresistenssiä:– Sairaalabakteerit: MRSA, VRE jne.– Malarialoisiot

Madagaskar Madagaskar

eristyneenä viimeiset n. 85 miljoonaa vuotta

Ihmisasutus vakiintui n. 1500 vuotta sitten

Merkittävä määrä eläimiä kuollut sukupuuttoon viimeisen 1000 vuoden aikana

Alkuperäisestä metsäalasta jäljellä noin 15 prosenttia

Ranomafanan kansallispuisto

• Itäisen Madagaskarin vuoristosademetsä

• Perustettu 1990• Kansainvälisen tason

tutkimusasema, Centre Valbio

Madagaskarin eläimistö

• Neljä endeemistä nisäkäsryhmää:– Makit, puoliapinoita– Tanrekit, afrikkalaisia hyönteissyöjiä– Madagaskarinrotat, jyrsijöitä– Falanukit, kissamaisia

• Tulokaslajeja:– Mustarotta, hiiri– Koira, kissa– Ihminen, zebu

• Puoliapinoita• Pitkäikäisiä, jopa 10

vuotta luonnossa• Pieniä• Suhteellisen

pysyvät reviirit• Monenlaisissa

elinympäristöissä• Aktiivisimmillaan

lokakuussa (tää on vaan bonus)

Hiirimakit

Makit

• Puoliapinoita• Yleisesti naarasdominantteja

• Mallieläin Alzheimerin taudille?• Vanhenevat vankeudessa, eivät luonnossa• Horrostavat, naarasdominantteja, yöaktiivisia• Tulevaisuuden suunnitelmat sekvenoida

Kenttätyö• Syyskuulta joulukuulle• Ansat öisin silmien

korkeudelle• Sisälle banaania

Punkit ja täit:Ulkoloisten määrä

Mikrosiru yksilöt

Karvanäyte genetiikka

Morfometriikka-Paino-Hännän, hauiksen ja reiden ympärysmitta

Ulostenäyte:-Hormoonit-Sisäloiset-Ruokavalio

Vaginan ja kivesten kokoLisääntymistilaSukupuoli

Hammasvalos ikä

Persoonallisuus

Ansan sijainti ja aika

Opportunistista ulosteenkeräystä

Ansoihin tulee monenlaisia muitakin eläimiä

Isoja makeja voi seurata ja kerätä ulosteet

Sukkulamadot

• Prevalenssi lähes 100%• Helppo eristää• Paljon tutkittuja, mutta…

Pyrosekvensointi

• Lajintunnistaminen 18S-geenisekvenssin (ribosomin pieni yksikkö) perusteella

• Yhdessä näytteessä 0-1500 toukkamuotoa

Mitä tehdä miljoonan 700 emäksen sekvenssin kanssa?

Alustavia tuloksia

• Mustarotilla ja koirilla samaa lajistoa, joka eroaa hiirimakeista

• Hiirimakien loisia myös mustarotilla– > tulokaslaji lisää loistaakkaa?

• Horrostaminen tappaa sukkulamadot suolesta

Kysymyksiä?

Lisätietojahttp://twitter.com/aivelo http://www.biocenter.helsinki.fi/bi/evodevo/group_Jernvall.shtml

http://fifi.voima.fi/blogit/tekija/tuomas-aivelo

http://blogs.helsinki.fi/t-retki/author/aivelo/

https://peda.net/oppimateriaalit/e-oppi/lukio/biologia/symbioosi2/1pje/haastattelu

http://oppiminen.yle.fi/solubiologia/bioteknologia/hiirimakien-loisten-tutkimus-perustuu-dnan-sekvensointiin

http://oppiminen.yle.fi/solubiologia/perinnollisyys/tutkijan-kommentti-perinnollisyyden-opetus-kaipaa-paivittamista