kromosoomid karüotüüp, karüogramm kliiniline tsütogeneetika
Post on 10-Jan-2016
215 Views
Preview:
DESCRIPTION
TRANSCRIPT
kromosoomid karüotüüp, karüogrammkliiniline tsütogeneetika
rakubioloogia praktikumokt. 2010
kati kuusetsütogeneetik
kromosoomi struktuurrakutsükkel
mitoosi metafaas
kromosoomide arv eri liikidel:
• inimene
• koer
• kass
• hobune
• toakärbes
• karpkala
• mugulsibul
• tomat
• kartul
Homo sapiens
Canis familiaris
Felis domesticus
Equus calibus
Musca domestica
Cyprinus carpo
Allium cepa
Lycopersicon esculentum
Solanum tuberosum
46
78
38
64
12
104
16
24
48
Karüotüüp – kromosoomide komplekt jagunevas rakus
Iseloomulik liigile/indiviidile/koele/rakule
kromosoomide arv ja morfoloogia (kuju, suurus)
kromosoomide suurus:
Spix macaw
oder
kromosoomide kuju:
telotsentriline:
vöödistuse muster
inimese kromosoomid - 46
1956.a Tijo ja Levan Rahvusvaheline klassifikatsioon: 1960
kromosoomide vöödistuse muster
1956.a 1969.a
rahvusvaheline tsütogeneetika nomenklatuur – ISCN
kromosoomide diferentsiaalvärving (banding):
kogu kromosoomi ulatuses:
Q-banding (quinakriin-dihüdrokloriid)
G-banding (trüpsiiniga töötlus)
R-banding (temperatuuriga töötlus)
high-resolution banding
teatud kromosoomipiirkonna värving:C-banding (tsentromeerid ja heterokromatiin)NOR-värving (tuumakese organisaatorpiirkond)
inimese karüogramm (G-banding):
karüotüüp:46,XY
A
B
C
DE
F
G
hakkame karüotüpeerima:
AB
C
D E
F
G
9
4
17
6
11
520
6
420
22 8
12
14
3
1
2
1110
13
18
18
15
1613
19
21
3
21
9 1012
7
5
X 8
17141
15 1916 22
X
Q-band C-band
rakkude kasvatamine koekultuuris
kromosoomide uurimiseks sobiv materjal:
• perifeerne veri• nahk• luuüdi
rakutsükli kontrollpunktid:
X
X
X mitogeen (PHA)
X kolhitsiin
• amnionivesi• koorion• loote nabaväädi veri
koekultuuriprotokoll (perifeerne veri)
• kultuuri initsiatsioon – mitogeen PHA (fütohemaglutiniin)
• käävi inhibiitor – kolhitsiin
• rakkude hüpotooniline töötlus – KCl, Na-tsitraat
• rakkude fikseerimine – metanool/jää-äädikas
• kromosoomipreparaadi valmistamine
OK vaatame
prepsi
rahvusvaheline tsütogeneetika nomenklatuur – ISCN 2009
7. kromosoom band level: 300 400 550 700 850
karüotüübi analüüs
*polümorfism e. normivariandid (qh+; p+; ps+; pstk+) 9qh+; Yqh+; 13p+; 21ps+; 21pss; 22pstk+
balansseeritud translokatsioon
mitte kõik muutused karüotüübis ei põhjusta haigust
*kromosoomide struktuuri balansseeritud muutused:
45,XY,t(14;15)(q10;q10)mat(Robertsoni translokatsioon)
46,XY,t(5;11)(p11;q12)mat
46,XY,t(7;8)(q31.3;p21.2)
kromosoomide struktuuri balansseeritud muutus
inversioon
inv(9)(p12q13)
inv(2)(p11q12)
46,XX,inv(13)(q14q22)mat(paratsentriline inversioon)
inv(7)(p22q11.2)(peritsentriline inversioon)
kromosoomihaigused e. sündroomid
• ei ole ravitavad
• diagnoosimine vajalik prognoosi ja kordusriski andmiseks
• võimalik diagnoosida enne sündi
tingitud kromosoomide arvu või struktuuri tasakaalustamata muutusest
kromosoomihaigused / autosoomide trisoomiadtrisoomia 21 e. Downi sündroomsagedus 1:600
• lihashüpotoonia• liigeste üliliikuvus• mongoloidne silmade lõige• epikantus e. kolmas
silmalaug• lai silmavahe• suur keel• väikesed düsplastilised
kõrvad• lame profiil• südamerike• tsöliaakia
kromosoomihaigusedDowni sündroom – 47,XY,+21
Downi sündroom: 46,XY,der(14;21)(q10;q10)
Eesti, 2009.a.
Downi sündroom: 46
sündis 14
8 valenegatiivset skriiningtesti
3 loobusid kromosoomianalüüsist
2 ei teinud skriiningtesti
1 sünnieelse diagnoosiga
32 sünnieelselt diagnoositud, rasedus katkestatud
autosoomide trisoomiad
trisoomia 18Edwardsi sündroomsagedus 1:7000
trisoomia 13Patau sündroomSagedus 1:10 000
Eestis 2009:tri18 – 4tri13 - 1
sugukromosoomide arvuanomaaliad
47,XXY Klinefelteri sündroom
45,X Turneri sündroom
45,X47,XXY
47,XYY
47,XXX Triplo-X sündroom
kromosoomide balansseerimata struktuurimuutused:
• deletsioon• duplikatsioon• insertsioon• translokatsioon
• ringkromosoom• lisa(marker)kromosoom• isokromosoom
47,XY,+mar
46,X,i(X)(q10)
molekulaarne tsütogeneetika – FISH-analüüs
kasutatakse fluorestsentsmärgisega DNA proove
• denaturatsioon• hübridisatsioon• signaali detekteerimine fluorestsentsmikroskoobiga
FISH-analüüs:
mikrodeletsioon 22q11.2 – DiGeorge sündroom
ish del(22)(q11.2q11.2)(TUPLE1-)
mikrodeletsioon 15. kromosoomi pikas õlas - Prader-Willi sündroom
ish del(15)(q11q13)
molekulaarne tsütogeneetika interfaasi tuumadel 13.kromosoomi DNA proov – roheline21.kromosoomi DNA proov - punane
18.kromosoomi DNA proov – sinine X-kromosoomi DNA proov – roheline Y-kromosoomi DNA proov - punane
molekulaarne ja klassikaline tsütogeneetika
47,XX,+21Downi sündroom
21
molekulaarne ja klassikaline tsütogeneetika
45,XTurneri sündroom
X
triploidia (69,XXX)
21 13 18 X21 13 18 X
top related