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PubMed en 10 images
Philippe Eveillard10 février 2012
Seattle_public_library_7 par man pikin Licence CC BY
Marbles par gurdonark Licence CC BY
1. PubMed ?PubMed est l’interface d’interrogation de la banque de données bibliographiques MEDLINE
Marbles par gurdonark Licence CC BY
MEDLINE est un sac de billes contenant 22 millions de billes
PubMed est la main qui plonge dans le sac de billes pour en extraire les billes en verre, de couleur rouge, de 25g et de 1,24cm de diamètre ou celles en terre, de couleur verte, de 41g et de 2,11cm de diamètre
PubMed le fait de façon précise parce que chaque bille est étiquetée quant à sa nature, son poids, sa couleur, sa grosseur…
2. Pour quoi faire ?PubMed sert à faire la bibliographie d’un article Q
PubMed ne doit pas servir à résoudre le problème clinique d’un patient.
Il y a d’autres outils plus performants pour cela : UpToDate, Dynamed ou (plus simple et francophone) CISMeF ou la DReFC
Bibliothèqsue de l’Ifpo, Damas, Abou Roumanech par innovation en bibliothèque Licence CC BY
3. Comment ?Pour faire une bibliographie, il faut s’asseoir, si possible dans une bibliothèque universitaire
Bibliothèqsue de l’Ifpo, Damas, Abou Roumanech par innovation en bibliothèque Licence CC BY
S’asseoir, parce qu’il faut « se poser » pour faire une bibliographie
Dans une bibliothèque universitaire pour :- ne pas être « tout seul » (les bibliothécaires sont là pour vous aider)- bénéficier de l’environnement et de l’accès aux périodiques de la BU
Au Marché De LA Butte par Jon Gos Licence CC BY
4. Avec quels mots clés ?Avec les mots clés du thesaurus MeSH
Au Marché De LA Butte par Jon Gos Licence CC BY
Quand vous allez chez le primeur pour acheter un kg de pommes :- si l’on vous sert 1 kg de fruits, vous avez fait une requête « à la Google »;- si l’on vous sert 1kg de pommes vous avez fait une requête en langage MeSH.
5. Pourquoi ?Parce que ce sont les mots clés (les descripteurs) du thesaurus MeSH qui sont inscrits sur l’étiquette
Barolo par Blue moon in her eyes Licence CC BY
Barolo par Blue moon in her eyes Licence CC BY
A chaque article est « accrochée » une étiquette sur laquelle sont inscrits les termes du MeSH qui ont servi à caractériser (indexer) le contenu de l’article.
Cette étiquette se trouve sous le résumé dans la notice au format abstract
6. L’affiliation descripteur/qualificatifLa combinaison entre le descripteur et le qualificatif (l’attelage entre la locomotive et son tender) est à la base de toute recherche dans PubMed
Denver et Rio Grande Western N°346 par David Jones Licence CC BY
Denver et Rio Grande Western N° 346 par David Jones Licence CC BY
La locomotive (le descripteur) et son tender (le qualificatif ) tirent le convoi de chemin de fer (l’équation de recherche) vers plus de cohérence et plus de précision qu’une équation de recherche en langage courant « à la Google ».
Le catalogue à roue de la BIUM par marlenedd Licence CC BY
7. Quelle méthode ?La méthode MeSH Database est celle qui permet de formuler de façon simple des affiliations
Le catalogue à roue de la BIUM par marlenedd Licence CC BY
Un mot clé (en anglais) est entré dans la fenêtre d’interrogation de la banque de données du MeSH (MeSH Database)
MeSH Database propose une liste de descripteurs et vous faites votre choix
Vous prenez connaissance de la liste de qualificatifs qui peuvent être affiliés à ce descripteur et vous en sélectionnez un.
8. Et les filtres ?Les filtres limitent le champ de la requête et…freinent la vitesse du convoi
Baldwin 2-6-6-2 Steam Locomotive par puukibeach Licence CC BY
La locomotive (le descripteur) et son tender (le qualificatif), attelés ensemble (affiliation descripteur/qualificatif) tirent les wagons (les filtres).
Chaque wagon est une limite (de date, de type de publication, de langue de publication, de classe d’âge…).
Baldwin 2-6-6-2 Steam Locomotive par puukibeach Licence CC BY
9. Quel résultatLa première équation n’est jamais la bonne
Sensibilité
La sensibilité d’une requête est :•assimilée à la sensibilité d’un test diagnostique•égale au rapport :références adéquates trouvées par l’outil de rechercheréférences adéquates hébergées par la banque de données
PrécisionLa précision d’une requête est :•assimilée à la valeur prédictive positive d’un test diagnostique•égale au rapport :références adéquates trouvées par l’outil de recherchetotalité des références trouvées par l’outil de recherche
Sensibilité
La sensibilité d’une requête est :•assimilée à la sensibilité d’un test diagnostique•égale au rapport :références adéquates trouvées par l’outil de rechercheréférences adéquates hébergées par la banque de données
PrécisionLa précision d’une requête est :•assimilée à la valeur prédictive positive d’un test diagnostique•égale au rapport :références adéquates trouvées par l’outil de recherchetotalité des références trouvées par l’outil de recherche
Il convient de faire évoluer la première équation (qui n’est pas la bonne) :- soit vers plus de sensibilité (en supprimant des membres de l’équation)-soit vers plus de précision (en ajoutant des membres à l’équation)
10. …et la veille bibliographique ?L’équation de veille est différente de celle de recherche
Veille St Girons par Le Xav’ Licence CC BY
Veille St Girons par Le Xav’ Licence CC BY
L’équation de veille est composée de deux parties :- une équation qui explore la partie indexée de MEDLINE- et une équation qui explore la partie non indexée (in process)
Les 2 équations sont unies par l’opérateur OR
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