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SIGNALINK DATABASE

Ana Raquel Nunes24392

Ricardo Fradique24566

Elisabete Alves25983

MENTORES DA SIGNALINK DATABASE

Projecto desenvolvido por professores e estudantes das

seguintes instituições:

• Eötvös University

• Semmelweis University

• Hungarian Academy of Sciences

FUNDAMENTOS PARA A CRIAÇÃO DA SIGNALINK

Inicialmente…

- Vias de transdução de sinal independentes.

Actualmente…

- Grandes interações entre vias de sinalização;

- Necessidade de novas experiências, técnicas de

modelação, e formas de armazenamento.

FUNDAMENTOS PARA A CRIAÇÃO DA SIGNALINK

• Fonte (seed) – proteínas e interações a partir de um pequeno

grupo de artigos de revisão;

• Pesquisa semi-automática da literatura para aprofundar as

proteínas e interações;

• Com critérios de arquivação manuais foram selecionadas

proteínas e interações dos resultados e adicionados às

“sementes”.

OBJECTIVO DA SIGNALINK DATABASE

5

Permitir análises

sistemáticas utilizando

uma rede das principais

vias de sinalização

intracelularesMap of the JAK/STAT pathway in H. sapiens

CARACTERÍSTICAS DA SIGNALINK DATABASE

CRITÉRIOS USADOS PARA DEFINIR E INCLUIR A INFORMAÇÃO

• 1) Pesquisa de informação:• Artigos de revisão;• Bases de dados especificas : WormBase , FlyBase e UniProt;• Resultados de pesquisa do IHOP , ChiliBot , e PubMed.

• 2) Seleção • De interações que tiveram evidência direta e indireta a nível experimental.

• 3) Detalhes técnicos:• Cada interação inserida teve de ser dirigida;• Os artigos analisados que descrevem as interações estavam eram os mais atuais.• Para todos os trabalhos de revisão e cerca de 70% dos artigos foi examinado não só

o seu resumo como também o texto principal.• Duas interações de sinalização entre as mesmas duas proteínas em direções opostas

são listadas separadamente na base de dados.

FINALIDADE DA SIGNALINK DATABASE

Procurar vias de sinalização

Fazer downloads de

artigos e informações sobre

espécies e as suas

vias específicas

Prever funções de proteínas

Observar modelos

de tecidos ou doenças por processos de sinalização

DEMONSTRAÇÃO

www.signalink.org