serveis cientificotècnics (sct) · 2018. 12. 17. · 2 anys 07/08 (prbb) • laboratoris comuns...
Post on 26-Jan-2021
0 Views
Preview:
TRANSCRIPT
-
Serveis Cientificotècnics (SCT)26 de gener de 2009
-
2
ANYS 07/08 (PRBB)
• Laboratoris Comuns– Histologia, Microscòpia, Cultius “externs”, Cultius P2, Reveladora, Instal·lació Radioactiva
• Aparells d’utilització comuna– Ubicats en diferents laboratoris: identificador carbassa
• Centralització d’alguns serveis: – Esterilització, Criopreservació
• Posta en marxa de nous serveis:– Instal·lació i training plataforma de Microarrays
-
3
Direcció SCTMontserrat Torà
SecretariaJordi Manaut
QualitatXavier Palazón
Serveis d’Assessorament
PublicacióBiomèdicaMarta Pulido
AMIB (Metodologia i Bioestadística)
Sergi Mojal
Microarrays Lara Nonell
E.Puigdecanet
Criopreservació i Biobancs
Núria Somoza
EsterilitzacióMontserrat Hidalgo
Cultius i P2Xavier Mayol
Piedad Navarro
Laboratoris Comuns
Piedad Navarro
Histologia
Microscòpia
Cambra fosca i reveladora
Aparellscomuns
Instal·lacióRadioactiva
Mtorà/IHernàndez
InfraestructuresH. del Mar
Servei Patologia
Preparació Blocs d’Histologia
Mª Lluïsa MariñosoConxa Naya
SKY (Cariotipatespectral)
Francesc Solé
MicrodissectorLasser
B. Bellosillo
Microscòpia ElectrònicaJosep Lloreta
ORGANITZACIÓ FUNCIONAL DELS SCT
-
4
Direcció SCTMontserrat Torà
SecretariaJordi Manaut
QualitatXavier Palazón
Serveis d’Assessorament
PublicacióBiomèdicaMarta Pulido
AMIB (Metodologia i Bioestadística)
Sergi Mojal
Microarrays Lara Nonell
E.Puigdecanet
Criopreservació i Biobancs
Núria Somoza
EsterilitzacióMontserrat Hidalgo
Cultius i P2Xavier Mayol
Piedad Navarro
Laboratoris Comuns
Piedad Navarro
Histologia
Microscòpia
Cambra fosca i reveladora
Aparellscomuns
Instal·lacióRadioactiva
Mtorà/IHernàndez
InfraestructuresH. del Mar
Servei Patologia
Preparació Blocs d’Histologia
Mª Lluïsa MariñosoConxa Naya
SKY (Cariotipatespectral)
Francesc Solé
MicrodissectorLasser
B. Bellosillo
Microscòpia ElectrònicaJosep Lloreta
ORGANITZACIÓ FUNCIONAL DELS SCT
-
5
INSTAL·LACIÓ RADIOACTIVA
• Instal·lacions: cambra calenta (“hot lab”), 4 poiates radioactives en 4 laboratoris
• Accés restringit
• Formació a l’usuari
• Aplicatiu: comandes “on line”, registre i consum d’isòtops, usuaris, responsables, etc.
-
6
APLICATIU I.R.
-
7
Direcció SCTMontserrat Torà
SecretariaJordi Manaut
QualitatXavier Palazón
Serveis d’Assessorament
PublicacióBiomèdicaMarta Pulido
AMIB (Metodologia i Bioestadística)
Sergi Mojal
Microarrays Lara Nonell
E.Puigdecanet
Criopreservació i Biobancs
Núria Somoza
EsterilitzacióMontserrat Hidalgo
Cultius i P2Xavier Mayol
Piedad Navarro
Laboratoris Comuns
Piedad Navarro
Histologia
Microscòpia
Cambra fosca i reveladora
Aparellscomuns
Instal·lacióRadioactiva
MTorà/IHernàndez
InfraestructuresH. del Mar
Servei Patologia
Preparació Blocs d’Histologia
Mª Lluïsa MariñosoConxa Naya
SKY (Cariotipatespectral)
Francesc Solé
MicrodissectorLasser
B. Bellosillo
Microscòpia ElectrònicaJosep Lloreta
ORGANITZACIÓ FUNCIONAL DELS SCT
-
8
ESTERILITZACIÓ
-
9
• Àrea de neteja:– Rentat i descontaminació del material volumètric (diari)– Neteja de laboratoris i equipaments
• Calendari programat: Col·laboració dels investigadors !!!– Emergències de neteja.
• Àrea d’esterilització:– Autoclavat de material volumètric (diari)– Servei d’autoclavat de solucions i tampons (diari)– Autoclavat de residus biològics
ESTERILITZACIÓ
Responsable: Montserrat Hidalgo
-
10
Direcció SCTMontserrat Torà
SecretariaJordi Manaut
QualitatXavier Palazón
Serveis d’Assessorament
PublicacióBiomèdicaMarta Pulido
AMIB (Metodologia i Bioestadística)
Sergi Mojal
Microarrays Lara Nonell
E.Puigdecanet
Criopreservació i Biobancs
Núria Somoza
EsterilitzacióMontserrat Hidalgo
Cultius i P2Xavier Mayol
Piedad Navarro
Laboratoris Comuns
Piedad Navarro
Histologia
Microscòpia
Cambra fosca i reveladora
Aparellscomuns
Instal·lacióRadioactiva
Mtorà/IHernàndez
InfraestructuresH. del Mar
Servei Patologia
Preparació Blocs d’Histologia
Mª Lluïsa MariñosoConxa Naya
SKY (Cariotipatespectral)
Francesc Solé
MicrodissectorLasser
B. Bellosillo
Microscòpia ElectrònicaJosep Lloreta
ORGANITZACIÓ FUNCIONAL DELS SCT
-
11
Direcció SCTMontserrat Torà
SecretariaJordi Manaut
QualitatXavier Palazón
Serveis d’Assessorament
PublicacióBiomèdicaMarta Pulido
AMIB (Metodologia i Bioestadística)
Sergi Mojal
Microarrays Lara Nonell
E.Puigdecanet
Criopreservació i Biobancs
Núria Somoza
EsterilitzacióMontserrat Hidalgo
Cultius i P2Xavier Mayol
Piedad Navarro
Laboratoris Comuns
Piedad Navarro
Histologia
Microscòpia
Cambra fosca i reveladora
Aparellscomuns
Instal·lacióRadioactiva
Mtorà/IHernàndez
InfraestructuresH. del Mar
Servei Patologia
Preparació Blocs d’Histologia
Mª Lluïsa MariñosoConxa Naya
SKY (Cariotipatespectral)
Francesc Solé
MicrodissectorLasser
B. Bellosillo
Microscòpia ElectrònicaJosep Lloreta
ORGANITZACIÓ FUNCIONAL DELS SCT
-
12
Direcció SCTMontserrat Torà
SecretariaJordi Manaut
QualitatXavier Palazón
Serveis d’Assessorament
PublicacióBiomèdicaMarta Pulido
AMIB (Metodologia i Bioestadística)
Sergi Mojal
Microarrays Lara Nonell
E.Puigdecanet
Criopreservació i Biobancs
Núria Somoza
EsterilitzacióMontserrat Hidalgo
Cultius i P2Xavier Mayol
Piedad Navarro
Laboratoris Comuns
Piedad Navarro
Histologia
Microscòpia
Cambra fosca i reveladora
Aparellscomuns
Instal·lacióRadioactiva
Mtorà/IHernàndez
InfraestructuresH. del Mar
Servei Patologia
Preparació Blocs d’Histologia
Mª Lluïsa MariñosoConxa Naya
SKY (Cariotipatespectral)
Francesc Solé
MicrodissectorLasser
B. Bellosillo
Microscòpia ElectrònicaJosep Lloreta
ORGANITZACIÓ FUNCIONAL DELS SCT
-
13
ANY 2009
• Unificació i ampliació de Cultius
• Nova instal·lació de Criopreservació (biobancs) soterrani PRBB
• Posta en marxa del Servei de Microarrays (SAM)
• Programa de Gestió de la Qualitat del SCT
• Sessions SCT: Microarrays, Criopreservació, Cultius, Edició Mèdica,…
-
14
COMUNICACIÓ
• Rebre el feed back dels investigadors: iniciatives, propostes, necessitats,…
• Canalització de les propostes (des dels investigadors als SCT): a través dels Caps de Programa
• Informació als investigadors (des dels SCT als investigadors):
– General: a través dels Caps de Programa que n’han de fer difusió a les persones del seu grup Caps de grup investigadors i tècnics
– Específica: a través de llistats d’usuaris registrats a la I.R., Cultius, P2, etc.
-
15
SCT
-
CRIOPRESERVACIÓNúria Somoza
-
17
QUINS SERVEIS OFERIM?
CRIOPRESERVACIÓ
Monitoritzacióequips fred
Assignacióespais fred/
Gestió localitzaciómostres
Centralització /Repartiment gel sec
Assessorament
Transport mostres
Codificació/etiquetatmostres
BiobancsDispensació N2Len lleteres
-
18
MONITORITZACIÓ EQUIPS FRED
• Tots els equips estan monitoritzats mitjançant sondes externes i emissors RF (radiofreqüència).
• Les dades s’envien a un servidor on són emmagatzemades.
• Els grups interessats en tenir els registres ho poden sol·licitar per correu electrònic indicant l’equip de fred i la periodicitat en que ho volen rebre.
-
19
GRÀFIC DEL REGISTRES DE Tª D’UN CONGELADOR -80ºC
-
20
GESTIÓ DELS ESPAIS DE FRED
• Instal·lacions:– Cambra 4ºC, Cambres -20ºC, sales amb control d’accés per ultracongeladors, 2 contenidors
automàtics N2L.
• Gestió de l’espai :– Assignació espai– Ampliació espai– Nou equip fred
• Com gestionem l’espai?:– Comunicació de necessitats mitjançant el qüestionari de projectes de criopreservació– Aplicatiu criopreservació per assignar l’espai als diferents projectes
-
21
QÜESTIONARI PROJECTES CRIOPRESERVACIÓ
-
22
Gestió de l’espai
-
23
APLICATIU: GESTIÓ ESPAIS
-
24
Gestió localització mostres
-
25
APLICATIU: GESTIÓ LOCALITZACIÓ MOSTRES
-
26
Gel sec
• Centralització del gel sec que es rep en enviaments de reactius/mostres
• Repartiment als grups que ho demanin, sol·licitar-ho amb temps suficient
• Emplenat de lleteres amb N2L: sol·licitud mitjançant correu electrònic
• Obertura tancs per recollida/entrega de mostres: dimarts i dijous a les 12h
N2L
Altres serveis
-
27
ASSESSORAMENT
• Formació en prevenció de riscos associats a la manipulació N2L
• Transport de mostres biològiques
• Codificació i etiquetat
-
28
PERSPECTIVES 2009
• Noves instal·lacions: – Adequació d'àrea planta -2 dedicada a ultracongeladors per mostres biobancs.– Accés restringit
• Desplegament aplicatiu per gestionar localització mostres
*BOE número 159 de 4/7/2007 LEY 14/2007, de 3 de julio, de Investigación biomédica
-
29
QUI SOM I COM CONTACTAR?
• Núria Somoza:
Parc de Recerca Biomèdica de Barcelona (despatx 121, costat hospital)Doctor Aiguader, 88 | 08003 BarcelonaTel. 933 160699nsomoza@imim.eswww.imim.es
-
SERVEI D’ANÀLISI DE MICROARRAYS (SAM)Lara Nonell
-
31
QUÈ ÉS I QUÈ FEM?
• Nou servei cientificotècnic de suport per a estudis d’investigacióbàsica, farmacogenòmica i, fins i tot, de diagnòstic
• Processat de microarrays utilitzant la plataforma tecnològica GeneChip d’Affymetrix
• Servei integrat per a estudis d’expressió gènica i de genòmica– Orientació en el disseny – Processat dels microarrays– Anàlisi de dades
• Servei prioritari a l’IMIM i PRBB però obert a altres institucions
-
32
Arrays humans disponibles• Human Exon 1.0 ST• GW Human SNP array 6.0
Possibilitat d’utilitzar microarrays d’altres tipus i espècies
APLICACIONS
• Arrays d’expressió– Descobriment de nous gens/biomarcadors involucrats en mecanismes complexos– Estudis de perfils d’expressió gènica, farmacogenòmica i toxicogenòmica– Classificació i models predictius de malalties complexes– Detecció de splicing alternatiu
• Arrays de SNPs– Detecció de guanys i pèrdues de regions genòmiques (cariotip molecular, LOH i UPD) – Determinació del nombre de còpies per a la detecció i diagnòstic de malalties genètiques – Genotipat de SNPs– Estudis de genètica poblacional i d’associació
• Aplicacions integrades
-
33
FUNCIONAMENT
Processat Laboratori
Assessorament
Sol·licitud entrevista
PressupostAprovaciópressupost
SI
NO
Anàlisi de dades
Resultats
-
34
QUI SOM I ON SOM?
• Responsable del serveiDra. Montse ToràEmail: mtora@imim.es
• Responsable científicDr. Francesc SoléEmail: fsole@imas.imim.es
• Responsable de l’anàlisi de dadesLara NonellEmail: lnonell@imim.es
• Responsable de laboratoriEulàlia PuigdecanetEmail: epuigdecanet@imim.es
• Despatx 166 (ext. 1577)• Laboratori 273.10.01
• Horari d’atencióDll.-DV.: 10-14hDj.: 15-18h
-
ÀREA DE CULTIUS CEL·LULARSXavier Mayol
-
36
ÀREA DE CULTIUS CEL·LULARS
280.01
280.02278P2
276274
en const
rucció
Cabines de bioseguretat 4 5 (2) 2 4 = 10 + 5
Incubadors CO2 4 6 (2) 2 4 = 10 + 6
Capacitat màxima 16-20 24-30 (?) 8-12 16-20 = 46 + 27(USUARIS)
-
37
• Preparació de medis de cultius.
• Test de micoplasma.
• Banc de línies cel·lulars.
SERVEIS
-
38
• Preparació de medis de cultius.
• Test de micoplasma.
• Banc de línies cel·lulars.
SERVEIS
-
39
• Comandes setmanals / quinzenals
• Medis freqüents D-MEM suplementats FBSRPMI Glutamina
PiruvatEstreptomicina + penicil·lina
• Lot homogeni de FBS ( 2 – 3 anys)
PREPARACIÓ DE MEDIS DE CULTIUS
-
40
• Preparació de medis de cultius.
• Test de micoplasma.
• Banc de línies cel·lulars.
SERVEIS
-
41
• Mycoplasma Detection PCR Kit ( Minerva – LabClinics ).
• 1 test / setmana.
TEST DE MICOPLASMA
-
42
• Preparació de medis de cultius.
• Test de micoplasma.
• Banc de línies cel·lulars.
SERVEIS
-
43
BANC DE LÍNIES CEL·LULARS
• Projecte dins la xarxa del FIS RTICCC ( 2004 ).
• 150 línies cel·lulars congelades en N2 líquid.
• Qualitat:– Passatges primerencs.– Origen i manteniment.– Micoplasma.
• Entrega de vials congelats 2 dies / setmana.
• 140 usuaris enregistrats.
-
44
WEB BANC DE LÍNES CEL·LULARS
• http://blc.imim.es
-
45
QUI SOM i ON SOM?
• Responsable: Xavier Mayol (Programa de Recerca de Càncer)
• Tècnic del servei: Piedad Navarro (SCT)
-
SERVEI D’ASSESSORAMENT BIOESTADÍSTIC (AMIB)Sergi Mojal
-
47
SERVEIS QUE S’OFEREIXEN
• Assessorament en el disseny de protocols
• Estimació de la grandària de la mostra
• Generació de llistes d'aleatorització
• Disseny, maneig i control de qualitat de bases de dades
• Anàlisis estadístiques amb programari SPSS, R o d’altres segons convingui
• Generació de gràfiques
• Assessorament en comunicacions i publicacions
-
48
EXEMPLE DE GRÀFIC
-
49
DADES DE CONTACTE
• Responsable Sergi Mojal
• Localització: despatx 160
• Tel. +34 93 316 06 34, extensió 1634
• Correu electrònic: smojal@imim.es
-
SERVEI D’ASSESSORAMENT EN PUBLICACIONS BIOMÈDIQUESMarta Pulido
-
51
SERVEI INTEGRAL DE LA PUBLICACIÓN BIOMÉDICA QUE INCLOU TOTES LES ETAPES DEL PROCÉS DE PUBLICACIÓ
• Valoració de les possibilitats de publicació d'un manuscrit a la literatura internacional i nacional
• Traducció inversa i directa de texts biomèdics especialitzats en: espanyol, català i anglès
• Cerques bibliogràfiques
• Correcció editorial del text (editing)
• Assessorament i cerca de la revista adient
-
52
SERVEI INTEGRAL DE LA PUBLICACIÓN BIOMÉDICA QUE INCLOU TOTES LES ETAPES DEL PROCÉS DE PUBLICACIÓ
• Preparació de la versió final del manuscrit d'acord amb les normes de la revista
• Model de carta al director de la revista per tal de presentar el manuscrit
• Acompliment de formularis: conflictes d'interès, copyright, autoria, separates, etc.
• Valoració de les crítiques del peer review i cartes de resposta als revisors
• Recursos d'Internet i publicació d'articles biomèdics
-
53
SERVEI INTEGRAL DE LA PUBLICACIÓN BIOMÉDICA QUE INCLOU TOTES LES ETAPES DEL PROCÉS DE PUBLICACIÓ
• Comprovació de referències bibliogràfiques amb la font original
• Disseny de taules i figures
• Tramesa del manuscrit per Internet (sistemes tipus Manuscript Central)
• Llistes de comprovació segons el disseny de l’estudi (CONSORT, STROBE, etc.)
-
54
FUNCIONAMENT
• Divendres, de 8,30 a 17,00 hores
• Resta de dies contactar per correu electrònic o telefònicament al 93 2007189 y 607732221
-
55
• Dra. Marta Pulido
• IMIM, despatx 160
• Telèfon 93 3160604
• Correu electrònic:
• mpulido@imim.es y mpulidomestre@gmail.com
RESPONSABLE DEL SERVEI
-
EL SISTEMA DE GESTIÓ DE LA QUALITAT ALS SCTXavier Palazón
-
57
EL SISTEMA DE GESTIÓ DE LA QUALITAT DELS SCT
Quin sistema?Norma ISO 9001:2008
• Què és això?És un sistema que gestiona informació.La informació està continguda en registres (suport paper o electrònic)Els registres estan definits en uns documents que anomenem PNT
• Per a què serveix aquesta informació?Per saber si es treballa en les millors condicionsPer corregir i prevenir problemes Per millorar l’organitzacióPer millorar la prestació de serveis
-
58
• Què demana que facin els usuaris dels SCT- Col·laboració en el seguiment de la normativa establerta- Participació en els Grups de Millora que es crearan- Adaptació al canvi
EL SISTEMA DE GESTIÓ DE LA QUALITAT DELS SCT
-
59
QUÈ ÉS EL CICLE DE MILLORA CONTINUA?
Revisióde la direcció
Prestacióde servei
Medició, Anàlisii Millora
Planificació i Gestiódels recursos
USUARISCLIENTS
RequisitsNecessitats
USUARISCLIENTS
SatisfaccióNecessitats
-
TORN OBERT DE PREGUNTES
top related