structure et fonction des protéines 2
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Structure et Fonction des Protéines 2
• 3 crédits• 24 heures de cours
– Amphi 2– 12 janvier-> 4 mars
• 8 heures de TP– Bio Cell : 8 / 26 mars– Bioch : 29 mars 23 avril
• Responsable – Jean-Pierre Duneau– jean-pierre.duneau@univmed.fr
Structure et Fonction des Protéines 2
• 3 crédits•24 heures de cours (12 jan-> 4 mars)
– I Modifications post-traductionnelles des protéines• Pr. Assou El-Battari • 14 heures• Les Mardi à 14h00 + jeudi 4/03 à 8h00
– II Relation Structure-Dynamique-fonction• Jean-Pierre Duneau• 10 heures• Les Jeudi à 8h sauf le 28/01 -> Mercredi 27/01
Maturation structurale et fonctionnelle des protéines
1- Régulation de la traduction des protéines. Rappels2- Modifications co- et post-traductionnelles
La glycosylation2.1: Les glucides (Rappel)2.2: La N-glycosylation (modification co-traductionnelle)2.3: La O-glycosylation (modification post-traductionnelle)
3- Formation des protéoglycanes et glycosaminoglycanes Synthèse de l'héparine et de l'acide hyaluronique
4- Anchrage GPI des protéines membranaires (Glypiation)5- Autres modifications co- et post-traductionnelles
5.1: Formation des ponts disulfures5.2: Clivage protéolytique. Exemple des facteurs de coagulation 5.3: Amidation, acylation, sulfatation, phosphorylation
1- Régulation de la traduction des protéines. Rappels
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GlcNAc-PP-Dol
GlcNAc1- 4GlcNAc-PP-Dol
Man1 - 4GlcNAc1- 4GlcNAc-PP-Dol
UDP-GlcNAc
UMP
Dolicholphosphate N-acétylglucosamine phosphotransférase
UDP-GlcNAc
UDP
N-acétylglucosaminyl diphosphodolicholN-acétylglucosaminyltransférase
GDP
Dolichol diphosphochitobiosemannosyltransférase
GDP-Man
4GDP
Glycolipide -mannosyltransférases4(GDP-Man)
CY
TO
PL
AS
ME
PP-Dol
6Man1 - 4GlcNAc1 - 4GlcNAc-PP-Dol3
Man1Man1 - 2Man1
Man1 – 2Man1 Dol-P-Man glycolipide-mannosyltransférase
6Man1 - 4GlcNAc1 - 4GlcNAc-PP-Dol3
6Man13
Glc1 - 2Glc1 - 3Glc1 - 3Man1 - 2Man1 - 2Man1
Man1 - 2Man1
Man1 - 2Man1
Glycolipide -glucosyltransférase
RE
TIC
UL
UM
Flippase
P-Dol
GlcNAc-PP-Dol
GlcNAc1- 4GlcNAc-PP-Dol
Man1 - 4GlcNAc1- 4GlcNAc-PP-Dol
6Man1 - 4GlcNAc1 - 4GlcNAc-PP-Dol3
Man1
Man1 - 2Man1 - 2Man1
6Man1 - 4GlcNAc1 - 4GlcNAc-PP-Dol3
6Man13
Man1 - 2Man1 - 2Man1
Man1 – 2Man1
Man1 - 2Man1
6Man1 - 4GlcNAc1 - 4GlcNAc-PP-Dol3
6Man13
Glc1 - 2Glc1 - 3Glc1 - 3Man1 - 2Man1 - 2Man1
Man1 - 2Man1
Man1 - 2Man1
6Man1 - 4GlcNAc1 - 4GlcNAc-Asn.peptide3
6Man13
Glc1 - 2Glc1 - 3Glc1 - 3Man1 - 2Man1 - 2Man1
Man1 - 2Man1
Man1 - 2Man1
6Man1 - R3
6Man13
Glc1 - 3Man1 - 2Man1 -2Man1
Man1 - 2Man1
Man1 - 2Man16Man1 - R3
6Man13
Man1 - 2Man1 - 2Man1
Man1 - 2Man1
Man1 - 2Man1
6Man1 - R3
6Man13
Man1 - 2Man1 - 2Man1
Man1 - 2Man1
Man1
UDP-GlcNAcUMP
Dolicholphosphate N-acétylglucosamine phosphotransférase
UDP-GlcNAcUDP
N-acétylglucosaminyl diphosphodolicholN-acétylglucosaminyltransférase
GDPDolichol diphosphochitobiose
mannosyltransférase
GDP-Man
4GDPGlycolipide -mannosyltransférases4(GDP-Man)
4Dol-PDol-P-Man glycolipide-mannosyltransférase
4(Man-P-Dol)
3Dol-PGlycolipide -glucosyltransférase3(Glc-P-Dol)
PP-DololigosaccharidyltransférasePeptide-(Asn-X-Ser/Thr)
1 Glc
1 Glc
Mannosyl-oligosaccharide-glucosidase I
-glucosidase II
UDP-GlcUDP
Glc
UDP-Glc:1,3glucosyltransférase
-glucosidase II
1 Man Mannosyl-oligosaccharide1,2--mannosidase IA
cyto
pla
sme
lum
ière
Figure 1 : Biosynthèse des N-glycannes dans le RE
R
RE
P
ERp57(disulphide isomerase)protein foldingon/off calnexin
glucosyl-transferase
-glucosidase II
-glucosidase I & II
P
Glc
GlcMan
Man
Glc
other chaperones
P
G II
P
cx
ER
Golgi
P
EDEM
EDEM
proteasome
Sec61
mannosidase
ERGIC-53
64Man1 - 4GlcNAc1 - 4GlcNAc1 - Asn3
64 Man13
GlcNAc1
GlcNAc1
GlcNAc1
GlcNAc1
64 Man13
GlcNAc1
GlcNAc1
GnT V
GnT VI
GnT II
GnT III
GnT IV
GnT I
6Man1 - R3
6Man13
Man1
Man1
Man16Man1 R3
Man1
Man1
6Man1 - R3
6Man13
GlcNAc1-2Man1
Man1
Man1 6GlcNAc1 - 4Man1 - R,R ’ 3
6Man13
GlcNAc1-2Man1
Man1
Man1 64GlcNAc1- 4GlcNAc-Asn-peptide
Fuc1
6Man1 - R,R ’3
Man1
GlcNAc1-2Man1
6GlcNAc1 - 4Man1 - R,R ’ 3
Man1
GlcNAc1-2Man1
6Man1 - R, R ’3
GlcNAc1-2Man1
GlcNAc1-2Man1 6GlcNAc1 - 4Man1 - R,R ’ 3
GlcNAc1-2Man1
GlcNAc1-2Man1
6Man1 R,R ’3
6Man12
GlcNAc1-2Man1
GlcNAc1
GlcNAc1 6GlcNAc1 - 4Man1 - R,R ’ 3
6Man12
GlcNAc1-2Man1
GlcNAc1
GlcNAc1
6Man1 - R,R ’34
Man12
GlcNAc1- 2Man1
GlcNAc1
GlcNAc1
6GlcNAc1 - 4Man1 - R,R ’ 3
4Man12
GlcNAc1-2Man1
GlcNAc1
GlcNAc1
6GlcNAc1 - 4Man1 - R,R ’ 3
4Man12
GlcNAc1
GlcNAc1
6Man12
GlcNAc1
GlcNAc16Man1 - R,R ’34
Man12
GlcNAc1
GlcNAc1
6Man12
GlcNAc1
GlcNAc16Man1 - R,R ’34
Man12
GlcNAc1
GlcNAc1
6GlcNAc1 - 4Man1 2
GlcNAc1
GlcNAc1 6GlcNAc1 - 4Man1 - R,R ’ 3
4Man12
GlcNAc1
GlcNAc1
6GlcNAcb1 - 4Man1 2
GlcNAc1
GlcNAc1
R ’
GnT III
GnT III
GnT III
GnT III
GnT III GnT III
GnT III
GnT V
GnT IV
GnT VI
GnT IVGnT V
Mannosyl-oligosaccharide1,3-1,6--mannosidase II
GnT II
GnT I Glycoprotéine-6--L-fucosyltransférase
Mannosyl-oligosaccharide1,3-1,6--mannosidase III
GnT I
Figure 4 : Action des GnTs dans la biosynthèse des N-glycannes. R= 4GlcNAc1 -4GlcNAc-Asn.peptide, R ’=
6Man1 - R3
6Man13
Man1 - 2Man1 - 2Man1
Man1 - 2Man1
Man1
Mannosyl-oligosaccharide1,2--mannosidase IB
GnT IV
6Man1 - R,R ’34
Man12
Man1
GlcNAc1
GlcNAc1
64GlcNAc1- 4GlcNAc-Asn-peptide.
Fuc1
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