visuomenės mokslas ir biohacking'as (nma žiemos sesija 2016, palanga)

EGLĖ MARIJA RAMANAUSKAITĖ, MScVilnius University, Citizen Cyberlab, Human Computation Institute

VISUOMENĖS MOKSLAS (CITIZEN SCIENCE) „ŽMONIŲ KOMPIUTERIJA“ BIOHACKING‘AS ... IR KITI DALYKAI !

Seplutia

@Seplute ir @mmokslas

linkedin.com/in/eglemarija

facebook.com/EgMaRam

emramanauskaite@gmail.com

# citizenscience # openscience # wecantwait #wecurealz # savethebees

# mmokslas

Mano mokslo populiarinimo straipsnių galite rasti technology.org ir kitur!

KĄ MES ŠIANDIEN VEIKSIME:

Tyrinėsime:

• „visuomenės mokslą“ (citizen science), „žmonių kompiuteriją“

• „debesų biochemiją“

• „biohackingą“, „atvirą mokslą“ (open science)

Galvosime:

• Kuo svarbus Mokslas 2.0, ypač atviras duomenų dalijimasis, „atvira genomika“ ir kt.

Hackinsime!

VISUOMENĖS MOKSLAS

(CITIZEN SCIENCE)

CITIZEN SCIENCE – real scientific research done by or together with non-scientists

• Popular in the English-speaking world, esp. US

• Europe catching up …

• Mostly biodiversity, but others popping up

HOW:• volunteer

computing

Rosetta@home

• thinking

Cell Slider (Cancer Research UK)

• gaming

EyeWire

FoldIt

Phylo

• sensing

WHY DOES CITIZEN SCIENCE MATTER?

Q1. Can you… be in a lot of places at once?

CITIZEN SCIENTISTS can

Charlop-Powers, Z. et al. (2015). Global biogeographic sampling of bacterial secondary metabolism. eLife, 4, e05048.

Q2. Can you… trick time to squeeze in ALL THAT DATA??

Q3. Or have a free-to-use supercomputer right in your lab???

CITIZEN SCIENTISTS will help you (if you ask kindly)

CITIZEN SCIENTISTS:

× ARE NOT cheap labor!

Enjoy learning about science

Appreciate a fun way to spend time

See the Big Picture & want to contribute to science!

PRIE KO ČIA „DEBESŲ BIOCHEMIJA“ ?Tai biochemija, kuri atliekama nebe laboratorijoje, o „kažkur kitur“

Pvz.:

• Tyrimai užsakomi iš privačių įmonių

• Eksperimentai „simuliuojami“ kompiuterinių algoritmų

• (jei tai nepavyksta – neracionalu) duomenis renka arba apdoroja civiliai mokslininkai

Ir pan.

Kas tuomet lieka „profesionaliems“ biochemikams?

Ar visuomenės mokslas, atviras mokslas, atviri duomenys – nėra „pavojingi“ visuomenei?

Ar Mokslo 2.0 (Science 2.0) laikais išliks vietos profesionaliam mokslui, profesionalioms

laboratorijoms?

IS CITIZEN SCIENCE RELIABLE?

YES:• 1 trained researcher = 23 citizen scientists

• Thousands of volunteers do this

• Usually one task / puzzle / experiment is given to several citizen scientists

CITIZEN SCIENTISTS: Have skills unmatched by any computer

Have “microexpertise” that makes a powerful team

Are quick to learn

Think outside the box!!

Not noise… whole new type of galaxy!

CITIZEN SCIENTISTS CAN: Achieve breakthroughs

Publish papers

Help solve the world’s most pressing problems, like climate change, Alzheimer’s, cancer…

Follett R, Strezov V (2015) An Analysis of Citizen Science Based Research: Usage and Publication Patterns. PLoS ONE 10(11): e0143687.

BENDROMIS ŽMONIŲ IR JŲ UNIKALIŲ

SUGEBĖJIMŲ JĖGOMIS GELBĖJAM PASAULĮ

ŽMONIŲ KOMPIUTERIJA(HUMAN COMPUTATION)

Gal kas pasiūlytų geresnius vertimus „visuomenės mokslui“, „žmonių kompiuterijai“, „debesų biochemijai“, „atviram

mokslui“ ?..

BIOHACKING‘AS

„PASIDARYK PATS“ BIO (DIY BIO)

Kodėl „Pasidaryk Pats“?

Ar inovacijoms didesnį potencialą turi „paprasti“ žmonės, ar mokslininkai?

Pavojai?

Hackeriai ar teroristai ?

Kas yra DNR barkodinimas? (DNA barcoding)

Kodėl lyginama su asmeninių kompiuterių pradžia?

Ką norėtumėt nubiohackintipirmiausia?

Kokį vaidmenį biohacking‘as turi visuomenės moksliniam „išprusimui“?

herocoli.com

PERSONAL GENOME PROJECT

Kam sekvenuoti individualius genomus?

Privalumai?

Pavojai?

Ar visus klausimus atsakys genomo sekos žinojimas?

Ar norėtumėt žinoti savo genomo seką?

OPENSNP

Ar įdėtumėte savo genomo seką į laisvai prieinamus internetus?

Dalius !

KĄ BIOHACKINSIME?

Global abundance and comparative distribution of AD/KS sequences.The global abundance (A

and C), sample-to-sample variation (B and D), and geographic distribution (E, F, G, and H) of

adenylation domains (AD) and ketosynthase domains (KS) were asse...

Zachary Charlop-Powers et al. eLife Sciences

2015;4:e05048

Biomedically relevant natural product hotspots and diversity.Hotspot analysis of natural product

biosynthetic diversity to identify samples with a high total proportion of reads corresponding to

a natural product family of interest (A and D), the ...

Zachary Charlop-Powers et al. eLife Sciences

2015;4:e05048

O DABAR… IMPROVIZUOSIM