année 2008-2009 phylogénie des microbes endolithiques associés aux basaltes marins ue 106 dom -...
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Année 2008-2009
Phylogénie des microbes endolithiquesassociés aux basaltes marins
UE 106 DOM - Diversité des organismes marins
40 cm
Connaissances antérieures
1
Stuctures cellulaires observées
dans le basalte
Pillow lavas au niveau de la dorsale Est-Pacifique
5 µm 5 µm
40 cm
Santelli (2008) Nature
40 cm
Exemple d’une communauté microbienne en relation avec le basalte au Mont Baby Bare
Huber (2006) Environmental Microbiology 2
But de l’étude
Source : wikipedia
- Phylogénie des microbes associés à ces roches
-Distribution géographique des clades déterminés
3Source : www.geologie.ens.fr
Résultats et Discussion
4
11 clades monophylétiques solides originaires des sédiments, du basalte et du gabbro
7 appartiennent aux bactéries
4 appartiennent au Marine Group 1 Crenarcheota
MGI Crenarcheota
ε-proteobacteria
β-proteobacteria
γ-proteobacteria
Division Candidate TM6
δ-proteobacteria
α-proteobacteria
Verrucomicrobia
AcidobacteriaPlanctomycetes
Firmicutes
Actinobacteria
ChloroflexiBacteroidetes
β-proteobacteria
δ-proteobacteria
α-proteobacteria
Verrucomicrobia
AcidobacteriaPlanctomycetes
Firmicutes
Actinobacteria
ChloroflexiBacteroidetes
(4 clades solides)
(2 clades solides)
(2 clades solides)
5
Colonisation de la croûte par clades cosmopolites et spécifiques.Un clade du MG1 endémique du basalte.
Clades différents de ceux trouvés dans les autres habitats marins Un nouveau monde …
Travail des autres équipes
6
Massana, 2000
- Etude basée uniquement sur les Archea
- Répartition mondiale
Huber, 2006
- Domination des Bactéries
- Clades différents de ceux des autres biotopes
7
Santelli, 2008 :
- Bactéries (66% de Proteobacteria) plus abondantes que Archea
-Clades différents de ceux des autres biotopes
- Répartition mondiale
Bibliographie
8
- Santelli C.M., Orcutt B.N., Banning E., Bach W., Moyer C.L., Sogin M.L., Staudigel H. & Edwards K.J. Abundance and diversity of microbial life in ocean crust. Nature 453 : 653-657 (2008)
- Huber J.A., Johnson P., Butterfield D.A. & Baross J.A. Microbial life in ridge flank crustal fluids. Environmental Microbiology 8 : 88-99 (2006)
- Santelli C.M., Edgcomb V.P., Bach W. & Edwards K.J. The diversity and abundance of bacteria inhabiting seafloor lavas positively correlate with rock alteration. Environmental Microbiology 1-13 (2008)
- Massana R., DeLong E.F., Pedros-Alio C. A Few Cosmopolitan Phylotypes Dominate Planktonic Archaeal Assemblages in Widely Different Oceanic Provinces. Applied and Environmental Microbiology. 66 : 1777-1787 (2000)