antİbİyotİkler ve...

44
ANTİBİYOTİKLER VE MİKROBİYOTA 10 NİSAN 2017, ANKARA Prof. Dr. Esin Şenol

Upload: others

Post on 08-Aug-2020

2 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

Page 1: ANTİBİYOTİKLER VE MİKROBİYOTAprobiyotik2017.ftskongre.org/webkontrol/uploads/files/...(Mikrobiyom analizi): Aynı anda yüzbinlerce genomu inceleyebiliyor, ama bunları tanımlayamıyor,

ANTİBİYOTİKLER VE MİKROBİYOTA 10 NİSAN 2017, ANKARA

Prof. Dr. Esin Şenol

Page 2: ANTİBİYOTİKLER VE MİKROBİYOTAprobiyotik2017.ftskongre.org/webkontrol/uploads/files/...(Mikrobiyom analizi): Aynı anda yüzbinlerce genomu inceleyebiliyor, ama bunları tanımlayamıyor,

1945-NOBEL ÖDÜLÜ

Page 3: ANTİBİYOTİKLER VE MİKROBİYOTAprobiyotik2017.ftskongre.org/webkontrol/uploads/files/...(Mikrobiyom analizi): Aynı anda yüzbinlerce genomu inceleyebiliyor, ama bunları tanımlayamıyor,
Page 4: ANTİBİYOTİKLER VE MİKROBİYOTAprobiyotik2017.ftskongre.org/webkontrol/uploads/files/...(Mikrobiyom analizi): Aynı anda yüzbinlerce genomu inceleyebiliyor, ama bunları tanımlayamıyor,

MİKROBİYOTA

(a)Lactobacillus acidophilus

(b)Lactobacillus casei

(c)Bifidobacterium bifidum

Page 5: ANTİBİYOTİKLER VE MİKROBİYOTAprobiyotik2017.ftskongre.org/webkontrol/uploads/files/...(Mikrobiyom analizi): Aynı anda yüzbinlerce genomu inceleyebiliyor, ama bunları tanımlayamıyor,

KOLONİZAN MI? PATOJEN Mİ?

Page 6: ANTİBİYOTİKLER VE MİKROBİYOTAprobiyotik2017.ftskongre.org/webkontrol/uploads/files/...(Mikrobiyom analizi): Aynı anda yüzbinlerce genomu inceleyebiliyor, ama bunları tanımlayamıyor,

MİKROBİYOTA- ETKİ EDEN FAKTÖRLER

Page 7: ANTİBİYOTİKLER VE MİKROBİYOTAprobiyotik2017.ftskongre.org/webkontrol/uploads/files/...(Mikrobiyom analizi): Aynı anda yüzbinlerce genomu inceleyebiliyor, ama bunları tanımlayamıyor,
Page 8: ANTİBİYOTİKLER VE MİKROBİYOTAprobiyotik2017.ftskongre.org/webkontrol/uploads/files/...(Mikrobiyom analizi): Aynı anda yüzbinlerce genomu inceleyebiliyor, ama bunları tanımlayamıyor,

Hücrelerimizin yalnızca ¼ ü bizim

Gut mikrobiyota:

37 trilyon, >3 misli

Page 9: ANTİBİYOTİKLER VE MİKROBİYOTAprobiyotik2017.ftskongre.org/webkontrol/uploads/files/...(Mikrobiyom analizi): Aynı anda yüzbinlerce genomu inceleyebiliyor, ama bunları tanımlayamıyor,

ESNEKLİK EN ÖNEMLİ GÜÇ !

Page 10: ANTİBİYOTİKLER VE MİKROBİYOTAprobiyotik2017.ftskongre.org/webkontrol/uploads/files/...(Mikrobiyom analizi): Aynı anda yüzbinlerce genomu inceleyebiliyor, ama bunları tanımlayamıyor,

İntestinal Flora Araştırma Teknikleri

Kültür:≥%80 kültüre edilemiyor

16SrRNA: Bakteriye spesifik, ama tek bakteri

Microarray analiz veya benzer genomik testler (Mikrobiyom analizi): Aynı anda yüzbinlerce genomu inceleyebiliyor, ama

bunları tanımlayamıyor, daha çok uzaktan çekilmiş bir resmini veriyor

Metabolomik: Bakterilerin ürettiği biyokimyasal ürünlerin profilini

çıkarıyor

«Omics»

Page 11: ANTİBİYOTİKLER VE MİKROBİYOTAprobiyotik2017.ftskongre.org/webkontrol/uploads/files/...(Mikrobiyom analizi): Aynı anda yüzbinlerce genomu inceleyebiliyor, ama bunları tanımlayamıyor,

NE BİLİYORUZ/BİLMİYORUZ ?

• BARSAK MİKROBİYOM EN ÇOK BİLDİĞİMİZ – Barsak>17.5K – Oral ≈5K – Diğer ≈3.5 K

• DEĞİŞİM MÜMKÜN-----ANTİBİYOTİKLER • SAĞLIKTA VE HASTALIKTA FARKLI; YUMURTA-TAVUK • BARSAK DIŞI MİKROBİYOM • UZAK/LOKAL ETKİLERİ • PROBİYOTİKLERİN ETKİLERİNE DİYET ETKİSİ • MİKROBİYOM ZAMAN İÇİNDE GENEL OLARAK STABİL İSE,

PROBİYOTİKLERİN MİKROBİYOM ÜZERİNDE «ETKİSİ» VAR MI ?

Patricia Hibbard –IDWeek, San Diego ; 4-8 Ekim 2017

Page 12: ANTİBİYOTİKLER VE MİKROBİYOTAprobiyotik2017.ftskongre.org/webkontrol/uploads/files/...(Mikrobiyom analizi): Aynı anda yüzbinlerce genomu inceleyebiliyor, ama bunları tanımlayamıyor,

ANTİBİYOTİK MİKROBİYOTA ETKİLEŞİMLERİ

• ANTİBİYOTİK ETKİ SPEKTRUMU, DOZ, SÜRE, VERİLİŞ YOLU,PK/PD MEKANİZMALARI

• AAD

• Mayaların aşırı çoğalması

• Metabolizma ve vitamin emiliminin bozulması

• İnfeksiyon duyarlılığının artması

• DİRENÇ VE DİRENÇ YAYILIMI – Kısa süreli temas bile; «R» bakteri populasyonunu

stabilize ediyor ve yıllarca barsakta kalıyor Jernberrg C.Microbiology 2010:156:3216-3223 Jakobsson HE.PloSONE e.9836 Jernberg C .ISME 2007 :1:56-66

Page 13: ANTİBİYOTİKLER VE MİKROBİYOTAprobiyotik2017.ftskongre.org/webkontrol/uploads/files/...(Mikrobiyom analizi): Aynı anda yüzbinlerce genomu inceleyebiliyor, ama bunları tanımlayamıyor,

ANTİBİYOTİKLER VE MİKROBİYOTA

• MİKROBİYOM BÜTÜNLÜK VE ZENGİNLİĞİNE ETKİ

– Çeşitlilik azalıyor: ≈1000 tür, 7000 suş

– Populasyon dinamikleri bozuluyor

• İntrensik «kolonizasyon direnci» azalıyor

DİSBİYOZİS

Mitchell LJones.Gut Microbes 2014:5:4 MacFarlane S.Environmental Microbiology 2014:16:4

Page 14: ANTİBİYOTİKLER VE MİKROBİYOTAprobiyotik2017.ftskongre.org/webkontrol/uploads/files/...(Mikrobiyom analizi): Aynı anda yüzbinlerce genomu inceleyebiliyor, ama bunları tanımlayamıyor,

Antibiyotiklerin barsak florasına etkisi

KOLLATERAL HASAR

E.coli↑- Konak Stres↑-Mikrobiyota gen transferi-periferik organlarda

immun cevap↓

Page 15: ANTİBİYOTİKLER VE MİKROBİYOTAprobiyotik2017.ftskongre.org/webkontrol/uploads/files/...(Mikrobiyom analizi): Aynı anda yüzbinlerce genomu inceleyebiliyor, ama bunları tanımlayamıyor,

Normal B Florası Antibiyotiklerle

karşılaşan

floranın bozulması

(Beyaz)

Karbonhidrat

metabolizmasındaki

bozulma

Ozmotik

Anaerobik bakteri supresyonu

Azalmış Kısa Zincirli

Yağ Asitleri

inflamasyon Bozulan mikroflora

(ör, C difficile)

ANTİBİYOTİK

İSHAL

Bouhnik Y. Gut Microflora Digestive Physiology And Pathology. Paris;

2009:181-197.

ANTİBİYOTİK İLİŞKİLİ İSHAL

TANIM:ANTİBİYOTİK ALIRKEN VEYA 8 HAFTA

SONRASINA KADAR GELİŞEN İSHAL

Page 16: ANTİBİYOTİKLER VE MİKROBİYOTAprobiyotik2017.ftskongre.org/webkontrol/uploads/files/...(Mikrobiyom analizi): Aynı anda yüzbinlerce genomu inceleyebiliyor, ama bunları tanımlayamıyor,

ANTİBİYOTİK SONRASI İSHAL VE C.difficile İLE İLİŞKİSİ

Koliti olmayan olguların % 15 -25 i

Koliti olan olguların %50-70 i

Psödomembranöz enterokoliti- % 100

Page 17: ANTİBİYOTİKLER VE MİKROBİYOTAprobiyotik2017.ftskongre.org/webkontrol/uploads/files/...(Mikrobiyom analizi): Aynı anda yüzbinlerce genomu inceleyebiliyor, ama bunları tanımlayamıyor,

C. difficile ishaline neden olan antibiyotik ve antineoplastik ilaçlar

Sıklıkla

Klindamisin, Ampisilin, Amoksisilin,

Sefalosporinler(2. ve 3. kuşak)

Daha az sıklıkla

Kinolon, Tetrasiklin, Sülfonamid, Makrolid,

Kloramfenikol, Trimetoprim, 5 FU,

metotreksat, doksorubisin,siklofosfomit

Çok nadir

Parenteral aminoglikozit, Metronidazol,

Basitrasin, Vankomisin

Thielman NM, Wilson KH: Antibiotic-associated colitis. Benett, Mandell GL, JE

Dolin R.(eds), 2010

Page 18: ANTİBİYOTİKLER VE MİKROBİYOTAprobiyotik2017.ftskongre.org/webkontrol/uploads/files/...(Mikrobiyom analizi): Aynı anda yüzbinlerce genomu inceleyebiliyor, ama bunları tanımlayamıyor,

AAD-PEDİATRİK :%22 (%4.3-80 ), ERİŞKİN:%7-33

•Konak yaş;>2 yaş (%3 vs %18), >70 yaş (%10-37)

•Antibiyotik:SS,Penislinler :%60-70

Page 19: ANTİBİYOTİKLER VE MİKROBİYOTAprobiyotik2017.ftskongre.org/webkontrol/uploads/files/...(Mikrobiyom analizi): Aynı anda yüzbinlerce genomu inceleyebiliyor, ama bunları tanımlayamıyor,
Page 20: ANTİBİYOTİKLER VE MİKROBİYOTAprobiyotik2017.ftskongre.org/webkontrol/uploads/files/...(Mikrobiyom analizi): Aynı anda yüzbinlerce genomu inceleyebiliyor, ama bunları tanımlayamıyor,

20

Page 21: ANTİBİYOTİKLER VE MİKROBİYOTAprobiyotik2017.ftskongre.org/webkontrol/uploads/files/...(Mikrobiyom analizi): Aynı anda yüzbinlerce genomu inceleyebiliyor, ama bunları tanımlayamıyor,

NE KADAR ÇOK KULLANIRSAN,

O KADAR ÇABUK KAYBEDERSİN

Paterson DL Clin Infect Dis 2004;38(Suppl 4):S341–S345

Page 22: ANTİBİYOTİKLER VE MİKROBİYOTAprobiyotik2017.ftskongre.org/webkontrol/uploads/files/...(Mikrobiyom analizi): Aynı anda yüzbinlerce genomu inceleyebiliyor, ama bunları tanımlayamıyor,

Dirençli Patojenlerin Seleksiyonu

Sefalosporin ve kinolon kullanımı sonrası potansiyel

“kollateral hasar”

3.jenerasyon sefalosporinler

Vancomycin-resistant enterococci (VRE)

Extended-spectrum ß-lactamase–producing Klebsiella species

ß-lactam–resistant Acinetobacter species

Clostridium difficile

Kinolonlar

Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA)

Quinolone-resistant gram-negative bacilli (P.aeruginosa)

Paterson DL Clin Infect Dis 2004;38(Suppl 4):S341–S345.

Page 23: ANTİBİYOTİKLER VE MİKROBİYOTAprobiyotik2017.ftskongre.org/webkontrol/uploads/files/...(Mikrobiyom analizi): Aynı anda yüzbinlerce genomu inceleyebiliyor, ama bunları tanımlayamıyor,
Page 25: ANTİBİYOTİKLER VE MİKROBİYOTAprobiyotik2017.ftskongre.org/webkontrol/uploads/files/...(Mikrobiyom analizi): Aynı anda yüzbinlerce genomu inceleyebiliyor, ama bunları tanımlayamıyor,
Page 26: ANTİBİYOTİKLER VE MİKROBİYOTAprobiyotik2017.ftskongre.org/webkontrol/uploads/files/...(Mikrobiyom analizi): Aynı anda yüzbinlerce genomu inceleyebiliyor, ama bunları tanımlayamıyor,
Page 27: ANTİBİYOTİKLER VE MİKROBİYOTAprobiyotik2017.ftskongre.org/webkontrol/uploads/files/...(Mikrobiyom analizi): Aynı anda yüzbinlerce genomu inceleyebiliyor, ama bunları tanımlayamıyor,

Antibiyotik kullanımının mikroflora üzerine etkisi

1 Bakteri, diğer türlerdeki 100 geni aktive

edebilir

Page 28: ANTİBİYOTİKLER VE MİKROBİYOTAprobiyotik2017.ftskongre.org/webkontrol/uploads/files/...(Mikrobiyom analizi): Aynı anda yüzbinlerce genomu inceleyebiliyor, ama bunları tanımlayamıyor,

FARKLI YÖNTEMLERLE «Clindamycin» ETKİSİ

• PMEK: C.difficile • Diyare • Gastrit • «R» seçilimi • 16SrRNA: 3 ay • Bacteroides özgü

primerler ile≈2 yıl • Kültür :21 gün-18 ay • AmpR-9 ay

Jernberrg C.Microbiology 2010:156:3216-3223

Page 29: ANTİBİYOTİKLER VE MİKROBİYOTAprobiyotik2017.ftskongre.org/webkontrol/uploads/files/...(Mikrobiyom analizi): Aynı anda yüzbinlerce genomu inceleyebiliyor, ama bunları tanımlayamıyor,

H.Pylori Tedavi Ederken: Klaritromisin+Omeprazol +Metranidazol

• 4 yıla kadar süren fekal mikrobiyota değişimleri

• Boğaz flora daha R

• Amoksisilin >Klaritromisin eradikasyonda : ekolojiye daha az etkili

Jacobsson et al 2010 PLoSONE

Adamsonn et al 1999 JAC 44

Page 30: ANTİBİYOTİKLER VE MİKROBİYOTAprobiyotik2017.ftskongre.org/webkontrol/uploads/files/...(Mikrobiyom analizi): Aynı anda yüzbinlerce genomu inceleyebiliyor, ama bunları tanımlayamıyor,

İlk 48 sa. Gentamisin + Ampisilin alan İnfantlar

Proteobacteria ↑ Bifidobacteria ↓ 8 hafta süren bir değişim

Fouhy F.AAC 2012:56-58

Finlandiya çalışmaları ; EN SIK

MAKROLİDER,16sRNA ve Metagenomik

örneklem- metagenomik kütüphane

TÜR ZENGİNLİĞİNDE ↓ BAZI CİNSLERDE ↑ •≈2 YIL

•794 AB. R GENİ- BAZILARI HENÜZ

TANIMLANMAMIŞ

Page 31: ANTİBİYOTİKLER VE MİKROBİYOTAprobiyotik2017.ftskongre.org/webkontrol/uploads/files/...(Mikrobiyom analizi): Aynı anda yüzbinlerce genomu inceleyebiliyor, ama bunları tanımlayamıyor,
Page 32: ANTİBİYOTİKLER VE MİKROBİYOTAprobiyotik2017.ftskongre.org/webkontrol/uploads/files/...(Mikrobiyom analizi): Aynı anda yüzbinlerce genomu inceleyebiliyor, ama bunları tanımlayamıyor,

Probiyotiklerin bozulmuş florayı düzeltmesi

Page 33: ANTİBİYOTİKLER VE MİKROBİYOTAprobiyotik2017.ftskongre.org/webkontrol/uploads/files/...(Mikrobiyom analizi): Aynı anda yüzbinlerce genomu inceleyebiliyor, ama bunları tanımlayamıyor,
Page 34: ANTİBİYOTİKLER VE MİKROBİYOTAprobiyotik2017.ftskongre.org/webkontrol/uploads/files/...(Mikrobiyom analizi): Aynı anda yüzbinlerce genomu inceleyebiliyor, ama bunları tanımlayamıyor,
Page 35: ANTİBİYOTİKLER VE MİKROBİYOTAprobiyotik2017.ftskongre.org/webkontrol/uploads/files/...(Mikrobiyom analizi): Aynı anda yüzbinlerce genomu inceleyebiliyor, ama bunları tanımlayamıyor,
Page 36: ANTİBİYOTİKLER VE MİKROBİYOTAprobiyotik2017.ftskongre.org/webkontrol/uploads/files/...(Mikrobiyom analizi): Aynı anda yüzbinlerce genomu inceleyebiliyor, ama bunları tanımlayamıyor,
Page 37: ANTİBİYOTİKLER VE MİKROBİYOTAprobiyotik2017.ftskongre.org/webkontrol/uploads/files/...(Mikrobiyom analizi): Aynı anda yüzbinlerce genomu inceleyebiliyor, ama bunları tanımlayamıyor,
Page 38: ANTİBİYOTİKLER VE MİKROBİYOTAprobiyotik2017.ftskongre.org/webkontrol/uploads/files/...(Mikrobiyom analizi): Aynı anda yüzbinlerce genomu inceleyebiliyor, ama bunları tanımlayamıyor,

Türkiye J01 Grubu Antibakteriyellere Ait Tüketim Trendi 2007-2014 «TÜBA-İnsan ve Hayvan Sağlığında Akılcı Antibiyotik Kullanımı ve Antibiyotik Dirençlilik Sempozyumu» 3 HAZİRAN 2016-Uzm.Dr. Fatma İşli-ANKARA

2011-2014 :DSÖ ve Antwerp Üniversitesi koordinatörlüğünde yürütülen Doğu Avrupa Ülkeleri’nde antibiyotik kullanımı • En fazla tüketim

“beta-laktam», alt grubun “penisilin kombinasyonları”nın olduğu görülmüştür.

• 2.sıklıkla tüketimi olan “diğer beta-laktam antibakteriyeller”in alt grup tüketimin sırasıyla 2., 3. ve 1. kuşak sefalosporinler şeklinde olduğu tespit edilmiştir.

Page 39: ANTİBİYOTİKLER VE MİKROBİYOTAprobiyotik2017.ftskongre.org/webkontrol/uploads/files/...(Mikrobiyom analizi): Aynı anda yüzbinlerce genomu inceleyebiliyor, ama bunları tanımlayamıyor,

2000 KADAR ANTİBİYOTİK BİLEŞİĞİ

100.000 RED

107 Actinomyces türü taranmalı

GNB-FQ SONRA 45 YILDIR YENİ

SINIF YOK

Page 40: ANTİBİYOTİKLER VE MİKROBİYOTAprobiyotik2017.ftskongre.org/webkontrol/uploads/files/...(Mikrobiyom analizi): Aynı anda yüzbinlerce genomu inceleyebiliyor, ama bunları tanımlayamıyor,
Page 41: ANTİBİYOTİKLER VE MİKROBİYOTAprobiyotik2017.ftskongre.org/webkontrol/uploads/files/...(Mikrobiyom analizi): Aynı anda yüzbinlerce genomu inceleyebiliyor, ama bunları tanımlayamıyor,
Page 42: ANTİBİYOTİKLER VE MİKROBİYOTAprobiyotik2017.ftskongre.org/webkontrol/uploads/files/...(Mikrobiyom analizi): Aynı anda yüzbinlerce genomu inceleyebiliyor, ama bunları tanımlayamıyor,

YAŞLILIK HASTALIKLARIN

LİMANIDIR

Page 43: ANTİBİYOTİKLER VE MİKROBİYOTAprobiyotik2017.ftskongre.org/webkontrol/uploads/files/...(Mikrobiyom analizi): Aynı anda yüzbinlerce genomu inceleyebiliyor, ama bunları tanımlayamıyor,

İnfeksiyon hastalıklarından korunma, ölüm ve

sekellerinin azaltılmasında en önemli iki yöntem

“sanitasyon ve immünizasyon”dur

When meditating over a disease,

I never think of finding a remedy for it, but, instead, a means of

preventing it. Louis Pasteur

(1822-1895)

Page 44: ANTİBİYOTİKLER VE MİKROBİYOTAprobiyotik2017.ftskongre.org/webkontrol/uploads/files/...(Mikrobiyom analizi): Aynı anda yüzbinlerce genomu inceleyebiliyor, ama bunları tanımlayamıyor,

DİNLEDİĞİNİZ İÇİN TEŞEKKÜRLER… SORULARINIZ? Prof. Dr. Esin Şenol