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“Quenching” de fluorescencia
quenching = desactivación= apagamiento = menor emisión
IF (Q) < IF (-Q)
Reacciones en el estado excitado (Quenching colisional)
Entrecuzamiento intersistema a estado Triplete
Rearreglos moleculares
Transferencia de energía
Transferencia de carga
Formación de complejo en el estado basal (Quenching estático)
τ0
τ / τ0 = F/F0
Quenching colisional o dinámico
X X*hν
hν’
τ < τ0
QXQ*
X + Q
X
kQ
Quenching colisional o dinámico
F0/FStern-Volmer
Quenching de triptofano por O2
KSV = 32 M-1
Quenching colisional o dinámico
KSV = kq τ0 kq = cte. vel. quenching
k0 = cte. vel. colisional (controlada por difusión)
fQ = fracción de encuentros efectivos que terminan en quenching
kQ se determina experimentalmente a partir de KSV. Se estima la eficiencia de quenching fQ calculando k0 según Smoluchowski:
O se conoce la eficiencia de quenching fQ entonces se calcula k0 para estimar el coeficiente de difusión D usando la ecuación de Stokes-Einstein:
DeterminaciDeterminacióón de coeficiente de difusin de coeficiente de difusióón de NO en LDL n de NO en LDL por desactivacipor desactivacióón de la fluorescencian de la fluorescencia
O CO
(CH2)7 C CH H
(CH2)7CH3
CH3CHOCCH2O
••NO NONO
NO
Denicola et al (2002) J. Biol. Chem. 277, 932-
Denicola et al (2002) J. Biol. Chem. 277, 932-
= 1
Quenching colisional y estático combinado
Quenching dinámico y estático
• Se requiere contacto entre Q y F, interacción molecular
• Quenching dinámico o colisional: Q + F*
• Quenching estático: Q + F
• Q debe difundir hacia F distancias moderadas (a diferencia de relajación por solvente)
Indica localización del F, exposición de F de manera de ser accesible a Q
Colicin E1 = proteina de membrana12 W
Quenchers of W emission: Iodide, acrylamide, disulfide, e-defficient groups like –NH3+, -COOH, histidine protonated
Carga del quencher afecta el quenching (Ksv)
DHE = dihidroequinelin = esteroide fluorescenteSBP = steroid binding protein
Impedimento estérico disminuye quenching (Ksv)
Fracción accesible al quencher
Stern-Volmer modificada
a = fluoróforo accesible a Qb = fluoróforo no accesiblefa = fracción de la fluorescenciainicial que se quenchea
F0/F
cAMP Receptor Protein (CRP)
2 subunidades idénticas de 209 aa
W13 (expuesto) W85 (no accesible
+ cAMP = cambio conformacional = W13 y W85 expuestos
10-doxilnonadecano = quencher hidrofóbico
Acrilamida = quencher soluble
Quencher soluble en membranaCalcular la partición P
Lípido marcado (NBD)Q = 5-nitroxide estearico
Quenching como indicador de analitos – cuantificación del Q
Fluoróforo sensible a cloruros
Detección por levantamiento de Quenching
Secuencia de ADN con Fluoresceina quencheadapor pireno
Hibridización, se intercala el Pireno hidrofóbico y levanta el quenching de la Fluoresceina
Detección por levantamiento de Quenching
Oligómero con tiol en 3’ para unirse a la superfcie (o coloide) Au.Rodamina (TMR) en 5’ quencheada por Au.Hibridización correcta, levanta el quenching (aleja TMR de Au)
Quenching intermolecular
Q y F están unidos covalentemente
Enzima flavina reductasa con FMN unidoLa F de FMN es solución > F de FMN unido
La Y35 responsible de quenching interno de FMN por transferenciaelectrónica
Autoquenching – elevada concentración del fluoróforo
Fluoróforos con pococorrimiento Stokes
- reabsorción de las λmenores de emisión
- formación de excímeros
Rodamina 6G
5 µM
0.16 mM
5.7 mM