autentikasi ikan famili channidae di perairan taman ......autentikasi ikan famili channidae di...
TRANSCRIPT
-
Autentikasi Ikan Famili Channidae di Perairan
Taman Nasional Sebangau, Kalimantan Tengah
berdasarkan DNA MitokondriaEVA MUHAJIRAH - C251180091Pengelolaan Sumberdaya Perairan
Komisi Pembimbing:
Dr. Ir. Mohammad Mukhlis Kamal, M.Sc
Dr. Ir. Nurlisa Alias Butet, M.Sc
Dr. Arif Wibowo SP, M.Si
SEMINAR HASIL PENELITIAN
-
PENDAHULUAN
Taman Nasional Sebangau
TNS merupakan salah satu hutan rawa gambut terpenting di Kalimantan Tengah
Sebaran hutan rawa gambut (daerah gelap) di Kalimantan
pada tahun 2004
(Posa et al. 2011)
-
Potensi Perikanan TNS
PENDAHULUAN
Kawasan rawa gambut menunjukkan endemisitas tinggi (Posa et al. 2011).
Kondisi di rawa gambut mendukung evolusi spesies ikan, dan bahwa setiap petak
rawa gambut dapat berisi spesies enedemiknya sendiri (Kottelat & Colleagues, 2006)
Thornton et al. 2018
55 Jenis
ikan di TNS
Famili
Channidae
WWF 2018
Channa pleurophthalma
Channa micropeltes
Channa striataChanna marulioides
Channa lucius
Channa bankanensis
Ikan hitaman (Black Fish)
Ikan putihan (White Fish)
-
PENDAHULUAN
Isu penting yang dihadapi lahan gambut Indonesia adalah dampak fragmentasi
habitat terhadap keanekaragaman hayati yang ada di dalamnya.
Autentikasi ikan famili Channidae di perairan
TNS, Kalimantan Tengah berdasarkan mtDNA
Kelangsungan hidup jangka panjang
organisme tidak mungkin terjadi
kecuali terdapat tindakan konservasi
berdasarkan informasi ilmiah,
misalnya keanekaragaman hayati dan
garis keturunan.
-
METODE PENELITIAN
Maret 2020
Balai Riset Perikanan Perairan Umum
dan Penyuluhan Perikanan Palembang
(BRPPUPP), Sumatera Selatan
Oktober - Desember 2019
Taman Nasional Sebangau,
Kalimantan Tengah
PENGAMBILAN SAMPEL
ANALISIS DNA BARCODING
Gambar 1. Peta lokasi penelitian di perairan Taman Nasional Sebangau,
Kalimantan Tengah
-
METODE PENELITIAN
Pengambilan sampel dengan menggunakan alat tangkap tradisional seperti
- Kalang - Tempirai
- Bubu - Pengilar
- Renggeh - Pancing
Total 45 sampel terdiri dari 21 sungai Katingan dan 24 sungai Sebangau
Alat tangkap tradisional yang umum digunakan nelayan di perairan TNS
-
Mihau (Channa bankanensis) Kihung (Channa lucius)
Toman (Channa micropeltes)Peyang (Channa marulioides)
Kerandang (Channa pleurophthalma) Haruan (Channa striata)
Courtenay dan Williams (2004)
Kumar et al. (2012)
Identifikasi Spesies
Identifikasi dilakukan untuk memastikan spesies ikan yang didapatkan berdasarkan karakteristik morfologi
METODE PENELITIAN
-
Preservasi Sampel
METODE PENELITIAN
Sampel Jaringan
Sampel Terkoleksi
- Jaringan diambil dari sirip dorsal
- Dimasukkan kedalam tube dengan
Alkohol 96%
- Kode sampel berguna untuk
membedakan antara sampel, jenis, lokasi
dan waktu pengambilan
Kode Sampel
Kr1SiK - S.Sebangau
Sirip Dorsal
11/11/2019 Eva Muhajirah
-
Ekstraksi DNA Amplifikasi dan
VisualisasiSequencing
Source: Modified by Richard et al. 2016
Analisis DNA Barcoding
METODE PENELITIAN
-
Analisis Data
Basic Local
Alignment
Search Tool
(BLAST)
1. Input data sekuens
(input data sekuens ke
software MEGA X)
2. Edit data sekuens
Pensejajaran
Sekuen
Nukleotida
Jarak
Genetik
Metode
Pairwise Distance
Konstruksi
Pohon
Filogeni
Metode
Neighbour-Joinning (NJ)
1000 kali ulangan
(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)
Metoda
Clustal W
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
-
1. Identifikasi Species melalui BLAST NCBI
Query Cover Per. Ident
Channa bankanensis 89 – 93% 98,46 – 100%Channa lucius 93% 99,08 – 99,39%Channa marulioides 92 – 93% 95,55 – 95,99%Channa micropeltes 91 – 95% 98,62 – 99,40%Channa pleurophthalma 85 – 93% 98,73 – 99,69%Channa striata 89 – 93% 98,26 – 99,85%
Hasil data sekuens teridentifikasi sebagai:
Hasil analisis Automatic of Barcode Gap Discovery
(ABGD)
HASIL DAN PEMBAHASAN
-
1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 6 6 6 6 6
1 1 1 1 1 1 2 3 3 3 4 4 4 4 6 0 0 1 1 1 2 3 3 4 4 4 5 5 5 5 7 7 7 7 8 8 9 0 1 1 1 1 2 2 3 3 4 4 5 6 7 7 8 8 9 9 9 0 1 1 2 2 3 4 5 5 5 6 6 7 7 7 8 8 9 9 0 0 1 1 2 2 3 4 5 5 6 6 6 7 7 7 8 8 8 9 9 9 0 0 0 0 1 1 2 2 3 3 4 5 6 7 7 8 8 0 0 3 4 4
1 3 4 6 8 9 1 2 3 4 5 7 0 2 5 8 1 4 5 7 2 1 4 0 3 9 2 1 4 0 6 9 2 5 6 8 0 3 6 9 2 8 1 6 2 3 5 8 4 7 7 9 2 8 4 6 2 5 4 7 3 6 7 5 1 7 0 9 2 1 0 3 9 2 8 1 4 7 3 6 5 8 1 4 0 3 2 8 4 6 2 8 4 7 8 0 3 6 2 5 8 1 2 4 0 3 6 9 5 8 1 4 0 3 8 4 9 2 5 1 7 3 5 9 2 4
Katingan M10SiK Channa bankanensis C T A C A C T A T T C C G A A C C C C G C T C A C C G C A A A T T A T A C A C A A T A T A C T G C C C C C T A T G A A C G C C C A C G A A A C T A A C T A T G T T T A C T T C C A A A T C T C A A C A C C A T A T A C A T C T A T C A C C G A A C C T G C T
Katingan M11SiK Channa bankanensis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .
Katingan M9DK Channa bankanensis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Katingan M10DK Channa bankanensis . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Sebangau M9SiS Channa bankanensis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .
Sebangau M10SiS Channa bankanensis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .
Sebangau M7DS Channa bankanensis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .
Sebangau M9DS Channa bankanensis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .
Katingan K1SiK Channa lucius . . . . G . . . . . . T A . . . . . . . . . . G T G A A G . . . A . C . . . . . . . . C . . C A A A . A . C . . . . G . C T . T G . A . . C . . G . T . . . . . . . . . . C . . G . . . . . . . G . . . T G . . . T T . . T . . . . . . T A . . . . . . . .
Katingan Ki2SiK Channa lucius . . . . G . . . . . . T A . . . . . . . . . . G T G A A G . . . A . C . . . . . . . . C . . C A A A . A . C . . . . G . C T . T G . A . . C . . G . T . . . . . . . . . . C . . G . . . . . . . G . . . T G . . . T T . . T . . . . . . T A . . . . . . . .
Katingan Ki3SiK Channa lucius . . . . G . . . . . . T A . . . . . . . . . . G T G A A G . . . A . C . . . . . . . . C . . C A A A . A . C . . . . G . C T . T G . A . . C . . G . T . . . . . . . . . . C . . G . . . . . . . G . . . T G . . . T T . . T . . . . . . T A . . . . . . . .
Katingan Ki1DK Channa lucius . . . . G . . . . . . T A . . . . . . . . . . G T G A A G . . . A . C . . . . . . . . C . . C A A A . A . C . . . . G . C T . T G . A . . C . . G . T . . . . . . . . . . C . . G . . . . . . . G . . . T G . . . T T . . T . . . . . . T A . . . . . . . .
Sebangau Ki3SiS Channa lucius . . . . G . . . . . . T A . . . . . . . . . . G T G A A G . . . A . C . . . . . . . . C . . C A A A . A . C . . . . G . C T . T G . A . . C . . G . T . . . . . . . . . . C . . G . . . . . . . G . . . T G . . . T T . . T . . . . . . T A . . . . . . . .
Sebangau K2DS Channa lucius . . . . G . . . . . . T A . . . . . . . . . . G T G A A G . . . A . C . . . . . . . . C . . C A A A . A . C . . . . G . C T . T G . A . . C . . G . T . . . . . . . . . . C . . G . . . . . . . G . . . T G . . . T T . . T . . . . . . T A . . . . . . . .
Sebangau Ki2SiS Channa lucius . . . . G . . . . . . T A . . . . . . . . . . G T G A A G . . . A . C . . . . . . . . C . . C A A A . A . C . . . . G . C T . T G . A . . C . . G . T . . . . . . . . . . C . . G . . . . . . . G . . . T G . . . T T . . T . . . . . . T A . . . . . . . .
Sebangau K3DS Channa lucius . . . . G . . . . . . T A . . . . . . . . . . G T G A A G . . . A . C . . . . . . . . C . . C A A A . A . C . . . . G . C T . T G . A . . C . . G . T . . . . . . . . . . C . . G . . . . . . . G . . . T G . . . T T . . T . . . . . . T A . . . . . . . .
Katingan P1SiK Channa marulioides . . . T T . A . . . . A A . C . . A T A . . . G T A A A . . . A C . C . . T . . . . C C . . A T A T . A . A G A C . C . . . . . . . A T . T . A T . . C G . C . . . . T . C . . T . . . A . . . C T . T T C C C C . G . C . . . G . . T A C C . A . G . . .
Sebangau P4SiS Channa marulioides . . . T T . A . . . . A A . C . . A T A . . . G T A A A C . . A C . C . . T . . . . C C . . A T A T . A . A G A C . C . . . . . . . A T . T . A T . . C G . C . . . . T . C . . T . . . A . . . C T . T T C C C C . G . C . . . G . . T A C C . A . G . . .
Sebangau P3SiS Channa marulioides . . . T T . A . . . . A A . C . . A T A . . . G T A A A C . . A C . C . . T . . . . C C . . A T A T . A . A G A C . C . . . . . . . A T . T . A T . . C G . C . . . . T . C . . T . . . A . . . C T . T T C C C C . G . C . . . G . . T A C C . A . G . . .
Sebangau P5SiS Channa marulioides . . . T T . A . . . . A A . C . . A T A . . . G T A A A C . . A C . C . . T . . . . C C . . A T A T . A . A G A C . C . . . . . . . A T . T . A T . . C G . C . . . . T . C . . T . . . A . . . C T . T T C C C C . G . C . . . G . . T A C C . A . G . . .
Sebangau P2DS Channa marulioides . . . T T . A . . . . A A . C . . A T A . . . G T A A A C . . A C . C . . T . . . . C C . . A T A T . A . A G A C . C . . . . . . . A T . T . A T . . C G . C . . . . T . C . . T . . . A . . . C T . T T C C C C . G . C . . . G . . T A C C . A . G . . .
Katingan T5DK Channa micropeltes G . G . . . C . . C . A A . T A A . . A . . . G T A A A C . . C C . C . . C . . . C . C . . . T T A . A . . . G A . G T A . . . . T A C . C A G G G T C . . T A C . . A C C . . C . . C T . . C C . . T T T C C C . A G . . . C . G . A T A . . A . C . . .
Katingan T6DK Channa micropeltes . . G . . . C . . C . A A . T A A . . A . . . G T A A A C . . C C . C . . C . . . C . C . . . T T A . A . . . G A . G T A . . . . T A C . C A G G G T C . . T A C . . A C C . . C . . C T . . C C . . T T T C C C . A G . . . C . G . A T A . . A . C . . .
Katingan T14SiK Channa micropeltes . . G . . . C . . C . A A . T A A . . A . . . G T A A A C . . C C . C . . C . . . C . C . . . T T A . A . . . G A . G T A . . . . T A C . C A G G G T C . . T A C . . A C C . . C . . C T . . C C . . T T T C C C . A G . . . C . G . A T A . . A . C . . .
Katingan T13SiK Channa micropeltes . . G . . . C . . C . A A . T A A . . A . . . G T A A A C . . C C . C . . C . . . C . C . . . T T A . A . . . G A . G T A . . . . T A C . C A G G G T C . . T A C . . A C C . . C . . C T . . C C . . T T T C C C . A G . . . C . G . A T A . . A . C . . .
Sebangau T34SiS Channa micropeltes . . G . . . C . . C . A A . T A A . . A . . . G T A A A C . . C C . C . . C . . . C . C . . . T T A . A . . . G A . G T A . . . . T A C . C A G G G T C . . T A C . . A C C . . C . . C T . . C C . . T T T C C C . A G . . . C . G . A T A . . A . C . . .
Sebangau T35SiS Channa micropeltes . . G . . . C . . C . A A . T A A . . A . . . G T A A A C . . C C . C . . C . . . C . C . . . T T A . A . . . G A . G T A . . . . T A C . C A G G G T C . . T A C . . A C C . . C . . C T . . C C . . T T T C C C . A G . . . C . G . A T A . . A . C . . .
Sebangau T2DS Channa micropeltes . . G . . . C . . C . A A . T A A . . A . . . G T A A A C . . C C . C . . C . . . C . C . . . T T A . A . . . G A . G T A . . . . T A C . C A G G G T C . . T A C . . A C C . . C . . C T . . C C . . T T T C C C . A G . . . C . G . A T A . . A . C . . .
Sebangau T3DS Channa micropeltes . . G . . . C . . C . A A . T A A . . A . . . G T A A A C . . C C . C . . C . . . C . C . . . T T A . A . . . G A . G T A . . . . T A C . C A G G G T C . . T A C . . A C C . . C . . C T . . C C . . T T T C C C . A G . . . C . G . A T A . . A . C . . .
Katingan Kr1SiK Channa pleurophthalma . . . . . . C . . C . A A . T G . T . A . . . G A A A T . G G C . G C . T C T . G A . C G . . C T . . A . C . . A . . A T . T . . . A C . T T C . . . A . C T A . C . A . C A . C G G C T C . T T . G . T C C C . . . . C . C . . A . A G A C . . . A . . .
Katingan Kr2SiK Channa pleurophthalma . . . . . . C . . C . A A . T G . T . A . . . G A A A T . G G C . G C . T C T . G A . C G . . C T . . A . C . . A . . A T . T . . . A C . T T C . . . A . C T A . C . A . C A . C G G C T C . T T . G . T C C C . . . . C . C . . A . A G A C . . . A . . .
Katingan Kr2DK Channa pleurophthalma . A . . . G C . . C T A A . T G . T . A . . . G A A A T . G G C . G C . T C T . G A . C G . . C T . . A . C . . A . . A T . T . . . A C . T T C . . . A . C T A . C . A . C A . C G G C T C . T T . G . T C C C . . . . C . C . . A . A G A C . . . A . . .
Katingan Kr10DK Channa pleurophthalma . A . . . . C . . C T A A . T G . T . A . . . G A A A T . G G C . G C . T C T . G A . C G . . C T . . A . C . . A . . A T . T . . . A C . T T C . . . A . C T A . C . A . C A . C G G C T C . T T . G . T C C C . . . . C . C . . A . A G A C . . . A . . .
Sebangau Kr6SiS Channa pleurophthalma . . . . . . C . . C . A A . T G . T . A . . . G A A A T . G G C . G C . T C T . G A . C G . . C T . . A . C . . A . . A T . T . . . A C . T T C . . . A . C T A . C . A . C A . C G G C T C . T T . G . T C C C . . . . C . C . . A . A G A C . . . A . . .
Sebangau Kr7SiS Channa pleurophthalma . . . . . . C . . C . A A . T G . T . A . . . G A A A T . G G C . G C . T C T . G A . C G . . C T . . A . C . . A . . A T . T . . . A C . T T C . . . A . C T A . C . A . C A . C G G C T C . T T . G . T C C C . . . . C . C . . A . A G A C . . . A . . .
Sebangau Kr6DS Channa pleurophthalma . . . . . . C . . C . A A . T G . T . A . . . G A A A T . G G C . G C . T C T . G A . C G . . C T . . A . C . . A . . A T . T . . . A C . T T C . . . A . C T A . C . A . C A . C G G C T C . T T . G . T C C C . . . . C . C . . A . A G A C . . . A . . .
Sebangau Kr7DS Channa pleurophthalma . . . . . . C . . C . A A . T G . T . A . . . G A A A T . G G C . G C . T C T . G A . C G . . C T . . A . C . . A . . A T . T . . . A C . T T C . . . A . C T A . C . A . C A . C G G C T C . T T . G . T C C C . . . . C . C . . A . A G A C . . . A . . .
Katingan H7DK Channa striata T C . . T G . . . . G A A G T . T . . C T C T G T A A A C . . . . T C T . C . G C C . C . T G C A A T A A . T G A C . T A . . . . . A C C C . A . T G C . . . C . . T T . C . T T C . A T . T . T A . A T T C T C . A . A . . . A . C . T T T G T T A . . .
Katingan H6DK Channa striata T C . . T G . C C . G A A . T . T . . C T C T G T A A A C . . . . T C T . C . G C C . C . T G C A A T A A . T G A C . T A . . . . . A C C C . A . T G C . . . C . . T T . C . T T C . A T . T . T A . A T T C T C . A . A . . . A . C . T T T G T T A . . .
Katingan H7SiK Channa striata . C . . T T A . . . . A A G T . T . . C T C T G T A A A C . . . . T C T . C . G C C . C . T G C A A T A A . T G A C . T A . . . . . A C C C . A . T G C . . . C . . T T . C . T T C . A T . T . T A . A T T C T C . A . A . . . A . C . T T T G T T A . . .
Katingan H6SiK Channa striata . C . . T T A . . . . A A . T . T . . C T C T G T A A A C . . . . T C T . C . G C C . C . T G C A A T A A . T G A C . T A . . . . . A C C C . A . T G C . . . C . . T T . C . T T C . A T . T . T A . A T T C T C . A . A . . . A . C . T T T G T T A T T C
Sebangau H1SiS Channa striata . C . . T T A . . . . A A . T . T . . C T C T G . A A A C . . . . T C T . C . G C C . C . T G C A A T A A . T G A C . T A . . . . . A C C C . A . T G C . . . C . . T T . C . T T C . A T . T . T A . A T T C T C . A . A . . . A . C . T T T G T T A . . .
Sebangau H2SiS Channa striata . C . . T T A . . . . A A . T . T . . C . C T G T A A A C . . . . T C T . C . G C C . C . T G C A A T A A . T G A C . T A . . . . . A C C C . A . T G C . . . C . . T T . C . T T C . A T . T . T A . A T T C T C . A . A . . . A . C . T T T G T T A T T C
Sebangau H1DS Channa striata . C . . T T A . . . . A A . T . T . . C T C T G . A A A C . . . . T C T . C . G C C . C . T G C A A T A A . T G A C . T A . . . . . A C C C . A . T G C . . . C . . T T . C . T T C . A T . T . T A . A T T C T C . A . A . . . A . C . T T T G T T A . . .
Sebangau H2DS Channa striata . C . . T T A . . . . A A . T . T . . C . C T G T A A A C . . . . T C T . C . G C C . C . T G C A A T A A . T G A C . T A . . . . . A C C C . A . T G C . . . C . . T T . C . T T C . A T . T . T A . A T T C T C . A . A . . . A . C . T T T G T T A . . .
Position of Nucleotide Base
Species
Bertanda hitam = situs nukleotida spesifik
2. Nukleotida Spesifik
C.bankanensis = 18 situs nukleotida spesifik
C.lucius = 16 situs nukleotida spesifik
C.marulioides = 26 situs nukleotida spesifik
C.micropeltes = 16 situs nukleotida spesifik
C.pleurophthalma = 31 situs nukleotida spesifik
C.striata = 39 situs nukleotida spesifik
-
No. Species 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64
1 Katingan M10SiK Channa bankanensis
2 Katingan M11SiK Channa bankanensis 0.0034
3 Katingan M9DK Channa bankanensis 0.0000 0.0034
4 Katingan M10DK Channa bankanensis 0.0017 0.0050 0.0017
5 Sebangau M9SiS Channa bankanensis 0.0017 0.0017 0.0017 0.0034
6 Sebangau M10SiS Channa bankanensis 0.0017 0.0017 0.0017 0.0034 0.0000
7 Sebangau M7DS Channa bankanensis 0.0017 0.0017 0.0017 0.0034 0.0000 0.0000
8 Sebangau M9DS Channa bankanensis 0.0017 0.0017 0.0017 0.0034 0.0000 0.0000 0.0000
9 KJ937395.1 Channa bankanensis voucher CHAN038 (Kalimantan Tengah) 0.0153 0.0153 0.0153 0.0170 0.0136 0.0136 0.0136 0.0136
10 KJ937371.1 Channa bankanensis voucher CHAN039 (Kalimantan Tengah) 0.0153 0.0153 0.0153 0.0170 0.0136 0.0136 0.0136 0.0136 0.0000
11 MF496683.1 Channa bankanensis isolate LR09888 (Bangka) 0.0153 0.0153 0.0153 0.0170 0.0136 0.0136 0.0136 0.0136 0.0034 0.0034
12 MF496681.1 Channa bankanensis isolate LR05558 (Kalimantan Tengah) 0.0017 0.0017 0.0017 0.0034 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0136 0.0136 0.0136
13 MF496677.1 Channa bankanensis isolate LR02453 (Anjungan peat Dekat Sungai Kapuas) 0.0136 0.0136 0.0136 0.0153 0.0119 0.0119 0.0119 0.0119 0.0017 0.0017 0.0017 0.0119
14 Katingan K1SiK Channa lucius 0.1146 0.1146 0.1146 0.1165 0.1126 0.1126 0.1126 0.1126 0.1085 0.1085 0.1085 0.1126 0.1064
15 Katingan Ki2SiK Channalucius 0.1146 0.1146 0.1146 0.1165 0.1126 0.1126 0.1126 0.1126 0.1085 0.1085 0.1085 0.1126 0.1064 0.0000
16 Katingan Ki3SiK Channa lucius 0.1146 0.1146 0.1146 0.1165 0.1126 0.1126 0.1126 0.1126 0.1085 0.1085 0.1085 0.1126 0.1064 0.0000 0.0000
17 Katingan Ki1DK Channa lucius 0.1146 0.1146 0.1146 0.1165 0.1126 0.1126 0.1126 0.1126 0.1085 0.1085 0.1085 0.1126 0.1064 0.0000 0.0000 0.0000
18 Sebangau Ki3SiS Channa lucius 0.1146 0.1146 0.1146 0.1165 0.1126 0.1126 0.1126 0.1126 0.1085 0.1085 0.1085 0.1126 0.1064 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000
19 Sebangau Ki2SiS Channa lucius 0.1146 0.1146 0.1146 0.1165 0.1126 0.1126 0.1126 0.1126 0.1085 0.1085 0.1085 0.1126 0.1064 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000
20 Sebangau K2DS Channa lucius 0.1146 0.1146 0.1146 0.1165 0.1126 0.1126 0.1126 0.1126 0.1085 0.1085 0.1085 0.1126 0.1064 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000
21 Sebangau K3DS Channa lucius 0.1146 0.1146 0.1146 0.1165 0.1126 0.1126 0.1126 0.1126 0.1085 0.1085 0.1085 0.1126 0.1064 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000
22 KM213042.1 Channa lucius voucher Lampam LAM2 (Sumatera) 0.1105 0.1105 0.1105 0.1124 0.1085 0.1085 0.1085 0.1085 0.1044 0.1044 0.1044 0.1085 0.1023 0.0188 0.0188 0.0188 0.0188 0.0188 0.0188 0.0188 0.0188
23 KT001933.1 Channa lucius voucher CD35 (Vietnam) 0.1126 0.1126 0.1126 0.1145 0.1105 0.1105 0.1105 0.1105 0.1064 0.1064 0.1064 0.1105 0.1044 0.0240 0.0240 0.0240 0.0240 0.0240 0.0240 0.0240 0.0240 0.0153
24 KJ937399.1 Channa lucius voucher NRS059 (Trenggano Peninsula Malaysia) 0.1085 0.1085 0.1085 0.1103 0.1064 0.1064 0.1064 0.1064 0.1023 0.1023 0.1023 0.1064 0.1003 0.0240 0.0240 0.0240 0.0240 0.0240 0.0240 0.0240 0.0240 0.0188 0.0102
25 KJ937433.1 Channa lucius voucher NRS017 (Thailand) 0.1146 0.1146 0.1146 0.1165 0.1126 0.1126 0.1126 0.1126 0.1085 0.1085 0.1085 0.1126 0.1064 0.0258 0.0258 0.0258 0.0258 0.0258 0.0258 0.0258 0.0258 0.0170 0.0017 0.0119
26 MF496829.1 Channa lucius isolate LR13085 (Palangkaraya) 0.1167 0.1167 0.1167 0.1186 0.1146 0.1146 0.1146 0.1146 0.1105 0.1105 0.1105 0.1146 0.1085 0.0084 0.0084 0.0084 0.0084 0.0084 0.0084 0.0084 0.0084 0.0136 0.0188 0.0223 0.0205
27 MF496831.1 Channa lucius isolate LR13139 (Barito Timur) 0.1105 0.1105 0.1105 0.1124 0.1085 0.1085 0.1085 0.1085 0.1044 0.1044 0.1044 0.1085 0.1023 0.0067 0.0067 0.0067 0.0067 0.0067 0.0067 0.0067 0.0067 0.0188 0.0240 0.0240 0.0258 0.0084
28 Katingan P1SiK Channa marulioides 0.1874 0.1851 0.1874 0.1895 0.1874 0.1874 0.1874 0.1874 0.1806 0.1806 0.1851 0.1874 0.1829 0.1876 0.1876 0.1876 0.1876 0.1876 0.1876 0.1876 0.1876 0.1921 0.1899 0.1944 0.1921 0.1899 0.1876
29 Sebangau P4SiS Channa marulioides 0.1918 0.1895 0.1918 0.1939 0.1918 0.1918 0.1918 0.1918 0.1850 0.1850 0.1895 0.1918 0.1872 0.1897 0.1897 0.1897 0.1897 0.1897 0.1897 0.1897 0.1897 0.1943 0.1920 0.1966 0.1943 0.1920 0.1897 0.0050
30 Sebangau P3SiS Channa marulioides 0.1918 0.1895 0.1918 0.1939 0.1918 0.1918 0.1918 0.1918 0.1850 0.1850 0.1895 0.1918 0.1872 0.1897 0.1897 0.1897 0.1897 0.1897 0.1897 0.1897 0.1897 0.1943 0.1920 0.1966 0.1943 0.1920 0.1897 0.0050 0.0000
31 Sebangau P5SiS Channa marulioides 0.1918 0.1895 0.1918 0.1939 0.1918 0.1918 0.1918 0.1918 0.1850 0.1850 0.1895 0.1918 0.1872 0.1897 0.1897 0.1897 0.1897 0.1897 0.1897 0.1897 0.1897 0.1943 0.1920 0.1966 0.1943 0.1920 0.1897 0.0050 0.0000 0.0000
32 Sebangau P2DS Channa marulioides 0.1918 0.1895 0.1918 0.1939 0.1918 0.1918 0.1918 0.1918 0.1850 0.1850 0.1895 0.1918 0.1872 0.1897 0.1897 0.1897 0.1897 0.1897 0.1897 0.1897 0.1897 0.1943 0.1920 0.1966 0.1943 0.1920 0.1897 0.0050 0.0000 0.0000 0.0000
33 MF496837.1 Channa marulioides isolate LR01257 (Jambi) 0.2035 0.2012 0.2035 0.2057 0.2035 0.2035 0.2035 0.2035 0.1874 0.1874 0.1897 0.2035 0.1897 0.1995 0.1995 0.1995 0.1995 0.1995 0.1995 0.1995 0.1995 0.1948 0.1925 0.2018 0.1948 0.1971 0.1948 0.0434 0.0416 0.0416 0.0416 0.0416
34 Katingan T5DK Channa micropeltes 0.2040 0.1993 0.2040 0.2037 0.2016 0.2016 0.2016 0.2016 0.1900 0.1900 0.1923 0.2016 0.1923 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1811 0.1789 0.1834 0.1811 0.1879 0.1789 0.1821 0.1800 0.1800 0.1800 0.1800 0.1802
35 Katingan T6DK Channa micropeltes 0.2040 0.1993 0.2040 0.2037 0.2016 0.2016 0.2016 0.2016 0.1900 0.1900 0.1923 0.2016 0.1923 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1811 0.1789 0.1834 0.1811 0.1879 0.1789 0.1821 0.1800 0.1800 0.1800 0.1800 0.1802 0.0000
36 Katingan T14SiK Channa micropeltes 0.2040 0.1993 0.2040 0.2037 0.2016 0.2016 0.2016 0.2016 0.1900 0.1900 0.1923 0.2016 0.1923 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1811 0.1789 0.1834 0.1811 0.1879 0.1789 0.1821 0.1800 0.1800 0.1800 0.1800 0.1802 0.0000 0.0000
37 Katingan T13SiK Channa micropeltes 0.2040 0.1993 0.2040 0.2037 0.2016 0.2016 0.2016 0.2016 0.1900 0.1900 0.1923 0.2016 0.1923 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1811 0.1789 0.1834 0.1811 0.1879 0.1789 0.1821 0.1800 0.1800 0.1800 0.1800 0.1802 0.0000 0.0000 0.0000
38 Sebangau T34SiS Channa micropeltes 0.2040 0.1993 0.2040 0.2037 0.2016 0.2016 0.2016 0.2016 0.1900 0.1900 0.1923 0.2016 0.1923 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1811 0.1789 0.1834 0.1811 0.1879 0.1789 0.1821 0.1800 0.1800 0.1800 0.1800 0.1802 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000
39 Sebangau T35SiS Channa micropeltes 0.2040 0.1993 0.2040 0.2037 0.2016 0.2016 0.2016 0.2016 0.1900 0.1900 0.1923 0.2016 0.1923 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1811 0.1789 0.1834 0.1811 0.1879 0.1789 0.1821 0.1800 0.1800 0.1800 0.1800 0.1802 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000
40 Sebangau T2DS Channa micropeltes 0.2040 0.1993 0.2040 0.2037 0.2016 0.2016 0.2016 0.2016 0.1900 0.1900 0.1923 0.2016 0.1923 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1811 0.1789 0.1834 0.1811 0.1879 0.1789 0.1821 0.1800 0.1800 0.1800 0.1800 0.1802 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000
41 Sebangau T3DS Channa micropeltes 0.2040 0.1993 0.2040 0.2037 0.2016 0.2016 0.2016 0.2016 0.1900 0.1900 0.1923 0.2016 0.1923 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1811 0.1789 0.1834 0.1811 0.1879 0.1789 0.1821 0.1800 0.1800 0.1800 0.1800 0.1802 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000
42 KM213040.1 Channa micropeltes voucher Lampam LAM1 (Sumatera) 0.2063 0.2016 0.2063 0.2061 0.2040 0.2040 0.2040 0.2040 0.1923 0.1923 0.1946 0.2040 0.1946 0.1789 0.1789 0.1789 0.1789 0.1789 0.1789 0.1789 0.1789 0.1834 0.1811 0.1857 0.1834 0.1902 0.1811 0.1843 0.1823 0.1823 0.1823 0.1823 0.1825 0.0017 0.0017 0.0017 0.0017 0.0017 0.0017 0.0017 0.0017
43 MF496867.1 Channa micropeltes isolate LR02448 (Singapore) 0.2063 0.2016 0.2063 0.2061 0.2040 0.2040 0.2040 0.2040 0.1923 0.1923 0.1946 0.2040 0.1946 0.1789 0.1789 0.1789 0.1789 0.1789 0.1789 0.1789 0.1789 0.1834 0.1811 0.1857 0.1834 0.1902 0.1811 0.1843 0.1823 0.1823 0.1823 0.1823 0.1825 0.0017 0.0017 0.0017 0.0017 0.0017 0.0017 0.0017 0.0017 0.0000
44 MK049483.1 Channa micropeltes voucher KP008501 (Thailand) 0.2108 0.2061 0.2108 0.2106 0.2085 0.2085 0.2085 0.2085 0.1967 0.1967 0.1991 0.2085 0.1991 0.1832 0.1832 0.1832 0.1832 0.1832 0.1832 0.1832 0.1832 0.1878 0.1855 0.1900 0.1878 0.1900 0.1855 0.1980 0.1959 0.1959 0.1959 0.1959 0.1915 0.0118 0.0118 0.0118 0.0118 0.0118 0.0118 0.0118 0.0118 0.0136 0.0136
45 Katingan Kr1SiK Channa pleurophthalma 0.2261 0.2212 0.2261 0.2259 0.2237 0.2237 0.2237 0.2237 0.2261 0.2261 0.2286 0.2237 0.2286 0.2434 0.2434 0.2434 0.2434 0.2434 0.2434 0.2434 0.2434 0.2383 0.2383 0.2383 0.2409 0.2460 0.2434 0.2044 0.2065 0.2065 0.2065 0.2065 0.2281 0.1693 0.1693 0.1693 0.1693 0.1693 0.1693 0.1693 0.1693 0.1715 0.1715 0.1667
46 Katingan Kr2SiK Channa pleurophthalma 0.2261 0.2212 0.2261 0.2259 0.2237 0.2237 0.2237 0.2237 0.2261 0.2261 0.2286 0.2237 0.2286 0.2434 0.2434 0.2434 0.2434 0.2434 0.2434 0.2434 0.2434 0.2383 0.2383 0.2383 0.2409 0.2460 0.2434 0.2044 0.2065 0.2065 0.2065 0.2065 0.2281 0.1693 0.1693 0.1693 0.1693 0.1693 0.1693 0.1693 0.1693 0.1715 0.1715 0.1667 0.0000
47 Katingan Kr2DK Channa pleurophthalma 0.2308 0.2259 0.2308 0.2305 0.2283 0.2283 0.2283 0.2283 0.2308 0.2308 0.2333 0.2283 0.2333 0.2482 0.2482 0.2482 0.2482 0.2482 0.2482 0.2482 0.2482 0.2431 0.2431 0.2431 0.2456 0.2508 0.2482 0.2089 0.2111 0.2111 0.2111 0.2111 0.2327 0.1736 0.1736 0.1736 0.1736 0.1736 0.1736 0.1736 0.1736 0.1759 0.1759 0.1710 0.0034 0.0034
48 Katingan Kr10DK Channa pleurophthalma 0.2311 0.2261 0.2311 0.2308 0.2286 0.2286 0.2286 0.2286 0.2311 0.2311 0.2336 0.2286 0.2336 0.2485 0.2485 0.2485 0.2485 0.2485 0.2485 0.2485 0.2485 0.2434 0.2434 0.2434 0.2460 0.2511 0.2485 0.2092 0.2113 0.2113 0.2113 0.2113 0.2330 0.1693 0.1693 0.1693 0.1693 0.1693 0.1693 0.1693 0.1693 0.1715 0.1715 0.1667 0.0034 0.0034 0.0034
49 Sebangau Kr6SiS Channa pleurophthalma 0.2286 0.2237 0.2286 0.2283 0.2261 0.2261 0.2261 0.2261 0.2286 0.2286 0.2311 0.2261 0.2311 0.2460 0.2460 0.2460 0.2460 0.2460 0.2460 0.2460 0.2460 0.2409 0.2409 0.2409 0.2434 0.2485 0.2460 0.2068 0.2089 0.2089 0.2089 0.2089 0.2305 0.1670 0.1670 0.1670 0.1670 0.1670 0.1670 0.1670 0.1670 0.1693 0.1693 0.1645 0.0017 0.0017 0.0050 0.0017
50 Sebangau Kr7SiS Channa pleurophthalma 0.2286 0.2237 0.2286 0.2283 0.2261 0.2261 0.2261 0.2261 0.2286 0.2286 0.2311 0.2261 0.2311 0.2460 0.2460 0.2460 0.2460 0.2460 0.2460 0.2460 0.2460 0.2409 0.2409 0.2409 0.2434 0.2485 0.2460 0.2068 0.2089 0.2089 0.2089 0.2089 0.2305 0.1670 0.1670 0.1670 0.1670 0.1670 0.1670 0.1670 0.1670 0.1693 0.1693 0.1645 0.0017 0.0017 0.0050 0.0017 0.0000
51 Sebangau Kr6DS Channa pleurophthalma 0.2286 0.2237 0.2286 0.2283 0.2261 0.2261 0.2261 0.2261 0.2286 0.2286 0.2311 0.2261 0.2311 0.2460 0.2460 0.2460 0.2460 0.2460 0.2460 0.2460 0.2460 0.2409 0.2409 0.2409 0.2434 0.2485 0.2460 0.2068 0.2089 0.2089 0.2089 0.2089 0.2305 0.1670 0.1670 0.1670 0.1670 0.1670 0.1670 0.1670 0.1670 0.1693 0.1693 0.1645 0.0017 0.0017 0.0050 0.0017 0.0000 0.0000
52 Sebangau Kr7DS Channa pleurophthalma 0.2286 0.2237 0.2286 0.2283 0.2261 0.2261 0.2261 0.2261 0.2286 0.2286 0.2311 0.2261 0.2311 0.2460 0.2460 0.2460 0.2460 0.2460 0.2460 0.2460 0.2460 0.2409 0.2409 0.2409 0.2434 0.2485 0.2460 0.2068 0.2089 0.2089 0.2089 0.2089 0.2305 0.1670 0.1670 0.1670 0.1670 0.1670 0.1670 0.1670 0.1670 0.1693 0.1693 0.1645 0.0017 0.0017 0.0050 0.0017 0.0000 0.0000 0.0000
53 KM213041.1 Channa pleurophthalma voucher Buring BRG3 (Sumatera) 0.2261 0.2261 0.2261 0.2259 0.2286 0.2286 0.2286 0.2286 0.2311 0.2311 0.2336 0.2286 0.2336 0.2485 0.2485 0.2485 0.2485 0.2485 0.2485 0.2485 0.2485 0.2434 0.2434 0.2434 0.2460 0.2511 0.2485 0.2068 0.2089 0.2089 0.2089 0.2089 0.2305 0.1693 0.1693 0.1693 0.1693 0.1693 0.1693 0.1693 0.1693 0.1715 0.1715 0.1667 0.0034 0.0034 0.0067 0.0034 0.0017 0.0017 0.0017 0.0017
54 Katingan H7DK Channa striata 0.2473 0.2448 0.2473 0.2496 0.2473 0.2473 0.2473 0.2473 0.2423 0.2423 0.2398 0.2473 0.2398 0.2481 0.2481 0.2481 0.2481 0.2481 0.2481 0.2481 0.2481 0.2506 0.2506 0.2557 0.2532 0.2506 0.2456 0.1705 0.1729 0.1729 0.1729 0.1729 0.1753 0.2012 0.2012 0.2012 0.2012 0.2012 0.2012 0.2012 0.2012 0.1989 0.1989 0.2085 0.2161 0.2161 0.2139 0.2137 0.2137 0.2137 0.2137 0.2137 0.2137
55 Katingan H6DK Channa striata 0.2496 0.2471 0.2496 0.2518 0.2496 0.2496 0.2496 0.2496 0.2446 0.2446 0.2421 0.2496 0.2421 0.2503 0.2503 0.2503 0.2503 0.2503 0.2503 0.2503 0.2503 0.2529 0.2529 0.2580 0.2554 0.2529 0.2478 0.1725 0.1749 0.1749 0.1749 0.1749 0.1773 0.2033 0.2033 0.2033 0.2033 0.2033 0.2033 0.2033 0.2033 0.2010 0.2010 0.2106 0.2183 0.2183 0.2161 0.2159 0.2159 0.2159 0.2159 0.2159 0.2159 0.0050
56 Katingan H7SiK Channa striata 0.2476 0.2451 0.2476 0.2498 0.2476 0.2476 0.2476 0.2476 0.2426 0.2426 0.2401 0.2476 0.2401 0.2484 0.2484 0.2484 0.2484 0.2484 0.2484 0.2484 0.2484 0.2509 0.2509 0.2560 0.2534 0.2509 0.2458 0.1665 0.1689 0.1689 0.1689 0.1689 0.1713 0.1991 0.1991 0.1991 0.1991 0.1991 0.1991 0.1991 0.1991 0.1967 0.1967 0.2063 0.2139 0.2139 0.2161 0.2139 0.2116 0.2116 0.2116 0.2116 0.2116 0.0050 0.0101
57 Katingan H6SiK Channa striata 0.2451 0.2426 0.2451 0.2473 0.2451 0.2451 0.2451 0.2451 0.2401 0.2401 0.2376 0.2451 0.2376 0.2458 0.2458 0.2458 0.2458 0.2458 0.2458 0.2458 0.2458 0.2484 0.2484 0.2534 0.2509 0.2484 0.2433 0.1643 0.1667 0.1667 0.1667 0.1667 0.1691 0.1967 0.1967 0.1967 0.1967 0.1967 0.1967 0.1967 0.1967 0.1944 0.1944 0.2040 0.2116 0.2116 0.2137 0.2116 0.2092 0.2092 0.2092 0.2092 0.2092 0.0067 0.0084 0.0017
58 Sebangau H1SiS Channa striata 0.2426 0.2401 0.2426 0.2448 0.2426 0.2426 0.2426 0.2426 0.2426 0.2426 0.2401 0.2426 0.2401 0.2484 0.2484 0.2484 0.2484 0.2484 0.2484 0.2484 0.2484 0.2509 0.2509 0.2560 0.2534 0.2509 0.2458 0.1665 0.1689 0.1689 0.1689 0.1689 0.1713 0.1991 0.1991 0.1991 0.1991 0.1991 0.1991 0.1991 0.1991 0.1967 0.1967 0.2063 0.2116 0.2116 0.2137 0.2116 0.2092 0.2092 0.2092 0.2092 0.2092 0.0084 0.0101 0.0034 0.0017
59 Sebangau H2SiS Channa striata 0.2426 0.2401 0.2426 0.2448 0.2426 0.2426 0.2426 0.2426 0.2376 0.2376 0.2352 0.2426 0.2352 0.2433 0.2433 0.2433 0.2433 0.2433 0.2433 0.2433 0.2433 0.2458 0.2458 0.2509 0.2484 0.2458 0.2408 0.1621 0.1645 0.1645 0.1645 0.1645 0.1669 0.1944 0.1944 0.1944 0.1944 0.1944 0.1944 0.1944 0.1944 0.1921 0.1921 0.2016 0.2092 0.2092 0.2114 0.2092 0.2069 0.2069 0.2069 0.2069 0.2069 0.0084 0.0101 0.0034 0.0017 0.0034
60 Sebangau H1DS Channa striata 0.2426 0.2401 0.2426 0.2448 0.2426 0.2426 0.2426 0.2426 0.2426 0.2426 0.2401 0.2426 0.2401 0.2484 0.2484 0.2484 0.2484 0.2484 0.2484 0.2484 0.2484 0.2509 0.2509 0.2560 0.2534 0.2509 0.2458 0.1665 0.1689 0.1689 0.1689 0.1689 0.1713 0.1991 0.1991 0.1991 0.1991 0.1991 0.1991 0.1991 0.1991 0.1967 0.1967 0.2063 0.2116 0.2116 0.2137 0.2116 0.2092 0.2092 0.2092 0.2092 0.2092 0.0084 0.0101 0.0034 0.0017 0.0000 0.0034
61 Sebangau H2DS Channa striata 0.2426 0.2401 0.2426 0.2448 0.2426 0.2426 0.2426 0.2426 0.2376 0.2376 0.2352 0.2426 0.2352 0.2433 0.2433 0.2433 0.2433 0.2433 0.2433 0.2433 0.2433 0.2458 0.2458 0.2509 0.2484 0.2458 0.2408 0.1621 0.1645 0.1645 0.1645 0.1645 0.1669 0.1944 0.1944 0.1944 0.1944 0.1944 0.1944 0.1944 0.1944 0.1921 0.1921 0.2016 0.2092 0.2092 0.2114 0.2092 0.2069 0.2069 0.2069 0.2069 0.2069 0.0084 0.0101 0.0034 0.0017 0.0034 0.0000 0.0034
62 KU692421.1 Channa striata voucher BIF1307 (Java) 0.2426 0.2401 0.2426 0.2448 0.2426 0.2426 0.2426 0.2426 0.2376 0.2376 0.2352 0.2426 0.2352 0.2433 0.2433 0.2433 0.2433 0.2433 0.2433 0.2433 0.2433 0.2458 0.2509 0.2509 0.2534 0.2458 0.2408 0.1665 0.1689 0.1689 0.1689 0.1689 0.1713 0.1991 0.1991 0.1991 0.1991 0.1991 0.1991 0.1991 0.1991 0.1967 0.1967 0.2016 0.2092 0.2092 0.2114 0.2092 0.2069 0.2069 0.2069 0.2069 0.2069 0.0084 0.0101 0.0034 0.0017 0.0034 0.0034 0.0034 0.0034
63 KC789519.1 Channa striata voucher PNT-03 (Filipina) 0.2401 0.2401 0.2401 0.2423 0.2401 0.2401 0.2401 0.2401 0.2352 0.2352 0.2327 0.2401 0.2327 0.2453 0.2453 0.2453 0.2453 0.2453 0.2453 0.2453 0.2453 0.2478 0.2478 0.2529 0.2503 0.2478 0.2428 0.1681 0.1705 0.1705 0.1705 0.1705 0.1751 0.1983 0.1983 0.1983 0.1983 0.1983 0.1983 0.1983 0.1983 0.1960 0.1960 0.2055 0.2156 0.2156 0.2201 0.2156 0.2132 0.2132 0.2132 0.2132 0.2132 0.0169 0.0187 0.0135 0.0118 0.0135 0.0135 0.0135 0.0135 0.0135
64 MF496941.1 Channa striata isolate LR01447 (Borneo) 0.2526 0.2501 0.2526 0.2549 0.2526 0.2526 0.2526 0.2526 0.2426 0.2426 0.2401 0.2526 0.2401 0.2484 0.2484 0.2484 0.2484 0.2484 0.2484 0.2484 0.2484 0.2509 0.2509 0.2560 0.2534 0.2509 0.2458 0.1687 0.1712 0.1712 0.1712 0.1712 0.1691 0.1967 0.1967 0.1967 0.1967 0.1967 0.1967 0.1967 0.1967 0.1944 0.1944 0.2040 0.2116 0.2116 0.2137 0.2116 0.2092 0.2092 0.2092 0.2092 0.2092 0.0118 0.0135 0.0067 0.0051 0.0067 0.0067 0.0067 0.0067 0.0067 0.0170
3. Jarak Genetik
Jarak genetik yang diperoleh menunjukkan kedekatan
kekerabatannya. Diperoleh jarak genetik antar individu
(intra-spesies) dalam satu jenis kurang dari 3% sedangkan
antar jenis (inter-spesies) lebih dari 10%. Rata-rata nilai jarak genetik inter-spesies tertinggi diperoleh antara:C.striata dengan C.bankanensis = 24.72%
C.striata dengan C.lucius = 24.68%,
C.pleurophthalma dengan C.lucius = 24.60%.
Rata-rata nilai jarak genetik inter-spesies terendah yaitu antara:
C.bankanensis dengan C.lucius = 11,46%
C.marulioides dengan C.striata = 16,85%
C.micropeltes dengan C.pleurophthalma = 17,03%.
-
4. Rekonstruksi Filogeni
Klaster 1 terdiri atas C.bankanensis dan C.lucius
Spesies C.bankanensis TNS berada pada subklaster yang sama dengan isolate LR05558 (KalTeng)
Spesies C.lucius TNS berada pada subklaster yang samadengan Barito Timur, Palangkaraya dan Sumatera
Spesies C.marulioides TNS berada pada subklaster yang berbeda dengan Jambi
Spesies C.micropeltes TNS berada pada subklaster yang sama dengan Sumatera dan Singapore, terpisah dari Thailand
Spesies C.pleurophthalma TNS berada pada subklaster yang sama dengan isolate BRG3 (Sumatera)
Spesies C.striata TNS berada pada subklaster yang samadengan Jawa dan Borneo, terpisah dari Filipina
Klaster 2 terdiri atas C.micropeltes dan C.pleurophthalma
Klaster 3 terdiri atas C.marulioides dan C.striata
Klaster 1
Klaster 2
Klaster 3
-
Autentikasi terhadap ikan famili Channidae di perairan TNS dengan menggunakan penanda
mtDNA Gen COI berhasil mengidentifikasi enam spesies Channa yaitu C.bankanensis, C.lucius,
C.marulioides, C.micropeltes, C.pleurophthalma dan C.striata. Konstruksi pohon filogeni membentuk
tiga klaster yang berbeda yaitu spesies C.bankanensis dengan C.lucius, C.micropeltes dengan
C.pleurophthalma, dan C.marulioides dengan C.striata. DNA barcoding berdasarkan penanda mtDNA
gen COI menunjukkan efisiensi yang tinggi untuk mengidentifikasi spesies ikan.
Kesimpulan
-
TERIMA KASIH