bio it solutions (영문)대외홍보용 · application of transcriptome and variome information...
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http://bio.theragenetex.com
Bio IT Solutions
Proudly representing recent 10 years of Theragen Bio IT convergence technology.
Theragen Bio IT SolutionsA shortcut to an efficient and fast genomic infrastructure establishment.
테라젠 10년의 BT.IT 융합 노하우를 아낌없이 담았습니다.
빠르고 효율적인 유전체 인프라 구축의 지름길,
테라젠 BT.IT 솔루션이 있습니다.
1987 Founded Chang Ho Pharmaceutical
1997 Founded Leadpharm
2004 Listed on KOSDAQ
2009 Founded Bio institute
2010 Acquired Theragen (formerly known as Esseltech) and Etex Pharmaceutical (Korea Etex) company renamed as TheragenEtex
2009 The first in Korea (the fourth in the world) to complete human genome map
2010 The first in the world to: decode and analyze genome decode and analyze genome of tiger genome (completed in 2011, Nature communications) The first in the world to analyze Glycine soja The first in Korea to lead KPGP The first in Asia to commercialize personal genome analysis service (Hellogene)
2013 The first in the world to genetically analyze Snuffy the cloned dog The first in Korea to identify Korean stomach cancer gene
2014 The first in the world to decode and analyze genome of minke whale (Published on Nature Genetics) 2016 DTC gene analysis service (Genestyle Direct) commercialization
2017 The first in Korea to be approved by FDA of NGS clinical trial laboratory Founded a Japanese joint venture CPM
2018 Selected by Ministry of Commerce and Industry for‘Bio Big Data’, a national project Awarded in Korea New Growth Management, 2018 Awarded in Fourth Industrial Revolution Power Korea, 2018
2019 The first in Korea to commercialize‘Personal gene analysis chip’
The Establishment
Period
ThePreparatory
Period
TheDevelopment
Period
1987 창호약품 설립
1997 리드팜 설립
2004 코스닥 상장
2009 바이오연구소 설립
2010 테라젠(구 에쎌텍)과 이텍스제약(한국 이텍스) 합병,
테라젠이텍스 사명 변경
2009 국내 최초(세계 4번째) 인간 게놈 지도 완성
2010 세계 최초, 공개된 여성 ‘로잘린 길(Rosalynn Gill)’ 게놈 해독 및 분석
호랑이 게놈 해독 및 분석(2011년 완성, Nature communications)
세계 최초, 자생종 콩(Glycine soja) 분석
국내 최초, 한국인 개인 게놈 프로젝트(KPGP) 착수
아시아 최초, 개인 유전자 분석 서비스(헬로진) 상용화
2013 세계 최초, 복제 개 스너피 유전체 분석
국내 최초, 한국인 위암 유전자 규명
2014 세계 최초, 밍크고래 게놈 해독 완료(Nature genetics 게재)
개인 유전자 분석 서비스 임상 연구 수행
2016 DTC 유전자 검사 서비스(진스타일 다이렉트) 상용화
세계 최초 형질 전환 소 유전체 분석
2017 국내 1호 NGS 임상검사실 식약처 승인
일본 합작법인(CPM) 설립
2018 산자부 주관 ‘바이오 빅데이터’ 국책과제 선정
신성장경영대상 국무총리상 수상
4차산업혁명 기여 공로 과기정통부 장관상 수상
2019 국내 최초, 자사 전용 ‘맞춤형 유전체 분석 칩’ 상용화
설립기
준비기
성장기
http://bio.theragenetex.com
Theragen is a bio/pharmaceutical group that encompasses all related industries including: gene-based prediction and diagnosis,
prevention, development of novel drugs, pharmaceutical distribution, and medical big data.
Theragen possess the latest generation sequencer and genotypes analysis platform. These newest platforms and superior analytics capabilities of Theragen provide the finest results for our customers.
CEO: Samuel HwangFounded Date: March 16th, 1987Number of Employees: 430 (R&D 30%)
AICT bldg, 145 Gwanggyo-ro, Yeongtong-gu, Suwon-si, Gyeonggi-do, Republic of Korea, 16229
TEL : +82 - 1522 - 2375FAX : +82 - 31 - 888 - 9440E-Mail : [email protected]
경기도 수원시 영통구 광교로 145 차세대융합기술연구원 A동 4층 16229
(주)테라젠이텍스
TEL. 1522-2375 FAX. 031-888-9440
1987년에 설립된 테라젠이텍스는 바이오연구소와 제약사업부로 구성되며,메드팩토, 지놈케어, 리드팜, 테라젠 헬스케어 4개의 자회사를 가지고 있는 바이오/제약 그룹의 모기업입니다.
테라젠은 최신 차세대 시퀀서 및
유전형질 분석 플랫폼을 보유하고 있습니다.
이러한 최첨단 플랫폼과 테라젠만의 우수한 분석역량을 기반으로
고객들에게 최상의 결과를 제공하고 있습니다.
대 표 : 황태순
설립일 : 1987년 3월 16일
직원 수 : 300명 (R&D 34%).
GovernmentApproved Quality
Completion of human genome map first in Korea
Clinical tests for genome-based new drugs
Many government-sponsored projects and papers
Theragen is leading the genome-based research and diagnostics fields and is gradually expanding into platform technology.
The world’s fourth and Korea’s first completion of human genome map in 2008
The Asia’s first commercialization of disease outbreak risk forecasting services based on personal gene analysis in 2010
Support for clinical tests of new drugs such as new anticancer drug(Vactosertib) and oral Lou Gehrig medicine (TEJ-1704) based on genome analysis.
Discovery of new drug bio marker based on genome analysis technology.
Conducted 31 government-sponsored projects including key technology development projects in the bio industry by the Ministry of Trade, Industryand Energy
Published 99 international academic papers in Science, Nature Genetics,Nature Communications, etc.
2008년 세계 4번째, 국내 최초로 인간게놈지도 완성
2010년 아시아 최초, 개인 유전체 분석을 통한 질병 발생 위험도 예측 서비스 상용화
항암신약(백토서팁), 경구용 루게릭 치료제(TEJ-1704) 등 유전체 분석 기반의 신약개발 임상시험 지원
유전체 분석 기술을 활용한 신약 바이오 마커 발굴
산업통상자원부, ‘바이오산업 핵심기술 개발사업’ 등 31건의 국책과제 수행
Science, Nature Genetics, Nature Communications 등 99건의 국제 학술 논문 발표
한국인 최초 인간게놈지도 완성
유전체 기반 신약 임상시험
다수의 국책과제 수행 및 논문
GovernmentApproved Quality테라젠은 유전체 분석 기반의 연구 및 진단 분야를 선도하며, 점차 플랫폼 기술로
영역을 넓히고 있습니다.
Solid tumor
Blood vessel
ctRNA
ctDNA
12
4 CTC
Apoptotic or necrotictumor cell
Apoptotic CTC
3
Sample Acquisition
Sample Preparation
Theragen
LIMSInstrument Operation
Experiment Analysis
Report Delivery
Service FlowFlow Control
Data Filtering/Assessment of sequencing
Gene expressionand annotation
Dofferentiallyexpressed gene
Alternativesplicing
Noveltranscripts
GeneOntology
1
4 5 6
2 3
Out-licensing BT/IT Platform to CPM(Cancer Precision Medicine), which is the leading company for
precision medicine in Japan.
We licensed out software and systems developed with top-quality technology and capabilities such as LIMS, Liquid Biopsy Analysis Technology and
Analytical Pipeline to the CPM Inc.
< Theragen LIMS > < Liquid Biopsy Analysis Technology > < BI Pipeline >
Export of our own LIMS system specialized in NGS experiment and analysis.
The first version of LIMS was completed and delivered to
CPM in November, 2017.
Liquid Biopsy Analysis Technology
The experimental/analytic technology of our Liquid
Biopsy solution recognized for market value
Our unique and automated BI (Bioinformatics)
analytic pipelines valued with technology/capability
“$ 3 million license out to CPM” “일본 암 연구소에 31억 라이센싱 아웃”
< LIMS > < Liquid Biopsy 분석 기술 > < BI Pipeline >
일본 암 연구소BT/IT 플랫폼 라이센싱 아웃
LIMS 및 Liquid Biopsy 분석 기술, Analytical Pipeline 등 자사의 탁월한 기술력 및 역량으로
개발된 소프트웨어 및 시스템이 일본 암 연구소에 라이센싱 아웃하였습니다.
NGS 실험 및 분석에 특화된 자사
고유의 LIMS System 수출
2017년 11월 1차 버전
일본 암 연구소에 납품 완료
자사 Liquid Biopsy 솔루션의
실험/분석 기술에 대한
시장가치를 인정받았습니다.
자동화된 BI(Bioinformatics) 분석
파이프라인은 자사의 특화된
기술/역량으로 가치를
인정받았습니다.
NGS LIMS
Key points of NGS service–BI pipeline
Customized Genome Browser08
09
10
Products
11 12
The Best LIMS for Genome Analysis Service Hellogene
Theragen's Bio IT Solution offers a new direction, the foundation of technology leading to a new era of Bio IT.
테라젠이텍스는 유전자 기반의 예측 및 진단, 예방, 신약 개발, 제약, 의약품 유통,
의료 빅데이터 등 관련 산업 전반을 아우르는
종합 제약 바이오그룹입니다.
Virtual Private Network
Security
NGS LIMS
The computing resources and software systems are robust in security and are adaptive in scalability.
Scalability
All authenticated/authorized users are forced to use TLS all the time.
Transport Layer Security
All user credentials are stores usingone-way hash (cannot be recovered).
One-Way Hashing
A public open-sourced variant of Sun Grid Engine (proprietary) is used.
Compute : Sun Grid Engine
Another open-sourced file systemwithout limit on size is used.
Storage : Gluster File System
Used over four years in-house without any scalability problem so far.
Controllingcomputer
Wet Lab
Attachedcomputer
Analysis
Databaseserver
Compute/Storage
Instrument
Sequences
Documentserver
Web server
API server
Third party apps
LIMS frontend
LIMS : Enduring Heavy Loads
No unauthenticated user can accessany resources from public networks.
Dry Lab UsersLIMS Servers
08
The Theragen TotalOmicsBI pipeline contains a broad spectrum of services acrossa wide range of species.
Support advanced analysis to meet your needs.
Establish the AWSCloud-based custom analysis
environment for efficient resource operations for users.
All of Theragen TotalOmicsBI pipelines are made up of automated systems for convenient operation.
Valuable BI
AWS Cloud
TotalOmics Analytical Pipeline in Theragen provides the best solution tomeet the needs of the markets based on its know-how.
Wide Spectrum
Automation
Key points of NGS service–BI pipelineAll process automated for NGS analysis service
Bio IT Solution
09
테라젠 TotalOmics BI 파이프라인은 다양한 종, 다양한 서비스를 총망라하는 폭넓은 스펙트럼을 갖고 있습니다.
고객의 다양한 니즈에 부합하는 고급 분석을
지원합니다.
사용자의 효율적인 리소스 운영을 위해 AWS
클라우드 기반의 맞춤형 분석 환경을 구축합니다.
테라젠 TotalOmics 의 모든 BI 파이프라인은 자동화 시스템으로 이루어져 있어 운영이 편리합니다.
Valuable BI
AWS Cloud
테라젠 TotalOmics 분석 파이프라인은 그간의 노하우를 기반으로 다양한 시장의 요구를 빠르게 대응할 수 있는 최적의 솔루션을 제공합니다.
Wide Spectrum
Automation
NGS 서비스의 핵심 열쇠 – BI 파이프라인NGS 분석 서비스를 위한 모든 공정의 자동화
Application of Whole Genome Information
Application of Useful Genomic Information
Application of Transcriptome and Variome Information
Customized Genome Browser
We provide an easy access to information about genes of interest and gene locations.
We provide at-a-glance viewing of a list of useful genes on a separate page.
With your transcriptome and variome information, we made visualization of genomic structure easy for each samples with somatic variants and gene expression.
We assist your genome research through establishment of
Customized genome browser.
10
전장 유전자 정보 활용
유용 유전자 정보 활용
변이체 및 전사체 정보 활용
Customized Genome Browser
유전자의 위치 및 관심 유전자에 대해 쉽게 검색이 가능하고 해당 유전자의 정보를 쉽게 확인이 가능합니다.
종 특성에 따른 유용 유전자들에 대한 리스트는 페이지를 따로 구성하여 한눈에 확인이 가능하도록 합니다.
변이체와 전사체 정보를 가지고 있다면, 각 샘플 별 유전체 구조에 맞추어 변이 정보 및 발현 정보 시각화를 쉽게 구현하도록 합니다.
맞춤형 유전체 브라우저 구축을 통하여유전체 연구를
더욱 용이하게 하실 수 있도록 도와드립니다.
The Best LIMS for Genome Analysis Service
PGS progresses in response to time-changing genetic regulations. Along with the progress, the trotter manages plates and SNPs information
and helps develop prompt new services.
Automatically analyzes the results of the genotyping experiment to generate a
report with registered phenotype information.
Provides improved quality of services based on various statistics with the status
information of: stored and released, time period, and
inspection results.
System provides general management of the stored,
released and disposal of samples and complies with the guidelines of the Korea
Institute for Genetic Inspection and Evaluation.
Automated Experimental Analysis
Various Statistical Analysis
Sample Management
Bio IT Solution
11
We’re fransforming into the key player in Bio Medical Informatics.
인공지능 기반의 유전체 데이터
분석
국내 유일의 유전체 빅데이터 기반 신약 임상
이미지·의료정보·
오믹스 빅데이터
통합 분석
빅데이터 분석
및 컨설팅
전문가 보유
다년간 축적된 유전체 분석 노하우를 기반으로 헬스케어·의료·제약 분야의 빅데이터 및 인공지능 솔루션을 제공합니다.
대규모 오믹스 빅데이터 구축
First release in Asia in 2010!Disease prediction personal gene inspection service "Hellogene"Personal Genome Service, Hellogene
1. Cancer (11)2. General Illness (27)3. Platinum Light (Cancer 11 + General Illness 27)4. Platinum (Platinum light 38 + Physical Feature / Drug Response 10)5. Noble (Platinum + Rare Disease)6. Metabolic Syndrome (8)7. Geriatric Disease (10)8. Pediatric Disease (6)
"An ounce of prevention is worth a pound of cure"
Lifetime Prevalence
Suggesting use of test results
Early diagnosis and customized prescription
Increase multiplemarkers and
transparent disclosure
Genetic-Environmental
Interaction
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Genome Cloud Managed Service국내 유전체 서비스 기업 최초 출시!
Migration &Cost optimization
기존의 레거시를 클라우드로 이전함으로써최적화된 유전체 워크로드를
구현할 수 있습니다
기존 인프라의 클라우드 이전
Bioinformaticsconsulting
신약개발을 포함해 다양한 헬스케어 전 분야에서 활용가능한 유전체 데이터 분석을 위한 인프라 구축과
컨설팅을 제공합니다.
새로운 유전체 분석 인프라 구축
Infrastructure as a Service (IaaS)인프라스트럭쳐 레벨을 제공하는 서비스를 의미하며 유전체 분석 환경에 적절한 클라우드를 선택하고,
환경과 조건, 운영하려는 앱 유형에 맞춰 이 리소스를 설계해드립니다.
Platform as a Service (PaaS)Bioinformatics 개발자가 분석 워크플로우를 개발하기
위한 서비스와 기능들이 제공되는 서비스입니다. Bioin-formatics 개발자는 이 플랫폼에서 유전체 분석
워크플로우 개발에만 집중하면 됩니다. 여러 유전체 DB 제공도 가능합니다.
Software as a Service (SaaS)유전체 데이터 생산 플랫폼이 다양해지며 분석
워크플로우의 요구도 증가하고 있습니다. 인프라나 개발 환경이 구축이 어려운 분들께 직접 Bioinformatics 전문가가 투입되어 유전체 분석 워크로드를 구현해
드립니다.
필요한 만큼 가용한 분석 자원 구축 가능
쓸수록 저렴해지는 분석 비용
빠른 시간에 대용량 유전체 데이터 분석 가능
전문가의 도움으로 쉽게 커스터마이즈 워크플로우 구축
Bio IT Solution
THANK YOU FOR BEING WITH THERAGEN
Enhance your Bioinformatics efficiently.Our service is a Cloud-based Total Bioinformatics platform that allows you to learn from basic to professionals practically, analyze any NGS workflows with cloud server or create your own pipelines with user-friendly Theragen UX.
Analyze with adopted or customized tools
with user friendly UX.
Create your own pipeline easily
Your content and statistics are securely stored on Theragen’s servers. Even our platform is mainly a cloud-based solution, we also assist the complete
and secured platform by deploying the system on your own server.
Data Storage and Technical Support
Bioinformatics Online‘Leam and Run’Platform
Learn & Run Bioinformatics
Service Flow
Choose your lecture Follow the curriculum Get certificated
Genotyping 실험 결과를
자동분석하여 등록된
phenotype 정보로
보고서를 생성합니다.
The Best LIMS for Genome Analysis Service
실험 분석 자동화
시시로 변하는 유전체 관련 규제에 대응하여 PGS도 변화하고 있습니다.
이런 변화에 발맞추어 trotter에서는 플레이트와 SNP 등의 정보를 관리하며 이를 이용해
빠르게 신규 서비스를 개발할 수 있도록 도와줍니다.
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TEL : +82 - 1522 - 2375FAX : +82 - 31 - 888 - 9440E-Mail : [email protected]
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검사결과통계 등 다양한 통계를
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높일 수 있습니다.
검체의 입고, 출고, 폐기 등의
전반적인 관리를 하며
한국유전자검사평가원의
지침을 따르는 시스템입니다.
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2010년 아시아 최초 출시!!질병 예측 개인 유전자검사 서비스 “헬로진”Personal Genome Service, Hellogene
1. 암 (11종)
2. 일반 질환 (27종)
3. 플래티넘 라이트 (암11종 + 일반 질환 27종)
4. 플래티넘 (플래티넘 라이트 38종 + 신체적 특징 / 약물반응 10종)
5. 노블 (플래티넘 라이트 38종 + 신체적 특징 / 약물반응 10종 + 희귀질환 44종)
6. 대사증후군 질환 (8종)
7. 노인성 질환 (10종)
8. 아이 (9종)
유전자 감사를 통해 당신의 미래를 알 수 있습니다.
평생 유별률
정보 제공
검사 결과의
활용방안 제시