biotechnology 2012-08

38
Анализ экспрессии генов

Upload: bioinformaticsinstitute

Post on 11-Jul-2015

50 views

Category:

Documents


1 download

TRANSCRIPT

Page 1: Biotechnology 2012-08

Анализ экспрессии генов

Центральная догма молекулярной биологии

(FCrick 1958 1970)

DNA

RNA Protein

Экспрессия генов

Количество генов

4300

6300

18000

25000

28000

Тканеспецифичная экспрессия

Индуцибельная экспрессия

Тканеспецифичная экспрессия

Анализ экспрессии

bull На уровне мРНК

bull На уровне белков

Лазерная микродиссекциядля анализа экспрессии в отдельных клетках или гомогенных

популяциях клеток

Анализ мРНК

Синтез кДНК

Создание кДНК библиотек

Сравнение геномной и кДНКбиблиотек

Специфичный синтез кДНК

Методы основанные на гибридизации

bull Nothern blot

bull Tissue in situ hybridization (TISH)

Southern Blot (DNA)

Northern blot (RNA)

bull Наличие мРНКbull Размер мРНК

TISH

Локализации мРНК в тканях клетках

Количественная ПЦР

1 RT-PCR (reverse transcriptase PCR)

2 qPCR (real-time PCR)

Количественная ПЦР

bull Неспецифичная детекция- интеркалирующие красители

bullСпецифичная детекция- TaqMan- molecular beacon- и тд

TaqMan

Molecular Beacon

Microarray

Heatmap ndash визуализация microarray анализа

Heatmap ndash визуализация microarray анализа

Сравнительный экспрессиионный анализ

Сравнение экспрессии

Affymetrix GeneChip

Next-generation sequencingRNA-seq experiment

Анализ белков

Westernblot(иммуноблоттинг)

Используются специфичные антитела

А В ndash антитела с разной специфичностью

С ndash контрольные образцы здоровых людей1-8 ndash образцы больных мышечной дистрофией

in vitro

Двумерный электрофорез белков

1 Разделение по pH2 Разделение в электрическом

поле (электрофорез)

Разрешение ndash до 10 000 белков в одном геле

Иммуногистохимия

Используются специфичные меченые антитела

in situ

Флуоресцентная микроскопия

bull Белок метится аминоксилотнойпоследовательностью к которой подобраны антитела

bull Белок метится флюоресцентым белком GFP

in vivo

Масс-спектрометрия

Определение массы и заряда молекул

MALDI-TOF

Анализ белков при помощи масс-спектрометрии

ChiP-seq(chromatin immunoprecipitation sequencing)

Анализ взаимодействия белков с ДНК

Паттерны метилирования

Метилирование тканеспецифично локусспецифично особьспецифично

Methylated DNA immuno-precipitation (MeDIP-Seq)

Bisulfite sequencing

Спасибо за внимание

Page 2: Biotechnology 2012-08

Центральная догма молекулярной биологии

(FCrick 1958 1970)

DNA

RNA Protein

Экспрессия генов

Количество генов

4300

6300

18000

25000

28000

Тканеспецифичная экспрессия

Индуцибельная экспрессия

Тканеспецифичная экспрессия

Анализ экспрессии

bull На уровне мРНК

bull На уровне белков

Лазерная микродиссекциядля анализа экспрессии в отдельных клетках или гомогенных

популяциях клеток

Анализ мРНК

Синтез кДНК

Создание кДНК библиотек

Сравнение геномной и кДНКбиблиотек

Специфичный синтез кДНК

Методы основанные на гибридизации

bull Nothern blot

bull Tissue in situ hybridization (TISH)

Southern Blot (DNA)

Northern blot (RNA)

bull Наличие мРНКbull Размер мРНК

TISH

Локализации мРНК в тканях клетках

Количественная ПЦР

1 RT-PCR (reverse transcriptase PCR)

2 qPCR (real-time PCR)

Количественная ПЦР

bull Неспецифичная детекция- интеркалирующие красители

bullСпецифичная детекция- TaqMan- molecular beacon- и тд

TaqMan

Molecular Beacon

Microarray

Heatmap ndash визуализация microarray анализа

Heatmap ndash визуализация microarray анализа

Сравнительный экспрессиионный анализ

Сравнение экспрессии

Affymetrix GeneChip

Next-generation sequencingRNA-seq experiment

Анализ белков

Westernblot(иммуноблоттинг)

Используются специфичные антитела

А В ndash антитела с разной специфичностью

С ndash контрольные образцы здоровых людей1-8 ndash образцы больных мышечной дистрофией

in vitro

Двумерный электрофорез белков

1 Разделение по pH2 Разделение в электрическом

поле (электрофорез)

Разрешение ndash до 10 000 белков в одном геле

Иммуногистохимия

Используются специфичные меченые антитела

in situ

Флуоресцентная микроскопия

bull Белок метится аминоксилотнойпоследовательностью к которой подобраны антитела

bull Белок метится флюоресцентым белком GFP

in vivo

Масс-спектрометрия

Определение массы и заряда молекул

MALDI-TOF

Анализ белков при помощи масс-спектрометрии

ChiP-seq(chromatin immunoprecipitation sequencing)

Анализ взаимодействия белков с ДНК

Паттерны метилирования

Метилирование тканеспецифично локусспецифично особьспецифично

Methylated DNA immuno-precipitation (MeDIP-Seq)

Bisulfite sequencing

Спасибо за внимание

Page 3: Biotechnology 2012-08

Количество генов

4300

6300

18000

25000

28000

Тканеспецифичная экспрессия

Индуцибельная экспрессия

Тканеспецифичная экспрессия

Анализ экспрессии

bull На уровне мРНК

bull На уровне белков

Лазерная микродиссекциядля анализа экспрессии в отдельных клетках или гомогенных

популяциях клеток

Анализ мРНК

Синтез кДНК

Создание кДНК библиотек

Сравнение геномной и кДНКбиблиотек

Специфичный синтез кДНК

Методы основанные на гибридизации

bull Nothern blot

bull Tissue in situ hybridization (TISH)

Southern Blot (DNA)

Northern blot (RNA)

bull Наличие мРНКbull Размер мРНК

TISH

Локализации мРНК в тканях клетках

Количественная ПЦР

1 RT-PCR (reverse transcriptase PCR)

2 qPCR (real-time PCR)

Количественная ПЦР

bull Неспецифичная детекция- интеркалирующие красители

bullСпецифичная детекция- TaqMan- molecular beacon- и тд

TaqMan

Molecular Beacon

Microarray

Heatmap ndash визуализация microarray анализа

Heatmap ndash визуализация microarray анализа

Сравнительный экспрессиионный анализ

Сравнение экспрессии

Affymetrix GeneChip

Next-generation sequencingRNA-seq experiment

Анализ белков

Westernblot(иммуноблоттинг)

Используются специфичные антитела

А В ndash антитела с разной специфичностью

С ndash контрольные образцы здоровых людей1-8 ndash образцы больных мышечной дистрофией

in vitro

Двумерный электрофорез белков

1 Разделение по pH2 Разделение в электрическом

поле (электрофорез)

Разрешение ndash до 10 000 белков в одном геле

Иммуногистохимия

Используются специфичные меченые антитела

in situ

Флуоресцентная микроскопия

bull Белок метится аминоксилотнойпоследовательностью к которой подобраны антитела

bull Белок метится флюоресцентым белком GFP

in vivo

Масс-спектрометрия

Определение массы и заряда молекул

MALDI-TOF

Анализ белков при помощи масс-спектрометрии

ChiP-seq(chromatin immunoprecipitation sequencing)

Анализ взаимодействия белков с ДНК

Паттерны метилирования

Метилирование тканеспецифично локусспецифично особьспецифично

Methylated DNA immuno-precipitation (MeDIP-Seq)

Bisulfite sequencing

Спасибо за внимание

Page 4: Biotechnology 2012-08

Тканеспецифичная экспрессия

Индуцибельная экспрессия

Тканеспецифичная экспрессия

Анализ экспрессии

bull На уровне мРНК

bull На уровне белков

Лазерная микродиссекциядля анализа экспрессии в отдельных клетках или гомогенных

популяциях клеток

Анализ мРНК

Синтез кДНК

Создание кДНК библиотек

Сравнение геномной и кДНКбиблиотек

Специфичный синтез кДНК

Методы основанные на гибридизации

bull Nothern blot

bull Tissue in situ hybridization (TISH)

Southern Blot (DNA)

Northern blot (RNA)

bull Наличие мРНКbull Размер мРНК

TISH

Локализации мРНК в тканях клетках

Количественная ПЦР

1 RT-PCR (reverse transcriptase PCR)

2 qPCR (real-time PCR)

Количественная ПЦР

bull Неспецифичная детекция- интеркалирующие красители

bullСпецифичная детекция- TaqMan- molecular beacon- и тд

TaqMan

Molecular Beacon

Microarray

Heatmap ndash визуализация microarray анализа

Heatmap ndash визуализация microarray анализа

Сравнительный экспрессиионный анализ

Сравнение экспрессии

Affymetrix GeneChip

Next-generation sequencingRNA-seq experiment

Анализ белков

Westernblot(иммуноблоттинг)

Используются специфичные антитела

А В ndash антитела с разной специфичностью

С ndash контрольные образцы здоровых людей1-8 ndash образцы больных мышечной дистрофией

in vitro

Двумерный электрофорез белков

1 Разделение по pH2 Разделение в электрическом

поле (электрофорез)

Разрешение ndash до 10 000 белков в одном геле

Иммуногистохимия

Используются специфичные меченые антитела

in situ

Флуоресцентная микроскопия

bull Белок метится аминоксилотнойпоследовательностью к которой подобраны антитела

bull Белок метится флюоресцентым белком GFP

in vivo

Масс-спектрометрия

Определение массы и заряда молекул

MALDI-TOF

Анализ белков при помощи масс-спектрометрии

ChiP-seq(chromatin immunoprecipitation sequencing)

Анализ взаимодействия белков с ДНК

Паттерны метилирования

Метилирование тканеспецифично локусспецифично особьспецифично

Methylated DNA immuno-precipitation (MeDIP-Seq)

Bisulfite sequencing

Спасибо за внимание

Page 5: Biotechnology 2012-08

Тканеспецифичная экспрессия

Анализ экспрессии

bull На уровне мРНК

bull На уровне белков

Лазерная микродиссекциядля анализа экспрессии в отдельных клетках или гомогенных

популяциях клеток

Анализ мРНК

Синтез кДНК

Создание кДНК библиотек

Сравнение геномной и кДНКбиблиотек

Специфичный синтез кДНК

Методы основанные на гибридизации

bull Nothern blot

bull Tissue in situ hybridization (TISH)

Southern Blot (DNA)

Northern blot (RNA)

bull Наличие мРНКbull Размер мРНК

TISH

Локализации мРНК в тканях клетках

Количественная ПЦР

1 RT-PCR (reverse transcriptase PCR)

2 qPCR (real-time PCR)

Количественная ПЦР

bull Неспецифичная детекция- интеркалирующие красители

bullСпецифичная детекция- TaqMan- molecular beacon- и тд

TaqMan

Molecular Beacon

Microarray

Heatmap ndash визуализация microarray анализа

Heatmap ndash визуализация microarray анализа

Сравнительный экспрессиионный анализ

Сравнение экспрессии

Affymetrix GeneChip

Next-generation sequencingRNA-seq experiment

Анализ белков

Westernblot(иммуноблоттинг)

Используются специфичные антитела

А В ndash антитела с разной специфичностью

С ndash контрольные образцы здоровых людей1-8 ndash образцы больных мышечной дистрофией

in vitro

Двумерный электрофорез белков

1 Разделение по pH2 Разделение в электрическом

поле (электрофорез)

Разрешение ndash до 10 000 белков в одном геле

Иммуногистохимия

Используются специфичные меченые антитела

in situ

Флуоресцентная микроскопия

bull Белок метится аминоксилотнойпоследовательностью к которой подобраны антитела

bull Белок метится флюоресцентым белком GFP

in vivo

Масс-спектрометрия

Определение массы и заряда молекул

MALDI-TOF

Анализ белков при помощи масс-спектрометрии

ChiP-seq(chromatin immunoprecipitation sequencing)

Анализ взаимодействия белков с ДНК

Паттерны метилирования

Метилирование тканеспецифично локусспецифично особьспецифично

Methylated DNA immuno-precipitation (MeDIP-Seq)

Bisulfite sequencing

Спасибо за внимание

Page 6: Biotechnology 2012-08

Анализ экспрессии

bull На уровне мРНК

bull На уровне белков

Лазерная микродиссекциядля анализа экспрессии в отдельных клетках или гомогенных

популяциях клеток

Анализ мРНК

Синтез кДНК

Создание кДНК библиотек

Сравнение геномной и кДНКбиблиотек

Специфичный синтез кДНК

Методы основанные на гибридизации

bull Nothern blot

bull Tissue in situ hybridization (TISH)

Southern Blot (DNA)

Northern blot (RNA)

bull Наличие мРНКbull Размер мРНК

TISH

Локализации мРНК в тканях клетках

Количественная ПЦР

1 RT-PCR (reverse transcriptase PCR)

2 qPCR (real-time PCR)

Количественная ПЦР

bull Неспецифичная детекция- интеркалирующие красители

bullСпецифичная детекция- TaqMan- molecular beacon- и тд

TaqMan

Molecular Beacon

Microarray

Heatmap ndash визуализация microarray анализа

Heatmap ndash визуализация microarray анализа

Сравнительный экспрессиионный анализ

Сравнение экспрессии

Affymetrix GeneChip

Next-generation sequencingRNA-seq experiment

Анализ белков

Westernblot(иммуноблоттинг)

Используются специфичные антитела

А В ndash антитела с разной специфичностью

С ndash контрольные образцы здоровых людей1-8 ndash образцы больных мышечной дистрофией

in vitro

Двумерный электрофорез белков

1 Разделение по pH2 Разделение в электрическом

поле (электрофорез)

Разрешение ndash до 10 000 белков в одном геле

Иммуногистохимия

Используются специфичные меченые антитела

in situ

Флуоресцентная микроскопия

bull Белок метится аминоксилотнойпоследовательностью к которой подобраны антитела

bull Белок метится флюоресцентым белком GFP

in vivo

Масс-спектрометрия

Определение массы и заряда молекул

MALDI-TOF

Анализ белков при помощи масс-спектрометрии

ChiP-seq(chromatin immunoprecipitation sequencing)

Анализ взаимодействия белков с ДНК

Паттерны метилирования

Метилирование тканеспецифично локусспецифично особьспецифично

Methylated DNA immuno-precipitation (MeDIP-Seq)

Bisulfite sequencing

Спасибо за внимание

Page 7: Biotechnology 2012-08

Лазерная микродиссекциядля анализа экспрессии в отдельных клетках или гомогенных

популяциях клеток

Анализ мРНК

Синтез кДНК

Создание кДНК библиотек

Сравнение геномной и кДНКбиблиотек

Специфичный синтез кДНК

Методы основанные на гибридизации

bull Nothern blot

bull Tissue in situ hybridization (TISH)

Southern Blot (DNA)

Northern blot (RNA)

bull Наличие мРНКbull Размер мРНК

TISH

Локализации мРНК в тканях клетках

Количественная ПЦР

1 RT-PCR (reverse transcriptase PCR)

2 qPCR (real-time PCR)

Количественная ПЦР

bull Неспецифичная детекция- интеркалирующие красители

bullСпецифичная детекция- TaqMan- molecular beacon- и тд

TaqMan

Molecular Beacon

Microarray

Heatmap ndash визуализация microarray анализа

Heatmap ndash визуализация microarray анализа

Сравнительный экспрессиионный анализ

Сравнение экспрессии

Affymetrix GeneChip

Next-generation sequencingRNA-seq experiment

Анализ белков

Westernblot(иммуноблоттинг)

Используются специфичные антитела

А В ndash антитела с разной специфичностью

С ndash контрольные образцы здоровых людей1-8 ndash образцы больных мышечной дистрофией

in vitro

Двумерный электрофорез белков

1 Разделение по pH2 Разделение в электрическом

поле (электрофорез)

Разрешение ndash до 10 000 белков в одном геле

Иммуногистохимия

Используются специфичные меченые антитела

in situ

Флуоресцентная микроскопия

bull Белок метится аминоксилотнойпоследовательностью к которой подобраны антитела

bull Белок метится флюоресцентым белком GFP

in vivo

Масс-спектрометрия

Определение массы и заряда молекул

MALDI-TOF

Анализ белков при помощи масс-спектрометрии

ChiP-seq(chromatin immunoprecipitation sequencing)

Анализ взаимодействия белков с ДНК

Паттерны метилирования

Метилирование тканеспецифично локусспецифично особьспецифично

Methylated DNA immuno-precipitation (MeDIP-Seq)

Bisulfite sequencing

Спасибо за внимание

Page 8: Biotechnology 2012-08

Анализ мРНК

Синтез кДНК

Создание кДНК библиотек

Сравнение геномной и кДНКбиблиотек

Специфичный синтез кДНК

Методы основанные на гибридизации

bull Nothern blot

bull Tissue in situ hybridization (TISH)

Southern Blot (DNA)

Northern blot (RNA)

bull Наличие мРНКbull Размер мРНК

TISH

Локализации мРНК в тканях клетках

Количественная ПЦР

1 RT-PCR (reverse transcriptase PCR)

2 qPCR (real-time PCR)

Количественная ПЦР

bull Неспецифичная детекция- интеркалирующие красители

bullСпецифичная детекция- TaqMan- molecular beacon- и тд

TaqMan

Molecular Beacon

Microarray

Heatmap ndash визуализация microarray анализа

Heatmap ndash визуализация microarray анализа

Сравнительный экспрессиионный анализ

Сравнение экспрессии

Affymetrix GeneChip

Next-generation sequencingRNA-seq experiment

Анализ белков

Westernblot(иммуноблоттинг)

Используются специфичные антитела

А В ndash антитела с разной специфичностью

С ndash контрольные образцы здоровых людей1-8 ndash образцы больных мышечной дистрофией

in vitro

Двумерный электрофорез белков

1 Разделение по pH2 Разделение в электрическом

поле (электрофорез)

Разрешение ndash до 10 000 белков в одном геле

Иммуногистохимия

Используются специфичные меченые антитела

in situ

Флуоресцентная микроскопия

bull Белок метится аминоксилотнойпоследовательностью к которой подобраны антитела

bull Белок метится флюоресцентым белком GFP

in vivo

Масс-спектрометрия

Определение массы и заряда молекул

MALDI-TOF

Анализ белков при помощи масс-спектрометрии

ChiP-seq(chromatin immunoprecipitation sequencing)

Анализ взаимодействия белков с ДНК

Паттерны метилирования

Метилирование тканеспецифично локусспецифично особьспецифично

Methylated DNA immuno-precipitation (MeDIP-Seq)

Bisulfite sequencing

Спасибо за внимание

Page 9: Biotechnology 2012-08

Синтез кДНК

Создание кДНК библиотек

Сравнение геномной и кДНКбиблиотек

Специфичный синтез кДНК

Методы основанные на гибридизации

bull Nothern blot

bull Tissue in situ hybridization (TISH)

Southern Blot (DNA)

Northern blot (RNA)

bull Наличие мРНКbull Размер мРНК

TISH

Локализации мРНК в тканях клетках

Количественная ПЦР

1 RT-PCR (reverse transcriptase PCR)

2 qPCR (real-time PCR)

Количественная ПЦР

bull Неспецифичная детекция- интеркалирующие красители

bullСпецифичная детекция- TaqMan- molecular beacon- и тд

TaqMan

Molecular Beacon

Microarray

Heatmap ndash визуализация microarray анализа

Heatmap ndash визуализация microarray анализа

Сравнительный экспрессиионный анализ

Сравнение экспрессии

Affymetrix GeneChip

Next-generation sequencingRNA-seq experiment

Анализ белков

Westernblot(иммуноблоттинг)

Используются специфичные антитела

А В ndash антитела с разной специфичностью

С ndash контрольные образцы здоровых людей1-8 ndash образцы больных мышечной дистрофией

in vitro

Двумерный электрофорез белков

1 Разделение по pH2 Разделение в электрическом

поле (электрофорез)

Разрешение ndash до 10 000 белков в одном геле

Иммуногистохимия

Используются специфичные меченые антитела

in situ

Флуоресцентная микроскопия

bull Белок метится аминоксилотнойпоследовательностью к которой подобраны антитела

bull Белок метится флюоресцентым белком GFP

in vivo

Масс-спектрометрия

Определение массы и заряда молекул

MALDI-TOF

Анализ белков при помощи масс-спектрометрии

ChiP-seq(chromatin immunoprecipitation sequencing)

Анализ взаимодействия белков с ДНК

Паттерны метилирования

Метилирование тканеспецифично локусспецифично особьспецифично

Methylated DNA immuno-precipitation (MeDIP-Seq)

Bisulfite sequencing

Спасибо за внимание

Page 10: Biotechnology 2012-08

Создание кДНК библиотек

Сравнение геномной и кДНКбиблиотек

Специфичный синтез кДНК

Методы основанные на гибридизации

bull Nothern blot

bull Tissue in situ hybridization (TISH)

Southern Blot (DNA)

Northern blot (RNA)

bull Наличие мРНКbull Размер мРНК

TISH

Локализации мРНК в тканях клетках

Количественная ПЦР

1 RT-PCR (reverse transcriptase PCR)

2 qPCR (real-time PCR)

Количественная ПЦР

bull Неспецифичная детекция- интеркалирующие красители

bullСпецифичная детекция- TaqMan- molecular beacon- и тд

TaqMan

Molecular Beacon

Microarray

Heatmap ndash визуализация microarray анализа

Heatmap ndash визуализация microarray анализа

Сравнительный экспрессиионный анализ

Сравнение экспрессии

Affymetrix GeneChip

Next-generation sequencingRNA-seq experiment

Анализ белков

Westernblot(иммуноблоттинг)

Используются специфичные антитела

А В ndash антитела с разной специфичностью

С ndash контрольные образцы здоровых людей1-8 ndash образцы больных мышечной дистрофией

in vitro

Двумерный электрофорез белков

1 Разделение по pH2 Разделение в электрическом

поле (электрофорез)

Разрешение ndash до 10 000 белков в одном геле

Иммуногистохимия

Используются специфичные меченые антитела

in situ

Флуоресцентная микроскопия

bull Белок метится аминоксилотнойпоследовательностью к которой подобраны антитела

bull Белок метится флюоресцентым белком GFP

in vivo

Масс-спектрометрия

Определение массы и заряда молекул

MALDI-TOF

Анализ белков при помощи масс-спектрометрии

ChiP-seq(chromatin immunoprecipitation sequencing)

Анализ взаимодействия белков с ДНК

Паттерны метилирования

Метилирование тканеспецифично локусспецифично особьспецифично

Methylated DNA immuno-precipitation (MeDIP-Seq)

Bisulfite sequencing

Спасибо за внимание

Page 11: Biotechnology 2012-08

Сравнение геномной и кДНКбиблиотек

Специфичный синтез кДНК

Методы основанные на гибридизации

bull Nothern blot

bull Tissue in situ hybridization (TISH)

Southern Blot (DNA)

Northern blot (RNA)

bull Наличие мРНКbull Размер мРНК

TISH

Локализации мРНК в тканях клетках

Количественная ПЦР

1 RT-PCR (reverse transcriptase PCR)

2 qPCR (real-time PCR)

Количественная ПЦР

bull Неспецифичная детекция- интеркалирующие красители

bullСпецифичная детекция- TaqMan- molecular beacon- и тд

TaqMan

Molecular Beacon

Microarray

Heatmap ndash визуализация microarray анализа

Heatmap ndash визуализация microarray анализа

Сравнительный экспрессиионный анализ

Сравнение экспрессии

Affymetrix GeneChip

Next-generation sequencingRNA-seq experiment

Анализ белков

Westernblot(иммуноблоттинг)

Используются специфичные антитела

А В ndash антитела с разной специфичностью

С ndash контрольные образцы здоровых людей1-8 ndash образцы больных мышечной дистрофией

in vitro

Двумерный электрофорез белков

1 Разделение по pH2 Разделение в электрическом

поле (электрофорез)

Разрешение ndash до 10 000 белков в одном геле

Иммуногистохимия

Используются специфичные меченые антитела

in situ

Флуоресцентная микроскопия

bull Белок метится аминоксилотнойпоследовательностью к которой подобраны антитела

bull Белок метится флюоресцентым белком GFP

in vivo

Масс-спектрометрия

Определение массы и заряда молекул

MALDI-TOF

Анализ белков при помощи масс-спектрометрии

ChiP-seq(chromatin immunoprecipitation sequencing)

Анализ взаимодействия белков с ДНК

Паттерны метилирования

Метилирование тканеспецифично локусспецифично особьспецифично

Methylated DNA immuno-precipitation (MeDIP-Seq)

Bisulfite sequencing

Спасибо за внимание

Page 12: Biotechnology 2012-08

Специфичный синтез кДНК

Методы основанные на гибридизации

bull Nothern blot

bull Tissue in situ hybridization (TISH)

Southern Blot (DNA)

Northern blot (RNA)

bull Наличие мРНКbull Размер мРНК

TISH

Локализации мРНК в тканях клетках

Количественная ПЦР

1 RT-PCR (reverse transcriptase PCR)

2 qPCR (real-time PCR)

Количественная ПЦР

bull Неспецифичная детекция- интеркалирующие красители

bullСпецифичная детекция- TaqMan- molecular beacon- и тд

TaqMan

Molecular Beacon

Microarray

Heatmap ndash визуализация microarray анализа

Heatmap ndash визуализация microarray анализа

Сравнительный экспрессиионный анализ

Сравнение экспрессии

Affymetrix GeneChip

Next-generation sequencingRNA-seq experiment

Анализ белков

Westernblot(иммуноблоттинг)

Используются специфичные антитела

А В ndash антитела с разной специфичностью

С ndash контрольные образцы здоровых людей1-8 ndash образцы больных мышечной дистрофией

in vitro

Двумерный электрофорез белков

1 Разделение по pH2 Разделение в электрическом

поле (электрофорез)

Разрешение ndash до 10 000 белков в одном геле

Иммуногистохимия

Используются специфичные меченые антитела

in situ

Флуоресцентная микроскопия

bull Белок метится аминоксилотнойпоследовательностью к которой подобраны антитела

bull Белок метится флюоресцентым белком GFP

in vivo

Масс-спектрометрия

Определение массы и заряда молекул

MALDI-TOF

Анализ белков при помощи масс-спектрометрии

ChiP-seq(chromatin immunoprecipitation sequencing)

Анализ взаимодействия белков с ДНК

Паттерны метилирования

Метилирование тканеспецифично локусспецифично особьспецифично

Methylated DNA immuno-precipitation (MeDIP-Seq)

Bisulfite sequencing

Спасибо за внимание

Page 13: Biotechnology 2012-08

Методы основанные на гибридизации

bull Nothern blot

bull Tissue in situ hybridization (TISH)

Southern Blot (DNA)

Northern blot (RNA)

bull Наличие мРНКbull Размер мРНК

TISH

Локализации мРНК в тканях клетках

Количественная ПЦР

1 RT-PCR (reverse transcriptase PCR)

2 qPCR (real-time PCR)

Количественная ПЦР

bull Неспецифичная детекция- интеркалирующие красители

bullСпецифичная детекция- TaqMan- molecular beacon- и тд

TaqMan

Molecular Beacon

Microarray

Heatmap ndash визуализация microarray анализа

Heatmap ndash визуализация microarray анализа

Сравнительный экспрессиионный анализ

Сравнение экспрессии

Affymetrix GeneChip

Next-generation sequencingRNA-seq experiment

Анализ белков

Westernblot(иммуноблоттинг)

Используются специфичные антитела

А В ndash антитела с разной специфичностью

С ndash контрольные образцы здоровых людей1-8 ndash образцы больных мышечной дистрофией

in vitro

Двумерный электрофорез белков

1 Разделение по pH2 Разделение в электрическом

поле (электрофорез)

Разрешение ndash до 10 000 белков в одном геле

Иммуногистохимия

Используются специфичные меченые антитела

in situ

Флуоресцентная микроскопия

bull Белок метится аминоксилотнойпоследовательностью к которой подобраны антитела

bull Белок метится флюоресцентым белком GFP

in vivo

Масс-спектрометрия

Определение массы и заряда молекул

MALDI-TOF

Анализ белков при помощи масс-спектрометрии

ChiP-seq(chromatin immunoprecipitation sequencing)

Анализ взаимодействия белков с ДНК

Паттерны метилирования

Метилирование тканеспецифично локусспецифично особьспецифично

Methylated DNA immuno-precipitation (MeDIP-Seq)

Bisulfite sequencing

Спасибо за внимание

Page 14: Biotechnology 2012-08

Southern Blot (DNA)

Northern blot (RNA)

bull Наличие мРНКbull Размер мРНК

TISH

Локализации мРНК в тканях клетках

Количественная ПЦР

1 RT-PCR (reverse transcriptase PCR)

2 qPCR (real-time PCR)

Количественная ПЦР

bull Неспецифичная детекция- интеркалирующие красители

bullСпецифичная детекция- TaqMan- molecular beacon- и тд

TaqMan

Molecular Beacon

Microarray

Heatmap ndash визуализация microarray анализа

Heatmap ndash визуализация microarray анализа

Сравнительный экспрессиионный анализ

Сравнение экспрессии

Affymetrix GeneChip

Next-generation sequencingRNA-seq experiment

Анализ белков

Westernblot(иммуноблоттинг)

Используются специфичные антитела

А В ndash антитела с разной специфичностью

С ndash контрольные образцы здоровых людей1-8 ndash образцы больных мышечной дистрофией

in vitro

Двумерный электрофорез белков

1 Разделение по pH2 Разделение в электрическом

поле (электрофорез)

Разрешение ndash до 10 000 белков в одном геле

Иммуногистохимия

Используются специфичные меченые антитела

in situ

Флуоресцентная микроскопия

bull Белок метится аминоксилотнойпоследовательностью к которой подобраны антитела

bull Белок метится флюоресцентым белком GFP

in vivo

Масс-спектрометрия

Определение массы и заряда молекул

MALDI-TOF

Анализ белков при помощи масс-спектрометрии

ChiP-seq(chromatin immunoprecipitation sequencing)

Анализ взаимодействия белков с ДНК

Паттерны метилирования

Метилирование тканеспецифично локусспецифично особьспецифично

Methylated DNA immuno-precipitation (MeDIP-Seq)

Bisulfite sequencing

Спасибо за внимание

Page 15: Biotechnology 2012-08

Northern blot (RNA)

bull Наличие мРНКbull Размер мРНК

TISH

Локализации мРНК в тканях клетках

Количественная ПЦР

1 RT-PCR (reverse transcriptase PCR)

2 qPCR (real-time PCR)

Количественная ПЦР

bull Неспецифичная детекция- интеркалирующие красители

bullСпецифичная детекция- TaqMan- molecular beacon- и тд

TaqMan

Molecular Beacon

Microarray

Heatmap ndash визуализация microarray анализа

Heatmap ndash визуализация microarray анализа

Сравнительный экспрессиионный анализ

Сравнение экспрессии

Affymetrix GeneChip

Next-generation sequencingRNA-seq experiment

Анализ белков

Westernblot(иммуноблоттинг)

Используются специфичные антитела

А В ndash антитела с разной специфичностью

С ndash контрольные образцы здоровых людей1-8 ndash образцы больных мышечной дистрофией

in vitro

Двумерный электрофорез белков

1 Разделение по pH2 Разделение в электрическом

поле (электрофорез)

Разрешение ndash до 10 000 белков в одном геле

Иммуногистохимия

Используются специфичные меченые антитела

in situ

Флуоресцентная микроскопия

bull Белок метится аминоксилотнойпоследовательностью к которой подобраны антитела

bull Белок метится флюоресцентым белком GFP

in vivo

Масс-спектрометрия

Определение массы и заряда молекул

MALDI-TOF

Анализ белков при помощи масс-спектрометрии

ChiP-seq(chromatin immunoprecipitation sequencing)

Анализ взаимодействия белков с ДНК

Паттерны метилирования

Метилирование тканеспецифично локусспецифично особьспецифично

Methylated DNA immuno-precipitation (MeDIP-Seq)

Bisulfite sequencing

Спасибо за внимание

Page 16: Biotechnology 2012-08

TISH

Локализации мРНК в тканях клетках

Количественная ПЦР

1 RT-PCR (reverse transcriptase PCR)

2 qPCR (real-time PCR)

Количественная ПЦР

bull Неспецифичная детекция- интеркалирующие красители

bullСпецифичная детекция- TaqMan- molecular beacon- и тд

TaqMan

Molecular Beacon

Microarray

Heatmap ndash визуализация microarray анализа

Heatmap ndash визуализация microarray анализа

Сравнительный экспрессиионный анализ

Сравнение экспрессии

Affymetrix GeneChip

Next-generation sequencingRNA-seq experiment

Анализ белков

Westernblot(иммуноблоттинг)

Используются специфичные антитела

А В ndash антитела с разной специфичностью

С ndash контрольные образцы здоровых людей1-8 ndash образцы больных мышечной дистрофией

in vitro

Двумерный электрофорез белков

1 Разделение по pH2 Разделение в электрическом

поле (электрофорез)

Разрешение ndash до 10 000 белков в одном геле

Иммуногистохимия

Используются специфичные меченые антитела

in situ

Флуоресцентная микроскопия

bull Белок метится аминоксилотнойпоследовательностью к которой подобраны антитела

bull Белок метится флюоресцентым белком GFP

in vivo

Масс-спектрометрия

Определение массы и заряда молекул

MALDI-TOF

Анализ белков при помощи масс-спектрометрии

ChiP-seq(chromatin immunoprecipitation sequencing)

Анализ взаимодействия белков с ДНК

Паттерны метилирования

Метилирование тканеспецифично локусспецифично особьспецифично

Methylated DNA immuno-precipitation (MeDIP-Seq)

Bisulfite sequencing

Спасибо за внимание

Page 17: Biotechnology 2012-08

Количественная ПЦР

1 RT-PCR (reverse transcriptase PCR)

2 qPCR (real-time PCR)

Количественная ПЦР

bull Неспецифичная детекция- интеркалирующие красители

bullСпецифичная детекция- TaqMan- molecular beacon- и тд

TaqMan

Molecular Beacon

Microarray

Heatmap ndash визуализация microarray анализа

Heatmap ndash визуализация microarray анализа

Сравнительный экспрессиионный анализ

Сравнение экспрессии

Affymetrix GeneChip

Next-generation sequencingRNA-seq experiment

Анализ белков

Westernblot(иммуноблоттинг)

Используются специфичные антитела

А В ndash антитела с разной специфичностью

С ndash контрольные образцы здоровых людей1-8 ndash образцы больных мышечной дистрофией

in vitro

Двумерный электрофорез белков

1 Разделение по pH2 Разделение в электрическом

поле (электрофорез)

Разрешение ndash до 10 000 белков в одном геле

Иммуногистохимия

Используются специфичные меченые антитела

in situ

Флуоресцентная микроскопия

bull Белок метится аминоксилотнойпоследовательностью к которой подобраны антитела

bull Белок метится флюоресцентым белком GFP

in vivo

Масс-спектрометрия

Определение массы и заряда молекул

MALDI-TOF

Анализ белков при помощи масс-спектрометрии

ChiP-seq(chromatin immunoprecipitation sequencing)

Анализ взаимодействия белков с ДНК

Паттерны метилирования

Метилирование тканеспецифично локусспецифично особьспецифично

Methylated DNA immuno-precipitation (MeDIP-Seq)

Bisulfite sequencing

Спасибо за внимание

Page 18: Biotechnology 2012-08

Количественная ПЦР

bull Неспецифичная детекция- интеркалирующие красители

bullСпецифичная детекция- TaqMan- molecular beacon- и тд

TaqMan

Molecular Beacon

Microarray

Heatmap ndash визуализация microarray анализа

Heatmap ndash визуализация microarray анализа

Сравнительный экспрессиионный анализ

Сравнение экспрессии

Affymetrix GeneChip

Next-generation sequencingRNA-seq experiment

Анализ белков

Westernblot(иммуноблоттинг)

Используются специфичные антитела

А В ndash антитела с разной специфичностью

С ndash контрольные образцы здоровых людей1-8 ndash образцы больных мышечной дистрофией

in vitro

Двумерный электрофорез белков

1 Разделение по pH2 Разделение в электрическом

поле (электрофорез)

Разрешение ndash до 10 000 белков в одном геле

Иммуногистохимия

Используются специфичные меченые антитела

in situ

Флуоресцентная микроскопия

bull Белок метится аминоксилотнойпоследовательностью к которой подобраны антитела

bull Белок метится флюоресцентым белком GFP

in vivo

Масс-спектрометрия

Определение массы и заряда молекул

MALDI-TOF

Анализ белков при помощи масс-спектрометрии

ChiP-seq(chromatin immunoprecipitation sequencing)

Анализ взаимодействия белков с ДНК

Паттерны метилирования

Метилирование тканеспецифично локусспецифично особьспецифично

Methylated DNA immuno-precipitation (MeDIP-Seq)

Bisulfite sequencing

Спасибо за внимание

Page 19: Biotechnology 2012-08

Microarray

Heatmap ndash визуализация microarray анализа

Heatmap ndash визуализация microarray анализа

Сравнительный экспрессиионный анализ

Сравнение экспрессии

Affymetrix GeneChip

Next-generation sequencingRNA-seq experiment

Анализ белков

Westernblot(иммуноблоттинг)

Используются специфичные антитела

А В ndash антитела с разной специфичностью

С ndash контрольные образцы здоровых людей1-8 ndash образцы больных мышечной дистрофией

in vitro

Двумерный электрофорез белков

1 Разделение по pH2 Разделение в электрическом

поле (электрофорез)

Разрешение ndash до 10 000 белков в одном геле

Иммуногистохимия

Используются специфичные меченые антитела

in situ

Флуоресцентная микроскопия

bull Белок метится аминоксилотнойпоследовательностью к которой подобраны антитела

bull Белок метится флюоресцентым белком GFP

in vivo

Масс-спектрометрия

Определение массы и заряда молекул

MALDI-TOF

Анализ белков при помощи масс-спектрометрии

ChiP-seq(chromatin immunoprecipitation sequencing)

Анализ взаимодействия белков с ДНК

Паттерны метилирования

Метилирование тканеспецифично локусспецифично особьспецифично

Methylated DNA immuno-precipitation (MeDIP-Seq)

Bisulfite sequencing

Спасибо за внимание

Page 20: Biotechnology 2012-08

Heatmap ndash визуализация microarray анализа

Heatmap ndash визуализация microarray анализа

Сравнительный экспрессиионный анализ

Сравнение экспрессии

Affymetrix GeneChip

Next-generation sequencingRNA-seq experiment

Анализ белков

Westernblot(иммуноблоттинг)

Используются специфичные антитела

А В ndash антитела с разной специфичностью

С ndash контрольные образцы здоровых людей1-8 ndash образцы больных мышечной дистрофией

in vitro

Двумерный электрофорез белков

1 Разделение по pH2 Разделение в электрическом

поле (электрофорез)

Разрешение ndash до 10 000 белков в одном геле

Иммуногистохимия

Используются специфичные меченые антитела

in situ

Флуоресцентная микроскопия

bull Белок метится аминоксилотнойпоследовательностью к которой подобраны антитела

bull Белок метится флюоресцентым белком GFP

in vivo

Масс-спектрометрия

Определение массы и заряда молекул

MALDI-TOF

Анализ белков при помощи масс-спектрометрии

ChiP-seq(chromatin immunoprecipitation sequencing)

Анализ взаимодействия белков с ДНК

Паттерны метилирования

Метилирование тканеспецифично локусспецифично особьспецифично

Methylated DNA immuno-precipitation (MeDIP-Seq)

Bisulfite sequencing

Спасибо за внимание

Page 21: Biotechnology 2012-08

Heatmap ndash визуализация microarray анализа

Сравнительный экспрессиионный анализ

Сравнение экспрессии

Affymetrix GeneChip

Next-generation sequencingRNA-seq experiment

Анализ белков

Westernblot(иммуноблоттинг)

Используются специфичные антитела

А В ndash антитела с разной специфичностью

С ndash контрольные образцы здоровых людей1-8 ndash образцы больных мышечной дистрофией

in vitro

Двумерный электрофорез белков

1 Разделение по pH2 Разделение в электрическом

поле (электрофорез)

Разрешение ndash до 10 000 белков в одном геле

Иммуногистохимия

Используются специфичные меченые антитела

in situ

Флуоресцентная микроскопия

bull Белок метится аминоксилотнойпоследовательностью к которой подобраны антитела

bull Белок метится флюоресцентым белком GFP

in vivo

Масс-спектрометрия

Определение массы и заряда молекул

MALDI-TOF

Анализ белков при помощи масс-спектрометрии

ChiP-seq(chromatin immunoprecipitation sequencing)

Анализ взаимодействия белков с ДНК

Паттерны метилирования

Метилирование тканеспецифично локусспецифично особьспецифично

Methylated DNA immuno-precipitation (MeDIP-Seq)

Bisulfite sequencing

Спасибо за внимание

Page 22: Biotechnology 2012-08

Сравнительный экспрессиионный анализ

Сравнение экспрессии

Affymetrix GeneChip

Next-generation sequencingRNA-seq experiment

Анализ белков

Westernblot(иммуноблоттинг)

Используются специфичные антитела

А В ndash антитела с разной специфичностью

С ndash контрольные образцы здоровых людей1-8 ndash образцы больных мышечной дистрофией

in vitro

Двумерный электрофорез белков

1 Разделение по pH2 Разделение в электрическом

поле (электрофорез)

Разрешение ndash до 10 000 белков в одном геле

Иммуногистохимия

Используются специфичные меченые антитела

in situ

Флуоресцентная микроскопия

bull Белок метится аминоксилотнойпоследовательностью к которой подобраны антитела

bull Белок метится флюоресцентым белком GFP

in vivo

Масс-спектрометрия

Определение массы и заряда молекул

MALDI-TOF

Анализ белков при помощи масс-спектрометрии

ChiP-seq(chromatin immunoprecipitation sequencing)

Анализ взаимодействия белков с ДНК

Паттерны метилирования

Метилирование тканеспецифично локусспецифично особьспецифично

Methylated DNA immuno-precipitation (MeDIP-Seq)

Bisulfite sequencing

Спасибо за внимание

Page 23: Biotechnology 2012-08

Сравнение экспрессии

Affymetrix GeneChip

Next-generation sequencingRNA-seq experiment

Анализ белков

Westernblot(иммуноблоттинг)

Используются специфичные антитела

А В ndash антитела с разной специфичностью

С ndash контрольные образцы здоровых людей1-8 ndash образцы больных мышечной дистрофией

in vitro

Двумерный электрофорез белков

1 Разделение по pH2 Разделение в электрическом

поле (электрофорез)

Разрешение ndash до 10 000 белков в одном геле

Иммуногистохимия

Используются специфичные меченые антитела

in situ

Флуоресцентная микроскопия

bull Белок метится аминоксилотнойпоследовательностью к которой подобраны антитела

bull Белок метится флюоресцентым белком GFP

in vivo

Масс-спектрометрия

Определение массы и заряда молекул

MALDI-TOF

Анализ белков при помощи масс-спектрометрии

ChiP-seq(chromatin immunoprecipitation sequencing)

Анализ взаимодействия белков с ДНК

Паттерны метилирования

Метилирование тканеспецифично локусспецифично особьспецифично

Methylated DNA immuno-precipitation (MeDIP-Seq)

Bisulfite sequencing

Спасибо за внимание

Page 24: Biotechnology 2012-08

Affymetrix GeneChip

Next-generation sequencingRNA-seq experiment

Анализ белков

Westernblot(иммуноблоттинг)

Используются специфичные антитела

А В ndash антитела с разной специфичностью

С ndash контрольные образцы здоровых людей1-8 ndash образцы больных мышечной дистрофией

in vitro

Двумерный электрофорез белков

1 Разделение по pH2 Разделение в электрическом

поле (электрофорез)

Разрешение ndash до 10 000 белков в одном геле

Иммуногистохимия

Используются специфичные меченые антитела

in situ

Флуоресцентная микроскопия

bull Белок метится аминоксилотнойпоследовательностью к которой подобраны антитела

bull Белок метится флюоресцентым белком GFP

in vivo

Масс-спектрометрия

Определение массы и заряда молекул

MALDI-TOF

Анализ белков при помощи масс-спектрометрии

ChiP-seq(chromatin immunoprecipitation sequencing)

Анализ взаимодействия белков с ДНК

Паттерны метилирования

Метилирование тканеспецифично локусспецифично особьспецифично

Methylated DNA immuno-precipitation (MeDIP-Seq)

Bisulfite sequencing

Спасибо за внимание

Page 25: Biotechnology 2012-08

Next-generation sequencingRNA-seq experiment

Анализ белков

Westernblot(иммуноблоттинг)

Используются специфичные антитела

А В ndash антитела с разной специфичностью

С ndash контрольные образцы здоровых людей1-8 ndash образцы больных мышечной дистрофией

in vitro

Двумерный электрофорез белков

1 Разделение по pH2 Разделение в электрическом

поле (электрофорез)

Разрешение ndash до 10 000 белков в одном геле

Иммуногистохимия

Используются специфичные меченые антитела

in situ

Флуоресцентная микроскопия

bull Белок метится аминоксилотнойпоследовательностью к которой подобраны антитела

bull Белок метится флюоресцентым белком GFP

in vivo

Масс-спектрометрия

Определение массы и заряда молекул

MALDI-TOF

Анализ белков при помощи масс-спектрометрии

ChiP-seq(chromatin immunoprecipitation sequencing)

Анализ взаимодействия белков с ДНК

Паттерны метилирования

Метилирование тканеспецифично локусспецифично особьспецифично

Methylated DNA immuno-precipitation (MeDIP-Seq)

Bisulfite sequencing

Спасибо за внимание

Page 26: Biotechnology 2012-08

Анализ белков

Westernblot(иммуноблоттинг)

Используются специфичные антитела

А В ndash антитела с разной специфичностью

С ndash контрольные образцы здоровых людей1-8 ndash образцы больных мышечной дистрофией

in vitro

Двумерный электрофорез белков

1 Разделение по pH2 Разделение в электрическом

поле (электрофорез)

Разрешение ndash до 10 000 белков в одном геле

Иммуногистохимия

Используются специфичные меченые антитела

in situ

Флуоресцентная микроскопия

bull Белок метится аминоксилотнойпоследовательностью к которой подобраны антитела

bull Белок метится флюоресцентым белком GFP

in vivo

Масс-спектрометрия

Определение массы и заряда молекул

MALDI-TOF

Анализ белков при помощи масс-спектрометрии

ChiP-seq(chromatin immunoprecipitation sequencing)

Анализ взаимодействия белков с ДНК

Паттерны метилирования

Метилирование тканеспецифично локусспецифично особьспецифично

Methylated DNA immuno-precipitation (MeDIP-Seq)

Bisulfite sequencing

Спасибо за внимание

Page 27: Biotechnology 2012-08

Westernblot(иммуноблоттинг)

Используются специфичные антитела

А В ndash антитела с разной специфичностью

С ndash контрольные образцы здоровых людей1-8 ndash образцы больных мышечной дистрофией

in vitro

Двумерный электрофорез белков

1 Разделение по pH2 Разделение в электрическом

поле (электрофорез)

Разрешение ndash до 10 000 белков в одном геле

Иммуногистохимия

Используются специфичные меченые антитела

in situ

Флуоресцентная микроскопия

bull Белок метится аминоксилотнойпоследовательностью к которой подобраны антитела

bull Белок метится флюоресцентым белком GFP

in vivo

Масс-спектрометрия

Определение массы и заряда молекул

MALDI-TOF

Анализ белков при помощи масс-спектрометрии

ChiP-seq(chromatin immunoprecipitation sequencing)

Анализ взаимодействия белков с ДНК

Паттерны метилирования

Метилирование тканеспецифично локусспецифично особьспецифично

Methylated DNA immuno-precipitation (MeDIP-Seq)

Bisulfite sequencing

Спасибо за внимание

Page 28: Biotechnology 2012-08

Двумерный электрофорез белков

1 Разделение по pH2 Разделение в электрическом

поле (электрофорез)

Разрешение ndash до 10 000 белков в одном геле

Иммуногистохимия

Используются специфичные меченые антитела

in situ

Флуоресцентная микроскопия

bull Белок метится аминоксилотнойпоследовательностью к которой подобраны антитела

bull Белок метится флюоресцентым белком GFP

in vivo

Масс-спектрометрия

Определение массы и заряда молекул

MALDI-TOF

Анализ белков при помощи масс-спектрометрии

ChiP-seq(chromatin immunoprecipitation sequencing)

Анализ взаимодействия белков с ДНК

Паттерны метилирования

Метилирование тканеспецифично локусспецифично особьспецифично

Methylated DNA immuno-precipitation (MeDIP-Seq)

Bisulfite sequencing

Спасибо за внимание

Page 29: Biotechnology 2012-08

Иммуногистохимия

Используются специфичные меченые антитела

in situ

Флуоресцентная микроскопия

bull Белок метится аминоксилотнойпоследовательностью к которой подобраны антитела

bull Белок метится флюоресцентым белком GFP

in vivo

Масс-спектрометрия

Определение массы и заряда молекул

MALDI-TOF

Анализ белков при помощи масс-спектрометрии

ChiP-seq(chromatin immunoprecipitation sequencing)

Анализ взаимодействия белков с ДНК

Паттерны метилирования

Метилирование тканеспецифично локусспецифично особьспецифично

Methylated DNA immuno-precipitation (MeDIP-Seq)

Bisulfite sequencing

Спасибо за внимание

Page 30: Biotechnology 2012-08

Флуоресцентная микроскопия

bull Белок метится аминоксилотнойпоследовательностью к которой подобраны антитела

bull Белок метится флюоресцентым белком GFP

in vivo

Масс-спектрометрия

Определение массы и заряда молекул

MALDI-TOF

Анализ белков при помощи масс-спектрометрии

ChiP-seq(chromatin immunoprecipitation sequencing)

Анализ взаимодействия белков с ДНК

Паттерны метилирования

Метилирование тканеспецифично локусспецифично особьспецифично

Methylated DNA immuno-precipitation (MeDIP-Seq)

Bisulfite sequencing

Спасибо за внимание

Page 31: Biotechnology 2012-08

Масс-спектрометрия

Определение массы и заряда молекул

MALDI-TOF

Анализ белков при помощи масс-спектрометрии

ChiP-seq(chromatin immunoprecipitation sequencing)

Анализ взаимодействия белков с ДНК

Паттерны метилирования

Метилирование тканеспецифично локусспецифично особьспецифично

Methylated DNA immuno-precipitation (MeDIP-Seq)

Bisulfite sequencing

Спасибо за внимание

Page 32: Biotechnology 2012-08

Анализ белков при помощи масс-спектрометрии

ChiP-seq(chromatin immunoprecipitation sequencing)

Анализ взаимодействия белков с ДНК

Паттерны метилирования

Метилирование тканеспецифично локусспецифично особьспецифично

Methylated DNA immuno-precipitation (MeDIP-Seq)

Bisulfite sequencing

Спасибо за внимание

Page 33: Biotechnology 2012-08

ChiP-seq(chromatin immunoprecipitation sequencing)

Анализ взаимодействия белков с ДНК

Паттерны метилирования

Метилирование тканеспецифично локусспецифично особьспецифично

Methylated DNA immuno-precipitation (MeDIP-Seq)

Bisulfite sequencing

Спасибо за внимание

Page 34: Biotechnology 2012-08

Паттерны метилирования

Метилирование тканеспецифично локусспецифично особьспецифично

Methylated DNA immuno-precipitation (MeDIP-Seq)

Bisulfite sequencing

Спасибо за внимание

Page 35: Biotechnology 2012-08

Methylated DNA immuno-precipitation (MeDIP-Seq)

Bisulfite sequencing

Спасибо за внимание

Page 36: Biotechnology 2012-08

Bisulfite sequencing

Спасибо за внимание

Page 37: Biotechnology 2012-08

Спасибо за внимание