büyük ekoloji ve büyük demografi çağı · bu sürüm coğrafi konum, taksonomi ve büyüme...

1
Araş%rmacı COMPADRE & COMADRE ekibi Araş%rmacılar, Eğitmenler, Ögrenciler, Kurumlar, vs. COMPADRE çevrimiçi sürüm COMADRE çevrimiçi sürüm Hata önleme COMPADRE çalışma sürümü COMADRE çalışma sürümü Veri sayısallaş%rması Düzenli aramalar Yayınlama Kişisel ileJşim Popülasyon matriks modelinin oluşturulması Saha çalışması Büyük ekoloji ve büyük demografi çağı COMPADRE Bitki ve COMADRE Hayvan Matriks Veritabanlarının Tanıtılması Bu açık erişim veritabanları 2014 sonu (COMPADRE) ve 2015 başında (COMADRE) Max Planck Demografi Enstitüsü (Rostock, Almanya) tarafından çevrimiçi olarak sunulacaktır. COMPADRE ve COMADRE şu anda >900 bitki ve >1,300 hayvan türüne ait, bir çok popülasyon, dönem ve deneysel birim içeren, toplamda >12,000 popülasyon matriksten oluşmaktadır. Popülasyon matrikslerinin yanısıra, COMPADRE ve COMADRE araştırmacıların analizlerinde kullanabilecekleri (taksonomik özellikler, biyocoğrafi veriler, coğrafi konum, vb.) ek bilgileri de içermektedir. Demografik yöntemler kullanılarak bu matrikslerden biyolojik açıdan önemli bilgiler elde edilir (hassaslık, ortalama ömür uzunluğu, popülasyon büyüme hızı, vb.). 0 200 400 600 800 1000 1200 1400 Year of publication Cummulative number of plant studies 1945 1950 1955 1960 1965 1970 1975 1980 1985 1990 1995 2000 2005 2010 2015 COMPADRE v. 1.0 COMPADRE v. 2.0 COMPADRE v. 3.0 Leslie’s publication Fig. 1a COMPADRE’nin 1.0 sürümü M. Franco ve J. Silvertown tarafından kurulmuş ve yaklaşık 100 bitki türe ait ortalama matriksleri içermiştir. Sonraki senelerde veritabanı birçok araştırmacının (Y. Buckley, J. Che-Castaldo, E. Crone, D. Hodgson, T. Knight, S. Ramula, R. Salguero-Gómez) katkılarıyla büyütülmüş, özellikle R. Salguero-Gómez’in katkısıyla bitki türü sayısı 500’e çıkarılmıs ve popülasyonlara ait detay bilgiler eklenmiştir (örneğin, V2.0’daki deneysel birimler). COMPADRE 3.0 şu anda R. Salguero-Gómez ve O.R. Jones tarafından idare edilmektedir. Bu sürüm coğrafi konum, taksonomi ve büyüme formu gibi önemli ek bilgileri içermesinin yanısıra farklı araştırmacıların veritabanına paralel katkılarını tek bir zeminde birleştirmiştir. COMADRE’nin 1.0 sürümü R. Salguero-Gómez ve O.R. Jones tarafından kurulmuştur. Sürüm 2.0 birkaç farklı demografik veritabanını (D. Hodgson, L.A. Velez-Espino, M. van de Kerk) bir araya getirmiştir. Bu veritabanları 2012’den beri Evrimsel Demografi Laboratuarı ve Max Planck Demografi Enstitüsü’nde (Rostock, Almanya) Yaşlanmanın Evrimi üzerine çalışan bir araştırma grubu tarafından desteklenmektedir. İletişim: [email protected] Veritabanı danışmanları: Rob Salguero-Gómez ve Owen Jones. Merkez komite: Yvonne Buckley, Judy Che-Castaldo, Hal Caswell, Dalia Conde, Dave Hodgson, Rob Salguero-Gómez, Owen Jones, Alexander Scheuerlein, ve James Vaupel. Veri kayıt takımı: Hendrik de Buhr, Alexander Hartmann, Anne Henning, Claudia Farack, Fränce Gottschalk, Gesa Roemer, Tara Ruoff, Julia Wille, and Stefan Zeh, ve Ruth Archer. Bilim komitesi: Res Altwegg, Fernando Colchero, Ming Dong, Miguel Franco, David Hodgson, Hans de Kroon, Jean Dominique Lebreton, Jessica Metcalf, Maile Neel, Ingrid Parker, Bernt-Erik Sæther, Juan Silva, Jonathan Silvertown, Takenori Takada, Teresa Valverde, Luis Antonio Velez-Espino, ve Glenda Wardle. Tercüme: Arpat Ozgul Sahadan tüketiciye COMPADRE ve COMADRE dünyanın birçok yerinden ara ş tırmacnıın yayınlamı ş oldu ğ u popülasyon matriks modellerini arşivler. Bu matriksleri veritabanına giren kayıt takımımız verilerin alınması, hata kontrolü ve ek bilgi gerektiğinde araştırmacılarla iletişime geçme konularında eğitim almıştır. Periyodik olarak, (geçici ambargo süreleri olanlar dışında) yeni matriksler COMPADRE ve COMADRE websitelerinden erişime sunulmaktadır. Sayıları üssel olarak artan yayınlar (Figür 1a,b) bu veritabanlarının oluşturulmasını hem acil, hem de heyecanlı kılmaktadır. Ancak, bir hayvan veya bitki türünün demografisini çalı ş maya ba ş layacak ara ş tırmacılara tavsiyemiz araştırmalardaki belirgin coğrafi (Figür 3a,b*) ve taksonomik eğilimleri gözardı etmemeleridir. Araştırmacılar, öğrenciler, eğitmenler, çevre kurumları ve diğer kuruluşlar bu kayna ğ ı güncel ve yerinde demografik incelemelerde kullanabilir. * COMADRE veritabanındaki coğrafi bilgiler henüz kaydedilmediği için, ilgili figür yapım aşamasıdadır. n = 6730 1 5 10 50 100 500 1000 1500 Number of population matrix models per country 0 2500 Fig. 3a Fig. 4a 0 200 400 600 800 1000 1200 1400 Year of publication Cummulative number of animal studies 1945 1950 1955 1960 1965 1970 1975 1980 1985 1990 1995 2000 2005 2010 2015 COMADRE v. 1.0 COMADRE v. 2.0 Leslie’s publication Fig. 1b n = 2942 1 5 10 50 100 500 1000 1500 Number of population matrix models per country 0 2500 Fig. 3b Fig. 4b Son on yıl içerisinde, biyolojik soruların geniş kapsamlı küresel ölçeklerde incelenmesinde çığır açan genetik (GenBank), iklimsel (FetchClimate), anatomik, fizyolojik (TRY, BIEN) ve benzeri birçok veri tabanı erişime sunuldu. Demografik araştırmalar popülasyon dinamiklerini ve altında yatan etkenleri içeren soruları sorar: Neden bazı türler bölgesel olarak yok olurken, diğerleri istilacı türlere dönüşür? Geli şmekte olan ülkelerde besin üretimi nasıl sağlanır? Türler küresel değişime nasıl tepki verir? Bazı türler yaşlanma belirtileri gösterirken, neden diğerleri göstermez? Ancak, bu tür soruların incelenmesinde gerekli olan ve birçok türü içeren demografik veritabanlarının eksikliği bu incelemelerin boyutunu sınırlandırmıştır. Burada tanıtılan veritabanları bu problemin çözümüne yönelik kurulmuştur. Other Anthozoa Merostomata Gastropoda Bivalvia Cephalaspidomorphi Polychaeta Chondrichthyes Actinopterygii Branchiopoda Malacostraca Maxillopoda Insecta Arachnida Amphibia Reptilia Aves Mammalia 0 10 20 30 40 50 60 70 % taxonomic class in COMADRE Phaeophyceae Florideophyceae Rhodophyceae Bryopsida Polypodiopsida Pteridopsida Cycadopsida Pinopsida Liliopsida Magnoliopsida 0 10 20 30 40 50 60 70 % taxonomic class in COMPADRE www.compadre-db.org www.comadre-db.org

Upload: others

Post on 20-Sep-2019

4 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

Page 1: Büyük ekoloji ve büyük demografi çağı · Bu sürüm coğrafi konum, taksonomi ve büyüme formu gibi önemli ek bilgileri içermesinin yanısıra farklı araştırmacıların

0-

Araş%rm

acı)

COMPA

DRE

)&)COMAD

RE)ekibi)

Araş%rm

acılar,)

Eğitm

enler,)

Ögren

ciler,)

Kurumlar,)vs.)

COMPADRE)çevrimiçi)sürüm)COMADRE)çevrimiçi)sürüm)

Hata)önleme)

COMPADRE)çalışma)sürümü)COMADRE)çalışma)sürümü)

)

Veri)sayısallaş%rması)

Düzenli)aramalar)

Yayınlama) Kişisel)ileJşim)

Popülasyon)matriks)modelinin)oluşturulması))

Saha)çalışması)

Büyük ekoloji ve büyük demografi çağı

COMPADRE Bitki ve COMADRE Hayvan Matriks Veritabanlarının Tanıtılması Bu açık erişim veritabanları 2014 sonu (COMPADRE) ve 2015 başında (COMADRE) Max Planck Demografi Enstitüsü (Rostock, Almanya) tarafından çevrimiçi olarak sunulacaktır. COMPADRE ve COMADRE şu anda >900 bitki ve >1,300 hayvan türüne ait, bir çok popülasyon, dönem ve deneysel birim içeren, toplamda >12,000 popülasyon matriksten oluşmaktadır. Popülasyon matrikslerinin yanısıra, COMPADRE ve COMADRE araştırmacıların analizlerinde kullanabilecekleri (taksonomik özellikler, biyocoğrafi veriler, coğrafi konum, vb.) ek bilgileri de içermektedir. Demografik yöntemler kullanılarak bu matrikslerden biyolojik açıdan önemli bilgiler elde edilir (hassaslık, ortalama ömür uzunluğu, popülasyon büyüme hızı, vb.).

0

200

400

600

800

1000

1200

1400

Year of publication

Cum

mul

ative

num

ber o

f pla

nt s

tudi

es

1945 1950 1955 1960 1965 1970 1975 1980 1985 1990 1995 2000 2005 2010 2015

COMPADRE v. 1.0

COMPADRE v. 2.0

COMPADRE v. 3.0

Leslie’s publication

Fig. 1a

COMPADRE’nin 1.0 sürümü M. Franco ve J. Silvertown tarafından kurulmuş ve yaklaşık 100 bitki türe ait ortalama matriksleri içermiştir. Sonraki senelerde veritabanı birçok araştırmacının (Y. Buckley, J. Che-Castaldo, E. Crone, D. Hodgson, T. Knight, S. Ramula, R. Salguero-Gómez) katkılarıyla büyütülmüş, özellikle R. Salguero-Gómez’in katkısıyla bitki türü sayısı 500’e çıkarılmıs ve popülasyonlara ait detay bilgiler eklenmiştir (örneğin, V2.0’daki deneysel birimler). COMPADRE 3.0 şu anda R. Salguero-Gómez ve O.R. Jones tarafından idare edilmektedir. Bu sürüm coğrafi konum, taksonomi ve büyüme formu gibi önemli ek bilgileri içermesinin yanısıra farklı araştırmacıların veritabanına paralel katkılarını tek bir zeminde birleştirmiştir.

COMADRE’nin 1.0 sürümü R. Salguero-Gómez ve O.R. Jones tarafından kurulmuştur. Sürüm 2.0 birkaç farklı demografik veritabanını (D. Hodgson, L.A. Velez-Espino, M. van de Kerk) bir araya getirmiştir. Bu veritabanları 2012’den beri Evrimsel Demografi Laboratuarı ve Max Planck Demografi Enstitüsü’nde (Rostock, Almanya) Yaşlanmanın Evrimi üzerine çalışan bir araştırma grubu tarafından desteklenmektedir.

İletişim: [email protected] Veritabanı danışmanları: Rob Salguero-Gómez ve Owen Jones. Merkez komite: Yvonne Buckley, Judy Che-Castaldo, Hal Caswell, Dalia Conde, Dave Hodgson, Rob Salguero-Gómez, Owen Jones, Alexander Scheuerlein, ve James Vaupel. Veri kayıt  takımı: Hendrik de Buhr, Alexander Hartmann, Anne Henning, Claudia Farack, Fränce Gottschalk, Gesa Roemer, Tara Ruoff, Julia Wille, and Stefan Zeh, ve Ruth Archer. Bilim komitesi: Res Altwegg, Fernando Colchero, Ming Dong, Miguel Franco, David Hodgson, Hans de Kroon, Jean Dominique Lebreton, Jessica Metcalf, Maile Neel, Ingrid Parker, Bernt-Erik Sæther, Juan Silva, Jonathan Silvertown, Takenori Takada, Teresa Valverde, Luis Antonio Velez-Espino, ve Glenda Wardle. Tercüme: Arpat Ozgul

Sahadan tüketiciye!COMPADRE ve COMADRE dünyanın birçok yerinden araştırmacnıın yayınlamış olduğu popülasyon matriks modellerini arşivler. Bu matriksleri veritabanına giren kayıt takımımız verilerin alınması, hata kontrolü ve ek bilgi gerektiğinde araştırmacılarla iletişime geçme konularında eğitim almıştır. Periyodik olarak, (geçici ambargo süreleri olanlar dışında) yeni matriksler COMPADRE ve COMADRE websitelerinden erişime sunulmaktadır. Sayıları üssel olarak artan yayınlar (Figür 1a,b) bu veritabanlarının oluşturulmasını hem acil, hem de heyecanlı kılmaktadır. Ancak, bir hayvan veya bitki türünün demografisini çalışmaya baş layacak araştırmacılara tavsiyemiz araştırmalardaki belirgin coğrafi (Figür 3a,b*) ve taksonomik eğilimleri gözardı etmemeleridir. Araştırmacılar, öğrenciler, eğitmenler, çevre kurumları ve diğer kuruluşlar bu kaynağı güncel ve yerinde demografik incelemelerde kullanabilir. * COMADRE veritabanındaki coğrafi bilgiler henüz kaydedilmediği için, ilgili figür yapım aşamasıdadır.

Number of matrices in COMPADRE

n = 6730

1 5 10 50 100 500 1000 1500 Number of population matrix models per country

0 2500

Fig. 3a

Fig. 4a

0

200

400

600

800

1000

1200

1400

Year of publication

Cum

mul

ative

num

ber o

f ani

mal

stu

dies

1945 1950 1955 1960 1965 1970 1975 1980 1985 1990 1995 2000 2005 2010 2015

COMADRE v. 1.0

COMADRE v. 2.0

Leslie’s publication

Fig. 1b

Number of matrices in COMADRE

n = 2942

1 5 10 50 100 500 1000 1500 Number of population matrix models per country

0 2500

Fig. 3b

Fig. 4b

Son on yıl içerisinde, biyolojik soruların geniş kapsamlı küresel ölçeklerde incelenmesinde çığır açan genetik (GenBank), iklimsel (FetchClimate), anatomik, fizyolojik (TRY, BIEN) ve benzeri birçok veri tabanı erişime sunuldu. Demografik araştırmalar popülasyon dinamiklerini ve altında yatan etkenleri içeren soruları sorar: Neden bazı türler bölgesel olarak yok olurken, diğerleri istilacı türlere dönüşür? Gelişmekte olan ülkelerde besin üretimi nasıl sağlanır? Türler küresel değişime nasıl tepki verir? Bazı türler yaşlanma belirtileri gösterirken, neden diğerleri göstermez? Ancak, bu tür soruların incelenmesinde gerekli olan ve birçok türü içeren demografik veritabanlarının eksikliği bu incelemelerin boyutunu sınırlandırmıştır. Burada tanıtılan veritabanları bu problemin çözümüne yönelik kurulmuştur.

Other

Anthozoa

Merostomata

Gastropoda

Bivalvia

Cephalaspidomorphi

Polychaeta

Chondrichthyes

Actinopterygii

Branchiopoda

Malacostraca

Maxillopoda

Insecta

Arachnida

Amphibia

Reptilia

Aves

Mammalia

0 10 20 30 40 50 60 70

% taxonomic class in COMADRE

Phaeophyceae

Florideophyceae

Rhodophyceae

Bryopsida

Polypodiopsida

Pteridopsida

Cycadopsida

Pinopsida

Liliopsida

Magnoliopsida

0 10 20 30 40 50 60 70

% taxonomic class in COMPADRE

www.compadre-db.org www.comadre-db.org