büyük ekoloji ve büyük demografi çağı · bu sürüm coğrafi konum, taksonomi ve büyüme...
TRANSCRIPT
0-
Araş%rm
acı)
COMPA
DRE
)&)COMAD
RE)ekibi)
Araş%rm
acılar,)
Eğitm
enler,)
Ögren
ciler,)
Kurumlar,)vs.)
COMPADRE)çevrimiçi)sürüm)COMADRE)çevrimiçi)sürüm)
Hata)önleme)
COMPADRE)çalışma)sürümü)COMADRE)çalışma)sürümü)
)
Veri)sayısallaş%rması)
Düzenli)aramalar)
Yayınlama) Kişisel)ileJşim)
Popülasyon)matriks)modelinin)oluşturulması))
Saha)çalışması)
Büyük ekoloji ve büyük demografi çağı
COMPADRE Bitki ve COMADRE Hayvan Matriks Veritabanlarının Tanıtılması Bu açık erişim veritabanları 2014 sonu (COMPADRE) ve 2015 başında (COMADRE) Max Planck Demografi Enstitüsü (Rostock, Almanya) tarafından çevrimiçi olarak sunulacaktır. COMPADRE ve COMADRE şu anda >900 bitki ve >1,300 hayvan türüne ait, bir çok popülasyon, dönem ve deneysel birim içeren, toplamda >12,000 popülasyon matriksten oluşmaktadır. Popülasyon matrikslerinin yanısıra, COMPADRE ve COMADRE araştırmacıların analizlerinde kullanabilecekleri (taksonomik özellikler, biyocoğrafi veriler, coğrafi konum, vb.) ek bilgileri de içermektedir. Demografik yöntemler kullanılarak bu matrikslerden biyolojik açıdan önemli bilgiler elde edilir (hassaslık, ortalama ömür uzunluğu, popülasyon büyüme hızı, vb.).
0
200
400
600
800
1000
1200
1400
Year of publication
Cum
mul
ative
num
ber o
f pla
nt s
tudi
es
1945 1950 1955 1960 1965 1970 1975 1980 1985 1990 1995 2000 2005 2010 2015
COMPADRE v. 1.0
COMPADRE v. 2.0
COMPADRE v. 3.0
Leslie’s publication
Fig. 1a
COMPADRE’nin 1.0 sürümü M. Franco ve J. Silvertown tarafından kurulmuş ve yaklaşık 100 bitki türe ait ortalama matriksleri içermiştir. Sonraki senelerde veritabanı birçok araştırmacının (Y. Buckley, J. Che-Castaldo, E. Crone, D. Hodgson, T. Knight, S. Ramula, R. Salguero-Gómez) katkılarıyla büyütülmüş, özellikle R. Salguero-Gómez’in katkısıyla bitki türü sayısı 500’e çıkarılmıs ve popülasyonlara ait detay bilgiler eklenmiştir (örneğin, V2.0’daki deneysel birimler). COMPADRE 3.0 şu anda R. Salguero-Gómez ve O.R. Jones tarafından idare edilmektedir. Bu sürüm coğrafi konum, taksonomi ve büyüme formu gibi önemli ek bilgileri içermesinin yanısıra farklı araştırmacıların veritabanına paralel katkılarını tek bir zeminde birleştirmiştir.
COMADRE’nin 1.0 sürümü R. Salguero-Gómez ve O.R. Jones tarafından kurulmuştur. Sürüm 2.0 birkaç farklı demografik veritabanını (D. Hodgson, L.A. Velez-Espino, M. van de Kerk) bir araya getirmiştir. Bu veritabanları 2012’den beri Evrimsel Demografi Laboratuarı ve Max Planck Demografi Enstitüsü’nde (Rostock, Almanya) Yaşlanmanın Evrimi üzerine çalışan bir araştırma grubu tarafından desteklenmektedir.
İletişim: [email protected] Veritabanı danışmanları: Rob Salguero-Gómez ve Owen Jones. Merkez komite: Yvonne Buckley, Judy Che-Castaldo, Hal Caswell, Dalia Conde, Dave Hodgson, Rob Salguero-Gómez, Owen Jones, Alexander Scheuerlein, ve James Vaupel. Veri kayıt takımı: Hendrik de Buhr, Alexander Hartmann, Anne Henning, Claudia Farack, Fränce Gottschalk, Gesa Roemer, Tara Ruoff, Julia Wille, and Stefan Zeh, ve Ruth Archer. Bilim komitesi: Res Altwegg, Fernando Colchero, Ming Dong, Miguel Franco, David Hodgson, Hans de Kroon, Jean Dominique Lebreton, Jessica Metcalf, Maile Neel, Ingrid Parker, Bernt-Erik Sæther, Juan Silva, Jonathan Silvertown, Takenori Takada, Teresa Valverde, Luis Antonio Velez-Espino, ve Glenda Wardle. Tercüme: Arpat Ozgul
Sahadan tüketiciye!COMPADRE ve COMADRE dünyanın birçok yerinden araştırmacnıın yayınlamış olduğu popülasyon matriks modellerini arşivler. Bu matriksleri veritabanına giren kayıt takımımız verilerin alınması, hata kontrolü ve ek bilgi gerektiğinde araştırmacılarla iletişime geçme konularında eğitim almıştır. Periyodik olarak, (geçici ambargo süreleri olanlar dışında) yeni matriksler COMPADRE ve COMADRE websitelerinden erişime sunulmaktadır. Sayıları üssel olarak artan yayınlar (Figür 1a,b) bu veritabanlarının oluşturulmasını hem acil, hem de heyecanlı kılmaktadır. Ancak, bir hayvan veya bitki türünün demografisini çalışmaya baş layacak araştırmacılara tavsiyemiz araştırmalardaki belirgin coğrafi (Figür 3a,b*) ve taksonomik eğilimleri gözardı etmemeleridir. Araştırmacılar, öğrenciler, eğitmenler, çevre kurumları ve diğer kuruluşlar bu kaynağı güncel ve yerinde demografik incelemelerde kullanabilir. * COMADRE veritabanındaki coğrafi bilgiler henüz kaydedilmediği için, ilgili figür yapım aşamasıdadır.
Number of matrices in COMPADRE
n = 6730
1 5 10 50 100 500 1000 1500 Number of population matrix models per country
0 2500
Fig. 3a
Fig. 4a
0
200
400
600
800
1000
1200
1400
Year of publication
Cum
mul
ative
num
ber o
f ani
mal
stu
dies
1945 1950 1955 1960 1965 1970 1975 1980 1985 1990 1995 2000 2005 2010 2015
COMADRE v. 1.0
COMADRE v. 2.0
Leslie’s publication
Fig. 1b
Number of matrices in COMADRE
n = 2942
1 5 10 50 100 500 1000 1500 Number of population matrix models per country
0 2500
Fig. 3b
Fig. 4b
Son on yıl içerisinde, biyolojik soruların geniş kapsamlı küresel ölçeklerde incelenmesinde çığır açan genetik (GenBank), iklimsel (FetchClimate), anatomik, fizyolojik (TRY, BIEN) ve benzeri birçok veri tabanı erişime sunuldu. Demografik araştırmalar popülasyon dinamiklerini ve altında yatan etkenleri içeren soruları sorar: Neden bazı türler bölgesel olarak yok olurken, diğerleri istilacı türlere dönüşür? Gelişmekte olan ülkelerde besin üretimi nasıl sağlanır? Türler küresel değişime nasıl tepki verir? Bazı türler yaşlanma belirtileri gösterirken, neden diğerleri göstermez? Ancak, bu tür soruların incelenmesinde gerekli olan ve birçok türü içeren demografik veritabanlarının eksikliği bu incelemelerin boyutunu sınırlandırmıştır. Burada tanıtılan veritabanları bu problemin çözümüne yönelik kurulmuştur.
Other
Anthozoa
Merostomata
Gastropoda
Bivalvia
Cephalaspidomorphi
Polychaeta
Chondrichthyes
Actinopterygii
Branchiopoda
Malacostraca
Maxillopoda
Insecta
Arachnida
Amphibia
Reptilia
Aves
Mammalia
0 10 20 30 40 50 60 70
% taxonomic class in COMADRE
Phaeophyceae
Florideophyceae
Rhodophyceae
Bryopsida
Polypodiopsida
Pteridopsida
Cycadopsida
Pinopsida
Liliopsida
Magnoliopsida
0 10 20 30 40 50 60 70
% taxonomic class in COMPADRE
www.compadre-db.org www.comadre-db.org