cieto riekstu vācelīte

5
x y Cieto riekstu vācelīte Jānis Liepiņš 18/12/2010

Upload: harken

Post on 04-Jan-2016

63 views

Category:

Documents


4 download

DESCRIPTION

Cieto riekstu vācelīte. Jānis Liepiņš. 18 / 12 /20 10. 1. Pēterīts nolēma uzlabot molekulārās bioloģijas mācīšanu savā skolā. Viņš projektu nedēļā apņēmās izgatavot cilvēka genoma modeli. Lai sasniegtu šo mērķi viņš izvirzīja sekojošus uzdevumus: Uzzināt kāds ir cilvēka genoma garumu metros - PowerPoint PPT Presentation

TRANSCRIPT

Page 1: Cieto riekstu vācelīte

x

y

Cieto riekstu vācelīte

Jānis Liepiņš

18/12/2010

Page 2: Cieto riekstu vācelīte

x

y

1Pēterīts nolēma uzlabot molekulārās bioloģijas mācīšanu

savā skolā. Viņš projektu nedēļā apņēmās izgatavot cilvēka genoma modeli.

Lai sasniegtu šo mērķi viņš izvirzīja sekojošus uzdevumus:a) Uzzināt kāds ir cilvēka genoma garumu metrosb) Aprēķināt cik daudz makšķerauklas ar diametru 0.1 mm

būs nepieciešams (metri un izmaksas)c) Izgatavot cilvēka leikocīta kodola modeliPalīdziet Pēterītim!

Pēterīts nolēma uzlabot molekulārās bioloģijas mācīšanu savā skolā. Viņš projektu nedēļā apņēmās izgatavot cilvēka genoma modeli.

Lai sasniegtu šo mērķi viņš izvirzīja sekojošus uzdevumus:a) Uzzināt kāds ir cilvēka genoma garumu metrosb) Aprēķināt cik daudz makšķerauklas ar diametru 0.1 mm būs

nepieciešams (metri un izmaksas)c) Izgatavot cilvēka leikocīta kodola modeliPalīdziet Pēterītim!

a) Kāds ir cilvēka leikocīta genoma garums pilnos metros, ja zināms, ka 1 bāzes pāra garums ir 3.4 Ǻ (10-10 m), bet haploīdā genomā ir 3.4 miljardu bāzu pāru.

c) Cik lielam (aptuveni) jābūt Pēterīša izveidotajam leikocīta kodola modelim, ja zināms, ka leikocīta kodola diametrs ir 7 m

b1) Kāds būs modeļa “palielinājums” (mērogs)b2) Kāds makšķerauklas garums (metros) ir jāiepērk Pēterītim, lai izgatavotu cilvēka leikocīta kodola DNS modeli, ja zināms, ka DNS diametrs ir 2 nm. b3) Cik naudas būs nepieciešams, ja lētākā makšķeraukla 300 m maksā 5 LVL. (noapaļojiet līdz pilniem latiem)

(6 punkti)

Page 3: Cieto riekstu vācelīte

x

y

2Pēterītim radās jauna ideja – lai skolas biedriem nodemonstrētu informācijas apjomu, ko satur cilvēka genoms – izprintēt to uz A4 lapām (no abām pusēm, apm. 5000 simboli vienas lapas puses pusē).

a) Cik paku papīra būs nepieciešams Pēterītim lai izprintētu cilvēka leikocīta genomu?b) Kādas būs šī projekta izmaksas, ja ņem vērā, ka papīru pārdod 500 lpp/paka un pakas cena 2 LVL.

Pieņemiet, ka: • printēšanas izmaksas ir 0 snt/lpp (Pēterītis printēs savu projektu pie mammas darbā-kādas mazpilsētas tipogrāfijā),• cilvēka haploīdā genomā ir 3.4 miljardu bāzu pāru• Pēterīts printēs tikai DNS informatīvo ķēdi.

(2 punkti)

Page 4: Cieto riekstu vācelīte

x

y

Pēc iepriekš veiktajiem aprēķiniem Pēterīts pārskaitīja vasarā nopelnīto naudiņu – sanāca 180 LVL; viņš nolēma, ka visus finansiālos resursus veltīs šim projektam (maksimāli iztērējot visus līdzekļus kāda organisma somatiskās šūnas kodola genoma modelim). No internetā pieejamās informācijas viņš uzzināja par dažādu organismu genomu projektiem – zarnu nūjiņas, maizes rauga, kukurūzas, augļu mušiņas u.c.

3Pēc iepriekš veiktajiem aprēķiniem Pēterīts pārskaitīja vasarā nopelnīto naudiņu –

sanāca 180 LVL; viņš nolēma, ka visus finansiālos resursus veltīs šim projektam (maksimāli iztērējot visus līdzekļus kāda organisma somatiskās šūnas kodola genoma modelim un tā izdrukām uz papīra).

No internetā pieejamās informācijas viņš uzzināja par dažādu organismu genomu projektiem – zarnu nūjiņas, maizes rauga, kukurūzas, augļu mušiņas u.c.

Kura genoma modeli Pēterītis realizēs ar pieejamiem finanšu resursiem, ja zināms, ka organismu haploīdo genomu garumi ir sekojoši:Baktērijas Escherichia coli (zarnu nūjiņa) 4,6 miljonu bpMaizes rauga Saccharomyces cerevisiae 12 miljonu bpKukurūzas Zea mays 2 miljardi bpCilvēka Homo sapiens 3,4 miljardi bpHIV vīruss 9749 bpAugļu mušiņas Drosophila melanogaster 130 miljonu bpPlaušzivs Protopterus aethiopicus 130 miljardu bpBites Apis melifera 236 miljonu bp

Savu atbildi pamatojiet ar aprēķiniem no vismaz 3 atšķirīgiem genomiem.

(6 punkti)

Page 5: Cieto riekstu vācelīte

x

y

Paldies par uzmanību!Atbildes drīz sekos!