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Contexte scientifique
CO2
Capture du Carbone Organique Particulaire dans les abysses
Réseau trophique
planctonique
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De la vision à la modélisation, genèse d’une innovation
Observation in situ
Capture
MAIS,- Temps bateau important- Faible couverture spatiale- Analyse longue -zooplancton et flux de matière mal représentés dans les modèles
Automatiser l’acquisition et le
traitement des données en mer et en laboratoire
grâce à l’imagerie.
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VISION in-situ : Profileur de VisionEtude haute fréquence de la biodiversité et des flux de matière.
FUTURE INTEGRATION EOL, CETO
Plateformes multicapteurs
PVM6, <0.5 kg
Réseaux ARGO et BioARGO
VISION laboratoire : ZOOSCANAnalyse d’‘échantillons de plancton
35 instituts équipés dans le monde
de 1997 à 2010
FORMATION-20 Masters-7 thèses-3 post docs
PUBLICATION-30 de rang A
VALORISATION-Un BREVET-Un contrat de valorisation-Deux LICENCES-Un concours scientifique-Deux Stages internationaux de formation
Des développements instrumentaux cohérents, importance de la vision
PVM4 1997, 300 kg PVM5 2008, 30 kg
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Application: Suivi en temps réel du zooplancton à Villefranche depuis 1966
http://www.obs-vlfr.fr/Rade/RadeZoo/
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Application: Application: Biogéographie mondiale des Biogéographie mondiale des océans profonds océans profonds
200 profiles UVP9 régions océaniques
21 taxa
Stemmann et al., 2008a and b
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Perspectives: réseau mondial de surveillance
Réseau d’observation - Flotteurs équipés de système d’imagerie.- Stations fixes
Centres de réception et d’analyse- Serveur d’images pour la validation en réseau
Carbone Organique Particulaire
ZooplanctonAssimilation dans des modèles - biogéochimique- halieutique
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UVP principles
Camera
Light
Volumetric image
PVMThe UVP 4 is based on :1. Camera2. Specially design lighting system3. Computer4. Software
A CTD is associated on the frame
New 2007 version :o 30 Kgo Red light systemo Increased autonomyo Real time processingo Optional telemetryo 6000 m rangeo Rosette-AUV-adaptable
The UVP 4 was a real innovative system but it is heavy and limited to 1000 m.
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Size spectra / depth Organisms identification CTD
MATLAB routines
UVP in-situ Image
Measurements
Threshold
Large objects
Large Aggregates - Zooplankton
Large Particulate MaterSize Calibration
ESD ( > 60µm)
All objects
UVP Image process
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1987
2001 2001
2003
2005
From silhouette to Zooscan
Silhouette photography (Ortner et al., 1979)
The Zooscan system was constructed to allow the construction of a homogenous, permanent and secure digital image data bank allowing global comparison of zooplankton series. => Zooplankton Data standardization through networks or collaborations (50 Zooscans)
1979
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IMAGE ANALYSIS
Basic stats and graphs
Object Separation
Visualisation
Manual measurements
Calibration
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Vignettes (thumbnail images)
Basic stats and graphs
Object Separation
Visualisation
Manual measurements
Calibration
Vignette extraction for :
- Training sets for recognition
- Manual identification
- Semi automatic identification