APORTACIONES DE WINOGRADSKY, BEIJERINCK Y BROCK A LA ECOLOGÍA MICROBIANA.

Corral Gonzáles Erika Rojas Osnaya Jesús

Reza Valdés Marco Antonio

Sergei Winogradsky

- Aisla las bacterias nitrificantes. - Describe la oxidación microbiana de el sulfídrico y del ferroso, se describe la vida quimiolitrótofa. -Describe la fijación del nitrógeno y la simbiosis con plantas. “Padre de la microbiologia del suelo.”

Martinus Beijerinck

FIJACION SIMBIOTICA DEL NITROGENO POR LEGUMINOSAS

Reconoce la ubicuidad de los microorganismos y la influencia selectiva de las condiciones ambientales.

Desarrolla técnicas de enriquecimiento.

Funda una escuela dedicada al estudio de la diversidad y la fisiología bacteriana.

Thomas D. Brock

A finales de la década de los 60, halló bacterias en Yellowstone. Junto con Houdson Freeze aisló una muestra la cual nombraron Thermus aquaticus. “La vida a altas temperaturas”.

Extremófilos.

Grandes aportaciones a la Biología, contribuyó a la agricultura y medicina, además de ayudar a crear el nuevo campo de la biotecnología.

Unidad Iztapalapa

Materia: Ecología Microbiana Gpo. BH08

Profesora: Ma. de los Angeles Aquiahuatl Ramos

Artículo: La Ecología Microbiana se hace mayor de edad

Tema: Microorganismos procariotas y eucariotas

Expositores: Dominguez Paez Joel González Rodríguez Ana Karen

Clasificación de los organismos

Clasificación moderna: Dominio (secuencias de ARN16S)

3 DOMINIOS Carl Woese (1990) Bacteria

Archaea

Eukarya

TODOS son procariotas unicelulares

TODOS son eucariotas uni- y pluricelulares

Dominios

Bacteria

Archea

Eukarya

Reinos

Bacteria

Euryarchaeota Crenarchaeota Korarchaeota

Protozoa Chromista

Fungi Plantae Animalia

Unidad fundamental de todo organismo viviente. Formadas de moléculas complejas: proteínas, ácidos nucleicos, polisacáridos…

Unidad dinámica

Pequeñas (1 - 10μm) Molécula única de ADN circular: forma el nucleoide (sin membrana que lo rodee) Carecen de núcleo y organelos celulares Ribosomas 70S Membrana plasmática (MP) Pared celular de peptidoglicano (PG) que rodea la MP

Ribosomas Nucleoide Citoplasma

Membrana plasmática Pared celular

Más grandes (10 - 100 μm) Núcleo con membrana y nucleolo ADN lineal formando cromosomas

Organelos rodeados por membranas Ribosomas 80S

Membrana plasmática

Pared celular ausente en animales y protozoos.

Eukarya más compleja que las procariotas.

Bacteria y Archaea células simples diferentes a las eucariotas en su organización interna.

Entidad biológica que se autoreplica Material genético: ADN o ARN Sin autonomía metabólica Ciclo de “vida” con dos fases: •Extracelular

•Intracelular

Generalmente con pared celular compuesta por peptidoglicano Muchas tienen cilios o flagelos y son móviles Nucleoide, citoplasma con ribosomas Clasificación más aceptada: Bergey's Manual of Systematic Bacteriology

Microorganismos unicelulares procariotas Estructuras procariotas pero de composición muy diferente: alta resistencia vs. antibióticos agentes líticos Muchos se desarrollan en ambientes extremos Clasificación: Por su fisiología Metanógenas, Halófilas y Termo-acidófilas Por su genoma (ARNr) Euryarchaeota, Crenarchaeota y Korarchaeota

Organismos eucariotas autótrofosuni- y pluri-celulares. Fotosíntesis oxigénica: H2O O2 Cloroplastos estructuras con pigmentos fotosintéticos que captan luz (clorofila: todas tienen de tipo “a”) Hábitat: agua dulce/salada y ambientes húmedos (suelos, rocas)

Organismos unicelulares, SIN pared celular Heterótrofos, no fotosintéticos Viven en ambientes húmedos o en medios acuáticos Muchos son parásitos Móviles ¹tipos de locomoción: clasificación 4 grupos: Flagelados, Ameboides, Ciliados y Esporozoos

Organismos uni- (levaduras) y pluri-celulares (hongos filamentosos) Heterótrofos: necesitan una fuente de carbono orgánica Osmótrofos Reproducción sexual y asexual (esporas) Viven y se desarrollan casi en cualquier ambiente: acidez, [sales y azucares], T’s, [nutrientes] La mayoría aerobios y muchos (levaduras) anaerobios facultativos. Reproducción: Sexual y asexual.

RNA RIBOSOMAL Y LA FILOGENIA DE LAS POBLACIONES MICROBIANAS

Espinoza García Ingrid Jazmín Crescencio Tovar Nancy Karina

RNA ribosomal Es una molécula encargada de la síntesis de proteínas El RNA ribosomal es una molécula excelente para discernir las relaciones evolutivas entre los seres vivos, pero actualmente se utilizan los estudios del rRNA 16S,porque son secuencias que se han mantenido bastante uniformes a lo largo de la evolución y es un excelente marcador molecular para la reconstrucción de la mayoría de las relaciones filogenéticas.

FILOGENIA

Definición: es la historia o crónica evolutiva de las especies.

Carl Wose propuso la comparación de RNA ribosomal y creo una nueva clasificación en tres dominios: Bacteria Arquea Eukarya

BIBLIOGRAFIA http://curiosidadesdelamicrobiologia

.blogspot.mx/2011/03/visiones-del-cuarto-dominio.html

Gerard J. Tortora,Berdell R. Funke,Christine L. Case Introducción a la microbiología pg.284

http://www.ugr.es/~eianez/Microbiologia/Pres%2012_archivos/frame.htm

TRANSFERENCIA HORIZONTAL DE GENES EN BACTERIAS

Por: Aceves Zamora Ma. Lynet

Goche Hernandez Gustavo

Transferencia horizontal de genes

• También conocida como transferencia lateral de genes (LGT), proceso en el que un organismo transfiere material genético a otra célula que no es descendiente.

• Se da por tres mecanismos fundamentales conjugación, transducción y transformación.

• Conjugacion: Proceso mediante plasmidios, que tienen la propiedad de transferirse de una célula a otra gracias a un contacto cercano entre ambas células mediante un poro de conjugación o pili sexual.

• Transduccion: Es la transferencia de material genético de una bacteria a otra mediante un virus que infecta bacterias (bacteriófago).

• Transformacion: Es la captura de ADN extracelular del medio, que puede integrarse en el genoma y expresarse.

EQUIPO : Aguayo López Susana Mavel

García Flores María Concepción Hernández García Iris

Juárez Galván Paola Viridiana Reyes Benites Jocelyn

El PCR es un técnica simple que implica un conjunto de tratamientos desarrollados in vitro sobre una región de ADN para su amplificación selectiva:

Las reacciones de amplificación consiste en la repetición de un ciclo integrado por tres etapas:

Requisitos indispensables para llevar a cabo la reacciòn: La reacción se lleva a cabo in

vitro, en un medio adecuado y en presencia de los componentes necesarios (cebadores, enzima, sustrato).

parámetro esencial a controlar es la temperatura

PARA LLEVAR A CABO LA PCR LAS CONDICIONES EN UN VOLUMEN DE 100 µL G EN UN MEDIO QUE CONTIENE:

Un tampón Tris-HCl que a temperatura ambiente mantiene un pH en un valor de 8´3, y que a la temperatura de polimerización (72°C) cae hasta 7´2.

Sal (KCl) e iones Hg 2+, aunque su concentración óptima es muy baja, el Hg 2+ es muy esencial para la reacción, lo que obliga a evitar la presencia de EDTA en las disoluciones de otros componentes.

Una mezcla de los cuatro dNTPs, a una concentración saturante.

Los dos oligonucleótidos cebadores, también en exceso. El ADN molde. La ADN-polimerasa Taq

1 minuto a 94°C para provocar la desnaturalización del dsADN. 2 minutos a 50°C para permitir la unión de los cebadores al

molde. 3 minutos a 72°C para que la polimerasa catalice la elongación

del cebador. Cebador La longitud de los oligonucleótidos utilizados para llevar la

reacción de PCR suele ser del rango de 15 a 30 nucleótidos. Cuanto más corto sea el cebador más perfecto tiene que ser su complementariedad con el molde y más específica será la amplificación, aunque su unión al molde es más débil y conduce a un rendimiento menor.

Deben evitarse secuencias con bases repetidas (más de tres o cuatro seguidas).

Reducir la posibilidad de formación de estructuras bicatenarias no productivas, cebadores con estructura secundaria o cebadores parcialmente complementarios entre sí.

GENÓMICA

Barrón Gutiérrez Alfonso Fuentes Fonseca Nancy Erika

La genómica no puede representar por si sola un cuadro de la realidad biológica. Una de las limitaciones de la aplicación de las técnicas moleculares de muestras ambientales es que los resultados son cualitativos y no cuantitativos

EJEMPLO: ESCHERICHIA COLI

La única manera de comprender un genoma es mirar donde vive este genoma, conocer su habitad natural y comprender el complejo entramado de interacciones bióticas y abióticas.

El ambiente es el contexto en el que evoluciona y funciona un material genético, y el que , en el fondo, determina la supervivencia y forma del genoma.

UNIVERSIDAD AUTONOMA METROPOLITANA

PROFA: María de los Angeles Aquiahuatl INTEGRANTES: -Martha Monserrath Rodriguez -Alma Graciela Pérez Alba

PROTEÓMICA Proteómica es estudio a gran escala de las proteínas, en particular de

su estructura y función.Las proteínas son partes vitales de los organismos vivos, ya que son los componentes principales de las rutas metabólicas de las células. El término proteómica fue acuñado en 1997como una analogía con genómica, el estudio de los genes.

La palabra "proteoma" es la fusión de "proteína" y "genoma", y

fue acuñada por Marc Wilkins en 1994, mientras trabajaba en ese concepto como estudiante de doctorado. El proteoma es la dotación completa de proteínas, incluyendo las modificaciones hechas a un conjunto particular de proteínas, producidas por un organismo o sistema. Esto varía con el tiempo y con requisitos diferentes, o debido al estrés, que sufre una célula o un organismo.

APLICACIONES Las aplicaciones que se pueden vislumbrar es en diversos

terrenos científicos y biotecnológicos. Pero la aplicación más llamativa, con más impacto comercial, es el descubrimiento de fármacos, el diagnóstico molecular y la medicina personalizada. Este aspecto de la Proteómica está haciendo que la industria farmacéutica invierta grandes cantidades en el desarrollo de esta metodología y se esté avanzando rápidamente.

EJEMPLO: Los biomarcadores son biomoléculas que se determinan en un tejido o en un fluido corporal de un enfermo para definir una enfermedad a nivel molecular y para seguir o para predecir (prognosis) la respuesta a una terapia para una enfermedad determinada. Los marcadores proteicos ideales para la rutina clínica son los que se pueden detectar en el suero, ya que el suero contiene una información sobre el proteoma, que potencialmente refleja lo que está ocurriendo en cada tejido del cuerpo.

BIBLIOGRAFIA

http://www.uco.es/servicios/scai/pdf/proteomica_aplicaciones.pdf

www2.cbm.uam.es/jvazquez/PDFs/Proteomica.pdf

«οίκος» oikos="casa " «λóγος» logos=" conocimiento"

Biología Ecología

«Estudiar las interacciones y flujos energéticos de los organismos vivos y su entorno.»

Flujos de materia y energía Niveles de organización o Organismo

o Población o Comunidad o Ecosistema

Producción y productividad

o Productores o Autótrofos o Consumidores o Heterótrofos o Descomponedores

Cadena trófica

Ecosistema

o Ciclo del carbono. o Ciclo del oxígeno. o Ciclo del nitrógeno.

o Ciclo del azufre. o Ciclo del fósforo.