cours copag

Upload: hboudyach3577

Post on 03-Apr-2018

225 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

  • 7/28/2019 Cours Copag

    1/111

    Aperu sur la microbiologiealimentaire

    Formation COPAG, Octobre 2009

    Prs. EH. BOUDYACH & H. BOUBAKER

    Enseignants-chercheurs

    la facult des sciences dAgadir

  • 7/28/2019 Cours Copag

    2/111

    INTRODUCTION

    Un des effets les mieux connus desmicroorganismes contaminants de nos aliments

    est la dgradation de la qualit. Cette qualit de

    nos produits alimentaires peut, au plan

    microbiologique, tre dfinie de 2 faons :

  • 7/28/2019 Cours Copag

    3/111

    La qualit marchande

    concerne essentiellement les

    caractristiques organoleptiques et se traduitpar un attrait ou une rpugnance par les

    consommateurs. Ses incidences

    conomiques sont dterminantes pour

    lindustrie alimentaire. Les caractristiquesnutritionnelles et technologiques de lalimentcontribuent cette qualit.

  • 7/28/2019 Cours Copag

    4/111

    La qualit hyginique

    Linnocuit dun aliment correspond une

    qualit seuil et la norme zro dfaut doit treatteinte pour certains systmes aliment-

    microorganisme en particulier partir du

    moment o la prsence du microorganisme

    dans le produit risque davoir une incidencedfavorable et parfois trs grave sur la sant

    du consommateur.

  • 7/28/2019 Cours Copag

    5/111

  • 7/28/2019 Cours Copag

    6/111

    Sources primaires des microorganismes

    Sol & eau Plantes & produits drivs

    Animaux & produits drivs

    Air & poussire

  • 7/28/2019 Cours Copag

    7/111

    ALTERATIONS MICROBIENNES DES

    ALIMENTS

    Contamination naturelle

    La charge microbienne normale de la plupart denos aliments est de lordre de 104/g.

    Dans la nature, les prolifrations microbiennes

    par succession de flores ont pour finalit deminraliser compltement le produit (dans le cas

    de microorganismes htrotrophes).

  • 7/28/2019 Cours Copag

    8/111

    ALTERATIONS MICROBIENNES DES

    ALIMENTS

    Il y a mort quand les microorganismes ne

    trouvent pas dans laliment les conditionsncessaires leur croissance (composition,conditions dentreposage, traitementsantimicrobiens..). La survie des

    microorganismes est lie des conditionsnengendrant pas la mort mais ne permettantpas la multiplication (composition, froid ...).

  • 7/28/2019 Cours Copag

    9/111

    ALTERATIONS MICROBIENNES DES

    ALIMENTS

    Il y a prolifration quand les

    microorganismes trouvent les conditionsncessaires leur croissance. Dans ce cas

    gnralement dfavorable il y a altration de

    la qualit marchande si les germes sont

    saprophytes et altration de la qualitsanitaire (et parfois marchande) si les

    germes sont pathognes.

  • 7/28/2019 Cours Copag

    10/111

    Incidences sur la qualit marchande

    La prolifration de microorganismes dans un

    produit alimentaire se traduit par des modificationsdes qualits organoleptiques gnralement

    dtectables quand le nombre de germes dpasse

    les 106par g de produit. Les modifications daspect

    (couleur), de texture ou de flaveur (odeur etsaveur) sont souvent dfavorables : Pseudomonas,

    Acinetobacter, Moraxella, Alcaligenes, Aspergillus,

    Rhizopus,Flavobacterium, Clostridium .

  • 7/28/2019 Cours Copag

    11/111

    Incidences sur la qualit marchande

    Parfois cette prolifration engendre des

    modifications souhaites (beurre, fromages,yaourt, choucroute, etc.).

  • 7/28/2019 Cours Copag

    12/111

    Relations microorganisme / composition

    de laliment

    A partir des glucides de laliment (et drivs)

    * polymres (amidon, cellulose) : hydrolyse : texture modifie

    * dimres et monomres (saccharose, maltose, lactose, glucose, fructose,etc) : fermentations : formation dacides et de composs carbonyls

    par exemple : incidence sur le got et larme

    A partir des protides de laliment (et drivs)

    * polymres (protines) : hydrolyse : texture modifie* acides amins : dcarboxylation, dsamination, dsulfuration etc. :

    modifications du got, de lodeur, formation de catabolites toxiques

    A partir des lipides de laliment (et drivs) : oxydation et lipolyse

    (got).

  • 7/28/2019 Cours Copag

    13/111

    Modifications de lodeur

    Le dveloppement de microorganismes dans

    un produit est dabord dtect par desmodifications dodeurs en raison de lasensibilit de notre systme olfactif. Le seuil

    de dtection de composs organiques

    volatiles se situe en moyenne 10-6

    - 10-9

    g.

  • 7/28/2019 Cours Copag

    14/111

    Modifications de lodeur

    Il nest gnralement pas possible dattribuer chaquemicroorganisme la gense dune odeur particulire. Cetteproduction est fonction de la composition daliment, de latemprature, de la souche etc.. Nanmoins les moisissuresengendrent souvent une odeur de moisi (complexe) ou derance tandis que les bactries gnrent des odeurs agrables,fruites ou dsagrables.

    Pseudomonas : odeur de tilleul (milieux pauvres en matiresorganiques)

    Achromobaterou Flavobacterium : odeur de pomme ou denavet

    Bacillus subtilis : odeur de melon pourri

    Streptomyces : odeur de moisi.

  • 7/28/2019 Cours Copag

    15/111

  • 7/28/2019 Cours Copag

    16/111

    Modifications de laspect et de la couleur

    Ces modifications sont chronologiquement dtectables

    visuellement bien aprs lapparition dodeurs. Dans une

    premire phase il sagit de petites zones qui prsentent

    des caractristiques variables quant leur forme (rondes,

    plates, bombes, irrgulires...).

    Leuraspect (opaque, mat, brillant, rugueux...) et/ou leurcouleur (blanc, noir, jaune, rouge...) sont multiples. Ces

    zones sont constitues de bactries, levures, et de

    scrtions muqueuses qui stendent la surface de

    laliment et forment un revtement

  • 7/28/2019 Cours Copag

    17/111

    Modifications de laspect et de la couleur

    La prolifration de moisissures est caractrise

    par la formation de zones colores volution

    centrifuge. Ces zones peuvent prsenter des

    aspects varis (feutrage, taches rugueuses...).

  • 7/28/2019 Cours Copag

    18/111

    Modification de la structure et texture

    La structure dun produit alimentaire est lie la prsence de macromolcules comme lespectines, celluloses, hmicelluloses chez lesproduits vgtaux et les protines chez lesproduits animaux.

    Si les microorganismes contaminantssynthtisent et excrtent des hydrolases(pectinases, protases, etc...) unramollissement apparat.

  • 7/28/2019 Cours Copag

    19/111

    Modification de la structure et texture

    Pour un germe donn, ce ramollissement est dautant plus

    grand que la charge microbienne est leve :

    * Phnomne recherch (ex. claircissement des jus de fruits

    par pectinases)

    * Phnomne dfavorable : pertes de forme, etc...

    La production de gaz (CO2 le plus souvent) induit la formationde fissures ou de bulles et altre les emballages. La synthse de

    polymres (dextranes partir de saccharose avecLeuconostoc)

    augmente la viscosit de certains sirops ou jus.

  • 7/28/2019 Cours Copag

    20/111

    Modification de la valeur alimentaire

    Dans le cas de produits obtenus par fermentation, la structure,

    les qualits hyginiques, organoleptiques et nutritionnelles

    sont actuellement bien contrles.

    Les microorganismes intervenant dans ces processus

    consomment des molcules valeur nergtique leve et

    la valeur calorique des produits ferments est donc

    gnralement infrieure celle du produit initial.

    Ces mmes microorganismes ont un rle favorable en

    synthtisant des molcules activit biologique comme des

    vitamines ou encore en catabolisant des produits toxiques.

  • 7/28/2019 Cours Copag

    21/111

    Paramtres de contrle de la prolifration

    microbienne

    De nombreuses caractristiques

    physicochimiques de laliment et de sonenvironnement conditionnent le dveloppement

    des microorganismes.

  • 7/28/2019 Cours Copag

    22/111

    Caractres propres laliment

  • 7/28/2019 Cours Copag

    23/111

    Structures biologiques

    La prsence denveloppes, coques, peaux etc. confre

    certains aliments une excellente protection contre la

    prolifration microbienne (testas des graines, enveloppes

    des fruits, coquilles des noix, des oeufs, peau des

    animaux, etc.)

    Laltration de ces protections naturelles se traduitsouvent par une contamination / prolifration. Les

    emballages ont pour but principal de protger laliment

    stabilis ou non de la contamination .Il faut signaler quil

    existe des emballages comestibles.

  • 7/28/2019 Cours Copag

    24/111

    Agents antimicrobiens naturellement

    prsents

    Le lait frais contient des lactnines et des facteurs

    anti-coliformes activit limite dans le temps.Luf contient du lysozyme actif sur des germes

    Gram positif. Les airelles contiennent de lacide

    benzoque actif sur les levures et moisissures ; descomposs comme le thymol (thym), leugnol

    (clou de girofle) ou laldhyde cinnamique

    (cannelle) ont des activits antimicrobiennes.

  • 7/28/2019 Cours Copag

    25/111

    Composition chimique de laliment

    Pour prolifrer, les microorganismes doivent trouver dans

    laliment des substances nutritives. Rappelons que les

    microorganismes dangereux sont pour la plupart

    htrotrophes chimio-organotrophes et doivent donc

    trouver leur nergie dans les composants de laliment. Ils

    doivent aussi y trouver de leau, une source dazote, desminraux et pour certains des vitamines et des facteurs de

    croissance. Plus la diversit de composition dun aliment

    est grande (tel que le lait ...) et plus sa susceptibilit

    servir de milieu de culture est grande.

  • 7/28/2019 Cours Copag

    26/111

    Le pH

    Pour un microorganisme donn, la vitesse de

    croissance en fonction du pH passe par un

    optimum. Ce sont souvent des activits

    enzymatiques sensibles au pH qui sont les

    facteurs limitants de la croissance

    microbienne.

  • 7/28/2019 Cours Copag

    27/111

    Le pH

    Par rapport au pH il est habituel de considrer deux

    groupes daliments : ceux dont le pH est infrieur 4,5et ceux dont le pH est suprieur 4,5.

    Dans la premire catgorie les microorganismes

    dangereux ne se multiplient gnralement pas et

    Clostridium botulinum nlabore pas sa toxine.

    Lacidophilie est une proprit que lon rencontre surtout

    chez les levures, les moisissures et chez certaines

    bactries.

  • 7/28/2019 Cours Copag

    28/111

  • 7/28/2019 Cours Copag

    29/111

    Activit de leau

    Les microorganismes ont besoin, pour se multiplier,

    deau disponible ; la disponibilit de leau estcaractrise par son activit. Ce paramtrecorrespond au rapport de pression partielle de leaudans laliment celle de leau pure (aux coefficientsdactivit prs) :

    aeau = Peau aliment / Peau pure L activit de leau varie entre 0 et 1.

  • 7/28/2019 Cours Copag

    30/111

    Activit de leau

    Les microorganismes capables de se dvelopper dans desproduits faible aeau sont qualifis de xrophiles, ceuxen milieux fortement sucrs ou sals respectivementdosmophiles et de halophiles.

    Les moyens dabaisser lactivit de leau sont nombreux :

    - physiques (conglation, dshydratation)

    - additifs (salage, sucrage..)

    Ils conduisent respectivement des aliments congels,schs, aux salaisons et saumures, confitures et bonbons.

  • 7/28/2019 Cours Copag

    31/111

    Activit de leau

    Pour aw < 0,65 aucun microorganisme ne peut

    cultiver (ils peuvent survivre). Pour aw

  • 7/28/2019 Cours Copag

    32/111

    Potentiel doxydo-rduction

    Selon leur mode de respiration, lesmicroorganismes sont soit arobies stricts,soit anarobies stricts, soit aro-anarobies, soit micro-arophiles ...

  • 7/28/2019 Cours Copag

    33/111

    Potentiel doxydo-rduction

    Ces proprits expliquent la diversit des altrations que lon peutrencontrer :

    - les moisissures et les levures arobies strictes se dveloppent en surface enformant des voiles plus ou moins pais

    - les levures fermentantes se multiplient en profondeur avec production degaz

    - les Clostridium ne se dveloppent quen absence doxygne (masse,

    conserve..)- lesPseudomonas ne se dveloppent quen prsence doxygne (surface)

    - lesLactobacillus microarophiles ne se dveloppent qu une teneurrduite en oxygne.

    Dans les aliments, on peut considrer la prsence ou labsence doxygne

    comme un paramtre fondamental vis vis des microorganismes.

  • 7/28/2019 Cours Copag

    34/111

    Paramtres externes laliment

  • 7/28/2019 Cours Copag

    35/111

    Temprature dentreposage

    Dans les microorganismes, la temprature

    augmente la vitesse de lensemble desractions dont il est le sige (anabolisme et

    catabolisme) ; on observe donc une

    augmentation de la vitesse de croissance

    avec laugmentation de la temprature.

  • 7/28/2019 Cours Copag

    36/111

    Temprature dentreposage

    Cependant, quand la temprature augmente,

    la vitesse de dnaturation des protines

    bactriennes (enzymes en particulier)

    augmente. Quand toutes les molcules

    protiques activit mtabolique sont

    dnatures, le germe a une vitesse decroissance nulle

  • 7/28/2019 Cours Copag

    37/111

    Temprature dentreposage

    Pour des tempratures infrieures la temprature

    optimale de croissance, la vitesse des ractionsimpliques dans le mtabolisme et donc le taux de

    croissance diminue. Cependant le froid ne conduitpas une dnaturation significative des

    composants microbiens, ce qui conduit une

    reprise des activits mtaboliques ds que la

    temprature atteint des valeurs qui se rapprochent

    de la temprature optimale de croissance.

  • 7/28/2019 Cours Copag

    38/111

  • 7/28/2019 Cours Copag

    39/111

    Temprature dentreposage

    Parmi les germes dangereux en microbiologiealimentaire capables de cultiver entre 0 et 10C il

    faut citer: Listeria monocytogenes, Clostridium botulinum,

    Bacillus cereus, Yersinia enterocolytica, Vibrioparahaemolyticus, Aeromonas hydrophila, et mmeE. colientropathogne.

    Le froid est un moyen largement utilis de nos jourspour contrler la vitesse de croissance desmicroorganismes.

  • 7/28/2019 Cours Copag

    40/111

    Humidit relative

    Lhumidit relative du lieu dentreposage influe la fois

    sur lactivit de leau de laliment (quilibre dynamique)

    et sur la croissance des microorganismes la surface de

    cet aliment. Par exemple quand un aliment a une activit

    deau de 0,6 il faut viter que les conditions dhumidit

    relative de latmosphre environnante ne conduisent

    une augmentation de lactivit deau en surface jusqu

    une valeur compatible avec une croissance microbienne.

  • 7/28/2019 Cours Copag

    41/111

    Prsence et concentration de gaz

    La notion datmosphre contrle est dj ancienne. Une

    augmentation de la teneur en anhydride carbonique(jusqu 10 %) et une diminution de la teneur en oxygne

    permettent une meilleure conservation des fruits et

    lgumes en retardant le dveloppement de certains

    microorganismes et plus particulirement des moisissures.

    Une atmosphre dazote ou un conditionnement sous vide

    permet dviter des contaminations par des

    microorganismes arobies.

  • 7/28/2019 Cours Copag

    42/111

    Antimicrobiens

    Il sagit de substances qui sont soit bactriostatiquessoit bactricides (thanol, acides organiques comme

    les acides lactique, actique, citrique, tartrique,malique, etc. ).

    Laddition de composs antimicrobiens aux produitsalimentaires (additifs) ou lutilisation dagents

    antimicrobiens divers dans lenvironnement deproduction des aliments (agents de dsinfection, de

    nettoyage, etc.) est rglemente.

  • 7/28/2019 Cours Copag

    43/111

    LES AGENTS ANTIMICROBIENS

  • 7/28/2019 Cours Copag

    44/111

    LES AGENTS ANTIMICROBIENS

    Lutilisation dagents antimicrobiens permetde contrler le dveloppement des

    microorganismes, et plus particulirement

    des microorganismes pathognes et (ou) des

    microorganismes responsables des

    phnomnes de dgradation des produitsalimentaires.

  • 7/28/2019 Cours Copag

    45/111

    LES AGENTS ANTIMICROBIENS

    Les moyens de lutte contre les microorganismes sont trs

    nombreux et peuvent tre schmatiquement classs en :

    agents physiques (temprature, rayonnements, etc)

    agents chimiques (leur activit et leur nocivit

    sappliquent aussi bien aux cellules microbiennes quaux

    cellules humaines ou animales) dautres agents au pouvoir de toxicit slective; ils

    sopposent par exemple la multiplication microbienne

    sans nuire aux cellules de lhte. Cette proprit permet

    leur utilisation en thrapeutique.

  • 7/28/2019 Cours Copag

    46/111

    Gnralit & terminologie

  • 7/28/2019 Cours Copag

    47/111

    Strilisation

    La strilisation est communment considre

    comme la destruction de tous les

    microorganismes dun milieu et ce, quellesque soient leurs structures ou leurs

    proprits. Aucun microorganisme nest alors

    revivifiable dans ces conditions et le matrielou laliment trait est qualifi de strile.

  • 7/28/2019 Cours Copag

    48/111

    Dsinfectants

    Il sagit dagents chimiques capables de dtruire les germes

    pathognes dans des milieux extrieurs lhomme (eau, sol,

    air, etc). Le terme dsinfectant est gnralement rserv auxsubstances agissant sur des objets inanims. Dans ces

    conditions, il est possible dutiliser de telles substances

    concentrations leves, avec des temps de contact prolongs.

    Les produits sont parfois qualifis de germicides. Selon lAFNOR, la dsinfection est une opration , au

    rsultat momentan permettant dliminer ou de tuer les

    microorganismes et/ou dinactiver les virus indsirables

    supports par des milieux contamins.

  • 7/28/2019 Cours Copag

    49/111

    Antiseptiques

    Les antiseptiques sont des agents chimiques capables de dtruire les

    microorganismes ou darrter leur dveloppement (microbicides ou

    microbiostatiques). Ils exercent gnralement une action locale chezles tres vivants.

    Selon lAFNOR, lantiseptie est une opration , au rsultat

    momentan , permettant de tuer ou dliminer les microorganismes

    et/ou dinactiver les virus au niveau des tissus vivants dans la limite de

    leur tolrance .

    Dsinfectants et antiseptiques, toxiques, ne sont gnralement pas

    administrs lhomme par voie gnrale ou ingrs (il existe des

    exceptions comme celle de lingestion dhypochlorite de sodium utilis

    pour rendre leau potable).

  • 7/28/2019 Cours Copag

    50/111

    Facteurs influenant laction

    antimicrobienne

  • 7/28/2019 Cours Copag

    51/111

    Le microorganisme

    Toutes les espces ne sont pas galement sensibles un agent

    antimicrobien ; ce dernier est dailleurs caractris par son spectredactivit. Nanmoins, si lagent antimicrobien est actif sur de trs

    nombreuses espces, son efficacit sera universelle.

    Ltat physiologique de la bactrie influe sur sa sensibilit : ainsi les

    bactries sont moins rsistantes en phase exponentielle de croissance

    laction des agents antimicrobiens chimiques qui sont trs

    rapidement absorbs par le germe alors que les cellules gs de 24 h

    ou plus sont souvent plus sensibles des traitements physiques.

  • 7/28/2019 Cours Copag

    52/111

    Le microorganisme

    Les formes sporules sont beaucoup plus rsistantes

    aux agents physiques ou chimiques que les formes

    vgtatives correspondantes.

    Plus le nombre initial de microorganismes est lev

    (charge), plus le temps exig pour obtenir un niveau

    de destruction donn sera grand, toutes conditions

    tant gales par ailleurs.

  • 7/28/2019 Cours Copag

    53/111

    Le temps de traitement

    Laction antimicrobienne suit une loicintique .

  • 7/28/2019 Cours Copag

    54/111

    Lagent antimicrobien

    De nombreux paramtres contrlent laction antimicrobienne.

    Ainsi laction ltale des agents physiques augmente gnralement

    avec leurintensit dapplication ; les agents chimiques pourront,selon leurconcentration, possder des effets bactriostatiques ou

    bactricides. La stabilit de certains agents antimicrobiens

    chimiques est ncessaire lexpression de leur activit

    antibiotique tandis que pour dautres comme lhypochlorite desodium, le peroxyde dhydrogne lactivit nest nette que lors de

    leur dcomposition.

    Pour les agents chimiques, la solubilit dans leau est un facteur

    dterminant de leur activit.

  • 7/28/2019 Cours Copag

    55/111

    Lenvironnement Lenvironnement peut influencer considrablement lefficacit

    des agents antimicrobiens physiques ou chimiques. Parmi lesprincipaux facteurs influenant, on peut signaler :

    le pH du milieu la turbidit, la viscosit (les U.V. ne sont actifs que sur quelques

    millimtres de profondeur en milieu limpide)

    la duret de leau (les ions calcium et magnsium diminuent parexemple lactivit antimicrobienne dun dsinfectant comme lesammonium quaternaires)

    les matires organiques (les protines prcipitent en prsencedalcool et le prcipit form empche la diffusion de lalcool ; leshypochlorites donnent, en prsence de matires organiques deschloramines moins actives, etc...)

    la temprature peut modifier laction de certains agentsantimicrobiens chimiques (la plupart des antibiotiques perdent

    leur activit temprature leve).

  • 7/28/2019 Cours Copag

    56/111

    Agents Physiques

  • 7/28/2019 Cours Copag

    57/111

    Agents Physiques

    En raison de leur faible spcificit daction, la plupart

    des agents physiques antimicrobiens se montrent

    efficaces sur lensemble des microorganismes. La

    sensibilit relative des germes sera fonction de leur

    structure (espce), de leur composition et de leur

    environnement. Le plus souvent, ce sont des ractionsaffectant le gnme ou des protines fonctionnelles ou

    de structure qui sont lorigine des effets microbicides

    ou plus rarement microbiostatiques observs.

  • 7/28/2019 Cours Copag

    58/111

    La chaleur

    laugmentation de la temprature se traduit dabord par uneaugmentation de la vitesse des ractions caractrisant le

    mtabolisme microbien et donc par une augmentation de la vitessede croissance du germe. En parallle, cette augmentation detemprature induit des modifications conformationnelles auniveau de macromolcules impliques dans la structure ou lemtabolisme du microorganisme comme les enzymes.

    Il en rsulte alors une diminution de la vitesse de croissance, puis,quand le niveau de modification devient incompatible aveclexpression du mtabolisme, un arrt de cette croissance etenfin la mort quand le niveau de transformations irrversiblesatteint une valeur seuil.

  • 7/28/2019 Cours Copag

    59/111

    La pasteurisation

    permet essentiellement la destruction des formes vgtatives desmicroorganismes pathognes et/ou responsables de certaines altrations,

    microorganismes prsents dans laliment. Elle conduit ainsi ladestruction des moisissures, levures et bactries Gram ngatif. Laplupart des germes sporuls rsistent au traitement et certaines bactries gram positif ne sont que partiellement dtruites (Streptococcus et

    Lactobacillus du lait par exemple). La pasteurisation est gnralementpratique des tempratures infrieures 100C. Elle est effectue surdes produits relativement sensibles la chaleur (jambon, jus de fruits, lait,

    beurre, foie gras etc ...).

    Les couples temps/temprature permettant de pasteuriser les alimentsvarient entre 30 min 65C (lait, certaines boissons fruites, crmesglaces) et 1 h 90C (aliments moyenne ou faible teneur en eau).

  • 7/28/2019 Cours Copag

    60/111

    La strilisation

    correspond un traitement thermique permettant, au plan

    microbiologique dliminer tous les microorganismes pathognes, y

    compris ceux qui sont sous forme sporule et pratiquement la plupartdes autres germes susceptibles de contaminer le produit trait.

    Les conserves alimentaires strilises prsentent donc une trs grande

    stabilit et seules des ractions chimiques peuvent contribuer

    diminuer leur dure de conservation. Le qualificatif de strile signifie

    quil est impossible de dtecter des microorganismes revivifiables par

    des mthodes de culture usuelle.

    Les couples temps/temprature permettant de striliser les produits

    alimentaires ou autres varient entre 10 min 115C et 30 min

    121C.

  • 7/28/2019 Cours Copag

    61/111

    Radiations

    Pour les rayonnements ultra-violet, la rgion active du

    spectre se situe entre 260 et 280 nm. Ce sont souvent les

    composs aromatiques qui absorbent lnergie de cesrayonnements ; parmi les composs aromatiques prsents

    dans les protines microbiennes, ce sont surtout le

    tryptophane et un degr moindre la phnylalanine et la

    tyrosine qui sont lorigine des effets observs. Dans lesacides nucliques (ADN ou ARN) ce sont les bases puriques

    et pyrimidiques qui sont impliques dans les phnomnes

    antimicrobiens dirradiation UV. Les effets ionisants faibles

    mais efficaces contribuent aussi leffet antimicrobien

  • 7/28/2019 Cours Copag

    62/111

    ultra-violet

    Lutilisation des UV permet ladcontamination de salles ou des hottes

    plutt que leur strilisation.

    NB : Les effets mutagnes cutans ou les

    effets irritants au niveau des muqueuses (au

    niveau oculaire en particulier) ncessitentdes protections importantes pour les

    utilisateurs de ce type de radiations.

  • 7/28/2019 Cours Copag

    63/111

    rayons X et

    Les rayons X et sont considrs comme des moyens destrilisation froid des conserves alimentaires ou autres

    produits. Le cot lev et limage mdiatique de telstraitements ainsi que lionisation laquelle ils aboutissentsont aujourdhui lorigine de leur utilisation limite.

    Nanmoins il faut savoir que lirradiation X ou g est utilise

    depuis plus de 25 ans pour striliser du matriel mdico-chirurgical ou des emballages et matires premiresemployes dans les industries pharmaceutiques ou encosmtologie. Ses premires applications importantes enindustries agro-alimentaires remontent aux annes 1990.

  • 7/28/2019 Cours Copag

    64/111

    Elimination mcanique

    Filtration strilisante

    Il est possible de raliser des filtrations strilisantes

    en utilisant des supports poreux organiques (drivsde la cellulose, polyamide, tflon, etc) ou minraux

    (filtres damiantes, dalumine, de porcelaine, de verrefritt, amiante, etc .) au niveau desquels la taille des

    pores est parfaitement contrle et de dimensioninfrieure celle de la plupart des microorganismes retenir (

  • 7/28/2019 Cours Copag

    65/111

    Filtration strilisante

    Il faut signaler enfin la possibilit demploi deces mthodes pour des numrations de

    diverses flores ou des recherches de germes

    prsents en trs petit nombre dans de trs

    grands volumes liquides.

  • 7/28/2019 Cours Copag

    66/111

    Centrifugation

    La centrifugation au dessus de 5000 g permet de diminuer

    la charge microbienne (bactofugation en industrie

    laitire) ce qui rend beaucoup plus efficace lapasteurisation. Pour les laits non strilisables :

    60C, 95 % des spores sont limins par raction avec

    des agglutinines associes au globule gras et se retrouvent

    donc dans la phase lgre 80C, les agglutinines sont rapidement dnatures et

    perdent leur activit en une dizaine de minutes ; 98 99 %

    des spores sont alors limines dans le culot.

  • 7/28/2019 Cours Copag

    67/111

    Agents chimiques

  • 7/28/2019 Cours Copag

    68/111

    Agents chimiques

    Tous les composs chimiques possdant un effet

    antimicrobien ne sont pas utilisables comme

    antiseptiques ou dsinfectants. Certains, comme les

    fluorures ou les cyanures sont de puissants poisons

    cellulaires dont la toxicit interdit lemploi.

    Dautres, tels que les antibiotiques et les sulfamidessont traits part en raison de leur rle

    thrapeutique.

  • 7/28/2019 Cours Copag

    69/111

    Les antiseptiques, les dsinfectants et

    les conservateurs alimentaires

    Le choix dun antimicrobien dpend de

    lusage auquel il est destin, de sonactivit, de sa toxicit, de sa stabilit, de

    son pouvoir corrosif ou colorant, de son

    odeur etc...

    En ltat actuel de nos connaissances,

    lantimicrobien idal nexiste pas.

  • 7/28/2019 Cours Copag

    70/111

    Agents chimiques

    Le peroxyde dhydrogne

    (H2O2)

    Le chlore et ses drivs

    Liode et ses drivs.

    Les mtaux lourds et

    leurs sels.

    Les alcools.

    Les phnols.

    Les savons et detergents

    Les colorants

    Les conservateursAlimentaires

    Le formol

    Loxyde dthylne

    La propionolactone

    Les essences volatiles

    Ozone

  • 7/28/2019 Cours Copag

    71/111

    LABORATOIRE DANALYSE

    MICROBIOLOGIQUE

  • 7/28/2019 Cours Copag

    72/111

    Le laboratoire

    Le laboratoire danalyse microbiologique doit tre mme

    de raliser des analyses de routine (contrle de qualit parrapport une norme, valuation de la qualit des matires

    premires), mais aussi de permettre lvaluation de la

    qualit des oprations de transformation ou de prparation,

    la recherche et matrise des ventuels points critiques

    (HACCP), lvaluation de lefficacit des traitements

    antimicrobiens de conservation, demballage ou de

    nettoyage etc.

  • 7/28/2019 Cours Copag

    73/111

    Le laboratoire

    Le laboratoire doit tre compos de trois parties

    principales :- le laboratoire proprement dit o sont ralises les

    analyses

    - la salle de prparation des milieux de culture

    - la laverie qui traite les produits et matriels utiliss

    pour lanalyse et qui fournit la verrerie et le matriel

    propre et strile.

  • 7/28/2019 Cours Copag

    74/111

    MATERIEL DEQUIPEMENT DU LABORATOIRE

    Systmes de strilisation / dsinfection et zonesstriles

    Lautoclave

    Le four Pasteur

    Les systme de fi l tration membrane

    Les lampes UV rcipients contenant de lhypochlorite de sodium

    Les zones de travail (hottes flux laminaires)

    Disti l lateur ou cartouches dsionisantes

  • 7/28/2019 Cours Copag

    75/111

    Matriels dincubation et de

    prparation des milieux

    Etuvesbactriologiques

    jarres anarobies

    bains-marie

    four microondes

    Balances

    tubes essai en verre de 16 x 160 ou 18 x 180 mm pipettes striles & micropipettes

    agitateur magntiquechauffant

    ser ingue de Cornwall

  • 7/28/2019 Cours Copag

    76/111

    Prparation des chantillons et

    culture microbienne

  • 7/28/2019 Cours Copag

    77/111

  • 7/28/2019 Cours Copag

    78/111

    Traitement

    Le premier traitement auquel sont soumis la plupart des

    produits consiste en une homognisation. Celle-ci estralise au moyen de mortiers ou par des broyeurs

    couteaux (Virtis par exemple) ou des appareils de

    Potter ou encore par un Stomacher

    Cette opration doit permettre la mise en suspensionhomogne des microorganismes prsents sur ou dans le

    produit analys en vitant cependant toute

    contamination externe

  • 7/28/2019 Cours Copag

    79/111

    Homognisation / Dcantation &

    ensemencement

    Une centrifugeuseatteignant 3 4000 g (dcanter)

    Un vortex(Homogniser) Un trs grand nombre de matriels usage unique(si

    possible) comme des botes de Ptri en polycarbonate

    de 90 mm de diamtre ou plus, de tubes essai et

    hmolyse, des pipettes gradues striles (1 et 10 ml) oude pipettes automatiques(de 0,1 ou 1 ml) cnes en

    polypropylne strilisables, des pipettes Pasteur, des

    cannes de verre, des anses de platine etc.

  • 7/28/2019 Cours Copag

    80/111

    Culture & lecture

    Un ensemenseur sp iral

    Un compteur de co loniesPourfaciliter la numration des colonies

    dans les botes de Ptri il est possible

    dutiliser un systme du type sty lo-compteur

  • 7/28/2019 Cours Copag

    81/111

  • 7/28/2019 Cours Copag

    82/111

    pH

  • 7/28/2019 Cours Copag

    83/111

    pH optimum de

    croissance

  • 7/28/2019 Cours Copag

    84/111

    Le pH dequelques produits alimentaires

  • 7/28/2019 Cours Copag

    85/111

    Activit de leau

  • 7/28/2019 Cours Copag

    86/111

    Activit de leau de certaines denres

    alimentaires

  • 7/28/2019 Cours Copag

    87/111

    Molcules utilisables comme conservateurs sous rserve de

    leur autorisation par les autorits comptentes.

  • 7/28/2019 Cours Copag

    88/111

    CC dun Laboratoire

  • 7/28/2019 Cours Copag

    89/111

  • 7/28/2019 Cours Copag

    90/111

    Hottes flux laminaire

  • 7/28/2019 Cours Copag

    91/111

    Systmes de broyage

  • 7/28/2019 Cours Copag

    92/111

    Ecouvillonnage

  • 7/28/2019 Cours Copag

    93/111

    Poste de travail de microbiologie

  • 7/28/2019 Cours Copag

    94/111

  • 7/28/2019 Cours Copag

    95/111

    Autoclaves

  • 7/28/2019 Cours Copag

    96/111

    Four Pasteur

  • 7/28/2019 Cours Copag

    97/111

    Hotte flux laminaire

  • 7/28/2019 Cours Copag

    98/111

    Jarres danarobiose

  • 7/28/2019 Cours Copag

    99/111

    Units de filtration strilisantes

  • 7/28/2019 Cours Copag

    100/111

    Membranes de filtration

  • 7/28/2019 Cours Copag

    101/111

    Etuve bactriologique

  • 7/28/2019 Cours Copag

    102/111

    Bain-marie agit

  • 7/28/2019 Cours Copag

    103/111

    Four micro-ondes

  • 7/28/2019 Cours Copag

    104/111

    Balances

  • 7/28/2019 Cours Copag

    105/111

    Pipettes & micropipettes

  • 7/28/2019 Cours Copag

    106/111

    Plaque chauffante magntique

  • 7/28/2019 Cours Copag

    107/111

    Panier & portoirs

  • 7/28/2019 Cours Copag

    108/111

    Seringue Cornwall & Distributeur

  • 7/28/2019 Cours Copag

    109/111

    Stomacher; Broyeur & mortier

  • 7/28/2019 Cours Copag

    110/111

    Boites de Ptri, pipettes Pasteur, ansede platine & taloir

  • 7/28/2019 Cours Copag

    111/111

    Etaloir rotatif & compteur de colonies