Črevné infekcie z pohľadu klinického mikrobiológa

MUDr. Michal Vlčko ,Mgr. Lucia Kóňová

OKM FNsP Skalica a.s.

Delenie infekcií GIT traktu z hľadiska etiológie :

• bakteriálne

• vírusové

• parazitárne

Etiológia infekčných hnačiek:• Bakteriálne:• Campylobacter sp, Salmonella sp., Escherichia

coli enterotoxigénne, enteropatogénne, enterohemoragické, enteroinvazívne; Shigella sp., Yersinia enterocolitica, u novorodencov tiež Pseudomonas aeruginosa a iné, v nemocniciach Clostridium difficile, v zahraničí Vibrio cholerae, Vibrio parahaemolyticus, pravdepodobne i Citrobacter freundii, Morganella morganii a iné.

• Pôvodcovia otráv z potravín: Staphylococcus aureus tvoriaci enterotoxín A a D, Bacillus cereus tvoriaci emetický toxín, Clostridium botulinum tvoriaci botulotoxín A, B a E, Clostridium perfringens typ A.

• V prípade zistenia patogénneho mikroorganizmu v klinickej vzorke sa následne testuje jeho citlivosť na antibiotiká (ATB). Testovanie citlivosti diskovým difúznym testom a vyšetrenie BP (Break-Point) (kvalitatívne stanovenia citlivosti)

• Vírusové infekcie : Rotavírusy, Adenovírusy, Norovírusy,Astrovírusy,Calicivírusy ….

• Parazitárne infekcie : Enterobius vermicularis …

• Epidemiologické aspekty infekcii:• zdroje infekcie : konzumáciou nedostatočne tepelne

opracovaného mletého hovädzieho mäsa (hamburgery), či nepasterizovaného mlieka a mliečnych výrobkov, alebo konzumáciou kontaminovaného ovocia a zeleniny., znečistená voda. Prenos je možný aj priamym kontaktom z človeka na človeka (najmä v detských kolektívoch)

• Spôsob prenosu : hlavne fekálno-orálnou cestou

• Klinický obraz : závisí od konkrétneho patogénu

• Môžu sa vyskytnúť nauzea, kŕčovité bolesti brucha, zvracanie, hnačky , tenezmy, zvýšená telesná teplota, dehydratácia, poruchý vnútorného prostredia, v závažných prípadoch septický stav ,šok + možným pridruženým organovým zlyhávaním

• Dg.: anamnéza /dôležitá hlavne osobná, epidemiologická, cestovateľská/, fyzikálne vyšetrenie, základ. lab. screening /KO,dif.KO, základ. Biochémia + zápalové paramtre CRP, v závažných prípadoch Prokalcitonín,Presepsín/ a o mikrobiologické vyšetrenie.

• Mikrobiologické vyšetrenie

• odber materiálu : výter rekta, stolica

• Výter rekta .-,Sterilný vatový tampón detoxikovanýv transportnom médiu AMIES, Carry – Blair, Stuart, sterilná odberová nádobka, sterilná skúmavka

• Stolica:

• vhodná na dg. vírusov /imunochromatografický/,

• prítomnosť toxínov /napr. klostrídiový /

• parazitov

• Foto : Enterobius vermicularis

• Materiál na kultivačné vyšetrenie je ideálne dopraviť do lab. do dvoch hodín po uskutočnení odberu.

• Skladovanie takéhoto materiálu je možné len v transportných pôdach 24 -48 hod. pri izbovej teplote, nikdy nie na tampóne bez tejto pôdy.

• Stolicu na stanovenie vírusových Ag možno uchovať aj v chladničke.

Po dopravení na OKM sa material sprácovavá:

• inokulácia na kultivačné media : KA, Endová pôda , Dezo, XLD, CIN , Karmaliho pôda, Sabouraud,Cled, TSI, Christensen

• Hodnotíme spôsob rastu /morfológia,/ na týchto pôdach, utilizácia substrátu/fermentácia , tvorba plynov, H2S/

• Príklady rastu niektorých bakteriálnych druhov na kultivačných pôdach

E,coli na KA Salmonella sp. na KA

Campylobacter sp Salmonella sp.

E.coli Yersínia sp.

TSI agar

Salmonella sp. E.coli Rôzne Enterobacteriacae

Serotypizácia: salmonely ,EPEC na základe stanovenia prítomnosti telových , bičíkových Ag aglutinačnou metódou

• Spolupráca s NRC pre salmonely Trnavská 52,Bratislava /serotypizácia/ a NRC pre fagotypizáciusalmonel.Limbová 14,Bratislava 37/Nadstavbová diagnostika patogénnych týfusových a netýfusových sérovarov salmonel – S. enterica sérovar Typhi, Paratyphi B, Typhimurium, Enteritidis, spočívajúca v určovaní fágových typov potrebných pre epidemiologické sledovanie nákaz nimi vyvolanými. V prípade týfusových sérovarov (Typhi, Paratyphi B) je potrebná kontrola fágotypov chronických bacilonosičov, ktorí sú potenciálnym zdrojom týchto nákaz pre ľudí.

Terapia:

• u ľahkých foriem väčšiny infekcií GITu nie je indikovaná ATB terapia

• Pri závažnejších formách alebo generalizácii ochorenia s rozvojom septického stavu sa indikujú ATB na základe stanovenia kvalitatívnej citlivosti na ATB s ohľadom aj na prirodzené rezistencie jednotlivých MIO

Údaje o počte izolovaných kmeňov na OKM FNsP Skalica a.s.

Ambulancie Ambulancie Ambulancie Oddelenia Oddelenia Oddelenia

2010 2011 2012 2010 2011 2012

Campylobacter species 20 16 27 14 18 17

EPEC 112 64 25 175 77 9

EHEC O157 1 2 2 0 1 2

Salmonella sp 8 70 70 14 41 36

Yersinia enterocolitica 1 0 5 1 2 2

Viac ako 80% z identifikovaných salmonel tvorila Salmonella enterica serovar Enterica.

Ostaných menej ako 10% tvorili serovary Salmonella enetrica serovar Kentucky, Salmonella enetricaserovar Infantis, Salmonella enetrica serovar Ohaio, Salmonella enetrica serovar Typhimurium , Salmonella enetrica serovar Virchow, ....

Počet pozitívnych nálezov na prítomnosť vírusových antigénov na OKM FNsP Skalica a.s

Ambulancie Ambulancie Ambulancie Oddelenia Oddelenia Oddelenia

2010 2011 2012 2010 2011 2012

Ag Adenovírus - pozitívny 3 0 9 13 14 17Ag Rotavírus - pozitívny 0 11 9 32 86 51

Zoznam patogénov podliehajúcich povinnému hláseniu na RÚVZ Senica

• Salmonella sp.

• Shigella sp.

• Campylobacter sp.

• Yersínia sp.

• Adeno, Rota, Noro vírusy

• EPEC

Literatúra:Bálint a kol. : Infektológia a antinfekčná terapia , Osveta 2007Bednař a kol.:Lékařská mikrobiologie ,Triton 1996Murray : Manual of clinical microbiology,

6th ed. ASM Press 1995www. bacteriainphotos.comwww. hpl.skwww. infekce.czwww.sskm.tym.sk

Ďakujem za pozornosť