deteksi glaukoma pada citra fundus retina · pdf filedeteksi glaukoma pada citra fundus retina...
TRANSCRIPT
DETEKSI GLAUKOMA
PADA CITRA FUNDUS RETINA
DENGAN METODE K-NEAREST NEIGHBOR
SKRIPSI
Diajukan untuk Memenuhi Salah Satu Syarat
Memperoleh Gelar Sarjana Komputer
Program Studi Teknik Informatika
Oleh:
Dian Saktian Tobias
125314042
PROGAM STUDI TEKNIK INFORMATIKA
JURUSAN TEKNIK INFORMATIKA
FAKULTAS SAINS DAN TEKNOLOGI
UNIVERSITAS SANATA DHARMA
YOGYAKARTA
2016
PLAGIAT MERUPAKAN TINDAKAN TIDAK TERPUJI
GLAUCOMA DETECTION
IN RETINAL FUNDUS IMAGE
USING K- NEAREST NEIGHBOR METHOD
A THESIS
Presented as Partial Fulfillment of The Requirements
To Obtain the Sarjana Komputer Degree
In Informatics Engineering Study Program
By:
Dian Saktian Tobias
125314042
INFORMATICS ENGINEERING STUDY PROGRAM
DEPARTMENT OF INFORMATICS ENGINEERING
FACULTY OF SCIENCE AND TECHNOLOGY
SANATA DHARMA UNIVERSITY
YOYAKARTA
2016
PLAGIAT MERUPAKAN TINDAKAN TIDAK TERPUJI
iii
PLAGIAT MERUPAKAN TINDAKAN TIDAK TERPUJI
iv
PLAGIAT MERUPAKAN TINDAKAN TIDAK TERPUJI
v
HALAMAN PERSEMBAHAN
TALK LESS DO MORE
Karya ini saya persembahkan kepada Tuhan Yesus Kristus yang senantiasa
memberikan bimbingannya dalam segala hal, terutama dalam menyelesaikan
tugas akhir ini.
Saya juga persembahkan karya ini kepada siapa saja yang setia menanti akan
penyelesaian karaya ini dengan memberikan semangat, motivasi dan tidak lupa
selalu mengingatkan saya ketika saya mulai meninggalkan tanggung jawab saya
ini.
Dan yang tidak kalah penting para sahabat yang selalu hadir dalam kondisi
apapun selama proses pembuatan tugas akhir ini dalam memberi semangat
maupun menghibur dengan candaan-candaan konyol.
Terimakasih
PLAGIAT MERUPAKAN TINDAKAN TIDAK TERPUJI
vi
PLAGIAT MERUPAKAN TINDAKAN TIDAK TERPUJI
vii
PLAGIAT MERUPAKAN TINDAKAN TIDAK TERPUJI
viii
DETEKSI GLAUKOMA
PADA CITRA FUNDUS RETINA
DENGAN METODE K-NEAREST NEIGHBOR
ABSTRAK
Glaukoma adalah penyakit mata yang diakibatkan tekanan mata seseorang
sangat tinggi atau tidak normal. Salah satu penyebab tidak normalnya tekanan pada
mata adalah tersumbatnya aliran cairan mata atau berkurangnya pengeluaran cairan
mata. Glaukoma dapat diidentifikasi dengan meneliti area optik disk dari citra
fundus retina. Tulisan ini akan berfokus bagaimana mengidentifikasi glaukoma
dengan menggunakan citra fundus retina yang berstatus terjangkit glaukoma dan
citra fundus retina yang berstatus normal atau sehat.
Data yang akan diolah adalah citra fundus retina. Data diperoleh dari
sumber internet High-Resolution Fundus (HRF) Image Database. Data yang
diperoleh sebanyak 30 citra, dimana terdiri dari 15 citra terjangkit glaukoma dan 15
citra normal. Penelitian ini akan terbagi kedalam tiga proses utama yaitu
preproccessing, ekstraksi ciri, dan indentifikasi. Preprocesing yang digunakan
yaitu segmentasi manual, grayscaling, dan resize. Untuk ekstraksi ciri
menggunakan metode Gray Level Co-occurrence Matriks (GLCM). Dengan
menggunakan metode GLCM, akan didapatkan matriks kookurensi dari citra.
Matriks kookurensi ini kemudian dicari fiturnya yaitu kontras, korelasi,
homogenitas, dan energi. Sedangkan untuk identifikasinya menggunakan metode
K-Nearest Neighbor.
Penelitian ini akan membagi data menjadi dua bagian yaitu dataset dan data
uji. Dataset sebanyak 18 citra dan data uji 12 citra. Perhitungan akurasi
menggunakan metode 3 fold cross Validation, dimana dataset akan dibagi menjadi
tiga kelompok data dengan komposisi citra untuk tiap kelompok data adalah 6.
Perhitungan akurasi dan pengujian dilakukan sebanyak empat kali pengujian
dengan nilai k berbeda-beda yaitu 3, 5, 7, dan 9. Hasil akurasi tertinggi yang
didaptkan adalah 50%. Sedangkan untuk hasil pengujian identifikasi sebesar 83%.
PLAGIAT MERUPAKAN TINDAKAN TIDAK TERPUJI
ix
GLAUCOMA DETECTION
IN RETINAL FUNDUS IMAGE
USING K- NEAREST NEIGHBOR METHOD
ABSTRACT
Glaucoma is eye disease which is caused by high level or not normal eyes
pressure. One cause of being not normal eyes` pressure is the current of tears is clogged up,
so the lacking of tears` production happens. Glaucoma can be identified by observing at
the optic area from retinal fundus image. This thesis will be focusing on how glaucoma can
be identified by using retinal fundus image which is in glaucoma infected status and retinal
fundus image in normal or good.
The data that would be analyzed were retinal fundus image. The data was taken
from internet High-Resolution Fundus (HRF) Image Database. The data of this research
had 30 images, which 15 were infected by glaucoma image and the other 15 were normal.
This research was divided into 3 main processes; there were preprocessing, extraction of
characteristic, and identification. Preprocessing which was used like manual segmentation,
gray scaling and resize. For the extraction of characteristic used Gray Level Co-occurrence
Matrix (GLCM) method. Using GLCM method will get Co-occurrence matrix from image.
Then, the writer will find the Co-occurrence matrix features; those are contrast, correlation,
homogeneity and energy. Whereas to identify used K-Nearest Neighbor method.
This research was divided in two parts; those were dataset and test data. For the
dataset had 18 images and the test data had 12 images. The accurate calculation used 3 fold
cross Validation, where the data set was divided into 3 data groups with image composition
for each data group was 6. The accurate calculation and evaluation were done in 4 times by
different k point; those were 3, 5, 7 and 9. The high result of accuracy was 50%. Whereas
the result of test identification was 83%.
PLAGIAT MERUPAKAN TINDAKAN TIDAK TERPUJI
x
KATA PENGANTAR
Puji dan syukur penulis panjatkan kepada Tuhan Yang Maha Esa, sebab
berkat dan karunia yang diberikan-Nya penulis dapat menyelasikan tugas akhir
yang berjudul DETEKSI GLAUKOMA PADA CITRA FUNDUS RETINA
DENGAN METODE K-NEAREST NEIGHBOR dengan sebaik-baiknya.
Dengan selesainya tugas akhir ini penulis telah memenuhi salah satu syarat
memeroleh gelar Sarjana pada Program Studi Teknik Informatika Fakultas Sains
dan Teknologi Universitas Sanata Dharma.
Tidak lupa juga penulis ingin mengucapkan banyak-banyak terimakasih
kepada semua pihak yang telah ikut berpartisipasi dalam penyelesaian tugas akhir
ini. Ucapan terimakasih penulis berikan kepada:
1. Tuhan Yang Maha Esa yang senantiasa memberikan berkat, rahmat,
dan pencerahan selama proses menyelesaikan tugas akhir ini.
2. Ibu Dr. Anastasia Rita Widiarti selaku dosen pembibing sekaligus
kaprodi Teknik Informatika yang tidak bosan-bosanya senantiasa
memberikan bimbingan, pengarahan, semangat, dan pengetahuan
dalam proses penyelesaian tugas akhir ini dari awal hingga selesai.
3. Keluarga besar Bapak Tobias, yang selalu memberikan motivasi,
semangat, dan dukungan materi maupun non-materi.
4. Para sahabat kos Tasura 52, sahabat angkatan 2012 Teknik Informatika
Sanata Dharma, serta semua sahabat yang telah berpartisipasi dalam
memberikan dukungan motivasi, ilmu, semangat dan hiburan.
PLAGIAT MERUPAKAN TINDAKAN TIDAK TERPUJI
xi
PLAGIAT MERUPAKAN TINDAKAN TIDAK TERPUJI
xii
DAFTAR ISI
HALAMAN PERSETUJUAN ............................... Error! Bookmark not defined.
HALAMAN PENGESAHAN ................................ Error! Bookmark not defined.
HALAMAN PERSEMBAHAN ............................................................................ iv
PERNYATAAN KEASLIAN KARYA ................ Error! Bookmark not defined.
LEMBAR PERNYATAAN PERSETUJUAN PUBLIKASI KARYA ILMIAH
UNTUK KEPENTINGAN AKADEMIS ............................................................. vii
ABSTRAK ........................................................................................................... viii
ABSTRACT ........................................................................................................... ix
KATA PENGANTAR ............................................................................................ x
DAFTAR ISI .......................................................................................................... xi
DAFTAR GAMBAR ........................................................................................... xiv
DAFTAR TABEL ................................................................................................. xv
BAB I PENDAHULUAN ....................................................................................... 1
1.1. Latar Belakang ......................................................................................... 1
1.2. Perumusan Masalah .................................................................................. 2
1.3. Tujuan Penelitian ..................................................................................... 2
1.4. Pembatasan dan Ruanglingkup Permasalahan ......................................... 3
1.5. Metodologi Penelitian .................................................................