-
8/13/2019 3. Sifat , Numenklatur, Klasifikasi Virus UNDANA (1)
1/24
Sifat umum virus,
Nomenklatur Klasifikasi,Replikasi dan Reproduksi
Prof. Dr. Mochammad Hatta, Ph.D., SpMK (K)
Bagian Mikrobiologi,
Fakultas Kedokteran, Universitas HasanuddinMakassar
mochammad hatta@2013
-
8/13/2019 3. Sifat , Numenklatur, Klasifikasi Virus UNDANA (1)
2/24
TIU : Mahasiswa dapat melakukan penanganan
dan pencegahan terhadap kasus-kasus
infeksi mikrobial.
TIK : Mahasiswa dapat menjelasakan berbagai
aspek sifat virologi, numenklatur, klasifikasi,
replikasi dan reproduksinya secara umum
Pokok bahasan :
Sifat sifat virus
Numenklatur virus
Klasifikasi virus
Replikasi dan reproduksi virusmochammad hatta@2013
-
8/13/2019 3. Sifat , Numenklatur, Klasifikasi Virus UNDANA (1)
3/24
1. Terdiri atas DNA atau RNA
2. Struktur virus terdiri atas :
- Asam nukleat
- Kapsid
- Envelop3. Tidak memiliki ribosome
4. Virus tidak membelah secara
binary fission mochammad hatta@2013
-
8/13/2019 3. Sifat , Numenklatur, Klasifikasi Virus UNDANA (1)
4/24
5. Diameter 18 nm s.d 300 nm6. Bersifat parasitic intraselluler
7. Peka terhadap interferon8. Tidak peka terhadap antibiotik
9. Tak dapat dibiak dengan medium
biasa
mochammad hatta@2013
-
8/13/2019 3. Sifat , Numenklatur, Klasifikasi Virus UNDANA (1)
5/24
SIFAT FISIK KIMIA
Dirusak pd suhu 50o-60oC, 30 menit. Dpt
disimpan pd 4oC; -70oC; -170oC. penyimpanan
virus pada-170oC, pada NITROGEN TANK,
dicampur Dimetyl- Sulfoxida (DMSO) 5% untuk
menjagainfektivitasnya.
mochammad hatta@2013
-
8/13/2019 3. Sifat , Numenklatur, Klasifikasi Virus UNDANA (1)
6/24
Virus dpt distabilkan dgn menambahkan
- Mgcl2,MgSO4,Na2SO4
Stabilitas Virus penting pada pembuatan
vaksin. PH : 5.00 -9,00
Penyinaran :- Lampu ultra violet
- Sinar Xmenghilangkan aktifitas Virus
mochammad hatta@2013
-
8/13/2019 3. Sifat , Numenklatur, Klasifikasi Virus UNDANA (1)
7/24
Perbedaan sifat antara Bakteri, Virus,
Mikoplasma, Rickettsia dan Khlamydia
( - )( - )( - )DNA atau
RNa
( - )( - )( + )5. Virus
( + )( + )( + )( + )( - )( - )4. Khlamydia
( + )( + )( + )( + )( - )( - )3. Rickettsia
( + )( + )( + )( + )( + )( - )2. Mikoplasma
( + )( + )( + )( + )( + )( - )1. Bakteri
Sensitifterhadapantibiotik
MemilikiRibosome
MemilikiDNA danRNA
Berkembangsecaramembeladiri
Tumbuh padamedium biasa( non living )
Sensitifterhadapinterferon
Organisme
mochammad hatta@2013
-
8/13/2019 3. Sifat , Numenklatur, Klasifikasi Virus UNDANA (1)
8/24
mochammad hatta@2013
-
8/13/2019 3. Sifat , Numenklatur, Klasifikasi Virus UNDANA (1)
9/24mochammad hatta@2013
-
8/13/2019 3. Sifat , Numenklatur, Klasifikasi Virus UNDANA (1)
10/24mochammad hatta@2013
-
8/13/2019 3. Sifat , Numenklatur, Klasifikasi Virus UNDANA (1)
11/24
Fungsinya1.Melindungi asam Nukleat2. Mediator Adsorbsi dan penetrasi virus,
melalui interaksi dgn membran reseptor.Komposisi :Terdiri atas kumpulanprotomer/kapsomer yang membentukrantai polypeptide- unit struktural terdiri atas monomeric( single repeating polypeptide chain ) ataupolymeric ( dapat ) sampai enam
polipeptide yang berbedamochammad hatta@2013
-
8/13/2019 3. Sifat , Numenklatur, Klasifikasi Virus UNDANA (1)
12/24
SIMETRI KAPSID terdiri atas 3 jenis yaitu :
1. Helical Nucleo Caps id- Asam nukleat dikelilingi oleh protomer molekul protei
yang tersusun secara helical
-Semua human viruses dengan helical symetri memi-liki envelop termasuk :
Corona virus, Rabdovirus dan arenavirus
- Helical symetri memberi bentuk rod like appearence
( menyerupai batang )mochammad hatta@2013
-
8/13/2019 3. Sifat , Numenklatur, Klasifikasi Virus UNDANA (1)
13/24
2. Icosahedral Nucleo Capsid
- Asam nukleat dikelilingi Kapsomer yang
tersusun secara icosahedron
- Umumnya virus dengan icosahedral symetri
adalah naked ( tidak memiliki envelop ) ,
kecuali :Togavirus, Herpes virus, Retrovirusdan Falxivirus
- Icosahedral virus memberi bentuk sphere like
Appearance3. Complex symetri -------- bentuknya tak
beraturan.
Naked virus resisten terhadap eter
mochammad hatta@2013
-
8/13/2019 3. Sifat , Numenklatur, Klasifikasi Virus UNDANA (1)
14/24
1. KAPSID: Kulit protein yang simetris, yang menutupigenom asam Nucleat, yang merupakan kesatuan
kapsomer/protomer
2. NUKLEO KAPSID
Kapsid bersama asam nukleat
3. KAPSOMER Satuan unit morfologik yang terlihat
pada permukaan partikel virus simetris
ikosahedral yang merupakan kumpulan berbagai
jenis Polypeptide mochammad hatta@2013
-
8/13/2019 3. Sifat , Numenklatur, Klasifikasi Virus UNDANA (1)
15/24
4. Protomer : satuan unit morfologik pada
permukaan partikel virus semetris helikal yang
tersusun dari satu jenis polipeptida
5. VIRION=nukleo kapsid
Partikel virus yang infektif
6. TRANSKRIPSI
Proses sintesis molekul mRNA dengan menggunakan
DNA/RNA sebagai template.
mochammad hatta@2013
-
8/13/2019 3. Sifat , Numenklatur, Klasifikasi Virus UNDANA (1)
16/24
7. TRANSLASI : pembentukan protein dari
urutan asam amino spesifik berdasarkan
urutan basa tertentu pada mRNA.
8. MESSENGER RNA (mRNA)
RNA yang digunakan untuk mengirimkan
informasi dari gen pada DNA/RNA keribosome untuk pembuatan protein.
mochammad hatta@2013
-
8/13/2019 3. Sifat , Numenklatur, Klasifikasi Virus UNDANA (1)
17/24
1. Jenis asam Nucleat :RNA atau DNA;beruntai
tunggal atau ganda; cara Replikasi
2. Ukuran dan morfologi, termasuk tipe simetri, danadanya selaput.
3. Adanya enzim-enzim spesifik, terutama
polimerase RNA atau DNA.
4. Kepekaan terhadap zat kimia dan keadaan fisik,
terutama E T ER
mochammad hatta@2013
-
8/13/2019 3. Sifat , Numenklatur, Klasifikasi Virus UNDANA (1)
18/24
5. Sifat-sifat IMUNOLOGIK
6. Cara-cara penyebaran alamiah
7. Daya tarik tuan rumah, jaringan dan sel
8. PATOLOGI, termasuk pembentukan Badan
INKLUSI
9. Gejala-gejala
mochammad hatta@2013
-
8/13/2019 3. Sifat , Numenklatur, Klasifikasi Virus UNDANA (1)
19/24
Classification of Human Viruses
"Group" Family Genome Genome size (kb) Capsid Envelope
dsDNA
Poxviridae dsDNA, linear 130 to 375 Complex YesHerpesviridae dsDNA, linear 124 to 325 Icosahedral Yes
Adenoviridae dsDNA, linear 36 to 38 Icosahedral No
Polyomaviridae dsDNA, circular 5.0 Icosahedral No
Papillomaviridae dsDNA, circular 8.0 Icosahedral No
ssDNA
Parvoviradae ssDNA, linear, (- or +/-) 5.0 Icosahedral No
Retro
Hepadnaviridae dsDNA (partial), circular 3.2 Icosahedral YesRetroviridae ssRNA (+), diploid 7 to 11 Icosahedral Yes
ssRNA (+)
Picornaviridae ssRNA (+) 7.2 to 8.4 Icosahedral No
Noroviridae ssRNA (+) 7.2 to 7.9 Icosahedral No
Coronaviridae ssRNA (+) 20 to 30 Helical Yes
Flaviviridae ssRNA (+) 9.5 to 12.5 Spherical Yes
Togaviridae ssRNA (+) 9.7 to 11.8 Spherical Yes
ssRNA (-)Filoviridae ssRNA (-) 19.1 Helical Yes
Paramyxoviridae ssRNA (-) 16 to 20 Helical Yes
Rhabdoviridae ssRNA (-) 13 to 16 Helical Yes
Orthomyxoviridae ssRNA (-), segmented 10 to 13.6 Helical Yes
Bunyaviridae ssRNA (-, ambi), segmented 11 to 21 Helical Yes
Arenaviridae ssRNA (-, ambi), segmented 10 to 14 Helical Yes
dsRNA
Reoviridae dsRNA, segmented 16 to 27 Icosahedral No
mochammad hatta@2013
-
8/13/2019 3. Sifat , Numenklatur, Klasifikasi Virus UNDANA (1)
20/24
Major diseases caused by human viruses
"Group" Family Human pathogens (disease)
dsDNA
Poxviridae Variola (smallpox); Orf (pustular dermatitis); Molluscum contagiosum (pustular dermatitis)
Herpesviridae
Herpes simplex 1,2 (oral, genital herpes); Varicella-zoster (chickenpox); Epstein-Barr (mononucleosis);Cytomegalovirus (neonatal abnormalities); HHV6 (roseola); HHV8 (Kaposi's sarcoma)
Adenoviridae Adenovirus (respiratory infection, conjunctivitis)
Polyomaviridae Polyomavirus (benign kidney infection, respiratory disease, leukoencephalopathy)
Papillomaviridae Papillomavirus (warts, genital carcinoma)
ssDNA
Parvoviradae B-19 (fifth disease, fetal death)
Retro
Hepadnaviridae Hepatitis B ("serum" hepatitis)
Retroviridae HIV (aids); HTLV (leukemia)
ssRNA (+)
Picornaviridae Poliovirus (polio), rhinovirus (URI), Hepatitis A ("infectious" hepatitis)
Noroviridae Norwalk (gastroenteritis)
Coronaviridae Coronavirus (respiratory infection)
Flaviviridae Yellow fever virus (yellow fever); Hepatitis C (hepatitis)
Togaviridae Eastern Equine encephalitis virus (encephalitis); Rubella virus (rubella)
ssRNA (-)
Filoviridae Ebola virus (ebola)Paramyxoviridae Parainfluenza virus (respiratory infection); Mumps virus (mumps);
Respiratory syncytial virus (respiratory infection); Measles virus (measles)
Rhabdoviridae Rabies virus (rabies)
Orthomyxoviridae Influenza virus (influenza)
Bunyaviridae Hantaan virus (hemorrhagic fever with renal syndrome)
Arenaviridae Lassa fever virus (hemorrhagic fever)
dsRNA
Reoviridae Rotavirus (infantile gastroenteritis)
mochammad hatta@2013
-
8/13/2019 3. Sifat , Numenklatur, Klasifikasi Virus UNDANA (1)
21/24
1. Penyakit sistim saraf
2. Penyakit saluran pernafasan
3. Penyakit setempat pada kulit4. Penyakit mata
5. Penyakit hati
6. Penyakit kelenjar ludah
7. Penyakit saluran pencernaan
mochammad hatta@2013
-
8/13/2019 3. Sifat , Numenklatur, Klasifikasi Virus UNDANA (1)
22/24mochammad hatta@2013
-
8/13/2019 3. Sifat , Numenklatur, Klasifikasi Virus UNDANA (1)
23/24
REPLIKASI DNA VIRUS
1.ADSORPSI 2.PENETRASI
3.PELEPASAN SELUBUNG
4.TRANSKRIPSI AWAL ( m-RNA) 5.TRANSLASI AWAL
6.REPLIKASI DNA VIRUS
7.TRANSKRIPSI LAMBAT ( m-RNA)
8. TRANSLASI LAMBAT
9.PEMBENTUKAN VIRION
10.PELEPASAN VIRUS BARU
mochammad hatta@2013
-
8/13/2019 3. Sifat , Numenklatur, Klasifikasi Virus UNDANA (1)
24/24
Replication
of Virus