BEAUCOUP de gènes et PEU d’épistasie
Modèle additif multi-locus
Les expériences de réponse à long terme à la sélection
« Illinois Long Term Selection Corn Experiment »Dudley & lambert, 1992.
Le polymorphisme permettant une réponse soutenue à la sélection est:
• Infini (modèle infinitésimal)
• Caché (linkage)
• Régénéré régulièrement (mutations)
+ dérive génétique
+ mutations
+ linkage
Yoo, 1980
(D’après les données de Yoo, 1980)
Générations
Rép
onse
à la
sél
ecti
onLes modèles de réponse à long terme à la sélection
Mod
èle in
finité
simal
popu
latio
ns in
finies
Fisher, 1930
Robertson, 1960
Hill, 1982Weber and Diggins, 1990
Lynch and Walsh, 200x
Bulmer, 1971Chevalet, 1988
Comment est structuré le polymorphisme sélectionné le long du génome ?
Réserve de polymorphisme dans des segments à forte densité de gènes ?• à court terme / dans une population ?• à long terme ?
Thèse Emmanuelle Della-Chiesa
Le polymorphisme est caché (linkage)
Effet Bulmer (1971)
P=X1+X2sélection
X2
X1
P=seuilX2
X1
Cov(X1,X2)<0
P= G + E = iXi + E
Var(G) = i Var(Xi) + ij Cov(Xi , Xj)
Var(G) = Vg + C (C<0)
La variance disponible pour la sélection est réduite
Déséquilibre de liaison entre paires de locus
« fortement »négatif entre locus proches
« moinsfortement »négatif entre locus éloignés
Effet Hill-Robertson (1966)
Dérive génétique+
Liaison+
Sélection des allèles favorables
Augmentation de la probabilité de fixation des allèles défavorables
La recombinaison restaure la variance « cachée »
recombinaison
mutation?
Hospital & Chevalet, Genetical Research, 1996.
SA
NS
M
UT
AT
ION
AV
EC
MU
TA
TIO
NDistances entre locus
• Répartition aléatoire du polymorphisme
• Répartition observée sous sélection
Indice d’agrégation au cours du temps
t=50
t=0
t=200
t=50
t=0
t=200
Structuration du polymorphisme sélectionné
• A court terme, agrégation transitoire du polymorphisme dans une population– Importance en sélection artificielle (SAM)
• Faible impact sur le maintien du polymorphisme avec mutation-sélection– Fixations successives de mutations +/- indépendantes
• Effets sur la divergence entre populations ?
Impact de l’histoire sélective des populations sur l’architecture apparente des caractères quantitatifs
population
Lignée H’
Lignée H
Lignée L
sélection
CroisementDétection QTL
CroisementDétection QTL
Divergence entre lignées HH’: