Download - Cluster Analisis NTSYS Jorge Jue 28
Manual de NTSYSManual de NTSYSy análisis de taxonomía numéricay análisis de taxonomía numérica
Jorge NúñezJorge NúñezEditado por Daniel AndradeEditado por Daniel Andrade
Matriz de datos Matriz de datos y su conversión al formato NTSYSy su conversión al formato NTSYS
Datos (Score) en Microsoft ExcelDatos (Score) en Microsoft Excel
Grabar como Microsoft Excel 4.0 WorksheetGrabar como Microsoft Excel 4.0 Worksheet
Colocar los parametros de la matrizColocar los parametros de la matriz
Tipo de matrizTipo de matriz
Colocar los parametros de la matrizColocar los parametros de la matriz
150
mar
cado
res
150
mar
cado
res
Colocar los parametros de la matrizColocar los parametros de la matriz
128 entradas128 entradas
Grabar y cerrarGrabar y cerrar
Abrir el NTeditAbrir el NTedit
Importar el archivo excelImportar el archivo excel
SeleccionarSeleccionary abriry abrir
Matriz abiertaMatriz abierta
Guardar matrizGuardar matriz
Grabar como archivoGrabar como archivoNTSYSNTSYS
Nombrar el archivoNombrar el archivoy grabary grabar
Análisis de SimilitudAnálisis de Similitud
Abrir el programaAbrir el programaNTSYSNTSYS
Ingresar a SimQualIngresar a SimQual
Seleccionar Seleccionar la ventana “similarity”la ventana “similarity”
Ingresar Ingresar a “SimQual”a “SimQual”
Ingresar el archivo de datos“Click”“Click”
Ingresar el archivo de datos
Seleccionar el archivo Seleccionar el archivo y abriry abrir
Seleccionar el índice de similitudSeleccionar el índice de similitud
Nombrar el archivo de salidaNombrar el archivo de salida
“Click”“Click”
DICE archivo.NTSDICE archivo.NTS
Nombrar el archivo Nombrar el archivo y grabary grabar
SM archivo.NTSSM archivo.NTSJAC archivo.NTSJAC archivo.NTS
OperarOperar
“Click”“Click”
ReporteReporte
Análisis de AgrupamientoAnálisis de Agrupamiento
Ingresar a SAHNIngresar a SAHN
Seleccionar Seleccionar la ventana “Clustering”la ventana “Clustering”
Ingresar Ingresar a “SAHN”a “SAHN”
Ingresar el archivo de datosIngresar el archivo de datos
“Click”“Click”
Seleccionar el archivo Seleccionar el archivo y abriry abrir
Nombrar el archivo de salidaNombrar el archivo de salida
“Click”“Click”
Nombrar el archivo Nombrar el archivo y grabary grabar
NJ DICE archivo.NTSNJ DICE archivo.NTSUPGMA DICE archivo.NTSUPGMA DICE archivo.NTS
Seleccionar el método de agrupamientoSeleccionar el método de agrupamiento
Seleccione o no “Find” Seleccione o no “Find” para obtener los resultados de los empatespara obtener los resultados de los empates
Indique el número de resultados que desea obtenerIndique el número de resultados que desea obtenery operary operar
Indique elIndique elNumero de resultadosNumero de resultados“Click”“Click”
ReporteReporte
Obtención del DendogramaObtención del Dendograma
Ingresar a GraphicsIngresar a Graphics
Seleccionar Seleccionar la ventana “Grafics”la ventana “Grafics”
Ingresar Ingresar a “Tree plot”a “Tree plot”
Selección del archivoSelección del archivo
“Click”“Click”
Seleccionar el archivo Seleccionar el archivo y abriry abrir
OperarOperar
“Click”“Click”
ReporteReporte
El DendogramaEl Dendograma
Edición del DendogramaEdición del Dendograma
Abrir “Plot Options...”Abrir “Plot Options...”
“Titles”, “labels” y “lines”“Titles”, “labels” y “lines”
OTUs por pagina (cont...)OTUs por pagina (cont...)
OTUs por pagina (cont...)OTUs por pagina (cont...)
128 Solanum phureja150 alelos marcadores SSR
Coefficient0.43 0.58 0.72 0.86 1.00
703800 703812 703767 703278 701570 702287 705328 705812 705811 704208 705253 705314 706023 703508 705803 703545 705498 705438 705378 705299 703507 705269 705809 704060 701025 703587 706166 703596 703547 705262
El eje “x”El eje “x”
128 Solanum phureja150 alelos marcadores SSR
Coefficient0.43 0.58 0.72 0.86 1.00
703800 703812 703767 703278 701570 702287 705328 705812 705811 704208 705253 705314 706023 703508 705803 703545 705498 705438 705378 705299 703507 705269 705809 704060 701025 703587 706166 703596 703547 705262
Análisis CofenéticoAnálisis Cofenético
Ingresar a CophIngresar a Coph
Ingresar Ingresar a “Coph”a “Coph”
Seleccionar Seleccionar la ventana “Clustering”la ventana “Clustering”
Ingresar el archivo obtenido en el analisis de agrupamientoIngresar el archivo obtenido en el analisis de agrupamiento
“Click”“Click”
Seleccionar el archivo Seleccionar el archivo y abriry abrir
Nombrar el archivo de salidaNombrar el archivo de salida
“Click”“Click”
Nombrar el archivo Nombrar el archivo y grabary grabar
Coph NJ DICE archivo.NTSCoph NJ DICE archivo.NTSCoph UPGMA DICE archivo.NTSCoph UPGMA DICE archivo.NTS
OperarOperar
“Click”“Click”
ReporteReporte
Matriz cofenéticaMatriz cofenética
Correlación entre dos matricesCorrelación entre dos matrices
Ingresar a MxCompIngresar a MxComp
Seleccionar Seleccionar la ventana “graphics”la ventana “graphics”
Ingresar Ingresar a “MxComp”a “MxComp”
Ingresar el primer archivo de la matriz de similitud Ingresar el primer archivo de la matriz de similitud
“Click”“Click”
AbrirAbrirSeleccionar el archivo ySeleccionar el archivo y
Ingresar el segundo archivo de la matriz de similitud Ingresar el segundo archivo de la matriz de similitud
“Click”“Click”
AbrirAbrirSeleccionar el archivo ySeleccionar el archivo y
OperarOperar
“Click”“Click”
ReporteReporte
r = 0.87r = 0.87
LevelLevel InterpretationInterpretation
0.9 0.9 ≤≤ rr Muy buenaMuy buena
0.8 0.8 ≤≤ r < 0.9r < 0.9 BuenaBuena
0.7 0.7 ≤≤ r < 0.8r < 0.8 PobrePobre
r < 0.7r < 0.7 Muy pobreMuy pobre
Gráfico de la correlaciónGráfico de la correlación
Gracias!Gracias!