![Page 1: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/1.jpg)
Epigenetik Mekanizmalar Nedir?
F. Belgin ATAÇ (Ph.D)
Başkent Üniversitesi Tıp Fakültesi
Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı
52. Ulusal Diyabet Kongresi
21 Nisan 2016
![Page 2: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/2.jpg)
Epigenetik
DNA’nın baz diziliminde herhangi bir değişiklik yapmaksızın şeker fosfat omurgası üzerindeki değişimlerle gen ifadelenme biçiminin değişmesi
![Page 3: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/3.jpg)
![Page 4: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/4.jpg)
Santral dogma
![Page 5: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/5.jpg)
Biyokimyasal Analizler
Etkilenmiş Doku
DNA tanı amaçlı kullanımı
![Page 6: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/6.jpg)
Santral dogma
![Page 7: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/7.jpg)
Transkripsiyon
![Page 8: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/8.jpg)
TF
Promotör
Transkripsiyon
RNA Polimeraz
![Page 9: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/9.jpg)
Her transkiptten protein sentezi olmaz
Protein
PROTEİN KODLAYICI GENLERİN İFADESİNİ DÜZENLER
![Page 10: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/10.jpg)
İnsan Genom Projesi
• Hastalıkların yeniden sınıflandırılması gerçekleşti
• Yeni tanı yöntemleri gelişti
![Page 11: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/11.jpg)
?
Çok hücreli organizmalar aynı genomdan oluşan farklılaşmış hücrelerin belirli bir düzen içinde yerleşmesi ile ortaya çıkan karmaşık bir hücre kümesidir Her protein her dokuda aktif değil
![Page 12: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/12.jpg)
Gen İfadelenme
Haptoglobin 8,815.24
Fibrinojen, gamma 6,639.08
Fibrinojen, beta 6,578.81
Alfa 1 mikroglobulin 6,559.68
Alfa-1 tripsin inhibitör 5,996.51
Koagulasyon faktör 22 4,415.56
Kompleman faktör I 4,244.34
Apolipoprotein C-I 5,176.36
Sitokrom P450, 1a2 4,133.49
Komplement bileşeni 9 4,387.86
Uromodülin 4,558.93
Böbrek özgü protein 2,826.43
Defensin beta 1 2,129.96
Böbrek özgü kaderin
Klor kanal 1
1,445.64
1,444.95
Aquaporin 2
1,310.87
Gen İfadelenme Pankreatik elastaz IIB 27,712
Elsetaz 1 öncülü 34,596
Safra tuzunun stimüle
ettiği lipaz 15,430
Pankreatik lipaz
35,592
İnsulin 4,256
Doku/Organlara Özgü Gen İfadesi
«Genomik İmza»
![Page 13: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/13.jpg)
![Page 14: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/14.jpg)
Seslilik ve Sesizlik
• Farklı gen setleri işlevsel olur
![Page 15: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/15.jpg)
Zigot
![Page 16: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/16.jpg)
Kanıtlar
1. Fibroblastlar veya lenfositler gibi farklılaşmış hücreler, mitoz bölünmede fenotiplerini korur
2. Monozigotik ikizlerin hastalıklara genetik yatkınlıklarının farklıdır
![Page 17: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/17.jpg)
3. Özelleşmiş hücrelerin oluşumu
![Page 18: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/18.jpg)
(1975) DNA metilasyonu ile gen ekspresyonunun baskılanması «Silent remembrance»
![Page 19: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/19.jpg)
Epigenetik Mekanizmalar
–DNA metilasyonu – Histon modifikasyonları,
– Kromatin yeniden modelleme
– Mikro-RNA‘dır.
![Page 20: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/20.jpg)
DNA yapısında bulunan nükleotidler
![Page 21: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/21.jpg)
DNA Metilasyonu DNA’ya Diziye Özgü Bağlanan Proteinlerin Afinitesini Etkiler
![Page 22: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/22.jpg)
Epigenetik bilgi mitoz bölünmede aktarılır farklılaşmış fenotipi korur
Yeni CH3 Grupları
Metillenmemiş homolog
Mitoz
Metillenmiş homolog
![Page 23: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/23.jpg)
DNA metilasyonu
inhibitörü
MDS için klinik kullanıma girdi
![Page 24: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/24.jpg)
↑ 𝐝𝐨𝐳 𝐦etil donörü besin ile beslenen annenin yavrusu
![Page 25: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/25.jpg)
![Page 26: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/26.jpg)
![Page 27: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/27.jpg)
Dutch Hunger Winter
![Page 28: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/28.jpg)
• Beslenme < 700 cal
• Intaruterine yaşamda kalori kısıtlamasına maruz kalanlar;
– DM, KVH ve obesite yatkın
– Epidemiyolojik çalışmalar halen devam etmekte
![Page 29: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/29.jpg)
• F1 famine exposure in utero was, however, associated with increased F2 neonatal adiposity and poor health in later life. Our findings may imply that the increase in chronic disease after famine exposure in utero is not limited to the F1 generation but persists in the F2 generation.
![Page 30: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/30.jpg)
NE YİYORSAN O’SUN!
Yediklerin ve yaşam tarzın torunlarını da etkiler
![Page 31: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/31.jpg)
Epigenetik Mekanizmalar
– DNA metilasyonu
–Histon modifikasyonları – Kromatin yeniden modelleme
– Mikro-RNA‘dır.
![Page 32: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/32.jpg)
![Page 33: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/33.jpg)
Çekirdeğe nasıl sığar?
![Page 34: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/34.jpg)
NÜKLEOZOM
![Page 35: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/35.jpg)
Nükleozom bileşenleri
Histon proteinler
• Arjinin, lizin (+)
DNA
Negatif yük
![Page 36: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/36.jpg)
![Page 37: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/37.jpg)
![Page 38: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/38.jpg)
Hiperkondensasyon kromatini sessizleştirir
Ökromatin Aktif gen
bölgeleri
Heterokromatin
Gen içermezler yada baskılanmış genleri içerirler
![Page 39: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/39.jpg)
• İyonik denge
• Histon-DNA ilişkisini etkiler
![Page 40: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/40.jpg)
Histon asetilaz X Deasetilazların transkripsiyonel regülasyondaki işlevi
![Page 41: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/41.jpg)
Histon Asetilasyonu
Grup : (CH3CO)
Enzim :Histon asetil transferaz (HAT)
Amaç : HİSTON’un DNA’ya olan afinitesini bozmaktır
Etkisi : Lizin –DNA ilişkisi bozulur
Sonuç : Kromatinde gevşeme
Transkripsiyon
Kondanse kromatin
Gevşemiş kromatin
Asetil Histon deasetilaz (HDAC)
![Page 42: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/42.jpg)
HDAC inhibitörleri ile ilgili çalışmalar devam etmektedir.
Seçicilik
![Page 43: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/43.jpg)
Aynı gen kalıbından bu kadar farklı fenotipik değişiklik nasıl olur?
![Page 44: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/44.jpg)
Histon kodu : Kombine modifikasyonlara bağlı olarak transkripsiyonel durumu belirler.
Metillenme-Arginin (R)
Metillenme- Lizin (K)
Fosforlanma -Serin (S)
Ubikütinlenme -Lizin (UB)
![Page 45: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/45.jpg)
• Gen regüle edici proteinlerin kromatin ile etkileştiği
![Page 46: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/46.jpg)
Bromodomain – asetile lizini Represör bağlanamaz transkripsiyona açık
Kromodomain- metil Transkripsiyona kapalı
Metil
İnaktif gen
![Page 47: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/47.jpg)
Epigenetik Mekanizmalar
– DNA metilasyonu
– Histon modifikasyonları
–Kromatin yeniden modelleme
– Mikro-RNA‘dır.
![Page 48: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/48.jpg)
Kromatin Yeniden Modellenmesi
• Dinamik yapıdadır
• Nükleozom, yapısında ya da lokalizasyonyonunda değişir
Kromatin yeniden modelleme kompleksi
Yeniden modellenmiş nükleozomlar
Standart nükleozomlar
![Page 49: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/49.jpg)
Kromatinin yeniden şekillenmesi transkripsiyon aktivasyonuna yol açar
Kromatin Yeniden modellenmesi promotörü açabilir
RNA Polimeraz
Promotör
DNAz duyarlı bölgeler
Promotör
DNAz duyarlı bölgeler
Promotör Nükleozom
Histon
![Page 50: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/50.jpg)
Yaşam boyu değişim gösterir
![Page 51: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/51.jpg)
PNAS, 2005
![Page 52: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/52.jpg)
![Page 53: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/53.jpg)
Epigenetik değişikliklerin genetik
değişimlerden farkı nedir?
• Geri dönüşümlü oluşları
• DNA’nın baz dizisinde bir değişime neden olmamaları
![Page 54: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/54.jpg)
Bora S. ve ark., Mol . Biol 2015
![Page 55: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/55.jpg)
Güncel besinlerin epigenetik mekanzimalar üzerindeki etkisi?
Brokoli - Histon asetilasyonu
Soya - DNA metilasyonu
Yeşil çay - DNA metilasyonu
Safran - DNA metilasyonu
![Page 56: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/56.jpg)
Epigenetik Mekanizmalar
– DNA metilasyonu
– Histon modifikasyonları
– Kromatin yeniden modelleme
– Mikro-RNA
![Page 57: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/57.jpg)
![Page 58: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/58.jpg)
![Page 59: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/59.jpg)
6 metil Adenozin modifikasyonu
![Page 60: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/60.jpg)
5’ şapkalama
İntron- ekzon çıkartılması
Poli A kuyruğu ilavesi
Ökaryotik mRNA
![Page 61: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/61.jpg)
• FTO nükleer bir protein, demetilaz
• FTO ↑ 6mA↓ → mRNA modifikasyonunda işlevsel
• GWAS çalışmaları FTO’nun DM ve obesite ile ilişkisi bildirildi
• FTO knockout çalışmaları ile hücresel metabolizmadaki önemini ortaya koydu
• ??
RNA modifikasyonları da epigenetik belirteç olarak sınıflandırılmasının mümkün
Liu N., Pan T. Translational Research, 2016
![Page 62: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/62.jpg)
Hastalık tablosu
Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar
METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi sendromu
METTL4 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Alkol bağımlılığı,alkoliklik
WTAP Metiltrasferaz mRNA kırpılması Wilm’s Tümör, Hypospadias, Sarkom, Kötü huylu mezotelyum, Sinoviyal sarkom
FTO Demetilaz Hücresel enerji homestazı
Obezite, diyabet,polikistik over sendromu, kalp krizi, kanser, alkolizm, zihinsel rahatsızlıklar, katarakt, hepatit
ALKBH5 Demetilaz Erkek fertilitesi Hipoksi, Smith-Magenis Sendromu
YTHDF1 m6A bağlanması mRNA kararlılığı Pankreatik kanser, pankreatit, dermatomiyozit
YTHDF2 m6A bağlanması mRNA kararlılığı Lösemi, renal hücre kanseri, meme kanseri
YTHDF3 m6A bağlanması
N/A N/A
ELAVL1 m6A bağlanması Apoptoz, mRNA kararlılığı
Kanser, lösemi, hepatit, alzaymır, anoksi, artrit, hipoksi, pankreatit, keratokon,larenjit, endotelit, prostatit
Liu N., Pan T. Translational Research, 2016
![Page 63: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/63.jpg)
RNA epigenetiği
![Page 64: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/64.jpg)
Epigenotipteki mutasyonlar
Epigenetik profilin nasıl kalıtılır
Genetik hastalıklar için yeni tedavi imkanlarının yaratılması mümkün olacaktır
![Page 65: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/65.jpg)
Özet
![Page 66: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/66.jpg)
Epigenetik mekanizma
Gen ifadelenme kontrolü
DNA aracılı DNA metilasyonu
Histon modifikasyonları Kromatin yeniden modelleme
RNA aracılı RNA i
6metil adenozin
DNA’nın baz diziliminde değişiklik olmaksızın
Epigenomik
![Page 67: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/67.jpg)
Epigenetik mekanizmalar
• Kalıtsal
• Geri dönüşümlü
• Yaşam boyu değişen
• Çevresel faktörlerden etkilenen
• mRNA regülasyonda rol oynar
Yaşamının iyileştirilmesi
![Page 68: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/68.jpg)
RNA aracılı epigenetik mekanizmalar ?
![Page 69: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/69.jpg)
Penetrans değişikliği gösteren kompleks hastalıkların patogenezi açıklanmasında katkı
Epigenetik mekanizmalar
![Page 70: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/70.jpg)
Epigenetik Mekanizmalar Nedir?
F. Belgin ATAÇ (Ph.D)
Başkent Üniversitesi Tıp Fakültesi
Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı
52. Ulusal Diyabet Kongresi
21 Nisan 2016
![Page 71: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/71.jpg)
Yeniden Programlama
![Page 72: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/72.jpg)
![Page 73: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/73.jpg)
![Page 74: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/74.jpg)
![Page 75: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/75.jpg)
Normal kromatin yapısı transkripsiyonu yavaşlatır.
![Page 76: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/76.jpg)
Genomik imprinting nedeni ile ayni ebeveynden gelen genler seçici olarak sessizleştirilir
• 1980lerde , in vitro fertilizasyon deneyleri iki dişiden gelen pronükleusun canlı embriyo vermediğini gösterdi
![Page 77: Epigenetik Mekanizmalar Nedir? - diabetcemiyeti.org · Hastalık tablosu Gen Fonksiyon Fenotip İlişkili olduğu Hastalıklar METTL3 Metiltransferaz Apoptoz, gelişim Prostat,Aicardi](https://reader030.vdocuments.pub/reader030/viewer/2022012323/5cb4c8a888c993185b8be796/html5/thumbnails/77.jpg)