I.DENEYSEL SİNİRBİLİM YÖNTEMLERİ KURSU 3-25 NİSAN 2017
AZİZ SANCAR DENEYSEL TIP ARAŞTIRMA ENSTİTÜSÜ
SİNİRBİLİM ANABİLİM DALI
İSTANBUL ÜNİVERSİTESİ
İSTANBUL, TÜRKİYE
İ.Ü. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi,
Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı,
Beyin ve Nörodejeneratif Hastalıklar Araştırma Ünitesi
Katkılarıyla…
Sevgili Meslektaşlarımız
Organizasyon komitesi olarak bu yıl 3-26 Nisan 2017 tarihleri arasında ilkini
düzenleyeceğimiz 1. Deneysel Sinirbilim Yöntemleri Kursuna sizleri davet
etmekten onur duyarız. Ülkemizde son yıllarda önemi giderek artan sinirbilimin
gelişimine katkıda bulunmak, temel ve güncel yöntemler konusunda bu alanda
çalışanlara ve ilgi duyanlara bilgi aktarımına yardımcı olmak temel hedeflerimiz.
Bu kursumuzda 3 temel alanda eğitim modülü hazırladık. Bu modüller sırası ile
“Temel Hücre Kültürü Teknikleri ve Primer Nöron Kültürü Kursu”,
“Teorik ve Uygulamalı Nörogenetik Kursu” ve “Teorik ve Uygulamalı
Nöroimmünoloji Kursu”’dur. Hedefimiz ilerdeki yıllarda sinirbilim ile ilgili alt
çalışma alanlarını genişletmek ve içeriğini daha da zenginleştirmektir. Sizlerden
alacağımız geri dönüşler ve istekler bu konuda bizlere yol gösterecektir.
Sınırlı sayıda katılımın olacağı bu kursumuzun sizler için yeterli ve keyifli
olmasını diler, İstanbul Üniversitesi, Aziz Sancar DETAE, Sinirbilim AD,
organizasyon komitesi olarak sevgi ve saygılarımızı sunarız.
Prof. Dr. Erdem TÜZÜN
Organizasyon Komitesi
ABACI Neslihan
ÇAKİRİS Aris
DURSUN Erdinç
EKMEKÇİ Sema Sırma
EMRENCE Zeliha
GEZEN-AK Duygu
KÜÇÜKALİ Cem İsmail
ORHAN Nurcan
PAÇAL Ferda Perçin
ULUSOY Canan Aysel
YILMAZ Vuslat
YILMAZ Canan Uğur
Bilimsel Komite
ABACI Neslihan, Doç. Dr.
ERGÜL Emel, Doç. Dr.
EKMEKÇİ Sema Sırma, Doç. Dr.
DURSUN Erdinç, Doç. Dr.
GEZEN-AK Duygu, Doç. Dr.
KÜÇÜKALİ Cem İsmail, Yrd. Doç. Dr.
ÖZKÖK Elif, Prof. Dr.
TÜZÜN Erdem, Prof. Dr.
YILMAZER Selma, Prof. Dr.
Kurs Sekreteri
YILMAZ Canan Uğur
Kurs Sekreter Asistanları
Ece AKBAYIR
Melis ŞEN
BİLİMSEL KONULAR
Nörogenetik
Hücre Kültürü
Primer Nöron Kültürü
Nöroimmünoloji
ÖNEMLİ TARİHLER
Kurs Adı Kurs Sorumlusu KDV Dahil Fiyat Kurs Tarihi
Öğrenci Uzman
Teorik ve Uygulamalı
Nöroimmünoloji
Prof. Dr. Erdem Tüzün 400 TL 600 TL 3-8 Nisan 2017
Temel Hücre Kültürü ve Primer
Nöron Kültürü
Yrd. Doç. Dr. Cem İsmail Küçükali
750 TL 1000 TL 17-21 Nisan 2017
Teorik ve Uygulamalı Nörogenetik
Prof. Dr. Elif Özkök 300 TL 500 TL 24-25 Nisan 2017
Ön Kayıt : Kurslara katılım kontenjanla sınırlıdır. Ön kayıt mail yolu ile yapılacaktır. Bu safhadaki değerlendirmede başvuru sırası esas alınacaktır. Olumlu yanıt alanlar kayıt döneminde ilgili hesaba parasını yatırıp, dekontu mail yolu ile gönderecektir. Ön kayıt dönemi 15 Mart 2017 tarihinde başlayacak olup, her bir kurs için başlangıç tarihinin 5 gün öncesine kadar devam etmektedir.
Kayıt : Kayıt için olumlu yanıt alanlar 25 Mart 2017 tarihinden itibaren kurs ücretlerini ilgili hesaba yatırıp dekontlarını mail ile göndereceklerdir. Kayıt her bir kurs için, kursun ilk gününe kadar devam etmektedir.
Ödeme Şekilleri: İstanbul Üniversitesi Tıp Fakültesi, Aziz Sancar DETAE, Sinirbilim AD veya Halk Bankası Beyazıt Şubesi, Hesap No: 06200407 IBAN:TR060001200982000006200407 NOT:Banka yolu ile kayıt yapanlar açıklama kısmına ilgili kursu yazıp, dekontu mail ile yollayacaktır.
Sertifika Dağıtımı: Her Kursun Son Günü (Sınavları geçenler “BAŞARI”, geçemeyenler ise “KATILIM” sertifikası alacaklardır.)
YER
İstanbul Üniversitesi Tıp Fakültesi, DETAE Sinirbilim AD, İstanbul Üniversitesi Cerrahpaşa Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyoloji AD., Beyin ve Nörodejeneratif Hastalıklar Laboratuvarı
DİL
Türkçe
İLETİŞİM BİLGİLERİ
Telefon: (0212)4142000/33321
Mail: [email protected]
Teşekkür:
Kursumuzun hazırlığında, tanıtımında ve yapılmasında katkıda bulunan İ.Ü. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, Beyin ve Nörodejeneratif Hastalıklar Araştırma Ünitesi’ne, Nöroimmunoloji Derneği’ne ( NiMDER), Medsantek ve Molgen firmalarına katkılarından dolayı teşekkür ederiz.
Teorik ve Uygulamalı
Nöroimmünoloji
Kurs Programı
1.GÜN (3 Nisan 2017 Pazartesi) Saat Bilimsel Program Konuşmacı/Uygulayıcı Yer 09.00-09.10 Açılış Prof. Dr. Erdem TÜZÜN İ.Ü. Aziz Sancar Deneysel
Tıp Araştırma Enstitüsü (ASDETAE)
09.10-10.00 İmmünohistokimya (IHK) Teorik Eğitim Nöroimmünolojik Hastalıklar
ve Otoantikorların Tanısal Önemi
İHK Genel Bakış / Uygulamalar
ve Genel Protokol Epitop Açığa Çıkarma Non-spesifik Boyamanın
Önlenmesi Dondurulmuş Dokuda Çalışm Parafinli Dokuda Çalışma Hücrelerle Çalışma İF Genel Bakış / Uygulamalar
ve Genel Protokol Ko-lokalizasyon
Prof. Dr. Erdem TÜZÜN İ.Ü. Aziz Sancar Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü (ASDETAE)
10.00-10.15 Kahve arası 10.15-13.00 Uygulama
Deparafinizasyon Dehidratasyon Yıkama Antijen iyileştirme Blokaj Primer Antikor Uygulaması
Araş. Gör. Dr. Nurcan ORHAN
İ.Ü. Aziz Sancar Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü (ASDETAE)
13.00-14.00 Öğle yemeği 14.00-15.30 Uygulama
Sekonder Antikor Uygulaması
Kromojen Nukleus boyaması Dehidratasyon ve Kapama
Araş. Gör. Dr. Nurcan ORHAN
İ.Ü. Aziz Sancar Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü (ASDETAE)
15.30-17.00 Uygulama IF- fiksasyon Blokaj Primer antikor uygulaması
Araş. Gör. Canan Aysel ULUSOY
İ.Ü. Aziz Sancar Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü (ASDETAE)
2.GÜN (4 Nisan 2017 Salı)
Saat Bilimsel Program Konuşmacı/Uygulayıcı Yer
09.00-11.00 Uygulama
IF sekonder antikor uygulaması
Lamların kapatılması
Araş. Gör. Canan Aysel ULUSOY
İ.Ü. Aziz Sancar Deneysel
Tıp Araştırma Enstitüsü (ASDETAE)
11.00-11.15 Kahve arası
11.15-12.00 Uygulama
Görüntüleme
Araş. Gör. Canan Aysel ULUSOY
İ.Ü. Aziz Sancar Deneysel
Tıp Araştırma Enstitüsü (ASDETAE)
12.00-13.00 Öğle yemeği
13.00-15.00 ELISA
Teorik Eğitim
Araş. Gör. Canan Aysel ULUSOY
İ.Ü. Aziz Sancar Deneysel
Tıp Araştırma Enstitüsü (ASDETAE)
15.00-15.15 Kahve arası
15.15-16.30 Uygulama
Plate kaplama Yıkama Blokaj Örneklerin hazırlanması,
kuyulara konulması Gece boyu inkübasyon
Araş. Gör. Canan Aysel ULUSOY
İ.Ü. Aziz Sancar Deneysel
Tıp Araştırma Enstitüsü
(ASDETAE)
3.GÜN (5 Nisan 2017 Çarşamba)
Saat Bilimsel Program Konuşmacı/Uygulayıcı Yer
09.00-11.00 Uygulama Sekonder antikor
uygulanması Kit ile Elısa uygulanması
Araş. Gör. Canan Aysel ULUSOY
İ.Ü. Aziz Sancar Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü (ASDETAE)
11.00-11.15 Kahve arası 11.15-12.00 Uygulama
Yıkama Sonuçların okunması
Araş. Gör. Canan Aysel ULUSOY
İ.Ü. Aziz Sancar Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü (ASDETAE)
12.00-13.00 Öğle yemeği 13.00-15.00 Uygulama
Kit sekonder antikor uygulama
Araş. Gör. Canan Aysel ULUSOY
İ.Ü. Aziz Sancar Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü (ASDETAE)
15.00-15.30 Kahve arası 15.30-16.30 Uygulama
Yıkama Sonuçların okunması
Araş. Gör. Canan Aysel ULUSOY
İ.Ü. Aziz Sancar Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü (ASDETAE)
4.GÜN(5 Nisan 2017 Perşembe) Saat Bilimsel Program Konuşmacı/ Uygulayıcı Yer
09.00-10.30 Western Blot Teorik Eğitimi
Dr. Sevgin DEĞİRMENCİOĞLU Araş. Gör. Canan Aysel ULUSOY
İ.Ü. Aziz Sancar Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü (ASDETAE)
10.30-10.45 Kahve arası 10.45-12.00 Western Blot
Uygulama Örneklerin Hazırlanması
(Doku veya Hücre Ekstraktı) Protein Konsantrasyon
Ölçümü
Dr. Sevgin DEĞİRMENCİOĞLU Araş. Gör. Canan Aysel ULUSOY
İ.Ü. Aziz Sancar Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü (ASDETAE)
12.00-13.00 Öğle yemeği
13.00-14.30 Uygulama SDS-PAGE Elektroforez Proteinlerin Membrana Transferi (Blotlama) ve Ponceau S Boyama
Dr. Sevgin DEĞİRMENCİOĞLU Araş. Gör. Canan Aysel ULUSOY
İ.Ü. Aziz Sancar Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü (ASDETAE)
14.30-14.45 Kahve arası 14.45-17.00 Uygulama
Bloklama Primer Antikor ile
İnkübasyon Yıkama Sekonder Antikor ile
İnkübasyon
Dr. Sevgin DEĞİRMENCİOĞLU Araş. Gör. Canan Aysel ULUSOY
İ.Ü. Aziz Sancar Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü (ASDETAE)
17.00-17.15 Kahve arası 17.15-18.00 Uygulama
Yıkama Kemiluminesans Görüntüleme
Dr. Sevgin DEĞİRMENCİOĞLU Araş. Gör. Canan Aysel ULUSOY
İ.Ü. Aziz Sancar Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü (ASDETAE)
5.GÜN(7 Nisan 2017Cuma) Saat Bilimsel Program Konuşmacı/ Uygulayıcı Yer 09.00-10.30 Lenfosit Uyarım Testleri
Teorik Eğitimi Prof. Dr. Erdem TÜZÜN İ.Ü. Aziz Sancar Deneysel
Tıp Araştırma Enstitüsü (ASDETAE)
10.30-10.45 Kahve arası 10.45-12.00 Lenfosit Uyarım Testleri
Uygulama Lenfosit İzolasyonu Lenfositlerin Antijenik
Uyarımı
Uzm. Dr. Vuslat YILMAZ İ.Ü. Aziz Sancar Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü (ASDETAE)
12.00-13.00 Öğle yemeği 13.00-15.00
Uygulama CFSE İle Proliferasyon Tayini Sonuçların Değerlendirilmesi
Uzm. Dr. Vuslat YILMAZ
İ.Ü. Aziz Sancar Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü (ASDETAE)
15.00-15.15 Kahve arası 15.15-16.15 Sınav
16.15-17.15
Sınav Değerlendirilmesi
17.15-17.30 Sonuçlarının Açıklanması
Temel Hücre Kültürü Teknikleri
ve
Primer Nöron Kültürü
Kurs Programı
1.GÜN (17 NİSAN 2017 PAZARTESİ)
Saat Bilimsel Program Konuşmacı/Uygulayıcı Yer
09.00-09.10 Açılış Prof.Dr.Selma YILMAZER
Doç. Dr. Duygu GEZEN AK
Doç.Dr.Erdinç DURSUN
İ.Ü. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, Beyin ve Nörodejeneratif Hastalıklar Araştırma Laboratuvarı
09.10-10.15 Bir Hücre Kültürü Laboratuvarı Nasıl Olmalı?
Bir kültür laboratuvarında olması gereken fiziki koşullar.
Kullanılan temel cihazlar. Temel sterilizasyon
yöntemleri ve kontaminasyondan korunma yolları.
Doç.Dr.Erdinç DURSUN
İ.Ü. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, Beyin ve Nörodejeneratif Hastalıklar Araştırma Laboratuvarı
10.15-10.30 Kahve arası
10.30-12.00 Hücre Kültürünün Temel Prensipleri
Hücre kültürü tipleri. Devamlı hücre soyları ve
primer hücre kültürü, benzerlikleri ve farkları.
Kültürü yapılacak dondurulmuş hücrelerin çözülmesi, sayımı, ekimi, pasajlanması ve dondurulması.
Çapraz-kontaminasyondan korunma yolları.
Doç. Dr. Duygu GEZEN AK İ.Ü. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, Beyin ve Nörodejeneratif Hastalıklar Araştırma Laboratuvarı
12.00-13.00 Öğle yemeği
13.00-15.00 Uygulama
Nöroblastoma hücreleri için petrilerin kaplanması, medyumların hazırlanması
Primer nöron kültürü için petrilerin kaplanması, medyumların hazırlanması
Doç. Dr. Erdinç DURSUN
MSc. İrem ATASOY
BSc. Büşra ŞENGÜL
İ.Ü. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, Beyin ve Nörodejeneratif Hastalıklar Araştırma Laboratuvarı
15.00-15.30 Kahve arası
15.30-18.00 Uygulama
Nöroblastoma hücreleri için petrilerin yıkanması
Nöroblastoma hücrelerinin pasajlanması (hücrelerin sayımı ve ekimi).
Doç. Dr. Duygu GEZEN AK
MSc. Merve ALAYLIOĞLU
BSc. Büşra ŞENGÜL
BSc. Ebru KESKİN
İ.Ü. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, Beyin ve Nörodejeneratif Hastalıklar Araştırma Laboratuvarı
2.GÜN (18 NİSAN 2017 Salı)
Saat Bilimsel Program Konuşmacı/Uygulayıcı Yer
08.30-10.00 Primer Nöron Kültürünün Prensipleri
Nöron kültürü tipleri. Hücrelerin alınacağı canlı
türünün, ilgili beyin bölgesinin ve gelişim gününün seçimi.
Disseksiyon-hücre ayrıştırma yöntemleri.
Bir nöronun kültürde yaşatılması ve olgunlaşması.
Kullanılan medyum tipleri.
Doç. Dr. Duygu GEZEN AK İ.Ü. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, Beyin ve Nörodejeneratif Hastalıklar Araştırma Laboratuvarı
10.00-10.15 Kahve arası
10.15-12.00 Uygulama
Primer nöron kültürü için hazırlanan petrilerin yıkanması
Disseksiyon öncesi hazırlıkların tamamlanması
Doç. Dr. Duygu GEZEN AK
MSc.İrem ATASOY
MSc. Merve ALAYLIOĞLU
İ.Ü. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, Beyin ve Nörodejeneratif Hastalıklar Araştırma Laboratuvarı
12.00-13.00 Öğle yemeği
13.00-15.00 Uygulama
Sezeryan ile embriyoların çıkarılması
Embriyolardan beyinlerin disseksiyonu
Stereo-zoom mikroskopu kullanılarak beynin neokorteks bölgelerinin disseksiyonu.
Doç. Dr. Duygu GEZEN AK
MSc.İrem ATASOY
MSc. Merve ALAYLIOĞLU
İ.Ü. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, Beyin ve Nörodejeneratif Hastalıklar Araştırma Laboratuvarı
15.00-15.30 Kahve arası
15.30-18.00 Uygulama
Elde edilen neokorteks bölgelerinin hücrelerine ayrıştırılması
Hücre sayımı ve ekimi.
Doç. Dr. Erdinç DURSUN
MSc. İrem ATASOY
MSc. Merve ALAYLIOĞLU
İ.Ü. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, Beyin ve Nörodejeneratif Hastalıklar Araştırma Laboratuvarı
3.GÜN (19 NİSAN 2017 Çarşamba)
Saat Bilimsel Program Konuşmacı/Uygulayıcı Yer
09.00-10.30 Hücre Kültüründe Canlılık Testleri
Toma lamı ile hücre sayımı ve hesaplanması
LDH, MTT, DAPI, TUNEL yöntemleri ile hücre canlılık/ölüm tayinleri
Doç. Dr. Erdinç DURSUN İ.Ü. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, Beyin ve Nörodejeneratif Hastalıklar Araştırma Laboratuvarı
10.30-10.45 Kahve arası
10.45-12.30 Kültür Hücrelerine Yapılacak Uygulamalar ve Deney Gruplarının Oluşturulması I
Peptid uygulamaları, Kimyasal/İlaç uygulamaları
Doç. Dr. Erdinç DURSUN İ.Ü. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, Beyin ve Nörodejeneratif Hastalıklar Araştırma Laboratuvarı
12.30-13.30 Öğle yemeği
13.30-15.00 Kültür Hücrelerine Yapılacak Uygulamalar ve Deney Gruplarının Oluşturulması II
siRNA aracılı gen susturma
Doç. Dr. Duygu GEZEN AK İ.Ü. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, Beyin ve Nörodejeneratif Hastalıklar Araştırma Laboratuvarı
15.00-15.30 Uygulama
Primer kortikal nöronların mikroskopta incelenmesi
Nöroblastoma hücrelerinin mikroskopta incelenmesi
MSc. İrem ATASOY
MSc. Merve ALAYLIOĞLU
İ.Ü. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, Beyin ve Nörodejeneratif Hastalıklar Araştırma Laboratuvarı
4.GÜN (20 NİSAN 2017 Perşembe)
Saat Bilimsel Program Konuşmacı/Uygulayıcı Yer
09.00-10.30 Kültür Hücrelerinden RNA ve Protein İzolasyonları
RNA ve protein izolasyonu protokolleri ve dikkat edilmesi gereken adımlar.
Doç. Dr. Duygu GEZEN AK İ.Ü. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, Beyin ve Nörodejeneratif Hastalıklar Araştırma Laboratuvarı
10.30-10.45 Kahve arası
10.45-12.00 Kültürdeki Hücrelerin Mikroskopta İncelenmesi
İmmün işaretlemede temel prensipler
Antikor çeşitleri ve seçimi, İmmünositokimyasal
işaretleme yöntemleri Problemler ve çözümleri. Kültür tabağına yapışan
(adherent) hücreler için immün işaretleme protokolü
.
Prof. Dr. Selma Yılmazer İ.Ü. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, Beyin ve Nörodejeneratif Hastalıklar Araştırma Laboratuvarı
12.00-13.00 Öğle yemeği
13.00-15.00 Uygulama
Primer kortikal nöronların ve nöroblastoma hücrelerinin faz-kontrast mikroskopta incelenmesi.
Fiksatif hazırlanması primer kortikal nöronların ve
nöroblastoma hücrelerinin fiksasyonu
Doç. Dr. Duygu GEZEN AK
MSc. Merve ALAYLIOĞLU
BSc. Büşra Şengül
BSc. Ebru Keskin
İ.Ü. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, Beyin ve Nörodejeneratif Hastalıklar Araştırma Laboratuvarı
15.00-15.30 Kahve arası
15.30-18.00 Uygulama (Devam)
İmmünfloresan işaretleme
Doç. Dr. Erdinç DURSUN
M.Sc.İrem ATASOY
İ.Ü. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, Beyin ve Nörodejeneratif Hastalıklar Araştırma Laboratuvarı
5.GÜN (21 NİSAN 2017 Cuma)
Saat Bilimsel Program Konuşmacı/Uygulayıcı Yer
09.00-12.00 Uygulama
İmmünfloresan işaretleme deneylerinin devamı
Floresan mikroskopta görüntüleme
Doç. Dr. Erdinç DURSUN
MSc. İrem ATASOY
MSc. Merve ALAYLIOĞLU
İ.Ü. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, Beyin ve Nörodejeneratif Hastalıklar Araştırma Laboratuvarı
12.00-13.00 Öğle yemeği
13.00-14.00
SINAV
14.00-15.00 Kahve arası / Sınav Sonuçlarının Değerlendirilmesi
Teorik ve Uygulamalı Nörogenetik
Kurs Programı
1.GÜN (24 Nisan 2017 Pazartesi) Saat Bilimsel Program Konuşmacı/Uygulayıcı Yer
09.00-09.10 Açılış Prof. Dr. Elif ÖZKÖK İ.Ü. Aziz Sancar Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü (DETAE)
09.10-10.00
Nörogenetiğe Giriş DNA ve RNA Temelli Genetik
Yöntemler Varyasyon analizi
Araş. Gör. Dr. Aris ÇAKİRİS İ.Ü. Aziz Sancar Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü (DETAE)
10.00-10.15 Kahve Arası
10.15-11.00
Uygulama DNA Temelli Nörogenetik Yöntemler Hücre Kültürü Örneklerinden
(Veya Kan) DNA İzolasyonu
MSc. Melda SARIMAN Biyomühendis Burcu SALMAN Biyomühendis N.Ece BİBEROĞLU
İ.Ü. Aziz Sancar Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü (DETAE)
11.00-12.00
Uygulama PCR-RFLP analizi Sonuçlarının Yorumlanması
Dr. Ferda PERÇİN PAÇAL MSc. Melda SARIMAN Biyomühendis Burcu SALMAN Biyomühendis N.Ece BİBEROĞLU
İ.Ü. Aziz Sancar Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü (DETAE)
12.00-13.00 Öğle Yemeği
13.00-13.30 RNA Temelli Nörogenetik Yöntemler Real-Time PCR
Araş. Gör. Dr. Zeliha EMRENCE
İ.Ü. Aziz Sancar Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü (DETAE)
13.30-14.00
RNA Temelli Nörogenetik Yöntemler Kantitatif Real-Time PCR Ekspresyon analizi
Doç. Dr. Sema SIRMA EKMEKÇİ
İ.Ü. Aziz Sancar Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü (DETAE)
14.00-14.15 Kahve Arası
14.15-14.45
RNA Temelli Nörogenetik Yöntemler Mikroarray: Gen Expresyon
Analizi
Doç. Dr. Emel ERGÜL İ.Ü. Aziz Sancar Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü (DETAE)
14.50-17.00
Uugulama RNA Temelli Genetik Yöntemler Hücre Kültürü Örneklerinden
(Veya Kan) RNA İzolasyonu Kantitatif Real-Time PCR ve
Sonuçların Analizi
Araş. Gör. Dr. Aris ÇAKİRİS Araş. Gör. Dr. Zeliha EMRENCE
İ.Ü. Aziz Sancar Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü (DETAE)
2.GÜN (25 Nisan 2017 Salı) Saat Bilimsel Program Konuşmacı/Uygulayıcı Yer
09.00-09.30
Yeni Nesil Dizileme Yöntemleri Yeni nesil dizileme prensipleri Yeni nesil dizilemenin
kazandırdıkları
Doç. Dr. Neslihan ABACI İ.Ü. Aziz Sancar Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü (DETAE)
09.30-10.00
Yeni Nesil Dizileme Yöntemleri devam Örneklerden Kütüphane
Hazırlama
Dr. Ferda PERÇİN PAÇAL İ.Ü. Aziz Sancar Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü (DETAE)
10.00-10.20 Kahve Arası
10.20-11.00 Yeni Nesil Dizileme Uygulamaları Ekzon Dizileme
Araş. Gör. Dr. Zeliha EMRENCE
İ.Ü. Aziz Sancar Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü (DETAE)
11.00-12.00 Yeni Nesil Dizileme Uygulamaları RNA Dizileme
MSc. Melda SARIMAN İ.Ü. Aziz Sancar Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü (DETAE)
12.00-13.00 Öğle Yemeği
13.00-13.40 Yeni Nesil Dizileme Uygulamaları ChIP Dizileme
Doç. Dr. Sema SIRMA EKMEKÇİ
İ.Ü. Aziz Sancar Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü (DETAE)
13.40-14.40
Yeni Nesil Dizileme Data Analizi Yeni Nesil Dizilemede kullanılan
data formatları Data kalite kontrol/referans
karşılaştırma/Varyant calling Homozigot Haritalama
Araş. Gör. Dr. Aris ÇAKİRİS Biyomühendis Burcu SALMAN Biyomühendis N.Ece BİBEROĞLU
İ.Ü. Aziz Sancar Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü (DETAE)
14.40-15.00 Kahve Arası
15.00-17.00 Sınav Sınav Sonuçlarının Değerlendirilmesi Sınav Sonuçlarının İlan Edilmesi
Kursta Teorik ve Uygulamalı Eğitim Verecek Bilim İnsanlarımız
Prof. Dr. Erdem Tüzün
İstanbul Üniversitesi, Sinirbilim AD, Aziz Sancar Deneysel Tıp ve Araştırma Enstitüsü, İstanbul
Erdem Tüzün tıp doktoru ve nöroloji uzmanı ünvanlarını İstanbul Tıp Fakültesi’nde aldı. Ardından Oxford, Teksas ve Pensilvanya Üniversitelerinde doktora sonrası araştırmacı olarak çalıştı. Halen İstanbul Üniversitesi, DETAE Sinirbilim AD’da bölüm başkanlığı görevini sürdürmektedir. Klinik nöroimmünoloji ve immünoloji ile ilgili SCI indeksli dergilerde yayınlanmış yüzden fazla makalesi vardır.
Nöropsikiyatri Arşivi’nin editör yardımcısı ve Nöroimmünoloji Derneği’nin kurucu üyelerindendir.
Doç.Dr. Duygu Gezen-Ak İstanbul Üniversitesi, Cerrahpaşa Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyoloji AD.
Lisans eğitimimi 2000 yılında İ.Ü Fen Fakültesi Biyoloji Bölümünde, Yüksek lisans eğitimini 2003 yılında doktora eğitimini ise 2009 yılında İstanbul Üniversitesi, Cerrahpaşa Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyoloji AD’da tamamladı. 2000 yılından 2014 yılına kadar aynı anabilim dalında araştırma görevlisi olarak hizmet verdi. 2014 yılında doçentlik ünvanını aldı. 2007 ve 2011 yıllarında University of Medicine and Dentistry of
New Jersey (UMDNJ) Department of Biochemistry and Molecular Biology, Department of Neuroscience bölümlerinde araştırma deneyimine sahip oldu. Şu ana kadar SCI ve SCI-E dergilerde yayınlanmış 22 adet makalesi 589 atıf almıştır. Halen Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı’nda öğretim üyesi olarak görevine devam etmektedir.
Doç. Dr. Erdinç Dursun İstanbul Üniversitesi, Cerrahpaşa Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyoloji AD.
Lisans eğitimini 2000 yılında İ.Ü Fen Fakültesi Biyoloji Bölümünde, Yüksek lisans eğitimini 2003 yılında doktora eğitimini ise 2009 yılında İstanbul Üniversitesi, Cerrahpaşa Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyoloji AD’da tamamladı.2000-2104 yılları arasında aynı anabilim dalında araştırma görevlisi olarak hizmet verdi. 2014 yılında doçentlik ünvanını aldı. 2007 ve 2011 yıllarında 1’er ay süreyle University of Medicine and
Dentistry of New Jersey (UMDNJ) Department of Biochemistry and Molecular Biology / Department of Neuroscience bölümlerinde araştırma deneyimine sahip oldu. Şu ana kadar SCI ve SCI-E dergilerde yayınlanmış 21 adet makalesi 583 atıf almıştır. Halen Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı’nda öğretim üyesi olarak görevine devam etmektedir.
Doç. Dr. Sema Sırma Ekmekçi
İstanbul Üniversitesi, Genetik AD, Aziz Sancar Deneysel Tıp ve Araştırma Enstitüsü, İstanbul
1996 yılında İstanbul Üniversitesi, Cerrahpaşa Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyolojik Bilimler Bölümünden mezun olmuştur. Yüksek Lisansını ve Doktorasını İstanbul Üniversitesi Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü, Genetik Anabilim Dalında tamamlamıştır. Amerika Birleşik Devletleri, St. Jude Çocuk Araştırma Hastanesi, Genetik ve Tümör Hücre Biyolojisi
bölümünde tez çalışmalarını sürdürmüş aynı zamanda Doktora sonrası araştırmacı olarak çalışmıştır. 1998 yılından beri İstanbul Üniversitesi Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü’nde görev yapmaktadır. Yeni nesil dizilemde; ChIP dizileme, Eksom dizileme ve Transkriptom çalışmalarında bulunmuştur. Bugüne kadar 26 uluslararası ve 7 ulusal makalesi bulunmaktadır.
Doç. Dr. Emel Ergül Kocaeli Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyoloji AD
2001 yılında Kocaeli Üniversitesi Tıp Fakültesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Tıbbi Biyoloji AD. Yüksek lisansını tamamladı. 2006 yılında Kocaeli Üniversitesi Tıp Fakültesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Tıbbi Biyoloji AD. Doktorasını tamamladı. 2010 yılında Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji AD.'na Yrd. Doç. olarak atandı. 2014 yılında Doçentlik ünvanını alarak Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji AD da Doç. Dr. olarak atandı. Kanser genetiği ve sitogenetik konularında çalışmakta olup
uluslararası 30 adet makalesi, uluslararası ve ulusal kongre özet kitapçıklarında basılmış 45 adet bildirisi bulunmaktadır. H-indexi 12 olup Bilimsel çalışmaları 546 adet atıf almıştır.
Doç. Dr. Neslihan Abacı İstanbul Üniversitesi, Genetik AD, Aziz Sancar Deneysel Tıp ve Araştırma Enstitüsü, İstanbul
M.Ü. Atatürk Eğitim Fakültesi Biyoloji Öğretmenliğinden (İngilizce) 1996 yılında mezun olmuştur. Yüksek lisans ve doktorasını İ.Ü. Sağlık Bilimleri Enstitüsü Genetik programında tamamlamıştır. 2009 yılında ABD’de kısa süreli olarak NIH’te Behçet Hastalığını ile “Genom wide associaton” çalışmasında
bulunmuştur. Medüller Tiroid Kanseri, Hipertrofik Kardiyomiyopati ve Otoinflamatuvar hastalıklar genetiği ile ilgili çalışmalarda bulunmuştur. 2009 yılında, Aziz Sancar DETAE bünyesinde kurulan Tüm Genom Laboratuarının kurucu kadrosunda yer almıştır. 2014 yılından bu yana Tüm Genom Laboratuvarı sorumlusudur. Yeni nesil dizilemede; viral DNA, mtDNA, Metagenomiks ve Transkriptom çalışmalarında ulusal ve uluslararası 13 makalede yer almıştır. Çalışma konuları ile ilgili uluslararası ve ulusal dergilerde yayınlanmış makaleleri bulunmaktadır.
Araş. Gör. Dr. Aris Çakiris
İstanbul Üniversitesi, Genetik AD, Aziz Sancar Deneysel Tıp ve Araştırma Enstitüsü, İstanbul
Lisans eğitimini İstanbul Üniversitesi Fen Fakültesi Biyoloji Bölümü’nde 2003’de tamamladı.Yine aynı üniversitenin Sağlık Bilimleri Enstitüsü’nde Genetik Bölümünde 2006 yılında yüksek lisansını 2012 yılında ise doktorasını tamamladı. Çalışma alanı otoinflamatuvar hastalıkların genetiği (FMF, Behçet) olmak üzere ayrıca 2009 yılında Aziz Sancar Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü
bünyesinde kurulmuş olan Tüm Genom Analiz Laboratuvarı’nın kurucu kadrosunda bulunmuş ve bu alanda uluslararası ve ulusal birçok makalede yer almıştır. Halen aynı enstitünün Genetik bölümünde çalışmalarını sürdürmektedir.
Araş. Gör. Dr. Zeliha Emrence
İstanbul Üniversitesi, Genetik AD, Aziz Sancar Deneysel Tıp ve Araştırma Enstitüsü, İstanbul
2008 yılında Marmara Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyoloji
Bölümünden mezun olmuştur. Yüksek Lisansını (2010) ve Doktorasını
(2016) İstanbul Üniverstesi Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü, Genetik
Anabilim Dalında tamamlamıştır. 2012 yılından beri İstanbul
Üniversitesi Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü’nde görev yapmaktadır.
Yeni nesil dizileme konusunda; Mitokondriyal DNA dizileme, Ekzom dizileme çalışmalarında
bulunmuştur. Bugüne kadar 12 uluslararası ve 3 ulusal makalesi bulunmaktadır.
Araş. Gör. Dr. Nurcan ORHAN, PhD. İstanbul Üniversitesi, Sinirbilim AD, Aziz Sancar Deneysel Tıp ve Araştırma Enstitüsü, İstanbul
İstanbul Üniversitesi Fen Fakültesi Biyoloji bölümünden 2001 yılında mezun oldu. Aynı bölümde Zooloji Yüksek Lisansını 2004 yılında “Sıçan (Rattus norvegicus)’larda Akut İskemi Reperfüzyon Modeli ile Oluşturulan Böbrek Yetmezliğinde Prostoglandin E(1)’in Rolü” başlıklı tezi ile tamamladı. Ardından İstanbul Üniversitesi Deneysel
Tıp Araştırma Enstitüsü Sinirbilim Anabilim Dalı’nda Yüksek Lisans eğitimine başladı. 2007 yılında Sinirbilim Yüksek Lisansını “Obsesif Kompulsif Bozukluğu Olan Kişilerde Eşleşme Bozucu Protein-2 ve Mangan Süperoksit Dismutaz Polimorfizmlerinin Oksidatif Stres İle İlişkisi“ başlıklı tezi ile tamamladı. 2007 yılında Sinirbilim Anabilim Dalı’nda İleri Nörolojik Bilimler Doktora programını 2013 yılında "Travmatik Beyin Hasarı Oluşturulan Sıçanlarda Beta-Hidroksibütiratın Beyin Damar Geçirgenliğine Etkileri“ başlıklı tezi ile doktora ünvanını alarak tamamladı. 2005 yılından beri DETAE Sinirbilim Anabilim Dalı’ında Araştırma Görevlisi olarak çalışmalarını sürdürmektedir. Nörolojik ve psikiyatrik hastalıklarda polimorfizm araştırmaları, kafa travması sonucu oluşan beyin hasarı, epilepsi ve kan beyin bariyeri başlıca çalışma alanlarıdır. Ulusal toplantılarda alınmış 8 adet bilimsel ödülü bulunmaktadır. Bir adet uluslararası sempozyumda sempozyum sekreteri olarak ve yedi adet ulusal bilimsel toplantıda düzenleme komitesi üyesi olarak görev almıştır. 17 adet uluslararası makalesi bulunmaktadır. Sözlü ve poster olarak sunulmuş 36 adet uluslararası ve 24 adet ulusal bildirisi vardır. Yurtdışı ortaklı ikisi devam eden 3 adet projede görev almaktadır. TÜBİTAK tarafından desteklenen 2 adet projede görev almış ve İstanbul Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Birimi tarafından desteklenmiş yürütücülüğünü yaptığı 3 adet tez projesini tamamlamıştır. Ayrıca aynı birim tarafından desteklenen 15 adet tamamlanmış 3 adet devam eden projede görev almaktadır.
Araş.Gör. Canan Aysel Ulusoy İstanbul Üniversitesi, Sinirbilim AD, Aziz Sancar Deneysel Tıp ve Araştırma Enstitüsü, İstanbul
İstanbul Üniversitesi Fen Fakültesi Biyoloji Bölümü’nden 2010 yılında mezun olmuştur. 2010-2013 yılları arasında İstanbul Üniversitesi Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü Sinirbilim Anabilim Dalı’nda Sinirbilim Yüksek Lisans Programı’nda yüksek lisans yapmıştır. Yüksek lisans tez danışmanı Doç. Dr. Erdem Tüzün, tez başlığı “ Deneysel otoimmün MuSK miyastenia graviste sitokinlerin rolü”dür.
2014 yılından beri İstanbul Üniversitesi Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü Sinirbilim Anabilim Dalı’nda İleri Nörolojik Bilimler Doktora Programı’nda eğitimine devam etmektedir. İlgilendiği araştırma konuları nöroimmünoloji ve deneysel hayvan modelleridir.
Uzm. Dr. Vuslat Yılmaz, PhD.
İstanbul Üniversitesi, Sinirbilim AD, Aziz Sancar Deneysel Tıp ve Araştırma Enstitüsü, İstanbul
İstanbul Üniversitesi Fen Fakültesi, Biyoloji Bölümü’nü 1997 yılında bitirdim. 2003 yılında Aziz Sancar, Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü, İmmünoloji AD’de 2003 yılında yüksek lisansımı, yine aynı bölümde 2010 senesinde doktora eğitimimi tamamladım. Bu sırada, İstanbul Tıp Fakültesi, Fizyoloji AD’de özellikle Miyasthenia gravis hastalığındaki immünolojik mekanizmalara yönelik çalışmalara devam ettim. Doktora sonrası bir yıl CNRS-AIM’ye bağlı Kas hastalıkları Araştırma
Merkezi’nde (Paris) “Miyasthenia gravis’te B hücrelerinin yeni rolleri” başlıklı çalışmayı yürüttüm. Halen Aziz Sancar, Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü, Sinirbilim AD’de nöroimmünolojik mekanizmalararaştırmak üzere insan ve deneysel hayvan modeli üzerinde çalışmaktayım.
Dr. Ferda PAÇAL İstanbul Üniversitesi, Genetik AD, Aziz Sancar Deneysel Tıp ve Araştırma Enstitüsü, İstanbul
2001 yılında İstanbul Üniversitesi Fen Fakültesi Biyoloji Bölümünden
mezun olmuştur. Fen Bilimleri Enstitüsü Biyoloji Anabilim Dalında
2004 yılında yüksek lisansını, 2010 yine aynı birimde doktorasını
tamamlamıştır. 2001 – 2011 yılları arasında Fen Fakültesi Biyoloji
Bölümünde Araştırma Görevlisi olarak çalışmıştır. 2011 yılından bu
güne kadar İstanbul Üniversitesi Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü’nde Biyolog Dr. Olarak görev
yapmaktadır. Bu güne kadar multidisipliner olarak 24 makale ve 2 kitapta yazarlığı bulunup, yeni nesil
dizileme konusunda Mitokondriyal genom analizi, RNA sekanslama çalışmalarında yer almıştır.
Dr. Sevgin Değirmencioğlu
İstanbul Üniversitesi, İstanbul Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyokimya Anabilim Dalında doktorasını tamamlamıştır. Başlıca araştırma alanları sitokinler, polimorfizm, DNA tamir genleri ve otoimmün hastalıklardır. 2011 yılından beri Molgen Biyoteknoloji firmasında Araştırma Geliştirme' den sorumlu yöneticidir.
Biyomüh. Burcu Salman İstanbul Üniversitesi, Genetik AD, Aziz Sancar Deneysel Tıp ve Araştırma Enstitüsü, İstanbul
2015 yılında Marmara Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Biyomühendislik (İngilizce) Bölümünden mezun olmuştur. İstanbul Üniversitesi Sağlık Bİlimleri Enstitüsü Genetik Anabilim Dalı’nda yüksek lisansına devam etmektedir. Yeni nesil dizileme yöntemleri, veri analizi ve biyoinformatik alanlarına ilgi duymaktadırve bu alanlardaki çalışmalarda rol almaktadır.
Biyomüh. Nezahat Ece Biberoğlu İstanbul Üniversitesi, Genetik AD, Aziz Sancar Deneysel Tıp ve Araştırma Enstitüsü, İstanbul
2014 yılında Yıldız Teknik Üniversitesi, Kimya-Metalurji Fakültesi, Biyomühendislik Bölümünden mezun olmuştur. İstanbul Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Genetik Anabilim Dalı’nda yüksek lisansına devam etmektedir. Yeni nesil dizileme yöntemleri ve biyoinformatik alanlarına ilgi duymaktadır.
MSc. Melda SARIMAN İstanbul Üniversitesi, Genetik AD, Aziz Sancar Deneysel Tıp ve Araştırma Enstitüsü, İstanbul
1985 yılında Bursa ‘da doğmuştur. 2008 yılında Marmara Üniversitesi Fen Edebiyat Fakültesi Biyoloji Bölümünden mezun olmuştur. 2008-2013 Yüksek Lisansını Genetik Programında Aziz Sancar Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü- İç Hastalıkları Tıbbi Genetik Anabilimdalında yapmış olup, 2010-2012 yılları arasında İstanbul Tıp Fakültesi Çoçuk Biyokimya Laboratuvarında çalışmıştır. 2015 yılında başladığı Doktora Genetik programına Aziz Sancar Deneysel Tıp
Araştırma Enstitüsü Genetik Anabilimdalında halen devam etmektedir. Yeni Nesil Dizileme konusunda RNA dizileme –Transkiptom konularında çalışmalarda bulunmuştur. 1 ulusal yayını 1 uluslararası makalesi bulunmaktadır.
KAYIT ÜCRETLERİ
Kurs Adı Kurs Sorumlusu KDV Dahil Fiyat Kurs Tarihi Öğrenci Uzman
Teorik ve Uygulamalı Nöroimmünoloji
Prof. Dr. Erdem Tüzün
400 TL
750 TL
3-8 Nisan 2017
Temel Hücre Kültürü ve Primer Nöron
Kültürü
Yrd. Doç. Dr. Cem İsmail Küçükali
6TL 500 TL 17-21 Nisan 2017
Teorik ve Uygulamalı Nörogenetik
Prof. Dr. Elif Özkök 300 TL 500 TL 24-25 Nisan 2017
Kurs Ücretine Dahil Hizmetler
Kayıt Ücreti
Kurs Çantası
Öğle Yemeği
Kahve Molaları
Sertifika
Nöroimmunoloji Derneği
NiMDER