Download - Molekuláris interakciós ujjlenyomat
Molekuláris interakciós ujjlenyomat
Málnási-Csizmadia András, Bikádi Zsolt, Hazai Eszter, Jelinek Balázs, Hári Péter, Simon Zoltán,
Zhenhui Yang, Zahoránszky Gergely
A projekt áttekintése
•Gyógyszerfejlesztés
– Nagyrészt szemiempirikus• Ismert/természetes hatóanyag továbbfejlesztése• High Throughput Screening
– Pontos hatásmechanizmus nem ismert, és nem is kell az engedélyezéshez
– Mellékhatások• Több fehérjepartner• A gyógyszerjelölt molekula elvetését okozhatja• Költséges (egy gyógyszer fejlesztése több 100 millió USD)
A projekt áttekintése
•Komplex szolgáltatás
A. Direct Similarity
B. ZMOL Similarity
C. Molecular Interaction Fingerprint
– Alkalmas gyógyszerjelölt molekulák többszintű szűrésére
• Szerkezetvizsgálat• Mellékhatás-vizsgálat
Straight et al, Science
Eötvös Loránd Tudományegyetem, Biokémiai Tanszék
• Dr. Málnási-Csizmadia András, Jelinek Balázs, Zahoránszky Gergely, Zhenhui Yang, Simon Zoltán
Virtua Drug Kft.• Dr. Bikádi Zsolt, dr. Hazai Eszter
DELTA Elektronik Kft.• Hári Péter, Akli Péter
eScience Regionális Egyetemi Tudásközpont
• Dr. Szathmáry Eörs
Résztvevők, partnerek
A projekt áttekintése
•Cél
Mellékhatás-predikció a bioinformatika eszközeivel
•Eszköz
Molekuláris dokkolás
Art Olson, TSRI
Dokkolási probléma: Két különálló molekula atomi koordinátáiból kiindulva hogyan adható meg kettejük komplexének szerkezete?
A projekt áttekintése
I. Adatgyűjtés, szelekció
II - III. Előkészítés és dokkolás
kcal/mol
8,5
2,5
0
-2,5
-4,5
Fehérjék
Ligandu
mo
k
Hasonló MIF
Hasonlókölcsönhatási partnerek
Hasonló hatások,Hasonló mellékhatások
IV. Az eredmények értékelése
MOLEKULÁRIS INTERAKCIÓS
UJJLENYOMAT (MIF)
Egyedileg jellemzi a kismolekulátKölcsönhatási partnerek előrejelzéseA fehérjekészlet diszkriminátor-felületként működik
V. A szolgáltatás beindítása
Összkép
• Adatgyűjtés– Gyógyszermolekulák és fehérjék 100%– Mellékhatások 50%
• Előkészítés 100%
• Dokkolás 100%
• Értékelés 2007. március
• Szolgáltatás indítása 2007. december
Állapot, ütemterv
Eötvös Loránd Tudományegyetem, Biokémiai Tanszék
• Dr. Málnási-Csizmadia András, Jelinek Balázs, Zahoránszky Gergely, Zhenhui Yang, Simon Zoltán
Virtua Drug Kft.• Dr. Bikádi Zsolt, dr. Hazai Eszter
DELTA Elektronik Kft.• Hári Péter, Akli Péter
eScience Regionális Egyetemi Tudásközpont
• Dr. Szathmáry Eörs
Résztvevők, partnerek